KEGG   Xenopus laevis (African clawed frog): 108719174
Entry
108719174         CDS       T01010                                 
Symbol
dsel.L
Name
(RefSeq) dermatan-sulfate epimerase-like protein
  KO
K01794  chondroitin-glucuronate 5-epimerase [EC:5.1.3.19]
Organism
xla  Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla00532  Glycosaminoglycan biosynthesis - chondroitin sulfate / dermatan sulfate
xla01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:xla00001]
 09100 Metabolism
  09107 Glycan biosynthesis and metabolism
   00532 Glycosaminoglycan biosynthesis - chondroitin sulfate / dermatan sulfate
    108719174 (dsel.L)
Enzymes [BR:xla01000]
 5. Isomerases
  5.1  Racemases and epimerases
   5.1.3  Acting on carbohydrates and derivatives
    5.1.3.19  chondroitin-glucuronate 5-epimerase
     108719174 (dsel.L)
SSDB
Motif
Pfam: Sulfotransfer_3 Sulfotransfer_1 DUF4962
Other DBs
NCBI-GeneID: 108719174
NCBI-ProteinID: XP_018123343
Xenbase: XB-GENE-17339038
UniProt: A0A166W7U1 A0A974CPW9
LinkDB
Position
6L:107780010..107791208
AA seq 1206 aa
MALNLTEHYIFLFITIVCFLLVDKSASNSSDWLLLTNNVAQYHKLYEFTSGTKQKSGLLH
PNLFFDATDVQELRQKSHTSHIHLFRTIRNAVMKMLSNPSYYLPPPKHADFTAKWNEIYG
NNLPPLALYCLLSPDDKTAFAFALEYMDRMANYKDWLVQTAPGDEVPLGHSLTGFATAFD
FLYSSLDRNKRQQYLEKIQTASEEMYEYSKIRSWGKQFLHNHQATNMLALLTGALVIQGY
KEAQANLWKQTVVDVMEKTMFLLNHVVDGSLDEGVAYGSYTSKSITQYVFLAHRHFGINH
FENIWLKMHFYFYYSTLLPGFQRTIGIADSNYNWFYGPESQLVFLDTFILKNGLGNWLAY
QIRKHRPKDGPMVPSTAQRWSTLHTEYLWYNADLFLHPPPDQGTAKMHLFPNWGVVTYGA
GLPNTQTNTFFSFKSGKLGGRAVYDIVHFQPYSWVDGWRSFNPGHEHPDQNSFTFAPNGQ
VFVSEALYGPKMSYLNNILVFAPSPTSQCNKPWEGQLGECSQWLKWTTEEYGDASGEIIT
ANQHDEMIFVSGEAVSAYSSSMRLKSVYRGLLLLNHQTLLVIDHIEKYQDSPISLASAFF
HNLDIDFKYVAFRFLNKYNGAMMDIWDAHYKMFWLDQNGNSPSARIQEAEQAAEFKKRWT
QFVNVTFQLNDKISRIAYLFFGPYVNVSDLKFLDHSKYGVKISVKINNTEHIVSLVTEYN
DLEARFSFLGFGGFAKVENHEKIVRFGLGVDHKRKHETVGLNIFHFGLKVNVMIGLTLCI
GLVILAFNWRFYISFSKLMRWILVLIITLYFFELLDVWSTCTQPICAKWNSEIADAENKY
ERQSIDLPAVIITSLPSSGAEILKQLFFNSSDFIYIRVPTAYIDIPDGEFKVDSFVDACE
WSSSDVQEGHFKLIQGWLQSLLQNTKIHLQNIDLHEPSKAKLFHHSIITKDKKRRFKRRD
PFPEQKNRIKGSYDRDAEYIRHLRKQLMKFPNAQPILGLSSGSWTLKVPFIQNIIGPSLR
AIFVVRDPRSWIYTLLYKSRPNLFSLRNIPQRLYEIFKEEEEQKCKSNAGYAFEYESLED
ELFDSESNPLSKLSHLWLSNTAAARRINRNLPAINYLLVRFEDIINSPQKTAEQIYKFFG
IPVSPASLNQILFASTTNLFYLPQEGEISPSSLNTWKLNMPKEDIKLIENICWTQMQQLG
YTKYID
NT seq 3621 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctctaaatttaacagaacactatatttttctatttattaccattgtttgcttttta
ctcgttgataaatctgctagcaattcatctgactggttgttactgacaaataatgttgct
caatatcacaaattatatgaatttacatctggcacgaaacagaagagtggccttttgcat
ccaaatttgttctttgatgctacagatgttcaagaattaaggcagaaatctcatactagt
cacatacacttatttaggacaattagaaatgctgtaatgaagatgctgtctaatccatca
tactatttgcctccaccaaagcatgctgattttactgcaaaatggaatgaaatttatgga
aacaatcttcctcctttggcactgtattgcctgctttctccagatgataaaacagcattt
gcttttgcactagaatatatggataggatggctaattataaagactggttggtccagact
gctcctggcgatgaagtacctcttggccattcattgactggctttgccacagcctttgac
tttctgtatagttcacttgatcgtaataaaaggcaacaatatttggaaaaaatccaaact
gccagtgaagaaatgtatgaatattctaaaattcgctcctggggaaaacagtttcttcac
aaccaccaagctactaatatgctagcactacttacaggagctttggttatacagggttat
aaagaagcccaggctaatctctggaaacaaactgtggttgatgtaatggaaaagacaatg
tttcttctcaatcatgttgttgatggctctttagatgaaggtgttgcttatggaagttat
acttctaaatccattactcagtatgtttttttagcacatcgacattttggtatcaatcac
tttgagaacatctggttaaaaatgcacttctacttttattattctactctgctgccaggt
tttcagagaacaattggaatagcagattcaaattataactggttttatggtcctgaaagc
cagttagtgtttctggacacttttatcttaaagaatggtcttggaaattggctagcctat
cagatccgaaaacacagacctaaagatggtcccatggtaccatccacagcacaaaggtgg
agcacccttcatacagaatatctatggtacaatgctgatctttttttgcatccacctcct
gatcaaggcactgcaaaaatgcacttgtttccaaactggggcgttgtgacttatggagct
ggattaccaaatactcagacaaatacatttttctctttcaaatctggaaagcttggtggt
cgggcagtttatgatattgttcattttcaaccatactcctgggtagatggatggagaagt
ttcaatccagggcatgagcatccagatcaaaactcctttacatttgctcccaatggacaa
gtatttgtctctgaagcactatatggaccaaaaatgagttatttaaataatattctagtt
tttgctccatcacctacaagtcagtgtaataaaccttgggaaggacagttgggtgaatgc
tcacagtggcttaaatggacaacagaagaatatggtgatgcatctggtgagattataaca
gccaatcagcatgatgaaatgatatttgtaagtggggaagcagtctctgcttattcgtct
tccatgagattaaagagtgtttaccgtggtttactgcttttaaaccaccagactcttctg
gtaattgatcatatagaaaagtatcaagattctccaatatccctagccagtgcctttttc
cataatctggatattgattttaaatatgttgctttcagatttttaaacaaatacaatggc
gccatgatggatatttgggatgctcattacaaaatgttttggttagaccaaaatggtaat
agcccctctgccaggatacaagaagcagagcaggctgctgaatttaagaagcgctggaca
caatttgtaaatgtaacctttcaattaaatgacaaaatttcacgaattgcatacttattc
tttgggccatatgttaatgtatctgatctaaaatttctagatcatagtaaatatggggtt
aagatttccgttaaaattaacaatactgaacatattgtatctttagtaactgaatataat
gatttagaggctcgatttagctttcttggatttggtgggtttgcaaaagtagagaatcat
gaaaaaatagtacgctttggtttaggagttgatcataaaagaaaacatgaaactgttggt
ttaaatatatttcactttggcttaaaagtaaatgtaatgattggattgacattgtgcata
ggtttggtaattttagcatttaactggagattttatatttcctttagtaagctgatgcgt
tggatcctagtattgattattacactttatttttttgaattactagatgtatggagcaca
tgtacgcaacccatttgtgctaagtggaacagtgaaattgcagacgctgaaaataaatat
gaaaggcaatctatagatctgccagctgtaattatcacttctcttcccagttcaggagct
gagattttgaaacagctttttttcaacagctctgatttcatatacattagagtccccact
gcttacattgatattccagatggagagtttaaggttgattcatttgtcgatgcatgcgaa
tggagtagttctgatgttcaggaaggacattttaaattaatccaaggttggctgcagtca
ctacttcagaatacaaaaattcatttacaaaacattgatttgcatgagcctagcaaagca
aaactttttcatcacagtatcatcactaaggataaaaaaagaagattcaaaagaagggac
ccttttcctgaacaaaaaaatagaatcaagggtagctatgacagagatgcagagtacatt
agacaccttaggaaacagttaatgaagtttccaaatgctcaacctatacttggtttaagc
agtggaagctggacattaaaagttccttttattcaaaatattattggcccttcattgaga
gcaatatttgttgttcgagaccctcgttcatggatttatacattgctatacaaaagtagg
cctaatctattctctttgaggaatatccctcagcgtttatatgaaatattcaaagaagaa
gaagaacagaaatgtaagtctaatgcaggctacgcatttgaatatgaatcattagaagat
gaactctttgattcagaatcaaatcctctttcaaaactgtcccacttgtggttatcaaac
acagctgcagcaagaaggataaacagaaatttgcctgcaataaattatctcttggttaga
tttgaagacattataaactcaccacagaaaacagcagaacaaatctataaattctttgga
atacctgtgtctcctgcaagtttaaaccaaatactctttgccagtaccacaaacttattt
taccttccacaagaaggagagatttcaccatcgagtttaaatacttggaaattgaatatg
cctaaggaagatattaaattaattgagaatatatgttggacacaaatgcaacagcttgga
tatacaaagtatatcgattaa

DBGET integrated database retrieval system