KEGG   ORTHOLOGY: K18961
Entry
K18961                      KO                                     
Symbol
rnlA
Name
Straboviridae RNA ligase 1 [EC:6.5.1.3]
Pathway
map03259  Virion - Bacteriophages T4 and T7
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09125 Information processing in viruses
   03259 Virion - Bacteriophages T4 and T7
    K18961  rnlA; Straboviridae RNA ligase 1
 09180 Brite Hierarchies
  09185 Viral protein families
   03200 Viral proteins
    K18961  rnlA; Straboviridae RNA ligase 1
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.5  Forming phosphoric-ester bonds
   6.5.1  Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.5.1.3  RNA ligase (ATP)
     K18961  rnlA; Straboviridae RNA ligase 1
Viral proteins [BR:ko03200]
 dsDNA viruses (phages)
  Escherichia phage
   K18961  rnlA; Straboviridae RNA ligase 1
Genes
VG: 10021469(rnlA) 10323213(rnlA-B) 10323610(rnlA) 10498982(Shfl2p229) 1258717(rnlA) 13165142(ZZ1p0235) 13165152(rnlA) 13997609(GAP161_068) 13998053(D862_gp050) 14008051(rnlA) 14010347(rnlA) 14010760(F412_gp050) 14016429(rnlA) 14017054(rnlA) 14295713(g229) 14516275(KP27_078) 14675457(I133_gp052) 1494352(rnlA) 15041437(rnlA) 15926585(rnlA) 16205011(rnlA) 1725432(rnlA) 18500011(CF80_gp305) 18502524(rnlA) 18560221(rnlA) 19485110(rnlA) 19485377(e112_238) 19524937(JS09_0219) 20284373(LD34_gp173) 22111881(ECML134_223) 22113210(rnlA) 22113540(CPTMiller_0068) 22113972(rnlA) 22277474(PI26_gp183) 22475308(pSs1_00234) 23301258(rnlA) 23680975(STP4a_215) 24629761(ACQ31_gp024) 24635666(g230) 24677402(rnlA) 24721844(ACQ46_gp208) 24722845(ACQ54_gp215) 2545928(rnlA) 26041704(rnlA) 26042001(rnlA) 2610698(rnlA) 26227900(AS348_gp186) 26518632(AU097_gp217) 26519073(rnlA) 2657864(rnlA) 26613251(CPT_Matisse69) 26622763(AVT59_gp156) 26624419(AVU02_gp034) 26627551(AVV33_gp168) 26628502(AVU32_gp176) 26629951(AVT32_gp231) 26632536(rnlA) 26633916(rnlA) 26636406(rnlA) 26636678(AVU04_gp060) 26638139(AVV36_gp202) 26640534(rnlA) 26643928(rnlA) 26644890(AVU18_gp254) 26647254(CPT_Margaery70) 26648176(CPT_Merlin251) 26795982(APCEc01_069) 29056304(BH804_gp181) 29059311(BI036_gp163) 29060395(BI049_gp168) 29060679(BI058_gp179) 29062238(BI057_gp049) 29063713(rnlA) 29067214(kpv477_234) 29067409(BI097_gp097) 29079104(BI016_gp241) 29079656(BI032_gp067) 29080676(BI014_gp164) 29081286(BIZ64_gp224) 30308556(BOW89_gp231) 30309031(BOW90_gp225) 3416136(rnlA) 3416829(rnlA) 40068226(FDG79_gp015) 40068721(FDG80_gp237) 40078038(rnlA) 40082989(FDI05_gp066) 40083272(FDI06_gp069) 40084462(FDI17_gp151) 40085637(FDI23_gp187) 40089414(FDI46_gp057) 40091291(FDI68_gp181) 40092176(FDI73_gp175) 40094845(FDI95_gp208) 40095636(FDJ02_gp179) 40095771(FDJ03_gp076) 40101907(FDJ54_gp051) 40102343(FDJ55_gp181) 40103209(FDG72_gp069) 4156564(rnlA) 4405630(rnlA) 55601023(HWB00_gp069) 55604518(HWB28_gp151) 55605154(HWB29_gp384) 55607040(HWB49_gp181) 55620902(HWC54_gp185) 55626683(rnlA) 55630790(HWB01_gp070) 55810249(rnlA) 55810754(HYP70_gp062) 55811489(HYP74_gp126) 55813280(HYP94_gp164) 55814778(HYQ09_gp171) 55815653(HYQ20_gp174) 55815910(HYQ21_gp167) 55816173(HYQ22_gp173) 55816426(HYQ23_gp170) 55816577(rnlA) 55819352(HYP65_gp172) 5602085(rnlA) 5783657(rnlA) 65053746(KMB91_gp179) 65054067(KMB92_gp186) 65054341(KMB93_gp186) 65054417(rnlA) 65054663(rnlA) 65054955(KMB96_gp045) 65055423(rnlA) 65055471(rnlA) 65055935(rnlA) 65056082(KMC00_gp223) 65056483(KMC01_gp179) 65056711(KMC02_gp180) 65057049(KMC03_gp186) 65057178(KMC04_gp229) 65057509(KMC05_gp152) 65057852(rnlA) 65058129(KMC07_gp186) 65058410(KMC08_gp178) 65058688(KMC09_gp182) 65058975(KMC10_gp190) 65059264(KMC11_gp185) 65059550(KMC12_gp188) 65059665(KMC13_gp066) 65060112(KMC14_gp187) 65060305(KMC15_gp180) 65060544(KMC16_gp191) 65060952(KMC17_gp174) 65061240(KMC18_gp192) 65061393(KMC19_gp182) 65061631(KMC20_gp062) 65061883(KMC21_gp041) 65062322(rnlA) 65062603(rnlA) 65062836(KMC24_gp145) 65063206(KMC25_gp182) 65063331(KMC26_gp081) 65063521(KMC27_gp001) 65063934(KMC28_gp184) 65064311(KMC29_gp227) 65064584(KMC30_gp180) 65064865(KMC31_gp177) 65065150(KMC32_gp185) 65065264(KMC33_gp073) 65065691(KMC34_gp219) 65065958(g219c) 65066077(KMC36_gp063) 65066344(KMC37_gp039) 65105704(rnlA) 65106442(KNT56_gp060) 65107022(KNT59_gp194) 65107295(KNT60_gp246) 65107533(KNT62_gp076) 65108433(KNT65_gp199) 65108753(g223c) 65109034(g224c) 65109378(KNT70_gp180) 65109637(KNT71_gp148) 65109946(KNT72_gp183) 65110641(rnlA) 65110870(KNT78_gp181) 65111175(KNT81_gp041) 65111716(KNT83_gp206) 65111800(KNT84_gp049) 65112072(KNT85_gp044) 65112332(KNT86_gp048) 65112821(KNT87_gp181) 65113280(KNT90_gp161) 65113575(KNT91_gp210) 65113844(KNT92_gp180) 65114137(KNT93_gp231) 65114908(KNU01_gp111) 65116138(KNU12_gp024) 65117382(KNU25_gp024) 65117646(KNU28_gp014) 65118054(KNU29_gp157) 65118137(KNU35_gp002) 65124092(KNU89_gp047) 70878934(KNT57_gp183) 70896186(FDH36_gp025) 75507269(D299_gp238) 7803486(rnlA) 7803976(rnlA) 7943270(rnlA) 7943371(rnlA) 8997292(KP15_60) 9384516(rnlA) 9712809(rnlA) 9830606(rnlA) 9861196(phiAS4_ORF0061) 9861504(phiAS5_ORF0097) 9925852(rnlA) 9926106(rnlA) 9926385(rnlA) 9926658(rnlA)
Reference
PMID:16671895
  Authors
Bullard DR, Bowater RP
  Title
Direct comparison of nick-joining activity of the nucleic acid ligases from bacteriophage T4.
  Journal
Biochem J 398:135-44 (2006)
DOI:10.1042/BJ20060313
  Sequence
[vg:1258717]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system