Xenopus tropicalis (tropical clawed frog): 100490545
Help
Entry
100490545 CDS
T01011
Symbol
fbn1
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
xtr
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Pathway
xtr04350
TGF-beta signaling pathway
xtr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xtr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
100490545 (fbn1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
100490545 (fbn1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xtr00536
]
100490545 (fbn1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xtr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100490545 (fbn1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
FBN_EGF_st1
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100490545
NCBI-ProteinID:
XP_002936615
Xenbase:
XB-GENE-954190
UniProt:
A0A6I8RXV1
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(103788735..103911783)
Genome browser
AA seq
2866 aa
AA seq
DB search
MRLLGSLRGCWALTLLLCVSSTHTAAEKDAPPADSAKEPRASRAKRRGGGTGAPHDVLKG
PNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQIAPSCGSKS
IQQCNIRCMNGGTCSDEQCHCQKGYAGAHCGHPVCEQGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGP
QCERDYRTGPCFTVVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGF
IPNIRTGACQDVDECQAIPGMCQGGTCINTVGSFECKCAAGHRFNDITQKCEDIDECSII
PGICESGECANTVGSYFCKCPPGFYTSADGSRCVDIRPGYCFTSLANGRCINQQPQTVTK
TQCCCDSGRCWSPGPTTPPDMCPIRGTDEYRKLCIVPGVPPIGPEYPPLGPIDGIRPFQP
IYPPPVYPGYPTRGPSVVVGVNVSQQQQITDYCALFRNLCLHGRCIPTPGSYRCECNKGF
TLDGRGECIDVDECENNPCLHADCVNTPGSYICKCYPGFQSTSTRTECRDIDECLQNGRI
CNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVSADGKNCEDMDECSVRNMCLNGMCINEDGSFKCICKP
GFQLAPNGRFCTDIDECETAGICMNGHCVNTEGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRST
CYGGYKRGQCVRPLLGAVTKSECCCASTDFAFGEPCQPCPAKMSEEYQALCSSGPGMTSV
GTDINECALDSEICPNGICENLRGTYKCICNAGYDVAITGKSCVDIDECALNTLLCDNGQ
CRNTPGSFSCTCPSGFVYKPDLKTCEDIDECESNPCINGVCRNIPGSFVCECPTGSTLDK
TKTICIETIKGTCWQNIVNGRCEININGGTLRSQCCSTLGAAWGSPCMPCEADPVCAKGF
ARSRGTTCEDVNECDVFPGLCTNGQCVNTMGSFVCQCPSGMTLDASKRTCLDIRLEICYL
KHEDEECSAQIAGRHRMDACCCSVGAAWGPDCDECPEKGTTEFETLCPRGPGFASKEIAP
GKTFSKDINECRMIPSLCKYGKCKNTIGSFKCRCDNGFALDAEERNCTDIDECRISPDVC
GQGNCVNTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGICLNTEGSFKCECP
PGHEVAPDNSACIDINECELSTDLCRHGRCINLIGRYQCACEPGYQLTPDKLSCVDTNEC
DFFNGGCDTFCTNSEGSYECHCRDGFALMPDHRSCTDIDECETNPNICDGGQCTNIPGEY
RCLCFEGYMASDDMKTCLDVDECELHLNICLSGSCENTKGSFICHCDPGYSGKKGQTGCT
DINECEIGAHNCDRHATCTNTPGSFKCSCSPGWVGNGIKCSDLDECSNGTHLCSPNADCK
NTMGSYRCLCKEGYVGDGFTCTDVDECSENLNLCGNGQCLNTPGGYRCDCDMGFLPSVDG
KACEDIDECTLPNICVFGTCRNLPGLFRCDCDTGYELDRTGGNCTDVDECSEPTMCISGT
CQNTPGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGTCYLDVKPRGDNGDVSCSNEIGVSVPKAS
CCCSLGKAWGTPCELCPAVNSSEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECLELPGLCQGGK
CINTFGSFQCRCPPGYYLNEETRVCDDVNECDQPGICGPGTCFNTVGNYTCICPPDYMQV
NGGNNCMDMRRSLCFRNYYAENQTCDGELLYNMTKKMCCCSYNIGRAWHRPCEECPLPST
DEFASLCGSARPGFLIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPMGFFYND
KLLICEDIDECQNGPVCQRNADCVNTPGSYRCDCKPGYKFTSTGQCVDRNECQEIPNICS
HGECTDTTGGYYCVCHNGFKTNEDQTMCLDINECERDPCGNGTCKNTIGSYNCRCFDGFI
LSHNNDCIDIDECTTLNGQLCRNGQCNNTVGSFVCLCNEGYEKASDERTCLDINECALDP
GKCAPGTCQNLDGAYRCICPPGYVLEGDTCKDIDECVEEPEICALGTCSNVPGSFTCLCP
EGFVLSSTGKRCQDLRVSFCFTKFEDGQCTSPKARNHSKQECCCALNGAGWGTPCELCPV
DGDAALQQICPFGMGVIVGPDDERVDMDECIDPDKCKNGQCINTDGSYRCECSFGYVLSV
DECIDIDECSVGNPCGNGTCKNIIGGFECTCEEGFEPGPMMSCEDVNECAQNPLLCAFRC
VNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQDECEDGTHDCESKQMTCKNLIGTYMCICGPGYQ
RRLDGEGCMDLNECLKPGICDNGKCVNTMGSYKCDCLEGFNASATETECIDNRLGYCFTE
VLHTMCQIGSSNRNSVTKSECCCNSGRGWGINCEICPFQGTVQFKKLCPYGKGFTTGGED
IDECQVLHGICRNGQCVNERGTYRCECNPGYTPDITGTSCIDLDECSQSPKPCNFICKNT
DGSFQCSCPRGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFICVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTAC
IDNNECASDVSLCGAKGICQNTPGSYSCDCQRGFTLDQSGAACEDVDECDGSHRCQHGCQ
NIVGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLNAHACGGASCHNTLGSFKCMCPTGFQFEQF
AGACQDVNECSSSQAPCSFGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVTGGGLSRAQDMAVSG
EIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSTNETALNGEEEQLEPPVSLESWDIEKPLILS
FNISHLNNKERILELTPALNTLTNHNRYLIDSGNEDGLFRINQKDGISYLHLTKKKPAPG
SYSIEINSVPLYKEKELFQLEDKHDRDYLSGELGDILKMKITILLH
NT seq
8601 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggctgctggggagcctgcggggctgctgggcacttacactgctcctgtgtgtcagc
tccactcacaccgccgccgagaaagatgcgccgcccgcagatagcgccaaggagcccaga
gccagcagagccaagaggagaggcggaggcacaggcgcaccgcacgatgtactcaaaggg
cccaatgtttgtggatcgcggtacaatgcttactgttgtcctggatggaaaacgcttcct
ggagggaaccaatgtattgtccctatttgtcggcattcttgtggggatggtttttgctct
cggccaaatatgtgcacttgtcccactggacagatagctccatcatgcggatccaagtct
atccagcagtgtaacatcagatgtatgaacggaggaacctgcagtgatgaacagtgtcat
tgccagaagggatatgcaggggcacactgtggccatcctgtctgtgaacaaggatgcctt
aatggtggaagatgtgttgcaccaaatcgctgtgcctgcacttatggctttacaggacca
cagtgtgaaagagattacaggacaggaccatgtttcacagttgtaagcaaccaaatgtgc
caagggcagctgagtgggatagtgtgcacaaagacgctatgttgtgcaactgttgggaga
gcttggggccacccttgtgaaatgtgccctgcccagccacatccatgccggcgtggcttc
ataccaaacatccgaacaggagcatgtcaagatgtggatgaatgtcaagcaatcccagga
atgtgccaaggtggaacttgcattaatacagttggatcttttgaatgcaaatgtgcagct
ggacaccggtttaatgatataacacaaaagtgtgaagatattgatgaatgcagcattata
ccaggaatctgtgaatcgggtgaatgtgcaaatacggttggcagttacttttgcaagtgc
cctccaggattttacacttcagctgatggttcaagatgtgtagatatccgtcctgggtat
tgtttcacttctttagcaaatggaaggtgcatcaaccagcaaccacaaacagtaacgaaa
acgcagtgttgttgtgattcaggaagatgttggtctccagggccgacaactccaccagac
atgtgtccaattcgtggaactgatgaatatcgcaaactgtgtatagtaccaggtgtccct
ccgattggtccagagtatccccccctgggtccaattgatggcattcgaccattccaaccc
atctatccacctccagtttacccaggatacccaacccgtggcccgtctgtggttgttgga
gttaacgtgagccagcagcagcaaataacagattactgtgctctgttccgtaacctctgt
ttacacggccgctgtattccaacccctggaagttaccgttgtgagtgtaacaaaggcttc
accttggatggtagaggagaatgcattgatgtcgatgagtgtgaaaataatccatgtctc
catgctgattgtgttaacacaccaggatcctatatttgcaagtgctatcctggatttcag
agtacatcgacccggacagagtgcagagacattgatgagtgcttacaaaatggaagaatc
tgtaataacgggcgatgtgtgaacacagatggaagttttcactgcgtgtgtaatgcaggc
tttcaagtttcagctgatggaaaaaattgtgaagatatggatgaatgcagtgtgcggaac
atgtgcctaaatggcatgtgcattaatgaagatggaagtttcaaatgtatctgcaaaccc
ggcttccaacttgctccaaatgggcgcttctgcacagatattgatgagtgcgagacggcc
ggcatctgtatgaatggacactgtgttaataccgagggttcctttaggtgcgagtgcttc
cctggtcttgcagttggacttgatggacgagtatgtgttgacacgcacatgagaagcacg
tgctatggaggctacaagcggggtcaatgcgtccgaccattgttgggagcagtcacaaag
tccgagtgttgctgtgccagtactgattttgcctttggagagccatgccagccttgccct
gcaaagatgtcagaagagtatcaagctctgtgtagcagtggacctggcatgacatctgta
ggaactgatatcaatgaatgtgcattggactctgaaatctgtccaaatggaatttgtgaa
aatcttcgtggaacctacaaatgcatctgtaatgcaggatatgacgtggctataactggg
aaaagttgtgttgatattgacgaatgtgccttgaacacgctgctctgtgataatggacag
tgtcggaataccccaggaagtttctcctgcacctgcccaagtggatttgtctataaacct
gaccttaaaacgtgtgaagatattgatgaatgcgagtccaatccctgcattaatggggta
tgccgcaatatcccaggctcctttgtgtgtgaatgtcccactggaagtaccctggataaa
acaaagacaatttgcattgaaaccataaaaggcacctgttggcagaacattgtgaatgga
aggtgtgagatcaacattaatggggggactctgagatcccagtgttgttccactctagga
gcagcttggggaagtccctgcatgccctgtgaagcagatcctgtctgtgcaaaaggcttt
gcccggtccagaggcacaacatgtgaagatgttaatgagtgtgatgtatttcctggattg
tgcactaatggccagtgtgttaacacaatgggatcctttgtctgtcaatgcccaagtgga
atgacgctggatgcttcaaaacgcacatgtcttgacatccgccttgagatctgctaccta
aaacatgaagatgaagaatgcagtgctcaaattgctggtcggcacaggatggatgcatgt
tgctgttctgtgggtgctgcctggggccctgactgtgatgagtgccctgagaaaggaaca
actgagtttgaaactctatgccccagggggccaggctttgcttctaaggagatagcacct
ggaaaaacattctctaaagatatcaatgaatgcagaatgatcccgagtctgtgcaagtat
gggaagtgcaaaaacactataggcagtttcaagtgtaggtgtgacaatggatttgctctt
gatgctgaggaaagaaactgcacagatattgatgaatgccgaatatctcctgatgtctgt
ggacaaggcaactgcgttaacactccaggagattttgagtgtgactgctttgaaggatac
gagagcggctttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgagagaaacccc
ctgttgtgccgtggtggtatctgcctgaatactgaaggaagctttaaatgtgaatgccct
cctgggcatgaagtggccccagataattctgcatgtatagatatcaatgaatgtgagctc
agtactgatctctgcagacatggcagatgtataaacctcattggcagataccagtgtgcc
tgtgagcctggatatcagttaacaccagataaactgtcttgtgttgacactaatgagtgt
gatttcttcaatgggggctgtgacaccttctgtaccaactctgaaggaagctatgagtgc
cactgcagagacggctttgctctaatgcctgaccaccgatcatgtactgatattgatgag
tgtgagacaaatccaaatatctgtgatgggggtcagtgtaccaacattcccggagaatac
aggtgtttgtgcttcgaaggatacatggcatcagatgatatgaaaacttgcttggatgtt
gatgagtgtgaactccacttgaacatctgtcttagcggaagttgtgaaaacactaaaggt
tccttcatctgccattgtgatcctggttattctggcaaaaaaggacaaactggatgcaca
gatatcaatgagtgtgagattggagcccataactgtgaccgtcacgccacctgtacaaat
actccagggagcttcaaatgcagctgcagtccaggatgggtaggaaatggaatcaaatgc
tcggatcttgatgaatgctcaaatggaacacatctgtgtagcccaaatgctgactgcaaa
aacacaatgggatcatacagatgtttgtgcaaagaaggatatgtcggggatggatttact
tgcacagatgttgatgagtgctcagaaaatctgaatctgtgtggaaatggccagtgccta
aacaccccaggaggataccgctgtgactgtgacatgggattcttaccaagtgtggatggg
aaggcatgtgaagatattgatgaatgcactttacccaacatctgtgtgtttggaacatgc
cgaaaccttcctggcctgttccgctgtgactgcgacacaggctacgagctggacagaact
gggggtaactgcacagatgtggatgaatgttctgaaccaacaatgtgtatcagtggtact
tgtcagaatactcctggcagttacacctgtgaatgccctccagattttgagctgaaccca
acaagggttggatgtgttgataccaggtccggaacttgttatttggatgtgaaaccacgg
ggagataatggagatgtgtcctgcagtaatgaaattggagttagtgttccaaaggcttct
tgctgttgctctcttggaaaagcctgggggacaccatgtgaactgtgtccagctgtaaac
tcaagtgaatataaagtcctttgtcctggtggtgaaggatttagaccaaatcctattaca
gttatcttggaagatattgatgaatgcctggagttgcctggtctctgtcagggtggaaag
tgtatcaacacgtttggtagcttccaatgtcgctgtccacctggctactaccttaatgaa
gagacccgtgtttgtgatgatgtcaatgaatgtgatcagcctggcatttgtggacctgga
acatgctttaacactgttggaaactatacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagta
aatggaggaaataattgcatggatatgagaaggagtttatgcttcagaaactattatgct
gaaaaccagacttgtgatggagaactgctttacaacatgacgaaaaaaatgtgctgctgt
tcctataatattggccgagcatggcacagaccttgtgaggaatgtcctttgccaagtaca
gatgaatttgcaagtctctgtggaagtgcaagacctggatttttgattgatatttacaca
gggctgcctgttgacattgatgaatgcagagaaattcctggtgtgtgtgaaaatggagtt
tgtataaacatggtgggcagtttcaggtgcgaatgtcccatgggattcttctacaatgac
aagctactgatatgtgaagatattgatgaatgtcagaatggacctgtatgtcaaagaaat
gcagactgtgtgaacaccccaggaagttaccgctgtgactgcaaacctggttacaagttt
acatccacaggccaatgtgttgatcgaaatgaatgccaagaaattccaaacatatgcagt
catggagaatgcacagacacaacaggagggtattattgtgtttgtcacaatggatttaaa
acaaatgaagatcagacgatgtgcctggatattaacgagtgtgaacgagatccttgtgga
aacggaacatgtaaaaatactattggttcttacaactgtcgctgctttgatgggtttata
ttgtcccacaataatgactgcatcgatattgatgaatgtaccacacttaatggtcagctg
tgcaggaatggacagtgcaataataccgttggatcttttgtgtgcctgtgcaatgagggg
tatgaaaaggcttctgatgaaagaacatgtcttgatatcaatgagtgtgcccttgaccct
ggcaaatgtgcaccaggaacttgtcagaatctggatggcgcctaccggtgcatctgtcct
cctggatatgtgttggagggtgacacatgtaaagacatcgatgaatgtgtagaggagcct
gaaatctgcgctttgggtacctgcagcaatgtgcctgggagcttcacgtgtctctgccca
gaaggctttgtgctgtcatctacaggaaaaagatgtcaagatttaagagtaagtttctgc
tttaccaagtttgaggatggacagtgcacttctcccaaagctcgaaatcactctaaacaa
gaatgttgctgtgcccttaatggagcaggatggggcactccatgtgaactgtgtcctgtg
gatggagatgccgccttacagcagatttgccccttcggaatgggagtaatagtcggacca
gatgatgagcgagttgatatggatgaatgtattgatccagacaaatgcaaaaatggacag
tgtattaacacagatggctcttatcggtgtgaatgctcctttggatatgttctctcagta
gatgaatgcatagatatcgatgaatgttctgtgggaaacccttgtgggaatgggacctgc
aagaatattattggtggatttgagtgcacttgtgaggagggcttcgagccaggtccaatg
atgtcctgtgaagatgttaatgaatgtgctcagaatcctctgttatgtgcattccgatgt
gtcaatacttatggatcttatgaatgcaagtgtccagcaggatatgttctgcgggaagac
aaaagaatgtgcaaagatcaagacgagtgtgaagatggaactcatgattgtgaatctaaa
caaatgacgtgcaaaaacctcattggaacatacatgtgcatatgtggccctggatatcag
cgtagattggatggggagggatgcatggatctgaacgaatgcctaaaaccaggaatttgt
gataatggaaagtgtgtgaacacaatgggaagttacaaatgtgactgtcttgagggtttc
aatgcgagtgctactgaaacagagtgcattgacaacaggctgggctattgcttcactgaa
gtattacataccatgtgccagatcggctcctccaacaggaattcagttaccaagtcggaa
tgctgttgtaactcagggagaggctggggtataaactgtgagatttgccccttccaaggc
acagttcagtttaagaagctctgtccttatggtaaagggttcaccaccggcggagaagat
attgatgagtgtcaagtgcttcatggtatctgccgcaatggacaatgcgttaacgagaga
gggacatatcggtgtgaatgcaatcccggttatacacctgatataactggtacatcttgc
atagatctggatgagtgcagtcagtcacccaaaccttgcaactttatatgtaaaaacaca
gacgggagtttccagtgttcctgcccaagaggatacattctgcaggaggatggacgaagc
tgcaaagacctcgatgaatgtgcaacaaaacaacataactgccagtttatttgtgttaac
accattggaggattcacctgtaaatgcccccctggtttcacgcagcatcacacagcatgc
attgacaacaacgagtgtgcttcagatgttagtctatgtggagctaaaggtatctgccag
aataccccggggagctattcttgtgattgccagcgtggatttactctggatcagagtgga
gctgcttgtgaagatgttgatgaatgtgatggaagccatcgttgtcaacacggatgccaa
aatatagttggagggtatagatgtagctgcccacaaggatatcttcagcattaccagtgg
aatcagtgtgtggatgagaatgaatgtctgaatgcccatgcctgtggaggagcctcctgc
cacaacactcttggaagctttaagtgcatgtgtcctacaggatttcagtttgagcagttt
gctggagcgtgccaagatgtcaatgaatgcagttctagtcaagcaccttgcagttttggc
tgttctaacacagaaggtggctacgtttgtggatgtccacctggatatttccgaatagga
caaggtcactgtgtaacgggaggaggactaagtagagctcaggacatggctgtcagtggg
gaaatagatgacaactctctgtcacctgaagcttgctacgactgtaaaataaatggctat
cctaagagaggaaggaaaagaaggagcactaatgagacagccctaaatggcgaagaggaa
caactggaacccccagttagtcttgaaagttgggatattgaaaaaccattaatcctatcc
ttcaacatatctcacctaaacaacaaagaacgtattttagagctcacgcctgctctaaat
acgttaacgaaccacaacagatatttaatagactctggaaatgaagatggactctttaga
ataaaccaaaaagatggtataagttacttacatctgacaaagaagaagccagcgcccggt
tcctactccatagagatcaacagtgttcctctctacaaggagaaagagcttttccagctt
gaagataaacatgacagagactacctcagcggggaactgggcgacattcttaaaatgaaa
attacaatcctactccattaa
DBGET
integrated database retrieval system
