Cetobacterium somerae: MKD34_11605
Help
Entry
MKD34_11605 CDS
T08261
Name
(GenBank) TolC family protein
KO
K18139
outer membrane protein, multidrug efflux system
Organism
csom
Cetobacterium somerae
Pathway
csom01501
beta-Lactam resistance
csom02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csom00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
MKD34_11605
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
MKD34_11605
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csom02000
]
MKD34_11605
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
csom01504
]
MKD34_11605
Transporters [BR:
csom02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MKD34_11605
Antimicrobial resistance genes [BR:
csom01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
MKD34_11605
Multidrug resistance, efflux pump MexJK-OprM [MD:
M00642
]
MKD34_11605
Multidrug resistance, efflux pump MexXY-OprM [MD:
M00643
]
MKD34_11605
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OEP
HEF_HK
DASH_Hsk3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPO98293
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:550730..552160
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MKSYIFFVILPFLLTGCFGTPKVTETPIKTLITENKPQNSNIFFKSQQWWLSTNNQQLIS
LIDEVLKTNSEIKIAKLNIEKAMYTLNSTKNSNLSSIDLGGSWNRNHVLTSHVKTDLPIK
DIKNSDTIDMGSLAIQGQYIFDIWGKFDALQNQAQYSKLATELQSEWSTLTLSTTVANLY
GKYILLTKEENILNEKLNIAKEVLNYQNILYKTGLGNKENILTADNNVNSLNQKIAEIAT
QKITLKNSFYSLVGNVKSKNIDEILSNIDYNTPEFDYFLNIPQYIDSDIVVNRPDVKYYL
ALINSQKENLKSLKADFYPRFSITGKYEYQNLNIQDLLKAHSTLWEFGPSLYLPLFNRNT
LTQNYNIAGVNLNIFIENYNNNLIKAYQDINNNLNALKTSKTNNELEEKNYNNVKSTYND
NDTLYQIGSISKLELLNQKNNLLDTKLSYIENNFTLYTNQINLIGSLGGYYKNEVK
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcttatattttttttgttattttgccttttttattaacaggttgttttggtact
cctaaggttactgaaactcctattaaaacattaattacagaaaataaaccacaaaatagc
aacattttttttaagtcacaacaatggtggcttagcacaaataatcagcaattgatttct
ctaattgatgaggttttaaaaacaaatagtgaaattaaaatagctaaactaaacattgaa
aaagcaatgtataccttaaattctacaaaaaactctaatctttctagcatagatttagga
ggaagttggaatagaaatcatgttttaacatctcatgtaaaaacagatcttcctataaaa
gatataaaaaatagcgatactattgatatgggatctttagctattcaaggtcaatatatc
tttgatatttggggaaaatttgatgctttacaaaatcaagctcaatattcaaaattagct
acagaacttcaaagtgaatggagcactctaactctttcaacaacagttgcaaatctctat
ggaaaatatattttactaacaaaagaggagaatatactaaacgaaaaactaaatattgca
aaagaggttttaaattatcaaaatattctttataaaactggccttggaaataaagaaaac
attttaactgctgataataatgttaactctttaaatcaaaaaattgctgagattgccact
caaaaaatcactttaaaaaatagcttttattctcttgttggaaatgtaaaatctaaaaat
attgatgaaattttatcaaatatagattataacacccctgagtttgactactttttaaat
attccccaatatattgattcagatatagtagttaatagacctgatgtaaaatattattta
gctttaattaattcacagaaagaaaatttaaagtctttaaaggctgatttttatcctaga
ttttctattactggaaaatatgagtatcaaaatttgaatattcaagatttattaaaagct
catagtacattatgggaattcggaccaagcttatatttgcctttatttaataggaataca
ctcactcaaaactataatatcgccggagttaatttaaatatttttatagaaaactataat
aataatttaattaaagcctaccaagatattaataataatcttaatgctttaaaaacatca
aaaacaaataacgaattagaagaaaaaaattacaataatgtaaaatctacttataatgat
aatgataccttatatcaaattggtagcatatctaaacttgagttattaaatcaaaaaaat
aatttacttgatactaaattaagttatattgaaaataactttacattatatacaaatcaa
attaatttaatcggatcccttggtggttactataaaaatgaggtgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system