KEGG   ORTHOLOGY: K19046
Entry
K19046                      KO                                     
Symbol
casB, cse2
Name
CRISPR system Cascade subunit CasB
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19046  casB, cse2; CRISPR system Cascade subunit CasB
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-E factors
    K19046  casB, cse2; CRISPR system Cascade subunit CasB
Genes
ECO: b2759(casB)
ECJ: JW2729(ygcK)
ECD: ECDH10B_2927(ygcK)
EBW: BWG_2495(ygcK)
ECOK: ECMDS42_2264(ygcK)
ECOC: C3026_15165
ECE: Z4068
ECS: ECs_3613(casB)
ECF: ECH74115_4012(cse2)
ETW: ECSP_3707
ELX: CDCO157_3373
EOI: ECO111_3483
EOJ: ECO26_3828
EOH: ECO103_3302
ECOO: ECRM13514_3613(cse2)
ECOH: ECRM13516_3479(cse2)
ESL: O3K_05735
ESO: O3O_19915
ESM: O3M_05780
ECK: EC55989_3032
EOK: G2583_3407(cse)
ELR: ECO55CA74_16225
ELH: ETEC_2950
ECW: EcE24377A_3061(cse2)
EUN: UMNK88_3438
ECOA: APECO78_17395
ECX: EcHS_A2898(cse2)
ECM: EcSMS35_2887(cse2)
ECY: ECSE_3014
ECR: ECIAI1_2862
EUM: ECUMN_3086
ELO: EC042_2954
ECL: EcolC_0953
EKO: EKO11_1010
EKF: KO11_09180(cse2)
EDH: EcDH1_0929
EDJ: ECDH1ME8569_2669(ygcK)
ELW: ECW_m2966(cse2)
ELL: WFL_14480(cse2)
ECOL: LY180_14015
EFE: EFER_0304(ygcK)
ESZ: FEM44_03685(casB) FEM44_05340(casB)
STY: STY3069
STT: t2843
SEX: STBHUCCB_29930
SENT: TY21A_14370
STM: STM2942
SEO: STM14_3546
SEV: STMMW_29051
SEY: SL1344_2921
SEM: STMDT12_C29920
SEJ: STMUK_2931
SEB: STM474_3083
SEF: UMN798_3194
SETU: STU288_14870
SETC: CFSAN001921_02365
SENR: STMDT2_28421
SEND: DT104_29401
SENI: CY43_15350
SEEN: SE451236_20805
SPT: SPA2798
SEK: SSPA2609
SEI: SPC_2986(tnpA)
SEC: SCH_2874(tnpA)
SEH: SeHA_C3136(cse2)
SHB: SU5_03423
SENH: CFSAN002069_17560
SEEH: SEEH1578_00715
SEE: SNSL254_A3152(cse2)
SENN: SN31241_40400
SEW: SeSA_A3096(cse2)
SEA: SeAg_B3070(cse2)
SENS: Q786_14180
SED: SeD_A3253(cse2)
SEG: SG2845
SEL: SPUL_2941
SEGA: SPUCDC_2927
SET: SEN2781
SENA: AU38_14125
SENO: AU37_14135
SENV: AU39_14135
SENQ: AU40_15900
SENL: IY59_14730
SEEC: CFSAN002050_21025
SEEB: SEEB0189_005445
SEEP: I137_14005
SENB: BN855_29920
SENE: IA1_14100
SENC: SEET0819_21545
SBG: SBG_2557
SBZ: A464_2964
SBV: N643_12510
SALZ: EOS98_04785(casB)
SSN: SSON_2908 SSON_2911
SBO: SBO_2761
ESA: ESA_02836
CSK: ES15_2922(cse2)
CSZ: CSSP291_13485
CDM: AFK67_05205
CSI: P262_04220
CMJ: AFK66_022640
CTU: CTU_10460
KPU: KP1_3169(cse2)
KPP: A79E_2162
KPZ: KPNIH27_20285
KPY: KPNIH31_20320
KPT: VK055_0381(casB)
KPR: KPR_4122
KPX: PMK1_04447
KPNK: BN49_1000
KVA: Kvar_0941
KOE: A225_4681
KQV: B8P98_11995(casB)
KAR: LGL98_05055(casB)
KGR: JJJ10_05850(casB)
KLM: BWI76_22740
RON: TE10_22470
CRO: ROD_30471
CYO: CD187_05030(casB)
CFQ: C2U38_20005(casB)
CIB: HF677_004845(casB)
EBT: EBL_c30670
KCO: BWI95_03660
LEH: C3F35_16485(casB)
AHN: NCTC12129_03757
ASUB: NLZ15_05745(casB)
METY: MRY16398_10390
IZH: FEM41_00200(casB)
PROD: PCO85_20490(casB)
SERA: Ser39006_005060(casB)
SERQ: CWC46_05060(casB)
PCC: PCC21_003730
PCV: BCS7_01850
PWA: Pecwa_0399
PPAR: A8F97_16435
PEC: W5S_0411
PWS: A7983_10010
PPOA: BJK05_18575
PBRA: B5S52_19985
PPUJ: E2566_02090(casB)
PARI: I2D83_20070(casB)
PAQU: DMB82_0001755(casB)
PVZ: OA04_04130(casB)
PPAV: LOZ86_19940(casB)
PPOO: LW347_02140(casB)
PCAC: OI450_02520(casB)
DZE: Dd1591_0910
DDC: Dd586_0350
DZC: W909_01830
CED: LH89_10325
DFN: CVE23_01930(casB)
DDQ: DDI_3189
DAQ: DAQ1742_00448
DIC: Dpoa569_003597(casB)
DLC: O1Q98_09570(casB)
DDA: Dd703_3589
EAM: EAMY_2818(ygcK)
EAY: EAM_0764
EPY: EpC_08090(cse2)
EPR: EPYR_00854(ygcK)
ERJ: EJP617_02880(ygcK)
MINT: C7M51_00062
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PLU: plu0747
PLUM: A4R40_03730
PAY: PAU_00708
PTT: VY86_03910
PAKH: B0X70_04205
PLUI: CE143_04135(casB)
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PHAU: PH4a_00620(casB)
XBO: XBJ1_3751
XBV: XBW1_4258
XNE: XNC1_3719
XNM: XNC2_3574
XDO: XDD1_0596
XPO: XPG1_0519
XGR: QL128_02950(casB)
ETE: ETEE_2628
EDW: QY76_16260
EDL: AAZ33_04135(casB)
EHO: A9798_03765
LPV: HYN51_03155(casB)
PRAG: EKN56_10350(casB)
LRI: NCTC12151_00611
VCO: VC0395_A2672(cse)
VCR: VC395_0323
VHR: AL538_00320(casB)
VGA: BSQ33_17930
VSR: Vspart_03912
PPR: PBPRC0038
SCOT: HBA18_15030(casB)
SPRO: N7E60_16985(casB)
PRP: M062_06745
PMY: Pmen_3759
PPSE: BN5_0769
PBM: CL52_18055
AVN: Avin_17190
AVL: AvCA_17190
AVD: AvCA6_17190
ACX: Achr_14820 Achr_14880 Achr_770
PPHA: BVH74_05370
SPSR: EGC80_19925
TVD: SG34_027140(casB)
PSEN: PNC201_20235
AMC: MADE_1014405
HMI: soil367_17150(casB)
PIN: Ping_1588
CEB: B0D95_06090
MTHD: A3224_03150
MII: BTJ40_18120(casB)
MCEL: LPW13_11285(casB)
KIM: G3T16_03670(casB)
MCA: MCA0934
MDN: JT25_007540
MDH: AYM39_06410
MKO: MKLM6_1300
METL: U737_02355(casB)
MPAD: KEF85_15000(casB)
MMOT: QZJ86_02065(casB)
MAH: MEALZ_3719
MBUR: EQU24_20295
MMAI: sS8_4542
MSZE: MSZNOR_2249
MMOB: F6R98_00785(casB)
MOZ: MoryE10_22520
MISZ: MishRS11D_33090
MESL: KKZ03_17520(casB)
MEIY: MIN45_P2348
MCAU: MIT9_P2186 MIT9_P2613
CZA: CYCME_2156
TSE: THMIRHAS_17880
TSB: HMY34_15635(casB)
TLC: RCF98_02095(casB)
NWA: Nwat_1402
ALV: Alvin_0652
ATEP: Atep_23430
TVI: Thivi_0458 Thivi_1077
MPUR: MARPU_07395
NTT: TAO_1714
TTP: E6P07_10985
TBOG: LT988_05105(casB)
TLR: Thiosp_02479(casB)
AEH: Mlg_0953
HHK: HH1059_07230
HHC: M911_01385
HAZ: A9404_08090
GHL: GM160_08070(casB)
TBN: TBH_C1505
EPS: L0Y14_13235(casB)
TTC: FOKN1_2816
CSA: Csal_0228
HAK: KO116_04135
HAM: HALO4334
HALO: BWR19_18130
HBE: BEI_3529
HPIS: P1P91_02455(casB)
HALK: CUU95_04745(casB)
HOL: HORIV_61740
KMA: B9H00_06480
SAJS: QO259_15975(casB)
ALCA: ASALC70_00279
MMW: Mmwyl1_3546
NIK: F5I99_01690(casB)
EMP: EZMO1_3782
GAP: GAPWK_2361
SOK: D0B54_08895(casB)
SINI: GT972_11600(casB)
GBI: PG2T_01370
GPB: HDN1F_07600
VFF: VITFI_CDS0400
AFF: H3L97_04515
CVC: BKX93_19890
CHRI: DK842_14500(casB)
CHRB: DK843_20060(casB)
PSE: NH8B_0691
AMAH: DLM_2393
AQL: BXU06_04405
MAER: DAI18_12505(casB)
RSC: RCFBP_11059
RSN: RSPO_c01085
RSG: JK151_17205(casB)
BYI: BYI23_B012710
BUE: BRPE67_BCDS16520
PACS: FAZ98_10445
TCAR: U0034_23840(casB)
BGM: CAL15_21620
PIG: EGT29_03865(casB)
PACR: FXN63_18890(casB)
CKE: B5M06_08955
CSER: CCO03_06690
CBAA: SRAA_1199
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RGE: RGE_06870(cse2)
ROI: N4261_17355(casB)
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JAB: VN23_00700
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NST: Nstercoris_01455
NLC: EBAPG3_008185
DOE: DENOEST_0915
NIM: W01_09230(casB)
NARC: NTG6680_1122
SULF: CAP31_12640
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TCL: Tchl_1797
ACOM: CEW83_06415
ZPA: C3497_14075(casB)
APP: CAP2UW1_2251
BEB: AEM42_05770
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MNO: Mnod_5413
MIND: mvi_16030
RLAC: QMO75_03030(casB)
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FIY: BN1229_v1_3553
NOH: G5V57_21900(casB)
PSTG: E8M01_22895
DSH: Dshi_3216
CON: TQ29_02850
PABY: Ga0080574_TMP2620
RBL: B6K69_16115
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PAEX: JHW48_15700(casB)
RHM: B5V46_07725
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HML: HmaOT1_18360
MON: G8E03_16970
PGV: SL003B_2841
CMAG: CBW24_14130
ZMP: Zymop_1013
SECH: B18_17920
HGN: E6W36_14930
GOH: B932_0092
GTI: FXF46_10010(casB)
GBE: GbCGDNIH1_1379 GbCGDNIH1_1694
GBH: GbCGDNIH2_1379 GbCGDNIH2_1694
GBC: GbCGDNIH3_1379
GBS: GbCGDNIH4_1379
ACR: Acry_1812 Acry_3316
GDI: GDI2208
GDJ: Gdia_0426
GXY: GLX_07810
APT: APA01_41050
APW: APA42C_41050
APF: APA03_41050
APU: APA07_41050
APG: APA12_41050
APQ: APA22_41050
APX: APA26_41050
APZ: APA32_41050
AOY: EOV40_007495(casB)
RMUC: FOB66_01585(casB)
RMT: IAI58_22130(casB)
NEH: E3E11_02160
SWF: E3E12_03285
BOB: GN304_00775(casB)
BOMB: GT348_01845
EBLA: JGUZn3_21200
PARZ: DTQ13_05050(casB)
RAP: RHOA_5003
SVC: STVA_22950
STEL: STAQ_18430
AZZ: DEW08_03420
AARE: D3093_33325
SROE: JL101_013320
RRU: Rru_A0173 Rru_A0343
RRF: F11_00865 F11_01745
RCE: RC1_3338
RPM: RSPPHO_01292
HYO: NNO_1914
GSU: GSU1386(cse2)
GSK: KN400_1352(cse2)
GPI: GPICK_09695
GAO: A2G06_10065
GBZ: JZM60_11005(casB)
GUR: Gura_0828
GLO: Glov_2478
PCA: Pcar_0958(cse2)
PACE: A6070_04040
PPD: Ppro_2341
DDS: Ddes_0924
DEF: CNY67_05500(casB)
DCB: C3Y92_05850(casB) C3Y92_08905
DDE: Dde_0863
DMS: E8L03_03330(casB)
DSX: GD604_14765(casB)
DEO: CAY53_04845
DOL: Dole_2985
DAL: Dalk_4935
DTI: Desti_4555
SFU: Sfum_2826
TMAI: FVE67_05095
ACP: A2cp1_0780
ANK: AnaeK_0780
BSED: DN745_02400(casB)
BMX: BMS_2208
HYI: K2M58_01330(casB)
SMC: SmuNN2025_0605
SMUT: SMUGS5_06730
STHE: T303_06240
SSR: SALIVB_1075
STF: Ssal_01146
SPAT: A0O21_05670
SRAT: FY406_10320(casB)
STRG: SRT_06160
SCHJ: DDV21_004815(casB)
LDB: Ldb0870
LBU: LBUL_0795
LDE: LDBND_0799
LHH: LBH_1245
LHD: HUO_04715
LCR: LCRIS_01212
LAY: LAB52_05095
LXO: KIM322_08400
LCA: LSEI_0351
LPX: ASU28_06290
LPG: BB562_09765
LARG: LPA65_05985(casB)
LFE: LAF_0693
LFF: LBFF_1328
LMU: LBLM1_06095
LSN: LSA_2p00310
LBN: LBUCD034_0103(casB)
LPAR: FAM21731_00953
LKO: ABN16_13115
LSUA: H3M12_03735(casB)
LAH: LA20533_05310
OSI: DLJ48_08420
XAK: KIMC2_16010
XAP: XA3_14110
TEY: GLW17_02300(casB)
TOO: C7K38_10765(casB)
AUN: AWM73_00830
AUI: APT62_03350
ASAN: AWM72_05590
ACG: AWM71_06230
AUH: AWM75_08300
AMIT: DBT49_0001060(casB)
ABAE: CL176_04460(casB)
CLS: CXIVA_19930
PROQ: P6M73_16365(casB)
ESR: ES1_14540
FPA: FPR_15500
LASA: L9O85_07145(casB)
AIM: PYS61_00810(casB)
STH: STH666
SALQ: SYNTR_0952
HMO: HM1_0183
STOM: QU660_06880(casB)
KIB: RBB56_01995(casB)
ABUT: Ami103574_04820(casB)
PHAR: NCTC13077_00395
AMEI: LV469_03205(casB)
ECOU: M1R54_04125(casB)
FRO: AALO17_23940
AMUO: KWG62_07935
LPIL: LIP_1461
FVG: I6G91_01030
CGO: Corgl_0422
MSA: Mycsm_07017
CDH: CDB402_0036(cas14)
CDR: CDHC03_0040(cas14)
CDA: CDHC04_0036(cas14)
CDD: CDCE8392_0034(cas14)
CDW: CDPW8_0032(cas14)
CJK: jk0647
CUR: cu1971(casF)
CUA: CU7111_1891(casF)
CRD: CRES_2076(casE)
CTER: A606_11700
CFN: CFAL_01935
CCG: CCASEI_04555
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MARC: AR505_1091
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Reference
PMID:23079036
  Authors
Nam KH, Huang Q, Ke A
  Title
Nucleic acid binding surface and dimer interface revealed by CRISPR-associated CasB protein structures.
  Journal
FEBS Lett 586:3956-61 (2012)
DOI:10.1016/j.febslet.2012.09.041
  Sequence
[eco:b2759]
Reference
PMID:18798563
  Authors
Agari Y, Yokoyama S, Kuramitsu S, Shinkai A
  Title
X-ray crystal structure of a CRISPR-associated protein, Cse2, from Thermus thermophilus HB8.
  Journal
Proteins 73:1063-7 (2008)
DOI:10.1002/prot.22224
  Sequence
[ttj:TTHB189]
LinkDB

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