Xenopus tropicalis (tropical clawed frog): 100490545
Help
Entry
100490545 CDS
T01011
Symbol
fbn1
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
xtr
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Pathway
xtr04350
TGF-beta signaling pathway
xtr04518
Integrin signaling
xtr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xtr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
100490545 (fbn1)
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
100490545 (fbn1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
100490545 (fbn1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xtr00536
]
100490545 (fbn1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xtr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100490545 (fbn1)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_PEAR1L
EGF_TEN
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100490545
NCBI-ProteinID:
XP_002936615
Xenbase:
XB-GENE-954190
UniProt:
A0A6I8RXV1
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(103788735..103911783)
Genome browser
AA seq
2866 aa
AA seq
DB search
MRLLGSLRGCWALTLLLCVSSTHTAAEKDAPPADSAKEPRASRAKRRGGGTGAPHDVLKG
PNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQIAPSCGSKS
IQQCNIRCMNGGTCSDEQCHCQKGYAGAHCGHPVCEQGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGP
QCERDYRTGPCFTVVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGF
IPNIRTGACQDVDECQAIPGMCQGGTCINTVGSFECKCAAGHRFNDITQKCEDIDECSII
PGICESGECANTVGSYFCKCPPGFYTSADGSRCVDIRPGYCFTSLANGRCINQQPQTVTK
TQCCCDSGRCWSPGPTTPPDMCPIRGTDEYRKLCIVPGVPPIGPEYPPLGPIDGIRPFQP
IYPPPVYPGYPTRGPSVVVGVNVSQQQQITDYCALFRNLCLHGRCIPTPGSYRCECNKGF
TLDGRGECIDVDECENNPCLHADCVNTPGSYICKCYPGFQSTSTRTECRDIDECLQNGRI
CNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVSADGKNCEDMDECSVRNMCLNGMCINEDGSFKCICKP
GFQLAPNGRFCTDIDECETAGICMNGHCVNTEGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRST
CYGGYKRGQCVRPLLGAVTKSECCCASTDFAFGEPCQPCPAKMSEEYQALCSSGPGMTSV
GTDINECALDSEICPNGICENLRGTYKCICNAGYDVAITGKSCVDIDECALNTLLCDNGQ
CRNTPGSFSCTCPSGFVYKPDLKTCEDIDECESNPCINGVCRNIPGSFVCECPTGSTLDK
TKTICIETIKGTCWQNIVNGRCEININGGTLRSQCCSTLGAAWGSPCMPCEADPVCAKGF
ARSRGTTCEDVNECDVFPGLCTNGQCVNTMGSFVCQCPSGMTLDASKRTCLDIRLEICYL
KHEDEECSAQIAGRHRMDACCCSVGAAWGPDCDECPEKGTTEFETLCPRGPGFASKEIAP
GKTFSKDINECRMIPSLCKYGKCKNTIGSFKCRCDNGFALDAEERNCTDIDECRISPDVC
GQGNCVNTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGICLNTEGSFKCECP
PGHEVAPDNSACIDINECELSTDLCRHGRCINLIGRYQCACEPGYQLTPDKLSCVDTNEC
DFFNGGCDTFCTNSEGSYECHCRDGFALMPDHRSCTDIDECETNPNICDGGQCTNIPGEY
RCLCFEGYMASDDMKTCLDVDECELHLNICLSGSCENTKGSFICHCDPGYSGKKGQTGCT
DINECEIGAHNCDRHATCTNTPGSFKCSCSPGWVGNGIKCSDLDECSNGTHLCSPNADCK
NTMGSYRCLCKEGYVGDGFTCTDVDECSENLNLCGNGQCLNTPGGYRCDCDMGFLPSVDG
KACEDIDECTLPNICVFGTCRNLPGLFRCDCDTGYELDRTGGNCTDVDECSEPTMCISGT
CQNTPGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGTCYLDVKPRGDNGDVSCSNEIGVSVPKAS
CCCSLGKAWGTPCELCPAVNSSEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECLELPGLCQGGK
CINTFGSFQCRCPPGYYLNEETRVCDDVNECDQPGICGPGTCFNTVGNYTCICPPDYMQV
NGGNNCMDMRRSLCFRNYYAENQTCDGELLYNMTKKMCCCSYNIGRAWHRPCEECPLPST
DEFASLCGSARPGFLIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPMGFFYND
KLLICEDIDECQNGPVCQRNADCVNTPGSYRCDCKPGYKFTSTGQCVDRNECQEIPNICS
HGECTDTTGGYYCVCHNGFKTNEDQTMCLDINECERDPCGNGTCKNTIGSYNCRCFDGFI
LSHNNDCIDIDECTTLNGQLCRNGQCNNTVGSFVCLCNEGYEKASDERTCLDINECALDP
GKCAPGTCQNLDGAYRCICPPGYVLEGDTCKDIDECVEEPEICALGTCSNVPGSFTCLCP
EGFVLSSTGKRCQDLRVSFCFTKFEDGQCTSPKARNHSKQECCCALNGAGWGTPCELCPV
DGDAALQQICPFGMGVIVGPDDERVDMDECIDPDKCKNGQCINTDGSYRCECSFGYVLSV
DECIDIDECSVGNPCGNGTCKNIIGGFECTCEEGFEPGPMMSCEDVNECAQNPLLCAFRC
VNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQDECEDGTHDCESKQMTCKNLIGTYMCICGPGYQ
RRLDGEGCMDLNECLKPGICDNGKCVNTMGSYKCDCLEGFNASATETECIDNRLGYCFTE
VLHTMCQIGSSNRNSVTKSECCCNSGRGWGINCEICPFQGTVQFKKLCPYGKGFTTGGED
IDECQVLHGICRNGQCVNERGTYRCECNPGYTPDITGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNT
DGSFQCSCPRGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFICVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTAC
IDNNECASDVSLCGAKGICQNTPGSYSCDCQRGFTLDQSGAACEDVDECDGSHRCQHGCQ
NIVGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLNAHACGGASCHNTLGSFKCMCPTGFQFEQF
AGACQDVNECSSSQAPCSFGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVTGGGLSRAQDMAVSG
EIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSTNETALNGEEEQLEPPVSLESWDIEKPLILS
FNISHLNNKERILELTPALNTLTNHNRYLIDSGNEDGLFRINQKDGISYLHLTKKKPAPG
SYSIEINSVPLYKEKELFQLEDKHDRDYLSGELGDILKMKITILLH
NT seq
8601 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggctgctggggagcctgcggggctgctgggcacttacactgctcctgtgtgtcagc
tccactcacaccgccgccgagaaagatgcgccgcccgcagatagcgccaaggagcccaga
gccagcagagccaagaggagaggcggaggcacaggcgcaccgcacgatgtactcaaaggg
cccaatgtttgtggatcgcggtacaatgcttactgttgtcctggatggaaaacgcttcct
ggagggaaccaatgtattgtccctatttgtcggcattcttgtggggatggtttttgctct
cggccaaatatgtgcacttgtcccactggacagatagctccatcatgcggatccaagtct
atccagcagtgtaacatcagatgtatgaacggaggaacctgcagtgatgaacagtgtcat
tgccagaagggatatgcaggggcacactgtggccatcctgtctgtgaacaaggatgcctt
aatggtggaagatgtgttgcaccaaatcgctgtgcctgcacttatggctttacaggacca
cagtgtgaaagagattacaggacaggaccatgtttcacagttgtaagcaaccaaatgtgc
caagggcagctgagtgggatagtgtgcacaaagacgctatgttgtgcaactgttgggaga
gcttggggccacccttgtgaaatgtgccctgcccagccacatccatgccggcgtggcttc
ataccaaacatccgaacaggagcatgtcaagatgtggatgaatgtcaagcaatcccagga
atgtgccaaggtggaacttgcattaatacagttggatcttttgaatgcaaatgtgcagct
ggacaccggtttaatgatataacacaaaagtgtgaagatattgatgaatgcagcattata
ccaggaatctgtgaatcgggtgaatgtgcaaatacggttggcagttacttttgcaagtgc
cctccaggattttacacttcagctgatggttcaagatgtgtagatatccgtcctgggtat
tgtttcacttctttagcaaatggaaggtgcatcaaccagcaaccacaaacagtaacgaaa
acgcagtgttgttgtgattcaggaagatgttggtctccagggccgacaactccaccagac
atgtgtccaattcgtggaactgatgaatatcgcaaactgtgtatagtaccaggtgtccct
ccgattggtccagagtatccccccctgggtccaattgatggcattcgaccattccaaccc
atctatccacctccagtttacccaggatacccaacccgtggcccgtctgtggttgttgga
gttaacgtgagccagcagcagcaaataacagattactgtgctctgttccgtaacctctgt
ttacacggccgctgtattccaacccctggaagttaccgttgtgagtgtaacaaaggcttc
accttggatggtagaggagaatgcattgatgtcgatgagtgtgaaaataatccatgtctc
catgctgattgtgttaacacaccaggatcctatatttgcaagtgctatcctggatttcag
agtacatcgacccggacagagtgcagagacattgatgagtgcttacaaaatggaagaatc
tgtaataacgggcgatgtgtgaacacagatggaagttttcactgcgtgtgtaatgcaggc
tttcaagtttcagctgatggaaaaaattgtgaagatatggatgaatgcagtgtgcggaac
atgtgcctaaatggcatgtgcattaatgaagatggaagtttcaaatgtatctgcaaaccc
ggcttccaacttgctccaaatgggcgcttctgcacagatattgatgagtgcgagacggcc
ggcatctgtatgaatggacactgtgttaataccgagggttcctttaggtgcgagtgcttc
cctggtcttgcagttggacttgatggacgagtatgtgttgacacgcacatgagaagcacg
tgctatggaggctacaagcggggtcaatgcgtccgaccattgttgggagcagtcacaaag
tccgagtgttgctgtgccagtactgattttgcctttggagagccatgccagccttgccct
gcaaagatgtcagaagagtatcaagctctgtgtagcagtggacctggcatgacatctgta
ggaactgatatcaatgaatgtgcattggactctgaaatctgtccaaatggaatttgtgaa
aatcttcgtggaacctacaaatgcatctgtaatgcaggatatgacgtggctataactggg
aaaagttgtgttgatattgacgaatgtgccttgaacacgctgctctgtgataatggacag
tgtcggaataccccaggaagtttctcctgcacctgcccaagtggatttgtctataaacct
gaccttaaaacgtgtgaagatattgatgaatgcgagtccaatccctgcattaatggggta
tgccgcaatatcccaggctcctttgtgtgtgaatgtcccactggaagtaccctggataaa
acaaagacaatttgcattgaaaccataaaaggcacctgttggcagaacattgtgaatgga
aggtgtgagatcaacattaatggggggactctgagatcccagtgttgttccactctagga
gcagcttggggaagtccctgcatgccctgtgaagcagatcctgtctgtgcaaaaggcttt
gcccggtccagaggcacaacatgtgaagatgttaatgagtgtgatgtatttcctggattg
tgcactaatggccagtgtgttaacacaatgggatcctttgtctgtcaatgcccaagtgga
atgacgctggatgcttcaaaacgcacatgtcttgacatccgccttgagatctgctaccta
aaacatgaagatgaagaatgcagtgctcaaattgctggtcggcacaggatggatgcatgt
tgctgttctgtgggtgctgcctggggccctgactgtgatgagtgccctgagaaaggaaca
actgagtttgaaactctatgccccagggggccaggctttgcttctaaggagatagcacct
ggaaaaacattctctaaagatatcaatgaatgcagaatgatcccgagtctgtgcaagtat
gggaagtgcaaaaacactataggcagtttcaagtgtaggtgtgacaatggatttgctctt
gatgctgaggaaagaaactgcacagatattgatgaatgccgaatatctcctgatgtctgt
ggacaaggcaactgcgttaacactccaggagattttgagtgtgactgctttgaaggatac
gagagcggctttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgagagaaacccc
ctgttgtgccgtggtggtatctgcctgaatactgaaggaagctttaaatgtgaatgccct
cctgggcatgaagtggccccagataattctgcatgtatagatatcaatgaatgtgagctc
agtactgatctctgcagacatggcagatgtataaacctcattggcagataccagtgtgcc
tgtgagcctggatatcagttaacaccagataaactgtcttgtgttgacactaatgagtgt
gatttcttcaatgggggctgtgacaccttctgtaccaactctgaaggaagctatgagtgc
cactgcagagacggctttgctctaatgcctgaccaccgatcatgtactgatattgatgag
tgtgagacaaatccaaatatctgtgatgggggtcagtgtaccaacattcccggagaatac
aggtgtttgtgcttcgaaggatacatggcatcagatgatatgaaaacttgcttggatgtt
gatgagtgtgaactccacttgaacatctgtcttagcggaagttgtgaaaacactaaaggt
tccttcatctgccattgtgatcctggttattctggcaaaaaaggacaaactggatgcaca
gatatcaatgagtgtgagattggagcccataactgtgaccgtcacgccacctgtacaaat
actccagggagcttcaaatgcagctgcagtccaggatgggtaggaaatggaatcaaatgc
tcggatcttgatgaatgctcaaatggaacacatctgtgtagcccaaatgctgactgcaaa
aacacaatgggatcatacagatgtttgtgcaaagaaggatatgtcggggatggatttact
tgcacagatgttgatgagtgctcagaaaatctgaatctgtgtggaaatggccagtgccta
aacaccccaggaggataccgctgtgactgtgacatgggattcttaccaagtgtggatggg
aaggcatgtgaagatattgatgaatgcactttacccaacatctgtgtgtttggaacatgc
cgaaaccttcctggcctgttccgctgtgactgcgacacaggctacgagctggacagaact
gggggtaactgcacagatgtggatgaatgttctgaaccaacaatgtgtatcagtggtact
tgtcagaatactcctggcagttacacctgtgaatgccctccagattttgagctgaaccca
acaagggttggatgtgttgataccaggtccggaacttgttatttggatgtgaaaccacgg
ggagataatggagatgtgtcctgcagtaatgaaattggagttagtgttccaaaggcttct
tgctgttgctctcttggaaaagcctgggggacaccatgtgaactgtgtccagctgtaaac
tcaagtgaatataaagtcctttgtcctggtggtgaaggatttagaccaaatcctattaca
gttatcttggaagatattgatgaatgcctggagttgcctggtctctgtcagggtggaaag
tgtatcaacacgtttggtagcttccaatgtcgctgtccacctggctactaccttaatgaa
gagacccgtgtttgtgatgatgtcaatgaatgtgatcagcctggcatttgtggacctgga
acatgctttaacactgttggaaactatacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagta
aatggaggaaataattgcatggatatgagaaggagtttatgcttcagaaactattatgct
gaaaaccagacttgtgatggagaactgctttacaacatgacgaaaaaaatgtgctgctgt
tcctataatattggccgagcatggcacagaccttgtgaggaatgtcctttgccaagtaca
gatgaatttgcaagtctctgtggaagtgcaagacctggatttttgattgatatttacaca
gggctgcctgttgacattgatgaatgcagagaaattcctggtgtgtgtgaaaatggagtt
tgtataaacatggtgggcagtttcaggtgcgaatgtcccatgggattcttctacaatgac
aagctactgatatgtgaagatattgatgaatgtcagaatggacctgtatgtcaaagaaat
gcagactgtgtgaacaccccaggaagttaccgctgtgactgcaaacctggttacaagttt
acatccacaggccaatgtgttgatcgaaatgaatgccaagaaattccaaacatatgcagt
catggagaatgcacagacacaacaggagggtattattgtgtttgtcacaatggatttaaa
acaaatgaagatcagacgatgtgcctggatattaacgagtgtgaacgagatccttgtgga
aacggaacatgtaaaaatactattggttcttacaactgtcgctgctttgatgggtttata
ttgtcccacaataatgactgcatcgatattgatgaatgtaccacacttaatggtcagctg
tgcaggaatggacagtgcaataataccgttggatcttttgtgtgcctgtgcaatgagggg
tatgaaaaggcttctgatgaaagaacatgtcttgatatcaatgagtgtgcccttgaccct
ggcaaatgtgcaccaggaacttgtcagaatctggatggcgcctaccggtgcatctgtcct
cctggatatgtgttggagggtgacacatgtaaagacatcgatgaatgtgtagaggagcct
gaaatctgcgctttgggtacctgcagcaatgtgcctgggagcttcacgtgtctctgccca
gaaggctttgtgctgtcatctacaggaaaaagatgtcaagatttaagagtaagtttctgc
tttaccaagtttgaggatggacagtgcacttctcccaaagctcgaaatcactctaaacaa
gaatgttgctgtgcccttaatggagcaggatggggcactccatgtgaactgtgtcctgtg
gatggagatgccgccttacagcagatttgccccttcggaatgggagtaatagtcggacca
gatgatgagcgagttgatatggatgaatgtattgatccagacaaatgcaaaaatggacag
tgtattaacacagatggctcttatcggtgtgaatgctcctttggatatgttctctcagta
gatgaatgcatagatatcgatgaatgttctgtgggaaacccttgtgggaatgggacctgc
aagaatattattggtggatttgagtgcacttgtgaggagggcttcgagccaggtccaatg
atgtcctgtgaagatgttaatgaatgtgctcagaatcctctgttatgtgcattccgatgt
gtcaatacttatggatcttatgaatgcaagtgtccagcaggatatgttctgcgggaagac
aaaagaatgtgcaaagatcaagacgagtgtgaagatggaactcatgattgtgaatctaaa
caaatgacgtgcaaaaacctcattggaacatacatgtgcatatgtggccctggatatcag
cgtagattggatggggagggatgcatggatctgaacgaatgcctaaaaccaggaatttgt
gataatggaaagtgtgtgaacacaatgggaagttacaaatgtgactgtcttgagggtttc
aatgcgagtgctactgaaacagagtgcattgacaacaggctgggctattgcttcactgaa
gtattacataccatgtgccagatcggctcctccaacaggaattcagttaccaagtcggaa
tgctgttgtaactcagggagaggctggggtataaactgtgagatttgccccttccaaggc
acagttcagtttaagaagctctgtccttatggtaaagggttcaccaccggcggagaagat
attgatgagtgtcaagtgcttcatggtatctgccgcaatggacaatgcgttaacgagaga
gggacatatcggtgtgaatgcaatcccggttatacacctgatataactggtacatcttgc
atagatctggatgagtgcagtcagtcacccaaaccttgcaactttatatgtaaaaacaca
gacgggagtttccagtgttcctgcccaagaggatacattctgcaggaggatggacgaagc
tgcaaagacctcgatgaatgtgcaacaaaacaacataactgccagtttatttgtgttaac
accattggaggattcacctgtaaatgcccccctggtttcacgcagcatcacacagcatgc
attgacaacaacgagtgtgcttcagatgttagtctatgtggagctaaaggtatctgccag
aataccccggggagctattcttgtgattgccagcgtggatttactctggatcagagtgga
gctgcttgtgaagatgttgatgaatgtgatggaagccatcgttgtcaacacggatgccaa
aatatagttggagggtatagatgtagctgcccacaaggatatcttcagcattaccagtgg
aatcagtgtgtggatgagaatgaatgtctgaatgcccatgcctgtggaggagcctcctgc
cacaacactcttggaagctttaagtgcatgtgtcctacaggatttcagtttgagcagttt
gctggagcgtgccaagatgtcaatgaatgcagttctagtcaagcaccttgcagttttggc
tgttctaacacagaaggtggctacgtttgtggatgtccacctggatatttccgaatagga
caaggtcactgtgtaacgggaggaggactaagtagagctcaggacatggctgtcagtggg
gaaatagatgacaactctctgtcacctgaagcttgctacgactgtaaaataaatggctat
cctaagagaggaaggaaaagaaggagcactaatgagacagccctaaatggcgaagaggaa
caactggaacccccagttagtcttgaaagttgggatattgaaaaaccattaatcctatcc
ttcaacatatctcacctaaacaacaaagaacgtattttagagctcacgcctgctctaaat
acgttaacgaaccacaacagatatttaatagactctggaaatgaagatggactctttaga
ataaaccaaaaagatggtataagttacttacatctgacaaagaagaagccagcgcccggt
tcctactccatagagatcaacagtgttcctctctacaaggagaaagagcttttccagctt
gaagataaacatgacagagactacctcagcggggaactgggcgacattcttaaaatgaaa
attacaatcctactccattaa
DBGET
integrated database retrieval system
