Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark): 119962322
Help
Entry
119962322 CDS
T11175
Name
(RefSeq) lactase-phlorizin hydrolase-like
KO
K01229
lactase-phlorizin hydrolase [EC:
3.2.1.108
3.2.1.62
]
Organism
scau Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark)
Pathway
scau00052
Galactose metabolism
scau01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scau00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00052 Galactose metabolism
119962322
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
scau03110
]
119962322
Enzymes [BR:
scau01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.62 glycosylceramidase
119962322
3.2.1.108 lactase
119962322
Chaperones and folding catalysts [BR:
scau03110
]
Intramolecular chaperones
Others
119962322
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119962322
NCBI-ProteinID:
XP_038646231
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(243085030..243181281)
Genome browser
AA seq
1952 aa
AA seq
DB search
MVIDGPLTNALVKTLAEDEYKDQKINFSVEGEGRYLCQDPLPRHLKDHLSFLHRKGVTHY
KVILSWTNILPEGTAEKADHNQIECYSNLLNEIIIANLKPLVVLHDNGIPQGLITKYSDW
ENVALVDSFVNYARFAFTTFGENVETWITFDDPLKIISKHKLQKSGLSAIKNIIHAHEKT
FHIYHNEGQFKGGRLSIVWSIDDMISTDVMFKPFQQIINEGMVDLIAVTVPYDCVPNQKL
DPSGNEVSKANEDSLQKKLTKIKGIGTFLQILVFSLDFSQCAVSAAGRTEPYRAALAGIV
KAVNYDKVSIIGCDASHLLDTLPLYYQTSNSDNNSNFSPAKEGSKVQFVEKSSDTHLHTA
SLLSSYQTVWKKFSQQSEAERDAFLYGTFPNAFLWSTATASFKIEGGWAEQGKGESIWDK
FAHDGKIEKNQTADVACDSFNKIDYDVYLMRGLRSNSYKFSLSWPRIFPTGYRAQQNQNG
IDYYNKLIDSLLESNIQPMVTLYHWDLPQALQDIGGWQNEDIIKAFRDYADFCFASFGDR
VKYWITFNEPWVVSYAGYGTGRHAPGISDLTAATFKVAHSIIKAHAEAWHVYDKKYRSQQ
RGQVGIALNSDWAEPSSPGNPEDVLTADRYLQFMLGWFAHPIFVNGDYPEALKTQIQKYN
QECPSAPVQLLSFTEKEKQYINGTSDFFGLSHYTSRLINSTTNKTCALSYNRIGDFSPQI
DTSWGPTVSPWIYIVPWGLRRLLNFVTHEYTGANIPIYITGHGMPTEYGGPDSINDSIRI
RSISAYINEVLKASILDSIDVKAFTLWSLLDNFEGPQGYSHRFGLHYVDFEDSNRPRTPK
ESAYFYTQIIENNGFVNSSSNNFIQTLNPNTDVKRLRNLPASEVPSNAKVVWEKFSNQEV
MERDKFLYDTFPEGFVWSVSSSAYQIEGGWNADGKGPSIWDNFTHTSNMVQNGDTACNSY
SKIDEDLYMLRALRVKSYHFSISWSRIFSNGTIESLNLAGVDYYNKLIDGLLANNITPMV
TLYHWDLPQALQDIGGWEKEELIDVFNAYADYCFRTFGDRVKFWITFHEPSVFSWEGYGT
NSFPPALNKPGDLPYIVAHTVLKAHAKAFHTYDDKYRSTQKGLISISLNADWVEPEIINN
LRDVAAADRYLQFILGWFAHPIFKNGDYPEVMKWQVGNKSELQRLSTSRLPQFTDKEKTF
IRGTADAFCLNTYTTKIVSHHIAKLKLFSYTYDRDTAEKFDTSWPPSATKKLRAVAWGLR
RLLNWIKEEYNNPPIYITGNGVATKPPSSVDDTDRIFYYKTYINEALKAYKLDDVNLKGY
TATSLLDSFEWTNGYSFQFGLHRVNFNDTNRQRTPKRSAHYYTEIIHDNGFPPQKEDKFL
YGEFPKNFAWSAATAAYQIEGAWRADGKGLSIWDTFTHTPLKVGNDDTGDVACDSYHKMD
EDLAILKELKVNHYRFSLSWSRILPNGTTGFVNEVGLNYYVKFIDALLAAQIKPQVTLYH
WDLPQALQDVGGWENRSTIDRFVEYANFCFKRLGDKVKFWITLNEPYNTALLGYGYGTAA
PGIGTRLGRAPYVVGHNLIKAHAEVWHLYNETYRPQQGGLISITINSDWVEPRNPYKQED
IDAATRHLMFYGGWFAYPIFKNGDYNEVMKARVREKSLAQGLPKSRLPEFTESEKKRIKG
TYDFMGFNHYTTVLAFNFDFGNAIPMYDADRGTGTTVDRSWLNSGSFWLKVTPWGYRRIL
NWIKKEFNNPPIYLTENGVSEHGDRGLNDTWRISYHKSYINEVLKAIKLDGIDIRGYTAW
SLMDNFEWAVGYADRFGLFYINYSDPSLPRIPKASSKYYSTIIRCNGFPDPVLGPHECLQ
LETTTIEPTVRPIATIKTTVSTTTNAGKVHFLGFEMSNVNATSALYTLFFILIIALVMLA
IVLFKTWKMRKVNKRKSTPLTTELSINPNTNF
NT seq
5859 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaattgatggccccttaacaaatgctctggtgaagactttagcagaagatgaatat
aaagaccagaagatcaacttcagtgtggaaggagagggacggtacctttgccaggaccct
cttccaaggcacctaaaagatcatctttcctttctacatcggaaaggagttacccattac
aaagtcatcctttcctggactaatatcctgcctgaggggacagctgagaaggcagatcat
aaccagatagaatgctattcgaatctcctaaatgaaataataattgcaaatctcaagcct
ttggttgttctacatgacaatgggatccctcaaggactgattacaaaatacagtgactgg
gagaatgtggctcttgttgattcatttgtcaactacgcacggtttgcttttacaaccttt
ggagaaaacgttgaaacctggataacatttgatgatcctttaaagataatatccaaacac
aagctgcagaagagtggattgtcagcaatcaagaatataattcatgcccatgaaaagact
ttccatatttatcacaatgaggggcaattcaaaggaggaagattgtctattgtttggagc
attgatgacatgatttctacagatgttatgttcaagccatttcagcaaattatcaatgag
ggaatggtggatttgattgctgtaactgtaccatatgattgtgtgccaaaccaaaagctt
gacccctcaggaaatgaagtctcaaaagcaaatgaagattctttacagaaaaagctgaca
aaaatcaagggcattggcacctttttgcagattttggtctttagcttagacttttcacag
tgtgctgtttcagctgcaggccgcacagagccttacagagctgcactcgctggaattgta
aaagctgtaaattacgataaggtgtcgattattggctgtgatgccagtcaccttttggac
actttgcctctgtattaccagacaagcaactccgataataacagcaacttttctccagcg
aaagaaggaagtaaagttcagtttgtggagaaaagcagtgatacccaccttcatacagca
tcgctcctttcatcttatcaaactgtatggaagaagttttctcaacaatcagaggcagag
agggacgccttcctgtatggcactttccccaatgctttcctttggagcacagctaccgcc
tcatttaaaattgagggaggttgggcagaacaggggaaaggagaaagtatttgggacaag
tttgctcatgatggaaaaattgaaaaaaaccagacggcggatgttgcttgtgatagcttc
aataaaattgattatgatgtttatttaatgagaggtttacgatctaactcttataagttc
tccttgtcatggcctagaattttcccgacaggctatcgggcccaacagaaccaaaatgga
atagactattacaataaattaatagacagtctgctggagtccaacattcagccaatggtg
accctataccactgggatcttcctcaagctttgcaagatattggtggatggcagaatgag
gacataataaaagcgtttcgtgactatgcagatttttgctttgccagctttggagaccgt
gtgaagtactggatcacatttaacgagccctgggtagttagttatgctggatatggcaca
ggaagacatgctcctggaatcagtgatctaactgctgcaacctttaaggtggcccattct
ataatcaaggcccatgctgaggcttggcatgtctatgacaaaaagtatcgttctcagcag
cgtggccaagtagggatagcgttaaattcagactgggctgaacctagctcccctggtaat
ccagaagatgtcttaacagctgatcgatacctgcaatttatgttgggctggtttgctcat
cccatctttgttaatggcgactatccagaggccttgaaaacacagatacaaaaatataac
caggaatgtccttctgctcctgtccagcttctatcatttacagaaaaggaaaaacaatac
ataaatggaacttcagatttttttggtctcagtcactacacctctcgactgatcaattca
actacaaataaaacatgtgctttaagctacaatcgtattggggatttttctccacagata
gacacatcatggggcccaactgtatctccgtggatatatattgtgccctggggattgcga
aggttattaaattttgttacccatgaatatacaggtgccaacattccaatttacataaca
ggacatggaatgccaacagaatatggtggccctgattccataaatgacagcataaggata
aggagtatttctgcctatattaatgaggtactgaaagcttcaattctggatagtatcgat
gtgaaggcatttacactatggtcactgttggataattttgaaggtccgcaaggatacagc
catagatttggacttcattatgtggattttgaagattcaaacagacccagaactccaaag
gaatcagcatatttttacacgcagataatcgagaacaatggttttgttaacagctcttca
aacaatttcattcagacccttaatcccaacactgatgtaaaaagattgcgtaacttgcca
gcatctgaagtgccctcgaatgctaaagttgtgtgggagaagttttcaaatcaggaagtc
atggaacgggacaagttcttatatgacacattccctgaaggatttgtatggagtgtatct
tcttcagcttatcagattgaaggaggatggaatgctgatggtaaaggaccgagtatctgg
gacaatttcacacatacatcaaatatggttcagaatggtgatacagcttgcaacagctac
agcaaaattgatgaagatctttatatgcttcgagctttgagagttaaaagctaccacttt
tctatttcatggtctcgtattttctctaatggaacaattgagtcactgaaccttgccggt
gttgattattataacaaactaattgatggtcttcttgcaaacaatataacaccaatggta
acactttaccattgggatttacctcaagctcttcaagatattggaggttgggagaaagaa
gaactgattgacgtatttaatgcatatgctgattactgcttcagaacctttggtgatagg
gttaagttctggataacctttcatgaaccttctgtattcagttgggaaggttatggcaca
aattccttccccccggctttgaacaaaccaggtgatcttccgtacatagtggcacataca
gtgctgaaggctcacgccaaagcctttcacacgtatgatgataaatacagaagtacacag
aaaggcttaatttcaatcagccttaatgcagattgggtggaaccagagataattaataac
ctccgagatgtggctgcagccgatcgctacttgcagtttattttgggctggtttgcacac
cccatttttaaaaatggggattatcctgaggtaatgaaatggcaggttggaaacaagagt
gaactacagcgtctgtcgacttcaaggcttccccagtttacagacaaagagaaaactttc
atccgtggtactgcagatgcattttgtctcaatacatacaccacaaaaattgtaagccat
cacattgccaaactcaaattgttttcttatacatatgatcgagatacagcggagaaattt
gacacaagttggccaccttcagcgactaagaaattgagggctgtagcctggggtttgaga
agactactgaactggatcaaggaagaatacaacaatcctccaatttacataactggaaat
ggggtggcgacaaaacctccttccagtgtggatgatacagatagaatattctactacaaa
acatatatcaatgaggcgctaaaagcttacaagttggatgatgttaatttgaaaggctac
acagctacgtctctgttggacagctttgaatggaccaatggatacagttttcaatttggg
ctgcatcgtgttaacttcaatgacactaacagacaaagaactcccaagcggtcagcacat
tattatacagaaataattcatgacaatggcttcccaccacagaaagaagacaaatttctt
tatggagaatttccgaagaactttgcatggagtgcagctactgctgcctatcagattgaa
ggagcttggagagctgatggaaaaggacttagtatatgggacaccttcactcatactccc
ttaaaagtgggcaacgatgatactggagatgtagcgtgtgacagctatcacaagatggat
gaagatttggctattctgaaagaactgaaagtcaaccattatcgcttttccctatcctgg
tctcgcattcttccaaatggaaccacgggatttgtgaatgaagttggattaaactactat
gtaaagtttatagatgctcttcttgctgctcaaattaaacctcaggttacgctttatcac
tgggatctgcctcaagctctacaagatgtgggtggctgggaaaatcgtagcaccattgac
cgatttgtggaatatgctaatttctgctttaaaagattgggtgacaaggtcaagttctgg
ataaccttgaatgagccttacaacacagcactccttggttatggctacggcacagcagca
ccaggtattggcacaagattaggcagagctccttatgttgttggtcacaatctaatcaaa
gctcacgctgaggtttggcacttgtacaatgaaacgtatagaccacaacagggagggctg
atctccattactatcaattccgattgggttgagccgaggaatccgtataaacaggaagat
attgatgctgcaactagacatttgatgttttatggcgggtggtttgcctatccaattttc
aaaaatggtgattacaatgaggtgatgaaagctcgtgtgagagagaagagtttggctcaa
ggtttgcctaaatctcgactccctgaatttactgaatctgaaaaaaaaaggattaaggga
acatatgactttatgggatttaatcactacaccacagtgttggcattcaatttcgatttt
ggaaatgctattccaatgtatgatgccgatagaggaaccgggactacagtagaccgcagc
tggcttaattctggatctttctggctgaaagtaactccctggggttataggagaattctt
aactggattaagaaagaatttaacaaccctcctatttacctgacggaaaatggagtttcg
gagcatggggatcgaggcctcaatgacacgtggagaatcagctatcataaaagttatata
aatgaggttttaaaagccattaaacttgatggaattgacatccgtggctacacagcatgg
tcgctgatggacaactttgaatgggctgtaggatatgccgacagatttggtttattttac
ataaattattccgacccttctttacctcgcattcctaaagcttcaagtaaatattattcc
acaattatacgctgtaacggcttcccagatccagttttaggaccccatgagtgtctccaa
ttggaaactaccaccatagaacccacagtgagaccaatcgctactatcaaaacaactgtc
tcaacgacaactaacgctggaaaggttcattttctgggatttgaaatgtctaatgtgaat
gccacaagtgctttgtatactttgttttttattttaataattgctcttgttatgttggct
atcgttttgtttaaaacttggaaaatgagaaaagtgaacaaacgtaaatcaactccacta
acaactgaattatcgataaatccgaacaccaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
