Flavobacterium sediminilitoris: LXD69_14935
Help
Entry
LXD69_14935 CDS
T08185
Name
(GenBank) TolC family protein
KO
K18139
outer membrane protein, multidrug efflux system
Organism
fsd
Flavobacterium sediminilitoris
Pathway
fsd01501
beta-Lactam resistance
fsd02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fsd00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
LXD69_14935
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
LXD69_14935
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fsd02000
]
LXD69_14935
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
fsd01504
]
LXD69_14935
Transporters [BR:
fsd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LXD69_14935
Antimicrobial resistance genes [BR:
fsd01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
LXD69_14935
Multidrug resistance, efflux pump MexJK-OprM [MD:
M00642
]
LXD69_14935
Multidrug resistance, efflux pump MexXY-OprM [MD:
M00643
]
LXD69_14935
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OEP
DUF2963
DUF6284
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOX33323
LinkDB
All DBs
Position
complement(3251004..3252458)
Genome browser
AA seq
484 aa
AA seq
DB search
MKKIMIKMLNKKIYLYVGIAFILLNLASCKTPEMVEKIANANVPEQYNSSQDTINSGKMK
WEDYFADPYLKSLIDTALKNNQELNITLQEIEIARNEIRVRKGEYLPFLGIKGSAGLDKV
GRYTSKGANDATTDIKPDTEMPEPLPDYMIGAYASWEVDIWGKLHNAKKSAVSRYLATVE
GKNFVITNLIAEIANSYYELLALDNQLNLVKQNIDIQNNALKIVKLLKESARSNELAVKR
FEAQVLNTQSLQFTIEQRIVETENKINFLLGRYPQPIERDVTIFNNLSLENISAGLPSEL
LANRPDIKQAELDLAAAKLDIKVAKARFYPSLGISAGIGFQAFNPSYLIKTPQSLLYSIA
GDLVAPLINRNAIKATYYNANAKQIQAVYNYERTILNAYVEVANQLSMIKNMSKTYDFKS
KQVDALNTSVIISNDLFRSARADYMEVLLTQRDALESEFDLIEAKMELMNAKVNIYKALG
GGWN
NT seq
1455 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaataatgataaagatgcttaacaaaaagatatatttatatgtaggtattgcc
ttcatattattgaatttagctagttgtaaaacaccagaaatggttgaaaaaatagctaat
gctaatgtgccagagcaatataattcatctcaagatactatcaattcaggaaaaatgaaa
tgggaagattattttgccgatccgtatttgaagagtttaattgatactgctttaaaaaat
aatcaagaattgaatatcacgttgcaagaaattgaaattgcacgtaatgaaattcgagta
agaaaaggagaatatttaccatttctaggaattaaaggttcagcaggacttgacaaagtt
ggtcgttatacaagtaaaggagcaaatgatgctacgactgatattaaacctgatactgaa
atgccagaaccattaccagattatatgatcggagcttatgcaagttgggaagttgatatt
tgggggaaattacataatgctaaaaaatctgcggttagcagatatttagcaacagttgaa
ggaaaaaactttgtaataacaaatcttattgcagaaattgctaattcatattatgagcta
ttagcgttggataatcaattaaacttggttaaacaaaatattgatattcagaacaatgca
cttaaaattgtaaaattgttaaaagaatctgcacgttcaaatgaattagctgtaaaacga
tttgaagctcaggtattaaacacacaaagtcttcaatttactattgagcaaagaatagta
gaaacagagaataaaattaactttttattaggtagatatccccaacctatagaaagagat
gtaactatttttaataatttaagtttagaaaatattagtgctggtttaccttcagaatta
ttagcaaatagaccagatattaaacaggcagaattagatttggctgctgctaaattagat
attaaagttgctaaagcacgtttttatccttctttaggtatttccgctggaattggtttt
caagcttttaacccttcatatttgattaaaacaccacaatcattattgtattcaattgca
ggagatttggtagcaccattaatcaatagaaatgcgataaaagcaacttattataatgca
aatgcaaaacaaattcaagcagtttataattatgaacgtactattttaaatgcttatgtt
gaagtagccaatcaattgtcaatgattaaaaatatgtcaaaaacatatgactttaaatca
aaacaagttgatgcacttaatacatcagtaattatttcaaacgatctttttaggtcagct
cgtgctgattacatggaagtgttgttaacacaacgtgatgctttggaatctgaatttgat
ttaattgaagctaaaatggaactgatgaatgctaaagttaacatttataaagctttagga
ggtggatggaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
