KEGG   ORTHOLOGY: K14811
Entry
K14811                      KO                                     
Symbol
DBP3
Name
ATP-dependent RNA helicase DBP3 [EC:5.6.2.7]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K14811  DBP3; ATP-dependent RNA helicase DBP3
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.7  DEAD-box RNA helicase
     K14811  DBP3; ATP-dependent RNA helicase DBP3
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Helicases
    K14811  DBP3; ATP-dependent RNA helicase DBP3
Other DBs
COG: COG0513
GO: 0003724
Genes
SGRE: 126319855
EAF: 111708470
LSM: 121127600
ATH: AT1G31970(STRS1)
ALY: 110230856 9306243 9324853 9329757
CRB: 17899806
CSAT: 104741798 104757564 104777235
EUS: EUTSA_v10007300mg
BRP: 103833681 103840203
BNA: 106418768 106435144 106445083
BOE: 106308253 106343170
RSZ: 108814538 108820160
THJ: 104798505
CPAP: 110819887
CIT: 102614699
CIC: CICLE_v10000690mg
PVY: 116125465
MINC: 123196847
TCC: 18606853
GRA: 105789395
GHI: 107938593 107941389
GAB: 108453487
HSYR: 120139492 120145019 120204385
DZI: 111275794
EGR: 104442383
GMX: 100305353(SLTI248) 100806057
GSJ: 114368996 114407951
PVU: PHAVU_002G133300g
VRA: 106776444
VAR: 108323275
VUN: 114174029
VUM: 124827818
CCAJ: 109809737
APRC: 113868738
MTR: 11409569
TPRA: 123907620
CAM: 101504332
PSAT: 127119813
VVO: 131651831
LJA: Lj2g3v1536140.1(Lj2g3v1536140.1)
ADU: 107487142
AIP: 107642378
AHF: 112747472 112800080
LANG: 109331973 109333115
PCIN: 129311931
QSA: O6P43_025094
FVE: 101312256
RCN: 112179800
PPER: 18778014
PMUM: 103336809
PAVI: 110770454
PDUL: 117627777 117627778
MDM: 108173609 114823678
MSYL: 126608143
PXB: 103938773 103962517
ZJU: 107434551
MNT: 21405606
CSAV: 115716314 115716567
CSV: 101220294
CMO: 103502795
BHJ: 120078577
MCHA: 111024437
CMAX: 111466827 111491423
CMOS: 111437470 111464108
CPEP: 111776281 111796143
RCU: 8278528
JCU: 105631769
HBR: 110645023
MESC: 110605259
POP: 7456107
PEU: 105128220
PALZ: 118028678
JRE: 109008320
CILL: 122281975
CAVE: 132176186
QSU: 112017087
QLO: 115972136
TWL: 119987067 120016364
VVI: 100247646
VRI: 117932137
SLY: 101253217
SPEN: 107028535
SOT: 102592140
SSTN: 125842361
SDUL: 129889632
CANN: 107869619
LBB: 132635372
NTA: 107789804 107794787
NSY: 104216693
NTO: 104103727
NAU: 109228532
INI: 109149340
ITR: 116023098
SIND: 105159408
OEU: 111395363
EGT: 105967137
SSPL: 121756545 121759562
SMIL: 131024604
SHIS: 125222511
APAN: 127250345
HAN: 110923469
ECAD: 122578545
LSV: 111916762
CCAV: 112527781
DCR: 108209521
CSIN: 114267561 114304508
RVL: 131333815
AEW: 130767750 130785744
BVG: 104893063
SOE: 110791175
CQI: 110730077 110732647
ATRI: 130801478
MOF: 131164520
NNU: 104600395
MING: 122074410 122082125
TSS: 122646262
PSOM: 113297615 113301816
OSA: 4342981
DOSA: Os07t0301200-01(Os07g0301200)
OBR: 102720203
OGL: 127779491
BDI: 100821068
ATS: 109782025
TDC: 119300800 119308151
TAES: 123102849 123111069 123120033
TUA: 125508399
LPER: 127316449
LRD: 124679524 124685300
SBI: 8057317
ZMA: 100383160
SITA: 101776410
SVS: 117845757
PVIR: 120658095 120669033
PHAI: 112880579
PDA: 103698326
EGU: 105043970
MUS: 103970528
ZOF: 122042369 122046882
DCT: 110115176
PEQ: 110018938
AOF: 109836976
MSIN: 131247973
NCOL: 116252812
ATR: 18443847
SMO: SELMODRAFT_232454 SELMODRAFT_232961
PPP: 112274253
CRE: CHLRE_12g539100v5
VCN: VOLCADRAFT_103394
MNG: MNEG_8651
CSL: COCSUDRAFT_35789
CVR: CHLNCDRAFT_36420
APRO: F751_4983
OLU: OSTLU_38084
OTA: OT_ostta10g00150
BPG: Bathy11g00600
MIS: MICPUN_97883
MPP: MICPUCDRAFT_45119(JGI:MicpuC2_45119)
SCE: YGL078C(DBP3)
SEUB: DI49_1895
SPAO: SPAR_G01660
AGO: AGOS_AFL080W
ERC: Ecym_2213
KLA: KLLA0_C15499g
KMX: KLMA_30511(DBP3)
LTH: KLTH0H04466g
VPO: Kpol_1033p40
ZRO: ZYRO0G08580g
CGR: CAGL0H03377g
NCS: NCAS_0D03740(NCAS0D03740)
NDI: NDAI_0I01150(NDAI0I01150)
TPF: TPHA_0E02410(TPHA0E02410)
TBL: TBLA_0B05050(TBLA0B05050)
TGB: HG536_0A01400
TDL: TDEL_0G01420(TDEL0G01420)
KAF: KAFR_0C02220(KAFR0C02220)
KNG: KNAG_0F02050(KNAG0F02050)
ZMK: HG535_0E01350
PPA: PAS_chr2-1_0030
DHA: DEHA2A03454g
PIC: PICST_82655(DBP3)
PGU: PGUG_00233
SPAA: SPAPADRAFT_50932
LEL: PVL30_003087(DBP3)
CAL: CAALFM_C110030WA(DBP3)
CTP: CTRG_03355
COT: CORT_0G00980
CDU: CD36_09430
CTEN: CANTEDRAFT_94286
YLI: YALI0D09449g
CLU: CLUG_05054
CLUS: A9F13_03g01804
CAUR: CJI96_0001278
SLB: AWJ20_3852(DBP3)
PKZ: C5L36_0C11260
BNN: FOA43_002544(DBP3)
BBRX: BRETT_000095(DBP3)
OPA: HPODL_03747
SLUD: SCDLUD_001093
NCR: NCU05782
NTE: NEUTE1DRAFT124213(NEUTE1DRAFT_124213)
SMP: SMAC_09016
PAN: PODANSg631
PBEL: QC761_400310(DBP3)
PPSD: QC762_400310(DBP3)
PPSP: QC763_400310(DBP3)
PPSA: QC764_400310(DBP3)
TTT: THITE_2111136
MTM: MYCTH_2307795
CTHR: CTHT_0047360
PPEI: PpBr36_02150
PGRI: PgNI_07851
TMN: UCRPA7_1305
SSCK: SPSK_06104
FGR: FGSG_02637
FPU: FPSE_00345
FPOA: FPOAC1_002765(DBP3)
FVN: FVRRES_03080
FVR: FVEG_09259
FOX: FOXG_10616
NHE: NECHADRAFT_43102
FFC: NCS54_00854100
FKR: NCS57_00897700
FMU: J7337_005146(DBP3)
TRE: TRIREDRAFT_112384
TRR: M419DRAFT_134937
MAW: MAC_05382
MAJ: MAA_07749
PCHM: VFPPC_10876
CMT: CCM_05715
AMUS: LMH87_008113
PLJ: VFPFJ_09609
PTKZ: JDV02_002111(DBP3)
VAL: VDBG_07075
VDA: VDAG_06714
CFJ: CFIO01_00416
CLUP: CLUP02_17273
CHIG: CH63R_09469
SAPO: SAPIO_CDS8508
ELA: UCREL1_4089
PFY: PFICI_13442
SSL: SS1G_10526
BFU: BCIN_04g01690(Bcdbp3)
MBE: MBM_05070
PSCO: LY89DRAFT_647605
GLZ: GLAREA_10163
ANI: ANIA_07424
AFM: AFUA_2G06310
ACT: ACLA_068010
NFI: NFIA_083090
AOR: AO090001000749
ANG: An02g14950
AFV: AFLA_012884
ALUC: AKAW2_11252A(DBP3)
ACHE: ACHE_80228S(DBP3)
APUU: APUU_80626A(DBP3)
PCS: N7525_007724
POU: POX_h09574
TMF: EYB26_001301
TRG: TRUGW13939_06087
CIM: CIMG_04255
CPW: CPC735_001810
URE: UREG_05684
PBL: PAAG_00292
PBN: PADG_07837
AJE: HCAG_02028
BGH: BDBG_09490
PNO: SNOG_03302
PTE: PTT_14848
BZE: COCCADRAFT_36878
BSC: COCSADRAFT_138086
BOR: COCMIDRAFT_79873
AALT: CC77DRAFT_1097837
ARAB: EKO05_0000231
ZTR: MYCGRDRAFT_73558
PFJ: MYCFIDRAFT_165866
FFU: CLAFUR5_09777
CBET: CB0940_10318
BCOM: BAUCODRAFT_508764
NPA: UCRNP2_7318
SPO: SPBC17D1.06(dbp3)
SOM: SOMG_00959(dbp3)
CNE: CNE00590
CNB: CNBE0530
CNG: CNAG_02502
CGI: CGB_E0550C
CDEU: CNBG_4201
TMS: TREMEDRAFT_41622
TASA: A1Q1_07707
CCAC: CcaHIS019_0110930(DBP3)
TVS: TRAVEDRAFT_160183
DSQ: DICSQDRAFT_149050
PCO: PHACADRAFT_23751
SHS: STEHIDRAFT_46362
HIR: HETIRDRAFT_325996
PSQ: PUNSTDRAFT_94351
ADL: AURDEDRAFT_78430
FME: FOMMEDRAFT_107201
GTR: GLOTRDRAFT_31519
RSX: RhiXN_01027
LBC: LACBIDRAFT_181543
CCI: CC1G_08643
ABP: AGABI1DRAFT65941(AGABI1DRAFT_65941)
ABV: AGABI2DRAFT182780(AGABI2DRAFT_182780)
PCUB: JR316_0001235
MRR: Moror_12686
MORE: E1B28_009788
CPUT: CONPUDRAFT_161055
SLA: SERLADRAFT_352582
WSE: WALSEDRAFT_68621
WIC: J056_001164
UMA: UMAG_01732
PFP: PFL1_04955
SGRA: EX895_003811
MGL: MGL_1922
MRT: MRET_1883
MSYM: MSY001_1024
PGR: PGTG_00882
PTRC: PtA15_17A275
PSTR: Pst134EA_030529
MLR: MELLADRAFT_51000
NCE: NCER_100260
MBR: MONBRDRAFT_26581
SRE: PTSG_00863
ACAN: ACA1_157270
SMIN: v1.2.015979.t1(symbB.v1.2.015979.t1)
PTI: PHATRDRAFT_10782
FCY: FRACYDRAFT_207057
TPS: THAPSDRAFT_32807
NGD: NGA_0439110
AAF: AURANDRAFT_26912
PIF: PITG_01427
PSOJ: PHYSODRAFT_300186
SPAR: SPRG_00534
EHX: EMIHUDRAFT_70141
GTT: GUITHDRAFT_115782
 » show all
Reference
PMID:16449635
  Authors
Bernstein KA, Granneman S, Lee AV, Manickam S, Baserga SJ
  Title
Comprehensive mutational analysis of yeast DEXD/H box RNA helicases involved in large ribosomal subunit biogenesis.
  Journal
Mol Cell Biol 26:1195-208 (2006)
DOI:10.1128/MCB.26.4.1195-1208.2006
  Sequence
[sce:YGL078C]
Reference
PMID:9032262
  Authors
Weaver PL, Sun C, Chang TH
  Title
Dbp3p, a putative RNA helicase in Saccharomyces cerevisiae, is required for efficient pre-rRNA processing predominantly at site A3.
  Journal
Mol Cell Biol 17:1354-65 (1997)
DOI:10.1128/MCB.17.3.1354
  Sequence
[sce:YGL078C]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system