KEGG   ORTHOLOGY: K15451
Entry
K15451                      KO                                     
Symbol
PPM2, LCMT2, TYW4
Name
tRNA wybutosine-synthesizing protein 4 [EC:2.1.1.290 2.3.1.231]
Reaction
R10586  S-adenosyl-L-methionine:tRNA(Phe) {7-[(3S)-3-amino-3-carboxypropyl]wyosine37-O}-methyltransferase
R10587  S-adenosyl-L-methionine:tRNA(Phe) {7-[(3S)-3-amino-3-(methoxycarbonyl)propyl]wyosine37-N}-methyltransferase (carbon dioxide-adding)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis
    K15451  PPM2, LCMT2, TYW4; tRNA wybutosine-synthesizing protein 4
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.290  tRNAPhe [7-(3-amino-3-carboxypropyl)wyosine37-O]-methyltransferase
     K15451  PPM2, LCMT2, TYW4; tRNA wybutosine-synthesizing protein 4
  2.3  Acyltransferases
   2.3.1  Transferring groups other than aminoacyl groups
    2.3.1.231  tRNAPhe {7-[3-amino-3-(methoxycarbonyl)propyl]wyosine37-N}-methoxycarbonyltransferase
     K15451  PPM2, LCMT2, TYW4; tRNA wybutosine-synthesizing protein 4
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic type
  tRNA modification factors
   Methyltransferases
    K15451  PPM2, LCMT2, TYW4; tRNA wybutosine-synthesizing protein 4
Other DBs
GO: 0008175
Genes
HSA: 9836(LCMT2)
PTR: 104002283(LCMT2)
PPS: 100976029(LCMT2)
GGO: 109023522(LCMT2)
PON: 100460816(LCMT2)
NLE: 100605890(LCMT2)
HMH: 116482075(LCMT2)
MCC: 710047(LCMT2)
MCF: 102138167(LCMT2)
MTHB: 126959817
MNI: 105491421(LCMT2)
CSAB: 103245741(LCMT2)
CATY: 105574243(LCMT2)
PANU: 101017137(LCMT2)
TGE: 112627990(LCMT2)
MLEU: 105546127(LCMT2)
RRO: 104678483
RBB: 108518286(LCMT2)
CANG: 105511082(LCMT2)
CJC: 100390904(LCMT2)
SBQ: 101043117(LCMT2)
CIMI: 108316431(LCMT2)
CSYR: 103262022(LCMT2)
MMUR: 105872520(LCMT2)
LCAT: 123630356(LCMT2)
PCOQ: 105814494(LCMT2)
OGA: 100941669(LCMT2)
MMU: 329504(Lcmt2)
MCAL: 110283859(Lcmt2)
MPAH: 110317837(Lcmt2)
RNO: 296098(Lcmt2)
MCOC: 116090781(Lcmt2)
ANU: 117703890(Lcmt2)
MUN: 110556213(Lcmt2)
CGE: 100768317(Lcmt2)
MAUA: 101837584(Lcmt2)
PROB: 127221576(Lcmt2)
PLEU: 114699580(Lcmt2)
MORG: 121465661(Lcmt2)
MFOT: 126496727
AAMP: 119814760(Lcmt2)
NGI: 103725087(Lcmt2)
HGL: 101718972(Lcmt2)
CPOC: 100724318(Lcmt2)
CCAN: 109682287(Lcmt2)
DORD: 105981183(Lcmt2)
DSP: 122114528(Lcmt2)
PLOP: 125341115(Lcmt2)
NCAR: 124976680
MMMA: 107138166(Lcmt2)
OCU: 100358713
OPI: 101522018(LCMT2)
TUP: 102496763(LCMT2)
GVR: 103591538(LCMT2)
CLUD: 112676041(LCMT2)
VVP: 112919997(LCMT2)
VLG: 121485130(LCMT2)
NPO: 129504135(LCMT2)
AML: 100474938(LCMT2)
UMR: 103673403(LCMT2)
UAH: 113241970(LCMT2)
UAR: 123776072(LCMT2)
ELK: 111161240
LLV: 125104131
MPUF: 101684017(LCMT2)
MNP: 131999686(LCMT2)
MLK: 131836189(LCMT2)
NVS: 122893373(LCMT2)
ORO: 101379169(LCMT2)
EJU: 114226542(LCMT2)
ZCA: 113909198(LCMT2)
NSU: 110585165(LCMT2)
LWW: 102739864(LCMT2)
FCA: 101100137(LCMT2)
PYU: 121041592(LCMT2)
PCOO: 112856420(LCMT2)
PBG: 122467632(LCMT2)
PVIV: 125167295(LCMT2)
LRUF: 124508656
PTG: 102967781(LCMT2)
PPAD: 109263085(LCMT2)
PUC: 125909925
AJU: 106968493
HHV: 120232268(LCMT2)
BTA: 538825(LCMT2)
BOM: 102286559(LCMT2)
BIU: 109575422(LCMT2)
BBUB: 102401907(LCMT2)
BBIS: 104985788(LCMT2)
CHX: 102180973(LCMT2)
OAS: 101110182(LCMT2)
BTAX: 128066928(LCMT2)
ODA: 120875021(LCMT2)
CCAD: 122455163(LCMT2)
MBEZ: 129550566(LCMT2)
SSC: 100156590(LCMT2)
CFR: 102508672(LCMT2)
CBAI: 105076951(LCMT2)
CDK: 105101728(LCMT2)
VPC: 102536068(LCMT2)
BACU: 102999234(LCMT2)
BMUS: 118890706(LCMT2)
LVE: 103084551(LCMT2)
OOR: 101285867(LCMT2)
DLE: 111181676(LCMT2)
PCAD: 102980438(LCMT2)
PSIU: 116749168(LCMT2)
NASI: 112391229(LCMT2)
ECB: 100146685(LCMT2)
EPZ: 103556413(LCMT2)
EAI: 106835024(LCMT2)
MYB: 102246789(LCMT2)
MYD: 102752640(LCMT2)
MMYO: 118650816(LCMT2)
MLF: 102427346(LCMT2)
PKL: 118722606(LCMT2)
EFUS: 103287359(LCMT2)
MNA: 107536344(LCMT2)
DRO: 112311316(LCMT2)
SHON: 118992547(LCMT2)
AJM: 119056499(LCMT2)
PDIC: 114493173(LCMT2)
PHAS: 123808181(LCMT2)
MMF: 118627912(LCMT2)
PPAM: 129064304(LCMT2)
HAI: 109383999(LCMT2)
RFQ: 117023322(LCMT2)
PALE: 102882425(LCMT2)
PGIG: 120622730(LCMT2)
PVP: 105288689(LCMT2)
RAY: 107510952(LCMT2)
MJV: 108385688(LCMT2)
TOD: 119238546(LCMT2)
SARA: 101538895(LCMT2)
SETR: 126020884(LCMT2)
LAV: 100677390(LCMT2)
TMU: 101354347
ETF: 101648989(LCMT2)
DNM: 101418808(LCMT2)
MDO: 107650707(LCMT2)
GAS: 123235944(LCMT2)
SHR: 100926867(LCMT2)
AFZ: 127549302
PCW: 110223589(LCMT2)
OAA: 100089395(LCMT2)
GGA: 419072(LCMT2)
PCOC: 116239529(LCMT2)
MGP: 100549859(LCMT2)
CJO: 107308567(LCMT2)
TPAI: 128088687(LCMT2)
LMUT: 125695690(LCMT2)
NMEL: 110391686(LCMT2)
APLA: 101790949(LCMT2)
ACYG: 106049772(LCMT2)
CATA: 118259747(LCMT2)
AFUL: 116488619(LCMT2)
TGU: 100223696(LCMT2)
LSR: 110474964(LCMT2)
SCAN: 103824408(LCMT2)
PMOA: 120499988(LCMT2)
OTC: 121334229(LCMT2)
PRUF: 121355116(LCMT2)
GFR: 102035314(LCMT2)
FAB: 101810513(LCMT2)
OMA: 130248383(LCMT2)
PHI: 102114241(LCMT2)
PMAJ: 107216417(LCMT2)
CCAE: 111942741(LCMT2)
CCW: 104698084(LCMT2)
CBRC: 103624054(LCMT2)
ETL: 114069898(LCMT2)
ZAB: 102063697(LCMT2)
SVG: 106861753(LCMT2)
MMEA: 130582722(LCMT2)
HRT: 120749440(LCMT2)
FPG: 101916966(LCMT2) 101920282
FCH: 102050993 102058812(LCMT2)
CLV: 102089517(LCMT2)
EGZ: 104130618(LCMT2)
NNI: 104014883(LCMT2)
PCRI: 104027619(LCMT2)
PLET: 104613634(LCMT2)
EHS: 104510496
ACUN: 113475998(LCMT2)
TALA: 104357899(LCMT2)
PADL: 103924869(LCMT2)
AFOR: 103901144(LCMT2)
ACHC: 115353234(LCMT2)
HALD: 104323759(LCMT2)
HLE: 104837589(LCMT2)
AGEN: 126048321
GCL: 127029420
CSTI: 104554164(LCMT2)
CMAC: 104472981(LCMT2)
FGA: 104073523(LCMT2)
GSTE: 104261656(LCMT2)
MNB: 103777682(LCMT2)
OHA: 104328430(LCMT2)
NNT: 104405390(LCMT2)
SHAB: 115603451(LCMT2)
DPUB: 104302342(LCMT2)
PGUU: 104461243(LCMT2)
ACAR: 104529477(LCMT2)
CPEA: 104385370(LCMT2)
AVIT: 104274897(LCMT2)
CVF: 104284859(LCMT2)
RTD: 128909828(LCMT2)
CUCA: 104056263(LCMT2)
BRHI: 104495073(LCMT2)
AAM: 106497744(LCMT2)
AROW: 112964993(LCMT2)
NPD: 112955057(LCMT2)
TGT: 104580298(LCMT2)
DNE: 112993495(LCMT2)
SCAM: 104150761(LCMT2)
ASN: 102377699(LCMT2)
AMJ: 102561035(LCMT2)
CPOO: 109306864(LCMT2)
GGN: 109303196(LCMT2)
PSS: 102461808(LCMT2)
CMY: 102931256(LCMT2)
CCAY: 125631262(LCMT2)
DCC: 119863281(LCMT2)
CPIC: 101950604(LCMT2)
TST: 117871331(LCMT2)
CABI: 116823491(LCMT2)
MRV: 120395690(LCMT2)
ACS: 103282304(lcmt2)
ASAO: 132772357(LCMT2)
PVT: 110078113(LCMT2)
SUND: 121926889(LCMT2)
PBI: 103063070(LCMT2)
PMUR: 107288485(LCMT2)
CTIG: 120301990 120310020(LCMT2)
TSR: 106541889(LCMT2)
PGUT: 117670880(LCMT2)
APRI: 131199218(LCMT2)
PTEX: 113450423(LCMT2)
NSS: 113426062(LCMT2)
VKO: 123022458(LCMT2)
PMUA: 114595160(LCMT2)
PRAF: 128412413(LCMT2)
ZVI: 118084888(LCMT2)
HCG: 128351930(LCMT2)
GJA: 107116949(LCMT2)
STOW: 125431824(LCMT2)
EMC: 129325677(LCMT2)
XLA: 108711843(lcmt2.L)
XTR: 100144923(lcmt2)
NPR: 108799881(LCMT2)
RTEM: 120928837
BBUF: 120996664(LCMT2)
BGAR: 122932271(LCMT2)
MUO: 115476380(LCMT2)
GSH: 117355550(LCMT2)
DRE: 100005300(lcmt2)
SRX: 107733625(lcmt2)
SGH: 107551959(lcmt2)
CCAR: 109096661(lcmt2)
CAUA: 113108700(lcmt2)
CGIB: 127965209
PTET: 122351904(lcmt2)
LROH: 127171440(lcmt2)
OMC: 131547558(lcmt2)
PPRM: 120486440(lcmt2)
RKG: 130076833(lcmt2)
MAMB: 125270253(lcmt2)
CIDE: 127518934
TROS: 130555488(lcmt2)
TDW: 130427849(lcmt2)
MANU: 129452175(lcmt2)
IPU: 108266389
IFU: 128608717(lcmt2)
PHYP: 113547024(lcmt2)
SMEO: 124382878(lcmt2)
TFD: 113641060(lcmt2)
TVC: 132849933(lcmt2)
AMEX: 103040183(lcmt2)
CMAO: 118808948(lcmt2)
EEE: 113592228(lcmt2)
CHAR: 105899365(lcmt2)
TRU: 101072307(lcmt2)
TFS: 130527299(lcmt2)
LCO: 104938167(lcmt2)
CGOB: 115025965(lcmt2)
EMAC: 134866845(lcmt2)
ELY: 117250934(lcmt2)
EFO: 125899566(lcmt2)
PLEP: 121949489(lcmt2)
SLUC: 116047514(lcmt2)
ECRA: 117953099(lcmt2)
PFLV: 114564093(lcmt2)
GAT: 120834137(lcmt2)
PPUG: 119228562(lcmt2)
AFB: 129104196(lcmt2)
CLUM: 117750616(lcmt2)
MSAM: 119904569(lcmt2)
SCHU: 122885757(lcmt2)
CUD: 121522756(lcmt2)
ALAT: 119025674(lcmt2)
MZE: 101474934(lcmt2)
ONL: 100702397(lcmt2)
OAU: 116327352(lcmt2)
OML: 112137969(lcmt2)
CSAI: 133445777(lcmt2)
XMA: 102230549(lcmt2)
XCO: 114147995(lcmt2)
XHE: 116722882(lcmt2)
PRET: 103481866(lcmt2)
PFOR: 103156737(lcmt2)
PLAI: 106950565(lcmt2)
PMEI: 106932476(lcmt2)
GAF: 122839515(lcmt2)
PPRL: 129379292(lcmt2)
CVG: 107102775(lcmt2)
CTUL: 119792023(lcmt2)
GMU: 124870916(lcmt2)
NFU: 107389574(lcmt2)
KMR: 108238857(lcmt2)
ALIM: 106530755(lcmt2)
NWH: 119419762(lcmt2)
MCEP: 125018117(lcmt2)
CSEM: 103391560(lcmt2)
POV: 109640502(lcmt2)
SSEN: 122762129(lcmt2)
HHIP: 117754767(lcmt2)
HSP: 118119919(lcmt2)
SMAU: 118282850(lcmt2)
LCF: 108902494
SDU: 111218380(lcmt2)
SLAL: 111659552(lcmt2)
XGL: 120801184(lcmt2)
HCQ: 109514521(lcmt2)
SSCV: 125974073
SBIA: 133512726(lcmt2)
PEE: 133410769(lcmt2)
PTAO: 133486972(lcmt2)
BPEC: 110170655(lcmt2)
MALB: 109971647(lcmt2)
BSPL: 114847332(lcmt2)
SJO: 128368042(lcmt2)
SASA: 106586340(lcmt2)
OTW: 112224235(lcmt2)
OMY: 110504286(lcmt2)
OGO: 124044422(lcmt2)
SNH: 120063935(lcmt2)
ELS: 105016270(lcmt2)
SFM: 108922249(lcmt2)
PKI: 111840663(lcmt2)
AANG: 118222161(lcmt2)
LOC: 102683947
PSPA: 121322406(lcmt2)
ARUT: 117426159(lcmt2)
PSEX: 120531150(lcmt2)
LCM: 102353544(LCMT2)
CMK: 103182907(lcmt2)
RTP: 109917026(lcmt2)
CPLA: 122551296(lcmt2)
HOC: 132817534(lcmt2)
LERI: 129698555(lcmt2)
PMRN: 116948305(LCMT2)
BFO: 118424723
BBEL: 109474411
CIN: 100181991
SPU: 585436
LPIC: 129274889
APLC: 110989265
SKO: 102806957
CLEC: 106670676
HHAL: 106682919
NLU: 111043787
HVI: 124364529
ZNE: 110839856
CSEC: 111863466
BROR: 134538751
IEL: 124158769
FCD: 110842720
DMK: 116932809
DPZ: 124349536
EAF: 111714511
LSM: 121127541
TCF: 131884949
DSV: 119465949
RSAN: 119407088
RMP: 119163509
DPTE: 113791205
DFR: 124499126
CSCU: 111642108
PTEP: 107439379
ABRU: 129981742
UDV: 129222546
SDM: 118193829
LPOL: 106466031
PMEO: 129581690
PVUL: 126831643
PCAN: 112563658
BGT: 106078509
GAE: 121381154
HRF: 124148056
HRJ: 124278232
CRG: 105343620
CANU: 128184833
OED: 125674351
MYI: 110449727
PMAX: 117343841
MMER: 123534421
DPOL: 127835710
OBI: 106871036
OSN: 115216487
LAK: 106168044
NVE: 5514363
EPA: 110255101
ATEN: 116300476
ADF: 107332030
AMIL: 114961514
PDAM: 113675897
SPIS: 111341187
HMG: 100197557
HSY: 130622590
AQU: 100641360
ATH: AT1G02100(SBI1)
ALY: 9328088
CRB: 17898295
BRP: 103843828
BOE: 106308422
RSZ: 108863445
THJ: 104801489
CPAP: 110810762
CIT: 102627581
PVY: 116136017
MINC: 123217734
TCC: 18614472
GRA: 105790311
GAB: 108458227
EGR: 104441368
VRA: 106772101
VAR: 108340358
VUN: 114169479
VUM: 124847460
APRC: 113862725
MTR: 25498937
TPRA: 123890445
CAM: 101510447
PSAT: 127126866
VVO: 131609766
ADU: 107486159
AIP: 107635262
LANG: 109325163
PCIN: 129288313
FVE: 101315088
RCN: 112180655
PPER: 18785493
PMUM: 103331617
PDUL: 117617061
ZJU: 107406475
MNT: 21404692
CSV: 101210913
CMO: 103498812
BHJ: 120067048
MCHA: 111020748
RCU: 8265781
JCU: 105643220
HBR: 110635838
MESC: 110616056
POP: 18105061
PEU: 105130990
PALZ: 118034173
JRE: 109016645
CILL: 122291195
CAVE: 132167628
QSU: 112038906
QLO: 115987428
VVI: 100251361
VRI: 117932206
SLY: 101257704
SPEN: 107008230
SOT: 102598619
SSTN: 125864923
SDUL: 129886751
CANN: 107845277
LBB: 132645793
NSY: 104242704
NTO: 104115518
NAU: 109224239
INI: 109182849
ITR: 116017656
SIND: 105173274
OEU: 111367085
EGT: 105952464
SMIL: 131020597
SHIS: 125222875
APAN: 127250534
HAN: 110900111
LSV: 111893281
CCAV: 112499709
DCR: 108203067
CSIN: 114292805
RVL: 131331800
BVG: 104905270
SOE: 110803938
ATRI: 130803088
MOF: 131166988
NNU: 104610492
MING: 122069290
OSA: 4340066
DOSA: Os06t0140100-01(Os06g0140100)
OBR: 102722682
OGL: 127776819
BDI: 100830236
ATS: 109786856
TUA: 125522284
LPER: 127311371
SBI: 8070707
ZMA: 100282206
SITA: 101780798
SVS: 117854276
PVIR: 120702548
PHAI: 112889440
PDA: 103698719
EGU: 105061523
MUS: 103992952
DCT: 110107766
PEQ: 110021942
AOF: 109839467
MSIN: 131233931
NCOL: 116266270
ATR: 18428274
PPP: 112283989
APRO: F751_0856
MPP: MICPUCDRAFT_4965(JGI:MicpuC2_4965)
SCE: YOL141W(PPM2)
SEUB: DI49_2267
NCS: NCAS_0C04370(NCAS0C04370)
NDI: NDAI_0G03760(NDAI0G03760)
TPF: TPHA_0P01530(TPHA0P01530)
TBL: TBLA_0H00180(TBLA0H00180)
TDL: TDEL_0A00340(TDEL0A00340)
KAF: KAFR_0I02910(KAFR0I02910)
KNG: KNAG_0A01180(KNAG0A01180)
PIC: PICST_80234(PPM2)
LEL: PVL30_001362(PPM2)
CAL: CAALFM_C101150CA(CaO19.3303)
SLB: AWJ20_3662(PPM2)
NCR: NCU05392
NTE: NEUTE1DRAFT123268(NEUTE1DRAFT_123268)
PBEL: QC761_605120(PPM2)
PPSD: QC762_605120(PPM2)
PPSP: QC763_605120(PPM2)
PPSA: QC764_605120(PPM2)
MGR: MGG_03140
PGRI: PgNI_09679
FPOA: FPOAC1_006757(PPM2)
FMU: J7337_011765(PPM2)
MAW: MAC_08067
MAJ: MAA_05301
CMT: CCM_07440
PTKZ: JDV02_002688(PPM2)
BFU: BCIN_13g04270(Bcppm2)
MBE: MBM_09582
ALUC: AKAW2_31279S(PPM2)
ACHE: ACHE_41177S(PPM2)
APUU: APUU_12026A(PPM2)
ABE: ARB_03109
TVE: TRV_05813
PTE: PTT_17719
SOM: SOMG_01215(ppm2)
PTRC: PtA15_1A18
DFA: DFA_06610
TPV: TP04_0135
SMIN: v1.2.018262.t1(symbB.v1.2.018262.t1) v1.2.038056.t1(symbB.v1.2.038056.t1) v1.2.038056.t2(symbB.v1.2.038056.t2) v1.2.038056.t3(symbB.v1.2.038056.t3)
SPAR: SPRG_02835
 » show all
Reference
  Authors
Noma A, Kirino Y, Ikeuchi Y, Suzuki T
  Title
Biosynthesis of wybutosine, a hyper-modified nucleoside in eukaryotic phenylalanine tRNA.
  Journal
EMBO J 25:2142-54 (2006)
DOI:10.1038/sj.emboj.7601105
  Sequence
[sce:YOL141W]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system