KEGG   ORTHOLOGY: K06969
Entry
K06969                      KO                                     
Symbol
rlmI
Name
23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase [EC:2.1.1.191]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K06969  rlmI; 23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.191  23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase
     K06969  rlmI; 23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic type
  rRNA modification factors
   23S rRNA modification factors
    K06969  rlmI; 23S rRNA (cytosine1962-C5)-methyltransferase
Other DBs
COG: COG1092
GO: 0009383
Genes
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ECD: ECDH10B_1037(yccW)
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ECE: Z1319
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ESO: O3O_08790
ESM: O3M_16480
ECK: EC55989_1016(yccW)
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EOK: G2583_1202(yccW)
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ECY: ECSE_1029
ECR: ECIAI1_1008(yccW)
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ECI: UTI89_C1034(yccW)
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CITZ: E4Z61_08970(rlmI)
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CIX: M4I31_14870(rlmI)
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KOT: EH164_14365(rlmI)
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PSGC: G163CM_18280(rlmI)
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SUPE: P0H77_08895(rlmI)
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YPH: YPC_2714
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YPW: CH59_396(rlmI)
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YPV: BZ15_2109(rlmI)
YPL: CH46_3682(rlmI)
YPS: YPTB1463
YPO: BZ17_1055(rlmI)
YPY: YPK_2620
YPB: YPTS_1569
YPQ: DJ40_761(rlmI)
YPU: BZ21_741(rlmI)
YPR: BZ20_509(rlmI)
YPC: BZ23_1076(rlmI)
YPF: BZ19_873(rlmI)
YEN: YE1593
YEY: Y11_04741
YEW: CH47_1039(rlmI)
YET: CH48_62(rlmI)
YAL: AT01_925(rlmI)
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YRU: BD65_24(rlmI)
YHI: D5F51_06295(rlmI)
YCA: F0T03_08770(rlmI)
YMO: HRD69_17745(rlmI)
YAS: N0H69_11465(rlmI)
YKI: HRD70_12825(rlmI)
SMAR: SM39_1218
SMW: SMWW4_v1c17460(rlmI)
SPE: Spro_1764
SRL: SOD_c16280(rlmI)
SPLY: Q5A_008765(rlmI)
SMAF: D781_1670
SERF: L085_19745
SQU: E4343_07310(rlmI)
SFJ: SAMEA4384070_1802(rlmI)
SOF: NCTC11214_05058(rlmI)
SURI: J0X03_14965(rlmI)
SRHZ: FO014_01755(rlmI)
SENP: KHA73_08980(rlmI)
SNEM: NLX84_08790(rlmI)
SNEV: OI978_24665(rlmI)
RACE: JHW33_02045(rlmI)
RAA: Q7S_07545
RVC: J9880_15530(rlmI)
RBON: QNM34_08045(rlmI)
RIU: I2123_16230(rlmI)
EAME: GXP68_13440(rlmI)
RBAD: H2866_14825(rlmI)
RCB: O1V66_10950(rlmI)
CARU: P0E69_12765(rlmI)
SOD: Sant_2584(rlmI)
PES: SOPEG_1596(rlmI)
SLIG: GTU79_08740(rlmI)
EAM: EAMY_1397(yccW)
EAY: EAM_1387
ETA: ETA_20930
EPY: EpC_22260
EPR: EPYR_02402(yccW)
EBI: EbC_15510
ERWI: GN242_13345(rlmI)
ETP: LU633_15265(rlmI)
ERP: LJN55_07745(rlmI)
ETO: RIN69_08510(rlmI)
EGE: EM595_1340(rlmI)
PAM: PANA_1403(yccW)
PLF: PANA5342_2875(rlmI)
PAJ: PAJ_0726(yccW)
PVA: Pvag_0789(yccW)
PSTW: DSJ_09795
PANS: FCN45_07105(rlmI)
PEY: EE896_12650(rlmI)
PDIS: D8B20_06510(rlmI)
PER: LAC65_05710(rlmI)
PJI: KTJ90_12525(rlmI)
PANO: OJ965_14425(rlmI)
KPIE: N5580_11285(rlmI)
PALF: K6R05_12070(rlmI)
MINT: C7M51_00804(rlmI)
MTHI: C7M52_01953(rlmI)
MHAN: K6958_08070(rlmI)
TPTY: NCTC11468_01402(rlmI)
ETR: ETAE_1279(yccW)
ETD: ETAF_1193(rlmI)
ETE: ETEE_3233(rlmI)
EDL: AAZ33_06590(rlmI)
XFA: XF_0407
XFT: PD_1665
XCC: XCC4231
XCB: XC_4320
XCP: XCR_4583
XCV: XCV4476
XAX: XACM_4252
XAC: XAC4364
XFU: XFF4834R_chr42880(rlmI)
XOM: XOO4361(XOO4361)
XOO: XOO4625
XOP: PXO_03498
XOR: XOC_4678
XAL: XALC_3146
XPH: XppCFBP6546_11915(XppCFBP6546P_11915)
XHD: LMG31886_44810(rlmI)
SML: Smlt4687
SMT: Smal_4035
SMZ: SMD_4230(rlmI)
SACZ: AOT14_37460(rlmI)
SINC: DAIF1_41890(rlmI)
PSUW: WQ53_08210
PSD: DSC_01670
LEZ: GLE_5244
LEM: LEN_0076
LLZ: LYB30171_02573(rlmI)
RBD: ALSL_0410
VCH: VC_1354
VCS: MS6_1130
VCI: O3Y_06295
VPB: VPBB_1489
VTA: A0761(yccW) A0864
VAQ: FIV01_06245(rlmI1) FIV01_07015(rlmI2)
VSR: Vspart_01557(rlmI_1) Vspart_01641(rlmI_2)
VPL: SA104470976_01102(rlmI)
VSY: K08M4_15920(rlmI_1) K08M4_18590(rlmI_2)
PPR: PBPRA2194(Y2725) PBPRA2510(SO2919)
PCQ: PcP3B5_48610(rlmI_1) PcP3B5_59250(rlmI_2)
PPU: PP_4306 PP_5127(rlmI)
PPUN: PP4_14600 PP4_51910(rlmI)
PPRC: PFLCHA0_c24990(rlmL2) PFLCHA0_c52560(rlmI1) PFLCHA0_c58260(rlmI2)
PMUD: NCTC8068_00780(rlmI_1) NCTC8068_02722(rlmI_2) NCTC8068_05092(rlmI_3)
PTAE: NCTC10697_00265(rlmI_1) NCTC10697_01671(rlmI_2) NCTC10697_03790(rlmI1)
MAQ: Maqu_0812
MHC: MARHY0682
MAD: HP15_460
MBS: MRBBS_0677(rlmI)
MARJ: MARI_22450(rlmI)
SON: SO_1149(rlmI) SO_2451 SO_2919
SKH: STH12_01132(rlmI_1) STH12_02857(rlmI_2)
PHA: PSHAa1111 PSHAa1147(yccW)
PTN: PTRA_a1299(rlmI) PTRA_a1346(rlmI)
PSM: PSM_A1876(yccW) PSM_A1917
PEA: PESP_a2469(rlmI) PESP_a2510(rlmI)
PSPO: PSPO_a1393(rlmI) PSPO_a1952(rlmI)
PART: PARC_a1357(rlmI) PARC_a1395(rlmI)
PTU: PTUN_a1592(rlmI) PTUN_a1654(rlmI)
PNG: PNIG_a1381(rlmI) PNIG_a1421(rlmI)
PTD: PTET_a2151(rlmI) PTET_a2196(rlmI)
PSEN: PNC201_06730(rlmI) PNC201_07475(rlmK)
PAGA: PAGA_a1425(rlmI) PAGA_a1466(rlmI)
PSAZ: PA25_11890(rlmI) PA25_38950
AMAL: I607_07855
AMAE: I876_08120
AMAO: I634_08225
AMAD: I636_08665
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AMAG: I533_08165
AMAC: MASE_07730
AAUS: EP12_08585
GNI: GNIT_1707
GPS: C427_2832
PAT: Patl_2168
PIN: Ping_3313
MICC: AUP74_00912(rlmI_1) AUP74_02129(rlmI_2)
MICT: FIU95_00050(rlmI1) FIU95_13880(rlmI2)
ALG: AQULUS_22990(rlmI)
ASIP: AQUSIP_26370(rlmI)
LPN: lpg1190
LPH: LPV_1346
LPO: LPO_1205
LPM: LP6_1172
LPF: lpl1198
LPP: lpp1192
LPC: LPC_0657
LPA: lpa_01846
LPE: lp12_1171
LLO: LLO_1296
LFA: LFA_1135
LHA: LHA_1394
LOK: Loa_01453
LCD: clem_07900(rlmI)
LLG: 44548918_01231(rlmI)
LJR: NCTC11533_01700(rlmI)
LCJ: NCTC11976_02572(rlmI)
LWA: SAMEA4504053_1413(rlmI)
LSS: NCTC12082_00886(rlmI)
LADL: NCTC12735_00853(rlmI)
TMC: LMI_1945
MCA: MCA1049
MMAI: sS8_4951
MCAU: MIT9_P0249
TCX: Tcr_1849
HMAR: HVMH_0411
TIG: THII_1854
NHL: Nhal_3193
ATEP: Atep_12350
NTT: TAO_1326
THIP: N838_03430
TLR: Thiosp_04148(rlmI)
TFRI: Thiofri_00800(rlmI)
TWG: Thiowin_04270(rlmI)
AEH: Mlg_0366
HHA: Hhal_2043
TGR: Tgr7_2745
GAI: IMCC3135_10335(rlmI)
TBN: TBH_C0038
HCH: HCH_05988
CSA: Csal_2968
HEL: HELO_3822
HAM: HALO4078
HCO: LOKO_03002(rlmI)
HBE: BEI_3238(rlmI)
ALCA: ASALC70_01968(rlmI_1) ASALC70_04191(rlmI_2)
APAC: S7S_01070
TOL: TOL_3606
EMP: EZMO1_4757(rlmI)
AHA: AHA_2227
ASA: ASA_2074
AVR: B565_1894
AMED: B224_2256
ASR: WL1483_2144(rlmI)
ACAV: VI35_10715
AEL: NCTC12917_02085(rlmI)
TAU: Tola_2004
SLIM: SCL_0450
SVA: SVA_2743
CDIZ: CEDIAZO_02923(rlmI)
ENM: EBS_2165(rlmI)
CVI: CV_0361
AMAH: DLM_3857
RSO: RSc0051
RSE: F504_58
RSY: RSUY_31930(rlmI)
RPI: Rpic_3698
REH: H16_A0304(asmT)
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CCEL: CCDG5_0560(rlmI) CCDG5_1447
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OLS: Olsu_0072
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PSER: ABRG53_2016(rlmI) ABRG53_2851(rlmI)
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MPK: VL20_5899
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GLT: GlitD10_0049(rlmI)
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TTJ: TTHA1280(TTHA1280) TTHA1493(TTHA1493)
CTR: CT_404
CTA: CTA_0439
CTY: CTR_4031
CRA: CTO_0439
CTRQ: A363_00432
CTB: CTL0661
CTO: CTL2C_638
CTJ: JALI_4031
CTZ: CTB_4031
CSW: SW2_4101
CES: ESW3_4101
CTRB: BOUR_00429
CTEC: EC599_4161
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CFW: FSW5_4101
CTFW: SWFP_4341
CTCH: O173_02205
CTRI: BN197_4081
CTRA: BN442_4081
CTCT: CTW3_02210
CMU: TC_0684
CMUR: Y015_03595
CMX: DNC_03470
CMZ: TAC_03595
CPN: CPn_0531
CPA: CP_0221
CPJ: CPj0531(CPj0531)
CPT: CpB0552
CPM: G5S_0537
CPEC: CPE3_0219
CPEO: CPE1_0219
CPER: CPE2_0219
CHB: G5O_0244
CHR: Cpsi_2271
CPSC: B711_0248(rrm11)
CPSN: B712_0243(rrm11)
CPSB: B595_0248(rrm11)
CPSG: B598_0243(rrm11)
CPSM: B602_0241(rrm11)
CPSI: B599_0242(rrm11)
CPSV: B600_0254(rrm11)
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CPSD: BN356_2221
CPSA: AO9_01150
CCA: CCA_00214
CAB: CAB209
CABO: AB7_2371
CFE: CF0793(rrm11)
CHLA: C834K_0230(rlmL)
CSUI: Chls_735(SAM-dependent_methyltransferase)
CSEE: C10C_0487(rlmL)
PUV: PUV_14620(rlmI)
WCH: wcw_1746
OBG: Verru16b_01019(rlmI_1) Verru16b_03365(rlmI_2) Verru16b_03553(rlmI_3)
MFH: MFUM_0016
MCAO: IT6_06530
PIR: VN12_00350(rlmI_1) VN12_09015(rlmI_2) VN12_22140(rlmK)
RUL: UC8_35900 UC8_48830(rlmI)
MFF: MFFC18_16780(rlmK_1)
RUV: EC9_15190(rlmI) EC9_16470
AHEL: Q31a_45530(rlmI_1) Q31a_60670(rlmI_2) Q31a_62330(rlmI_3)
LCRE: Pla8534_08420(rlmK) Pla8534_15550(rlmI_1) Pla8534_29300(rlmI_2)
AAGG: ETAA8_19850(rlmI_1) ETAA8_66570(rlmI_2)
BVO: Pan97_13080(rlmI) Pan97_18640(rlmK)
SNEP: Enr13x_52280(rlmI_1) Enr13x_77960(rlmI_2)
LLH: I41_00900(rlmI)
AMUC: Pan181_50810(rlmI)
PND: Pla175_06600(rlmI_1) Pla175_20670(rlmI_2)
AMOB: HG15A2_05580(rlmK)
BMEI: Spa11_04400(rlmI)
PEH: Spb1_04880(rlmI_1) Spb1_05900(rlmI_2) Spb1_29540(rlmI_3)
PLS: VT03_07045(rlmI_1) VT03_17425(rlmI_2) VT03_28555(rlmI_3)
PLH: VT85_11335(rlmI_1) VT85_21940(rlmI_2)
FMR: Fuma_05075(rlmI_1) Fuma_05811(rlmI_2)
GMR: GmarT_21790(rlmI)
GPN: Pan110_21130(rlmI)
GFM: Enr17x_22890(rlmI)
MRI: Mal4_29950(rlmI_1) Mal4_53480(rlmI_2)
SDYN: Mal52_18120(rlmI)
ACAF: CA12_40380(rlmI)
SVP: Pan189_05600(rlmI_1) Pan189_37180(rlmI_2)
TPOL: Mal48_08010(rlmI_1) Mal48_14200(rlmI_2)
CHYA: V22_21680(rlmI_1) V22_31900(rlmI_2)
CCOS: Pan44_16610(rlmI_1) Pan44_16740(rlmI_2) Pan44_34690(rlmI_3)
CCOP: Mal65_22500(rlmK) Mal65_41150(rlmI)
GES: VT84_01570(rlmI_1) VT84_19345(rlmI_2)
ULI: ETAA1_00460(rlmI_1) ETAA1_18660(rlmI_2)
PBOR: BSF38_00760(rlmI)
AGV: OJF2_13660(rlmI_1) OJF2_55510(rlmI_2)
TPED: TPE_1879
LIL: LA_0788
LIE: LIF_A0643
LIC: LIC_12831
LIS: LIL_12921
LBJ: LBJ_0745
LBL: LBL_2333
LST: LSS_14144
BRM: Bmur_1019
BPW: WESB_2084
BIP: Bint_0437
ACA: ACP_2325
ABAS: ACPOL_1290
SUS: Acid_2335
ABAC: LuPra_05862(rlmI)
THYD: TTHT_1735(rlmI)
GEX: GETHOR_17040(rlmI)
MSIL: METEAL_28330(rlmI)
MSEA: METESE_24710(rlmI)
EMI: Emin_1342
EPO: Epro_0952
FNU: FN1033
FPOL: ERS445057_01182(rlmI)
HABY: HLVA_13430
TAI: Taci_1268
GAU: GAU_0663
GBA: J421_2617
BTH: BT_4331
BTHO: Btheta7330_03768(rlmI)
BFR: BF1030
BXY: BXY_34440
BOA: Bovatus_04563(rlmI)
BCEL: BcellWH2_04338(rlmI)
BEG: INE88_02961(rlmI)
BVU: BVU_3623
PGI: PG_0364
PGN: PGN_1597
PCRE: NCTC12858_00754(rlmI)
PCAG: NCTC12856_00123(rlmI)
PMUC: ING2E5A_2628(rlmI)
PSAC: PSM36_0600(rlmI)
PDI: BDI_0392
PMER: INE87_03611(rlmI)
TFO: BFO_3339
PRU: PRU_0904
POC: NCTC13071_01431(rlmI)
BLQ: L21SP5_03459(rlmI)
BACC: BRDCF_p1320(rlmI) BRDCF_p143(rlmL)
DORI: FH5T_00370
ANF: AQPE_0980
MBAS: ALGA_0801
CPI: Cpin_6903
FLN: FLA_4631
SGN: SGRA_3053(rlmI)
SMIZ: 4412673_00831(rlmI_1) 4412673_00893(rlmI_2)
SDJ: NCTC13534_00972(rlmI_1) NCTC13534_01199(rlmI_2)
STHA: NCTC11429_02356(rlmI_1) NCTC11429_02421(rlmI_2)
MGOT: MgSA37_00328(rlmI_1) MgSA37_00499(rlmI_2)
CHU: CHU_0743(yccW) CHU_3712
DFE: Dfer_1219
FLM: MY04_0467
PPSV: PEPS_40190
FIN: KQS_13665
DDO: I597_2425(rlmI)
WIN: WPG_3388
KOS: KORDIASMS9_02785(rlmI)
MESQ: C7H62_2614
PTAN: CRYO30217_01684(rlmI)
CTE: CT1213
CPC: Cpar_1153
CCH: Cag_0756
CLI: Clim_1096
PVI: Cvib_0980
PLT: Plut_1226
PPH: Ppha_1541
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CTS: Ctha_2380
RMR: Rmar_1493
IAL: IALB_2683
MRO: MROS_1710
CPRV: CYPRO_2206
HTH: HTH_0061
TAL: Thal_0985
TTK: TST_0941(rlmI)
TMA: TM1697
TMW: THMA_1739
TMQ: THMB_1739
TMX: THMC_1739
TPT: Tpet_0993
TNP: Tnap_1109
TRQ: TRQ2_1137
TNA: CTN_0884
TLE: Tlet_0494
TME: Tmel_1889
TAF: THA_185
THER: Y592_01000
FNO: Fnod_0592
ASAC: ATHSA_0831
MSCH: N508_000269(rlmL)
CABY: Cabys_3343
DTU: Dtur_0341
NDE: NIDE1670(yccW)
NMV: NITMOv2_3168(rlmI)
NIO: NITINOP_2196(yccW)
NJA: NSJP_3834(rlmI)
NIF: W02_11060(rlmI)
LFC: LFE_1643
SCHV: BRCON_0330
MMP: MMP1307
MMD: GYY_07360
MMAD: MMJJ_15350(rlmI_2)
MAE: Maeo_0857
MVO: Mvol_0142
MKA: MK1067
PFU: PF0251
PFI: PFC_00305
PHO: PH1915(PH1915)
PAB: PAB1237
PYN: PNA2_0891
PYS: Py04_0399
TKO: TK1785
TON: TON_1783
TGA: TGAM_0612
TSI: TSIB_1771
THE: GQS_06335
THA: TAM4_852
THM: CL1_0898
TLT: OCC_12881
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PPAC: PAP_05065
ACJ: ACAM_0109
HBU: Hbut_0583
PABI: PABY_20070
PARE: PYJP_18220
KCR: Kcr_1071
NAA: Nps_02505
VG: 18479491(mtt)
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Reference
  Authors
Purta E, O'Connor M, Bujnicki JM, Douthwaite S
  Title
YccW is the m5C methyltransferase specific for 23S rRNA nucleotide 1962.
  Journal
J Mol Biol 383:641-51 (2008)
DOI:10.1016/j.jmb.2008.08.061
  Sequence
[eco:b0967]
LinkDB

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