KEGG ORTHOLOGY: K09018

ORTHOLOGY: K09018

Entry

K09018                      KO

Symbol

rutA

Name

pyrimidine oxygenase [EC:1.14.99.46]

Pathway

map00240

Pyrimidine metabolism

map01100

Metabolic pathways

Module

M00939

Pyrimidine degradation, uracil => 3-hydroxypropanoate

Reaction

R09936

uracil,FMNH2:oxygen oxidoreductase (uracil hydroxylating, ring-opening)

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09100 Metabolism
  09104 Nucleotide metabolism
   00240 Pyrimidine metabolism
    K09018  rutA; pyrimidine oxygenase
Enzymes [BR:ko01000]
1. Oxidoreductases
  1.14  Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
   1.14.99  Miscellaneous
    1.14.99.46  pyrimidine oxygenase
     K09018  rutA; pyrimidine oxygenase

Other DBs

COG:

COG2141

GO:

0052614

Genes

ECO:	b1012(rutA)

ECJ:	JW0997(ycdM)

ECD:	ECDH10B_1084(rutA)

EBW:	BWG_0866(rutA)

ECOK:

ECMDS42_0857(ycdM)

ECOC:

C3026_06155

ECE:

Z1511

ECS:	ECs_1258(rutA)

ECF:	ECH74115_1249

ETW:

ECSP_1181

ELX:	CDCO157_1203

EOI:	ECO111_1201(ycdM)

EOJ:	ECO26_1250(ycdM)

EOH:	ECO103_1058(ycdM)

ECOO:

ECRM13514_1189(rutA)

ECOH:

ECRM13516_1118(rutA)

ESL:

O3K_15925

ESO:

O3O_09370

ESM:

O3M_15900

ECK:	EC55989_1123(rutA)

ECG:	E2348C_1063(rutA)

EOK:	G2583_1245(rutA)

ELR:	ECO55CA74_06090

ELH:

ETEC_1081

ECW:	EcE24377A_1130

EUN:	UMNK88_1167

ECP:

ECP_1011

ENA:	ECNA114_1083

ECOS:

EC958_1209(ycdM)

ECV:	APECO1_103(ycdM)

ECOA:

APECO78_09050

ECX:	EcHS_A1127

ECM:	EcSMS35_2113

ECY:

ECSE_1074

ECR:	ECIAI1_1057(rutA)

ECQ:	ECED1_1168(rutA)

EUM:	ECUMN_1195(rutA)

ECT:	ECIAI39_2143(rutA)

EOC:	CE10_1090(rutA)

EBR:	ECB_01015(ycdM)

ECOB:

C3029_09505

EBL:	ECD_01015(rutA)

EBE:	B21_01022(rutA)

EBD:

ECBD_2582

ECI:	UTI89_C1075(ycdM)

EIH:	ECOK1_1064

ECZ:	ECS88_1028(rutA)

ECC:

c1149

ELO:	EC042_1087(rutA)

ELN:	NRG857_04905

ESE:

ECSF_0918

ECL:	EcolC_2583

EKF:	KO11_17660(rutA)

EAB:	ECABU_c10390(rutA)

EDH:	EcDH1_2630

EDJ:	ECDH1ME8569_0966(rutA)

ELU:	UM146_12550

ELW:	ECW_m1122(rutA)

ELL:	WFL_05475(rutA)

ELC:

i14_1049

ELD:

i02_1049

ELP:	P12B_c0997(ycdM)

ELF:	LF82_2049(rutA)

ECOL:

LY180_05300

ECOI:

ECOPMV1_01034(rutA)

ECOJ:

P423_05500

ESZ:	FEM44_19940(rutA)

SFL:

SF1015

SFX:

S1085

SFV:

SFV_1024

SFE:	SFxv_1101(rutA)

SFN:

SFy_1390

SFS:

SFyv_1433

SFT:	NCTC1_01054(rutA)

SBO:

SBO_2045

SBC:	SbBS512_E2306

SDY:

SDY_0987

SDZ:	Asd1617_01250

SHQ:	A0259_09190

SHIG:

LXH19_13575(rutA)

ENC:	ECL_02622(rutA)

ENL:	A3UG_08165

ECLG:

ECLE:

ECLN:

ECLI:

ECLX:

ECLY:

ECLZ:

EHM:	AB284_17095

EXF:	BFV63_07825

ECLA:

ECNIH3_07870

ECLC:

ECR091_07845

EAU:	DI57_10690

EKB:	BFV64_08135

ENO:	ECENHK_08170

EEC:	EcWSU1_01610(rutA)

ELG:	BH714_04140

ERN:	BFV67_07755

ECLS:

LI67_009230

ECHG:

FY206_09415(rutA)

ESH:	C1N69_08300(rutA)

EPT:	HWQ17_04590(rutA)

ENT:	Ent638_1525

EAS:	Entas_1550

ENX:	NI40_007670

ENF:	AKI40_2539(rutA)

LNI:	CWR52_04065(rutA)

EBG:	FAI37_21405(rutA)

END:	A4308_12860

ENZ:	G0034_07985(rutA)

ENS:	HWQ15_16315(rutA)

ENK:	LOC22_18605(rutA)

EHU:	D5067_0014620(rutA)

EMOR:

L6Y89_07905(rutA)

ENB:	ELK40_08555(rutA)

EQU:	OM418_07885(rutA)

EPU:	QVH39_08310(rutA)

EDY:	F0320_07555(rutA)

EAX:	AAHF05_08050(rutA)

ESA:

ESA_02361

CSK:	ES15_2461(rutA)

CSZ:	CSSP291_10995

CSJ:	CSK29544_03670

CCON:

AFK62_07355

CDM:	AFK67_07585

CSI:	P262_03590

CMJ:	AFK66_012350

CUI:	AFK65_07345

CMW:	AFK63_11270

CTU:	CTU_15930(rutA)

KPN:	KPN_01038(ycdM)

KPU:	KP1_2027(ycdM)

KPM:	KPHS_19140

KPP:

A79E_3194

KPH:	KPNIH24_18945

KPZ:	KPNIH27_09050

KPV:	KPNIH29_09575

KPW:	KPNIH30_10090

KPY:	KPNIH31_09465

KPG:	KPNIH32_09930

KPC:	KPNIH10_09580

KPQ:	KPR0928_09755

KPT:	VK055_1439(rutA)

KPO:	KPN2242_08260

KPR:	KPR_3485(rutA)

KPJ:

N559_3248

KPI:	D364_05395

KPA:	KPNJ1_03488

KPS:	KPNJ2_03477

KPX:	PMK1_03378(rutA)

KPB:	FH42_01045

KPNE:

KU54_016570

KPNU:

LI86_16880

KPNK:

BN49_2127(rutA)

KVA:

Kvar_3341

KPE:

KPK_3520

KPK:	A593_19690

KVD:	KR75_17360

KVQ:	SP68_23735

KQU:	AVR78_14230

KQV:	B8P98_18060(rutA)

KOX:

KOX_17000

KOE:

A225_2250

KOY:	J415_20535

KOM:	HR38_15525

KOK:	KONIH1_11005

KOC:	AB185_25130

EAE:

EAE_16035

EAR:

CCG30700

KLL:	BJF97_11280

KLW:	DA718_17555(rutA)

KAR:	LGL98_16035(rutA)

KGR:	JJJ10_17520(rutA)

KPAS:

LUW96_17625(rutA)

KLC:	K7H21_17235(rutA)

KLM:	BWI76_10780

REE:	electrica_03235(rutA)

KLP:	GUC22_16495(rutA)

ROR:	RORB6_09465

RON:	TE10_11095

RPLN:

B1209_17360

RAO:	DSD31_16095(rutA)

RTG:	NCTC13098_04743(rutA)

PGE:	LG71_19240

KOR:	AWR26_15860(rutA)

KRD:	A3780_08430

KOO:	O9K67_15450(rutA)

KOU:	C0557_08830(rutA)

KCA:	AAEY27_13785(rutA)

LAX:	APT61_14385

LEI:	C2U54_13140(rutA)

LEH:	C3F35_03165(rutA)

LEE:	DVA44_15420(rutA)

LER:	GNG29_08310(rutA)

LEA:	GNG26_07930(rutA)

LPNU:

KQ929_12895(rutA)

LEY:	DVA43_09500(rutA)

LEF:	LJPFL01_1557

LEW:	DAI21_18780(rutA)

BUF:	D8682_07195(rutA)

BAGE:

BADSM9389_26670(rutA)

BFT:	MNO13_16125(rutA)

KIN:	AB182_16015

PDZ:	HHA33_18600(rutA)

METY:

MRY16398_36470(rutA)

IZH:	FEM41_12165(rutA)

MPHG:

MPHASIOC01_000659(rutA)

FPUL:

ACBV55_07610(rutA)

EBC:	C2U52_26760(rutA)

EBU:	CUC76_06065(rutA)

PSTS:

E05_37920

YEN:	YE1950(ssuD)

YEW:	CH47_1382(rutA)

YEF:	FORC2_2482

YEE:	YE5303_22861(ssuD)

YAK:	ACZ76_00785

YMA:	DA391_09485(rutA)

SPE:

Spro_1823

SRR:	SerAS9_1768

SRL:	SOD_c16480(rutA)

SRY:	M621_09130

SPLY:

Q5A_009030(rutA)

SRS:	SerAS12_1768

SRA:	SerAS13_1769

SLQ:	M495_08455

SQU:	E4343_07070(rutA)

SFJ:	SAMEA4384070_1850(rutA)

SENP:

KHA73_09110(rutA)

SGRI:

SGBXF1_01754(rutA)

RAH:	Rahaq_3017

RACE:

JHW33_09275(rutA)

RAQ:	Rahaq2_3045

RAA:

Q7S_15215

ROX:	BV494_10020

RVC:	J9880_00925(rutA)

RBON:

QNM34_15500(rutA)

RIU:	I2123_09145(rutA)

GQU:	AWC35_20505

EAME:

GXP68_07350(rutA)

RBAD:

H2866_14920(rutA)

RCB:	O1V66_10845(rutA)

CARU:

P0E69_12675(rutA)

NIG:	C1N62_10495(rutA)

LPOP:

I6N93_14380

EBI:	EbC_11600 EbC_15660(rutA)

EPE:	CI789_10745(rutA)

ERWI:

GN242_13265(rutA)

ERP:	LJN55_07860(rutA)

EPI:	Q3V30_13680(rutA) Q3V30_19520

ERWE:

GKQ23_15935(rutA)

ETO:	RIN69_08605(rutA)

EGE:	EM595_1350(rutA)

PAM:	PANA_4033(ycdM)

PLF:	PANA5342_p10175(rutA3)

PAJ:	PAJ_p0253(ycdM)

PAQ:

PAGR_p120

PVA:	Pvag_0805(ycdM)

PAGG:

AL522_11305(rutA)

PAO:	Pat9b_1395

KLN:	LH22_15225

PANT:

PANP:

PAGC:

PSTW:

PALH:

PANS:

FCN45_07195(rutA)

PEY:	EE896_12565(rutA)

PDIS:

D8B20_06590(rutA)

PER:	LAC65_05790(rutA)

PJI:	KTJ90_12440(rutA)

PANO:

OJ965_14340(rutA)

KPIE:

N5580_11205(rutA)

PALF:

K6R05_11985(rutA)

PPHO:

CTZ24_07180(rutA)

PDIP:

KFZ74_12830(rutA)

PANE:

P6287_07180(rutA)

PAMT:

IAI47_12510(rutA)

PANZ:

NR302_07245(rutA) NR302_21110

PGZ:	C2E15_07960(rutA)

PCD:	C2E16_07865(rutA)

MHAN:

K6958_08150(rutA)

TCI:	A7K98_09280

PLU:

plu3815

PLUM:

A4R40_18980

PAY:

PAU_00991

PTT:	VY86_03085

PAKH:

PLUI:

XBO:

XBV:

XGR:	QL128_16455

VZI:	G5S32_21240(rutA)

VOS:	KNV97_09985(rutA)

VIH:	AB0763_15630(rutA)

PPSL:

BJP27_10350

PST:	PSPTO_1157

PSB:

Psyr_0999

PSYR:

N018_20685

PSP:	PSPPH_1048

PSAV:

PSA3335_08755

PAMG:

BKM19_007705(rutA)

PAVL:

BKM03_06650(rutA)

PVD:	CFBP1590__4358(rutA)

PCAB:

JGS08_05410(rutA)

PSYI:

MME58_04935(rutA)

PAST:

N015_05620(rutA)

PLUL:

FOB45_22260(rutA)

PRH:	LT40_19385

PSES:

PSCI_0304

PEZ:	HWQ56_15555(rutA)

PPAO:

K3169_19075(rutA)

PSKU:

KUIN1_10370(rutA)

PBEN:

V6W80_20300(rutA)

PSIV:

LZ023_24290(rutA)

PSA:

PST_3597

PSZ:	PSTAB_3567

PSR:	PSTAA_3692

PSC:	A458_03440

PSTT:

CH92_21415

PSTU:

UIB01_03255

PCHL:

LLJ08_03335(rutA)

PKG:	LW136_03325(rutA)

SDEG:

GOM96_02820

PZD:	KQ248_04940(rutA)

HPEG:

EAO82_01540(rutA)

HAES:

LO767_00615(rutA)

HARR:

HV822_10655(rutA)

MSR:	AU15_03000

MPQ:	ABA45_09600

ACC:	BDGL_002277(rutA)

ACAL:

BUM88_16245

ACI:

ACIAD0027

AEI:	AOY20_13225

AJO:	RZ95_09030

ACW:	A0J50_03130

ASOL:

BEN76_13385

ASJ:	AsACE_CH00966(rutA)

ARJ:	DOM24_07655(rutA)

ACUM:

C9E88_009225(rutA)

AGU:	AS4_29280(rutA)

AUG:

URS_1156

ALW:	FOB21_15240(rutA)

ABER:

BSR55_14115

ATN:	FM020_07950(rutA)

AWG:	GFH30_04570(rutA)

ASHA:

G8E00_05340(rutA)

AVB:	RYU24_20540(rutA)

ABOU:

ACBO_20440(rutA)

ATZ:	M5E07_07980(rutA)

ACIE:

KIP84_03340(rutA)

ACIG:

BS636_00095(rutA) BS636_15340(rutA)

MOS:	AXE82_11210

MORK:

MOXK02_22820(rutA)

MORX:

MOXK23_21770(rutA)

AMC:	MADE_000001022910

AMH:	I633_17760

AMAA:

AMAL:

AMAE:

AMAO:

AMAD:

AMAI:

AMAG:

AMAC:

AMG:	AMEC673_16435

AAL:	EP13_18370

AAUS:

EP12_19150

ALTM:

BM527_15985

ALTO:

AltI4_01200 AltI4_38120(rutA)

GPS:

C427_0832

HARO:

R50071_36070

HAA:	A5892_14200

MME:	Marme_1361

MATH:

THO17_13680(rutA)

CUH:	BJN34_36115

PGP:	CUJ91_33805

PTS:	CUJ90_27805

PLG:	NCTC10937_03397(rutA)

VAP:	Vapar_4838

VPD:	VAPA_1c50080(rutA)

VAM:	C4F17_21770(rutA)

VAZ:	H7F35_08850(rutA)

VAX:	H7F36_05905(rutA)

HGR:	DW355_05670(rutA)

RGU:	A4W93_25205

XYK:	GT347_11520(rutA)

XYG:	R9X41_21355(rutA)

MESO:

BSQ44_10080

PLA:

Plav_0991

ATU:	Atu2500(rutA)

ATA:	AWN88_17375

AGR:	AGROH133_08499(rutA)

ATF:	Ach5_23700(rutA)

AGC:	BSY240_839(rutA)

AGT:	EYD00_10560(rutA)

ALF:	CFBP5473_19085(rutA)

ARUI:

G6M88_16290(rutA) G6M88_19500(rutA)

AVQ:	HRR99_16120(rutA) HRR99_19305(rutA)

AVV:	RvVAT039_pl03440(rutA)

ASAL:

CFBP5507_11225(rutA)

RIR:	BN877_I2581(rutA)

RPUS:

CFBP5875_10895(rutA)

ACUC:

KZ699_10930(rutA)

ALEG:

CFBP4996_10875(rutA)

AGRC:

GSF67_12090(rutA)

AVI:

Avi_7126

RHV:	BA939_06935

ROY:	G3A56_13450(rutA)

RLS:	HB780_12135(rutA)

RROS:

D4A92_16410(rutA)

RRHO:

PR018_18905(rutA)

ARA:

Arad_7073

ARO:	B0909_00430(rutA)

NEN:	NCHU2750_47470(rutA)

ASIT:

N7E02_00310(rutA)

BBT:	BBta_1128(ycdM)

TRB:	HB776_24815(rutA)

TARD:

RSO67_18405(rutA)

APRA:

G3A50_08470

MEA:	Mex_1p1664

MDI:

MEX:

MCH:

MPO:

MZA:	B2G69_16360

METQ:

MSPGM_17740(rutA)

MRD:	Mrad2831_1584

MOR:	MOC_1964(rutA)

META:

Y590_08280

MAQU:

Maq22A_c18500

MPHY:

MCBMB27_01224

MEE:	DA075_20040(rutA)

METX:

A3862_22955

METI:

DK427_02030(rutA)

MMES:

MMSR116_30935(rutA)

MIND:

mvi_25510(rutA)

MOG:	MMB17_22310(rutA)

MTAD:

M6G65_08160(rutA)

MFUJ:

ABC766_01180(rutA)

MENS:

LOK46_08520(rutA)

DEI:	C4375_16505(rutA) C4375_16510(rutA) C4375_16515(rutA) C4375_16520(rutA)

CCR:	CC_1169 CC_2798

CCS:	CCNA_01227 CCNA_02888

CAK:	Caul_1792 Caul_3982

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Reference

PMID:20400551

Authors

Kim KS, Pelton JG, Inwood WB, Andersen U, Kustu S, Wemmer DE

Title

The Rut pathway for pyrimidine degradation: novel chemistry and toxicity problems.

Journal

J Bacteriol 192:4089-102 (2010)
DOI:10.1128/JB.00201-10

Sequence

[eco:b1012]

LinkDB

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