KEGG   ORTHOLOGY: K14399
Entry
K14399                      KO                                     
Symbol
CLP1, HERB
Name
polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase [EC:2.7.1.78]
Pathway
map03015  mRNA surveillance pathway
Disease
H00897  Pontocerebellar hypoplasia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.1  Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor
    2.7.1.78  polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase
     K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Pre-mRNA cleavage factor IIm (CFIIm)
     K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
Other DBs
GO: 0046404 0051736
Genes
HSA: 10978(CLP1)
PTR: 451198(CLP1)
PPS: 100994100(CLP1)
GGO: 101143287(CLP1)
PON: 100460422(CLP1)
NLE: 100584876(CLP1)
HMH: 116468805(CLP1)
MCC: 705071(CLP1)
MCF: 102133691(CLP1)
MTHB: 126936102
MNI: 105496068(CLP1)
CSAB: 103235350(CLP1)
CATY: 105600787(CLP1)
PANU: 101017673(CLP1)
TGE: 112606862(CLP1)
MLEU: 105552869(CLP1)
RRO: 104677688(CLP1)
RBB: 108514865(CLP1)
TFN: 117080064(CLP1)
PTEH: 111544862(CLP1)
CANG: 105527169(CLP1)
CJC: 100386802(CLP1)
SBQ: 101048258(CLP1)
CIMI: 108282900(CLP1)
CSYR: 103257790(CLP1)
MMUR: 105863131(CLP1)
LCAT: 123642705(CLP1)
PCOQ: 105810062(CLP1)
OGA: 100951731(CLP1)
MMU: 98985(Clp1)
MCAL: 110288417(Clp1)
MPAH: 110318689(Clp1)
RNO: 311166(Clp1)
MCOC: 116090397(Clp1)
ANU: 117703977(Clp1)
MUN: 110551958(Clp1)
CGE: 100755872(Clp1)
MAUA: 101822526(Clp1)
PROB: 127222332(Clp1)
PLEU: 114689709 114710117(Clp1)
MORG: 121439307(Clp1)
MFOT: 126487976
AAMP: 119819105(Clp1)
NGI: 103736636(Clp1)
HGL: 101723956(Clp1)
CPOC: 100721583(Clp1)
CCAN: 109688983(Clp1)
DORD: 106002502(Clp1)
DSP: 122104929(Clp1)
PLOP: 125362184(Clp1)
MMMA: 107135843(Clp1)
OCU: 100350312
OPI: 101535929(CLP1)
TUP: 102490551(CLP1)
GVR: 103596322(CLP1)
CFA: 610161(CLP1)
CLUD: 112663381(CLP1)
VVP: 112930585(CLP1)
VLG: 121501317(CLP1)
NPO: 129494222(CLP1)
AML: 100478336(CLP1)
UMR: 103666119(CLP1)
UAH: 113246377(CLP1)
UAR: 123785062(CLP1)
MPUF: 101689132(CLP1)
MNP: 132009726(CLP1)
MLK: 131812828(CLP1)
NVS: 122912939(CLP1)
ORO: 101365436(CLP1)
EJU: 114215417(CLP1)
ZCA: 113914318(CLP1)
MLX: 118015866(CLP1)
NSU: 110575826(CLP1)
LWW: 102729095(CLP1)
FCA: 101091047(CLP1)
PYU: 121043402(CLP1)
PCOO: 112865988(CLP1)
PBG: 122483786(CLP1)
PVIV: 125147004(CLP1)
LRUF: 124505788
PTG: 102960670(CLP1)
PPAD: 109246457(CLP1)
PUC: 125933457
AJU: 106979564
HHV: 120240288(CLP1)
BTA: 506507(CLP1)
BOM: 102277848(CLP1)
BIU: 109569885(CLP1)
BBUB: 102398381(CLP1)
BBIS: 104984022(CLP1)
CHX: 102171898(CLP1)
OAS: 101106031(CLP1)
BTAX: 128060351(CLP1)
ODA: 120877078(CLP1)
CCAD: 122449909(CLP1)
MBEZ: 129554858(CLP1)
SSC: 100520541(CLP1)
CFR: 102515013(CLP1)
CBAI: 105066934(CLP1)
CDK: 105101224(CLP1)
VPC: 102527876(CLP1)
BACU: 103006007(CLP1)
BMUS: 118900207(CLP1)
LVE: 103089865(CLP1)
OOR: 101280708(CLP1)
DLE: 111183935(CLP1)
PCAD: 102975489(CLP1)
PSIU: 116758774(CLP1)
NASI: 112402508(CLP1)
ECB: 100066955(CLP1)
EPZ: 103558224(CLP1)
EAI: 106822557(CLP1)
MYB: 102240760 102247153(CLP1)
MMYO: 118665008(CLP1) 118676825
MLF: 102427341(CLP1)
PKL: 118712876(CLP1)
EFUS: 103302287(CLP1)
MNA: 107527665(CLP1)
DRO: 112320303(CLP1)
SHON: 118982782(CLP1)
AJM: 119062349(CLP1)
PDIC: 114500027(CLP1)
PHAS: 123831447(CLP1)
MMF: 118627985(CLP1)
PPAM: 129062741(CLP1) 129062930
HAI: 109371620(CLP1)
RFQ: 117029593(CLP1)
PALE: 102890706(CLP1)
PGIG: 120600817(CLP1)
PVP: 105304745(CLP1)
RAY: 107518402(CLP1)
MJV: 108402313(CLP1)
TOD: 119254370(CLP1)
SARA: 101552672(CLP1)
SETR: 126017659(CLP1)
LAV: 100657486(CLP1)
TMU: 101359940
ETF: 101651726(CLP1)
DNM: 101439531(CLP1)
MDO: 100017655 100022871(CLP1)
GAS: 123251351(CLP1)
SHR: 100931522(CLP1)
AFZ: 127539616
PCW: 110199481(CLP1)
OAA: 100091140(CLP1)
GGA: 423131(CLP1)
PCOC: 116229070(CLP1)
MGP: 100547570(CLP1)
CJO: 107314449(CLP1)
TPAI: 128085492(CLP1)
LMUT: 125695387(CLP1)
NMEL: 110401415(CLP1)
APLA: 119717231(CLP1)
ACYG: 106033820(CLP1)
CATA: 118249727(CLP1)
AFUL: 116489972(CLP1)
TGU: 100220989(CLP1)
LSR: 110467565(CLP1)
SCAN: 103822156
PMOA: 120501004(CLP1)
OTC: 121334799(CLP1)
PRUF: 121352357(CLP1)
GFR: 102032848(CLP1)
FAB: 101819677(CLP1)
OMA: 130254143(CLP1)
PHI: 102108463(CLP1)
PMAJ: 107205510(CLP1)
CCAE: 111930384(CLP1)
CCW: 120410132(CLP1)
CBRC: 103613043(CLP1)
ETL: 114063289(CLP1)
SVG: 106854783(CLP1)
MMEA: 130581647(CLP1)
HRT: 120754101(CLP1)
FPG: 101916434(CLP1)
FCH: 102056567(CLP1)
CLV: 102091765(CLP1)
EGZ: 104129563(CLP1)
NNI: 104010537(CLP1)
PLET: 104625483(CLP1)
ACUN: 113481203(CLP1)
TALA: 116959841(CLP1)
AFOR: 103908511(CLP1)
ACHC: 115351937(CLP1)
HLE: 104832062(CLP1)
AGEN: 126047036
CCRI: 104157782(CLP1)
CSTI: 104556378(CLP1)
OHA: 104336367(CLP1)
SHAB: 115607112(CLP1)
DPUB: 104297540(CLP1)
RTD: 128908096(CLP1)
CUCA: 104062049(CLP1)
AAM: 106489148(CLP1)
AROW: 112962476(CLP1)
NPD: 112948016(CLP1)
DNE: 112991677(CLP1)
SCAM: 104139305(CLP1)
ASN: 102384463(CLP1)
AMJ: 102571624(CLP1)
CPOO: 109318141(CLP1)
GGN: 109295672(CLP1)
PSS: 102462947(CLP1)
CMY: 102932686(CLP1)
CCAY: 125637844(CLP1)
DCC: 119857947(CLP1)
CPIC: 101933800(CLP1)
TST: 117873131(CLP1)
CABI: 116822150(CLP1)
MRV: 120403675(CLP1)
ACS: 100556487(clp1)
ASAO: 132772890(CLP1)
PVT: 110078286(CLP1)
SUND: 121919831(CLP1)
PBI: 103048829(CLP1)
PMUR: 107291539(CLP1)
CTIG: 120307025(CLP1)
TSR: 106541472(CLP1)
APRI: 131205006(CLP1)
PTEX: 113448832(CLP1)
NSS: 113422656(CLP1)
VKO: 123018602(CLP1)
PMUA: 114601208(CLP1)
PRAF: 128418452(CLP1)
ZVI: 118089774(CLP1)
HCG: 128326718(CLP1)
GJA: 107110661(CLP1)
STOW: 125427323(CLP1)
EMC: 129324463(CLP1)
XLA: 431824(clp1.L)
XTR: 493364(clp1)
NPR: 108788104(CLP1)
RTEM: 120909407(CLP1)
BBUF: 121005094(CLP1)
BGAR: 122941368(CLP1)
MUO: 115456853(CLP1)
GSH: 117348709(CLP1)
DRE: 565621(clp1)
SGH: 107594873(clp1) 107594950
CCAR: 109065566(clp1) 109102920
CAUA: 113057594(clp1) 113113321
CGIB: 128027738
PTET: 122357296(clp1) 122357305
LROH: 127175777(clp1)
OMC: 131553721(clp1)
PPRM: 120461161(clp1)
RKG: 130095679(clp1)
MAMB: 125258853(clp1)
CIDE: 127494561
MASI: 127418206
TROS: 130563838(clp1)
TDW: 130438025(clp1)
MANU: 129422155(clp1)
IPU: 108268688
IFU: 128611888(clp1)
PHYP: 113542851(clp1)
SMEO: 124386507(clp1)
TFD: 113647715(clp1)
TVC: 132856166(clp1)
AMEX: 103032393(clp1)
CMAO: 118807034(clp1)
EEE: 113570726(clp1)
CHAR: 105888934(clp1)
TRU: 101064782 115246464(clp1)
TFS: 130531534(clp1)
NCC: 104951307(clp1)
TBEN: 117487137(clp1)
CGOB: 115014228(clp1)
PGEO: 117453776(clp1)
GACU: 117555942(clp1)
EMAC: 134859387(clp1)
ELY: 117260451(clp1)
EFO: 125894411(clp1)
PLEP: 121948015(clp1)
SLUC: 116052629(clp1)
ECRA: 117952132(clp1)
ESP: 116696334(clp1)
PFLV: 114562827(clp1)
GAT: 120818086(clp1)
PPUG: 119211588(clp1)
AFB: 129090269(clp1)
CLUM: 117737884(clp1)
PSWI: 130209577(clp1)
MSAM: 119888900(clp1)
SCHU: 122880717(clp1)
CUD: 121516856(clp1)
ALAT: 119007568(clp1)
MZE: 101487618(clp1)
ONL: 100693433(clp1)
OAU: 116332983(clp1)
OLA: 101158455(clp1)
OML: 112152991(clp1)
CSAI: 133447591(clp1)
XMA: 102216608(clp1)
XCO: 114139372(clp1)
XHE: 116714775(clp1)
PRET: 103471362(clp1)
PFOR: 103147478(clp1)
PLAI: 106935350(clp1)
PMEI: 106905531(clp1)
GAF: 122836668(clp1)
PPRL: 129362688(clp1)
CVG: 107085664(clp1)
CTUL: 119788302(clp1)
GMU: 124860474(clp1)
NFU: 107376815(clp1)
KMR: 108243041(clp1)
ALIM: 106534459(clp1)
NWH: 119408971(clp1)
AOCE: 111576498(clp1)
MCEP: 125008428(clp1)
CSEM: 103390956(clp1)
POV: 109625289(clp1)
SSEN: 122778940(clp1)
HHIP: 117769053(clp1)
HSP: 118112811(clp1)
SMAU: 118319611(clp1)
LCF: 108885554
SDU: 111232652(clp1)
SLAL: 111662733(clp1)
XGL: 120784959(clp1)
HCQ: 109524444(clp1)
SSCV: 125986090
SBIA: 133508919(clp1)
PEE: 133408002(clp1)
PTAO: 133484716(clp1)
BPEC: 110163851
MALB: 109954801(clp1)
BSPL: 114863963(clp1)
SJO: 128363291(clp1)
ELS: 105028688(clp1)
SFM: 108935929(clp1)
PKI: 111834195(clp1)
AANG: 118232393(clp1)
LOC: 102689404(clp1)
PSPA: 121302119(clp1)
PSEX: 120538123(clp1)
LCM: 102366070(CLP1)
HOC: 132808833(clp1)
PMRN: 116950102(CLP1)
LRJ: 133348961(CLP1)
BFO: 118423976
CIN: 100183747
SCLV: 120347060
SPU: 763581
LPIC: 129275085
APLC: 110977606
AJC: 117125334
SKO: 102808002
DME: Dmel_CG5970(cbc)
DER: 6549640
DSE: 6609009
DSI: Dsimw501_GD25757(Dsim_GD25757)
DAN: 6494046
DSR: 110177794
DPO: 4804382
DPE: 6592646
DWI: 6640990
DGR: 6568947
DAZ: 108615616
DNV: 108653838
DHE: 111599696
DVI: 6635342
CCAT: 101459473
BOD: 106620353
BDR: 105225039
AOQ: 129241948
MDE: 101894426
SCAC: 106089418
LCQ: 111681096
LSQ: 119613783
ECOE: 129945596
CLON: 129612869
HIS: 119650073
AGA: 1269532
ACOZ: 120953964
AARA: 120902290
AMER: 121591405
AFUN: 125767283
AMOU: 128302133
AALI: 118462989
AAG: 5571757
AALB: 109409346
CPII: 120417829
CNS: 116338706
BCOO: 119075484
AME: 551305
ACER: 108001960
ALAB: 122714439
ADR: 102673090
AFLR: 100870156
BIM: 100743602
BBIF: 117217093
BVK: 117236422
BVAN: 117154561
BTER: 100645103
BAFF: 126925574
BPYO: 122576454
BPAS: 132914534
FVI: 122530551
CCAL: 108623335
OBB: 114877876
OLG: 117608774
MGEN: 117222372
NMEA: 116430731
CGIG: 122402228
SOC: 105197589
MPHA: 105838509
AEC: 105149961
ACEP: 105627146
PBAR: 105432806
HST: 105183231
DQU: 106746897
CFO: 105250962
FEX: 115243457
LHU: 105677442
PGC: 109854870
OBO: 105280550
PCF: 106787686
PFUC: 122513578
VPS: 122632460
VCRB: 124427296
VVE: 124951343
CSOL: 105364680
FAS: 105268627
DAM: 107043263
CINS: 118068150
VCAN: 122409129
CCIN: 107269014
DSM: 124405781
NPT: 124212030
NFB: 124176721
NLO: 107216509
NVG: 124297999
AROA: 105693841
TCA: 663900
DPA: 109545015
SOY: 115874748
AGRG: 126735026
CSET: 123315981
AGB: 108911506
NVL: 108561836
APLN: 108734369
PPYR: 116173480
OTU: 111425487
BMOR: 101736699
BMAN: 114251203
MSEX: 115449623
BANY: 112054488
MJU: 123874861
NIQ: 126776193
VCD: 124538570
MCIX: 123662053
PMAC: 106708729
PPOT: 106101089
PXU: 106119953
PRAP: 111001347
PBX: 123719863
PNAP: 125054344
ZCE: 119828770
CCRC: 123699471
LSIN: 126964928
AAGE: 121725836
HAW: 110381936
HZE: 124639973
TNL: 113504921
SLIU: 111350434
PXY: 105387358
PGW: 126375289
CCRN: 123292132
API: 100169363
DNX: 107173297
AGS: 114125919
DVT: 126893826
BTAB: 109043788
CLEC: 106660895
HHAL: 106677506
HVI: 124354916
MQU: 128996596
FOC: 113206288
TPAL: 117644937
ZNE: 110837369
SGRE: 126362216
BROR: 134530223
IEL: 124157312
FCD: 110852753
DMK: 116924530
PVM: 113804964
PJA: 122251289
PCHN: 125043746
PMOO: 119585727
HAME: 121861488
PTRU: 123505160
ESN: 126981194
MNZ: 135226468
HAZT: 108671817
EAF: 111701702
TCF: 131878900
PPOI: 119107114
ISC: 8031643
DSV: 119442956
RSAN: 119388036
RMP: 119187385
VDE: 111248739
VJA: 111270488
TUT: 107369488
DPTE: 113799326
DFR: 124500214
CSCU: 111617773
UDV: 129216976
CEL: CELE_F59A2.4(clpf-1)
BMY: BM_BM13976(Bma-clpf-1)
PVUL: 126807809
PCAN: 112565160
BGT: 106053831
GAE: 121381357
HRF: 124114702
HRJ: 124267770
CRG: 105326854
CVN: 111110811
CANU: 128162694
OED: 125665819
MYI: 110459436
PMAX: 117343689
MCAF: 127731069
MMER: 123549509
DPOL: 127858542
OBI: 106872450
OSN: 115216516
LAK: 106154821
SHX: MS3_00001579(CLP1_1)
EGL: EGR_04072
NVE: 5521765
EPA: 110231468
ATEN: 116304488
ADF: 107341117
AMIL: 114951457
PDAM: 113666996
SPIS: 111344292
DGT: 114515992
XEN: 124440343
HMG: 100197448
HSY: 130622031
AQU: 100635760
ATH: AT3G04680(CLPS3) AT5G39930(CLPS5)
THJ: 104811064
CIT: 102629299
TCC: 18601443
GRA: 105779456
GAB: 108458267
HSYR: 120138457
DZI: 111292887
EGR: 104419345
VRA: 106772085
VAR: 108326051
VUN: 114191005
VUM: 124835031
CCAJ: 109815121
APRC: 113871962
MTR: 11428339
TPRA: 123913855
CAM: 101492204
PSAT: 127098466
LJA: Lj5g3v2290070.2(Lj5g3v2290070.2) Lj5g3v2290070.3(Lj5g3v2290070.3)
ADU: 107494525
LANG: 109355315
PCIN: 129288447
FVE: 101299204
RCN: 112190468
PPER: 18784353
PMUM: 103329966
PAVI: 110752441
PDUL: 117623589
ZJU: 107415545
MNT: 21385122
CSAV: 115698518
CSV: 101211613
CMO: 103498469
BHJ: 120079029
MCHA: 111006662
CMAX: 111487604
CMOS: 111430040
CPEP: 111795469
RCU: 8276022
JCU: 105642601
HBR: 110643088
MESC: 110605501
POP: 7495951
PEU: 105109996
PALZ: 118031831
CAVE: 132182868
QSU: 112023368
QLO: 115976814
VVI: 100242380
SLY: 101249197
SPEN: 107001065
SOT: 102579213
SSTN: 125847983
SDUL: 129887630
CANN: 107875978
LBB: 132626323
NSY: 104238607
NTO: 104120109
NAU: 109231792
ITR: 116024610
SIND: 105178237
OEU: 111407478
EGT: 105967223
SMIL: 130995064
APAN: 127250252
ECAD: 122587176
LSV: 111906788
CCAV: 112515973
DCR: 108226436
RVL: 131304086
AEW: 130777762
BVG: 104887406
SOE: 110781838
ATRI: 130818805
MOF: 131167820
MING: 122060477
TSS: 122672763
OSA: 4328733
DOSA: Os02t0217500-01(Os02g0217500)
OBR: 102719269
OGL: 127762281
BDI: 100820915
ATS: 109748167
TUA: 125512456
LPER: 127307728
SBI: 8082954
ZMA: 100284798
SITA: 101758957
SVS: 117846609
PHAI: 112881937
PDA: 103709610
MUS: 103999305
MSIN: 131251320
NCOL: 116247625
ATR: 18433022
PPP: 112273924
APRO: F751_3781
MPP: MICPUCDRAFT_37065(CLP1)
SCE: YOR250C(CLP1)
SEUB: DI49_5071
ERC: Ecym_2382
KMX: KLMA_30448(CLP1)
NCS: NCAS_0B01210(NCAS0B01210)
NDI: NDAI_0E01090(NDAI0E01090)
TPF: TPHA_0D01350(TPHA0D01350)
TBL: TBLA_0D01320(TBLA0D01320)
TDL: TDEL_0A06350(TDEL0A06350)
KAF: KAFR_0A03930(KAFR0A03930)
KNG: KNAG_0G02640(KNAG0G02640)
LEL: PVL30_002286(CLP1)
CAL: CAALFM_C303840CA(CaO19.6931)
SLB: AWJ20_420(CLP1)
NCR: NCU06314
NTE: NEUTE1DRAFT79143(NEUTE1DRAFT_79143)
PBEL: QC761_609880(CLP1)
PPSD: QC762_609880(CLP1)
PPSP: QC763_609880(CLP1)
PPSA: QC764_609880(CLP1)
MGR: MGG_08804
PGRI: PgNI_07384
SSCK: SPSK_08992
MAJ: MAA_04815
CMT: CCM_08834
PTKZ: JDV02_003225(CLP1)
BFU: BCIN_12g03610(Bcclp1)
MBE: MBM_03259
ALUC: AKAW2_31141S(CLP1)
ACHE: ACHE_41142S(CLP1)
APUU: APUU_11982S(CLP1)
ABE: ARB_03056
TVE: TRV_03023
PTE: PTT_17730
CNE: CNE04260
CNB: CNBE4250
CDEU: CNBG_9576
TASA: A1Q1_06646
CCAC: CcaHIS019_0210920(CLP1)
ABP: AGABI1DRAFT104404(AGABI1DRAFT_104404)
ABV: AGABI2DRAFT176420(AGABI2DRAFT_176420)
MORE: E1B28_009067(CLP1)
SCM: SCHCO_02484365(SCHCODRAFT_02484365)
MGL: MGL_1095
MRT: MRET_3059
PTRC: PtA15_9A46
DDI: DDB_G0285507(clp1)
DFA: DFA_01263(clp1)
EHI: EHI_008100(55.t00023)
TAN: TA06270
TPV: TP01_0895
CPV: cgd5_2880
TCR: 507027.59
 » show all
Reference
  Authors
Ramirez A, Shuman S, Schwer B
  Title
Human RNA 5'-kinase (hClp1) can function as a tRNA splicing enzyme in vivo.
  Journal
RNA 14:1737-45 (2008)
DOI:10.1261/rna.1142908
  Sequence
[hsa:10978]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system