KEGG DRUG データベース
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KEGG DRUG は日本、米国、欧州の医薬品情報を、化学構造と成分の観点から一元的に集約・管理したデータベースです。とくに日本の医薬品は医療用（処方薬）だけでなく一般用（大衆薬、OTC薬）もすべて網羅し、個々の製品情報（添付文書情報）へのリンクがつけられています。また化学薬品だけでなく、生薬・漢方方剤もデータベース化されています。
KEGG DRUG のエントリーは D 番号で識別され、化学薬品は化学構造をベースに、混合物や生薬等は成分をベースに、エントリー化がなされています。各エントリーには以下の情報が蓄積されています (例えば、慢性骨髄性白血病治療薬グリベック D01441 を参照)。
- 一般名 (化学構造を反映した名称、詳細は下記参照)
- 商品名 (ゲノムネット医薬品データベースが提供する添付文書へのリンクがつけられています)
- 化学構造、混合物などの化学成分、ペプチドやポリケチドなどの配列
- ターゲット分子 (関連する KEGG PATHWAY 情報が提供されています)
- 薬物代謝に関与する酵素、トランスポーター
- その他の相互作用分子として、ゲノムバイオマーカー、CYP誘導・阻害薬など
- 薬物間相互作用 (添付文書より抽出した薬物間相互作用のデータを検索できます)
- 効能に関する記述
- 薬効分類や ATC 分類など、BRITE 機能階層としての医薬品情報
- 薬開発の歴史など医薬品化学者の知識を化学構造変化パターンで表現した構造マップ
- 外部データベースへのリンク
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医薬品分類
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KEGG では医薬品を様々な観点で分類し体系化して、BRITE データベースの一部として提供しています。まず、国や国際機関が提供する分類に KEGG DRUG を割り当てたものは以下の通りです。
さらにこれらを補完するために KEGG で独自に開発している分類は以下の通りです。
KEGG で蓄積している様々な情報は、医薬品分類の階層にのせて調べることができます。階層ファイルと二項関係ファイルを D 番号で JOIN する以下のインターフェースをご利用ください。
医薬品添付文書については、あらかじめ D 番号を通して日本と WHO の分類階層に並べたファイルが作成され、日本のすべての商品は以下の BRITE ファイルで検索できるようになっています。
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分子間相互作用ネットワーク
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KEGG DRUG には２つの意味での分子ネットワーク情報が蓄積されています。１つはターゲットなどとの分子間相互作用ネットワークの情報です。薬とターゲットの関係は単に分子と分子の関係だけではありません。ターゲット情報は KEGG パスウェイと関連づけて記載され、生体システムに対するゆらぎ物質として、薬のはたらきを解析できるようにすることを目指しています (KEGG DISEASE を参照)。ターゲット以外の相互作用情報として、薬物代謝酵素、薬物トランスポーター、副作用に関連した薬物間相互作用、個別化医療のためのゲノムバイオマーカーの情報なども蓄積されています。
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化学構造変換ネットワーク
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多くの医薬品はリード化合物や既存の医薬品を起点に構造展開を行うことで、すなわち基本骨格を維持しながら化学構造を変化させることで、新製品の開発が行われてきました。このような薬開発の歴史に伴う化学構造変化パターンの知識をグラフィカルなマップとして表現したのが KEGG DRUG 構造マップで、KEGG PATHWAY データベースの一部として提供されています。
ヒトゲノムの情報は創薬標的探索やパーソナライズド医療に広く用いられています。一方、微生物や植物のゲノムには創薬リードとなり得る天然物の情報が含まれているはずですが、未だ十分に活用されていないと考えられます。KEGG ではゲノムから天然物を見いだし薬効との関連を明らかにするリソースの開発を始めました (KEGG EDRUG を参照)。
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一般名と商品名
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薬の化学構造は標準化された一般名と対応づけられていますが、この名称は国によって、また国際機関等によって異なります。同じ構造が違う名前になっていたり、同じ名前が違う構造になっていたりします。これを明確にするために、KEGG DRUG には以下の名称が記載され、括弧内のコードで区別が示されています。
- JAN - 日本医薬品一般名称
- USAN - United States Adopted Name
- NF - National Formulary drug name
- INN - International Nonproprietary Name
- BAN - British Approved Name
- DCF - Dénomination commune française
さらに、日本薬局方および米国薬局方に収載された医薬品かの区別もされています。
- JP15 - 第十五改正日本薬局方
- USP - United States Pharmacopeia
JP15 は JAN の、USP は USAN の名称であることも意味します。
商品名については、英語表示の KEGG DRUG エントリーでは代表的なものしか記載されていません。米国の商品名は FDA が承認した医薬品の添付文書を蓄積した DailyMed への外部リンクをたどって調べてください。日本語表示の KEGG DRUG エントリーでは、 JAPIC が作成しゲノムネットが提供する医薬品添付文書データベースと統合され、日本で販売されているすべての医療用医薬品の商品名と個々の添付文書への直接リンクが提供されています。
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日本の医薬品情報
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KEGG では我が国の医薬品情報を英訳も含めて適切な形で表現し提供する作業も行っています。我が国の医療用医薬品については薬事法第41条で定められた日本薬局方の区分が以下の BRITE ファイルにまとめられています。
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参考資料
Last updated: July 17, 2010
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