ORTHOLOGY: K03186 Help Entry K03186                      KO                                      Symbol ubiX, bsdB, PAD1 Name flavin prenyltransferase [EC:2.5.1.129] Pathway map00130   Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis map00627   Aminobenzoate degradation map00740   Riboflavin metabolism map00900   Terpenoid backbone biosynthesis map00940   Phenylpropanoid biosynthesis map01100   Metabolic pathways map01110   Biosynthesis of secondary metabolites map01120   Microbial metabolism in diverse environments map01220   Degradation of aromatic compounds map01240   Biosynthesis of cofactors Module M00117   Ubiquinone biosynthesis, prokaryotes, chorismate (+ polyprenyl-PP) => ubiquinol M00849   C5 isoprenoid biosynthesis, mevalonate pathway, archaea Reaction R01238   4-hydroxybenzoate carboxy-lyase (phenol-forming) R02952   phenylacrylic acid decarboxylase R03367   R04985   4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate carboxy-lyase R04986   3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase R11225   dimethylallyl-phosphate:FMNH2 prenyltransferase R12895   trans-anhydromevalonate 5-phosphate carboxy-lyase Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]  09100 Metabolism   09108 Metabolism of cofactors and vitamins    00740 Riboflavin metabolism     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase    00130 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase   09109 Metabolism of terpenoids and polyketides    00900 Terpenoid backbone biosynthesis     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase   09110 Biosynthesis of other secondary metabolites    00940 Phenylpropanoid biosynthesis     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase   09111 Xenobiotics biodegradation and metabolism    00627 Aminobenzoate degradation     K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase Enzymes [BR:ko01000]  2. Transferases   2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups    2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)     2.5.1.129  flavin prenyltransferase      K03186  ubiX, bsdB, PAD1; flavin prenyltransferase BRITE hierarchy Other DBs COG:  COG0163 Genes MPHA:  105827991 SCE:  YDR538W(PAD1) SEUB:  DI49_4415 SPAO:  SPAR_D07090 ZRO:  ZYRO0E10406g ZMK:  HG535_0A09020 DHA:  DEHA2G00704g CAL:  CAALFM_C603630WA(PAD1) CDU:  CD36_64170 TMN:  UCRPA7_1729 FGR:  FGSG_06435 FGSG_12202 FPU:  FPSE_08155 FVN:  FVRRES_04321 FVRRES_11089 FVR:  FVEG_03406 FVEG_15727 FVEG_16811 FVEG_17112 FOX:  FOXG_02623 FOXG_04718 FOXG_21159 FOXG_21689 FOXG_21997 NHE:  NECHADRAFT_97489 NECHADRAFT_98161 FFC:  NCS54_00354600 NCS54_00475500 NCS54_00783700 NCS54_01378500 FKR:  NCS57_00360400 NCS57_00826000 NCS57_01359100 FMU:  J7337_001958(PAD1) TRE:  TRIREDRAFT_72549 TRR:  M419DRAFT_134240 TATV:  25784320(TrAtP1_013173) MAW:  19252414(PAD1_3) 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Hay S, Leys D   Title UbiX is a flavin prenyltransferase required for bacterial ubiquinone biosynthesis.   Journal Nature 522:502-6 (2015) DOI:10.1038/nature14559   Sequence [pae:PA4019] Reference PMID:25647642   Authors Lin F, Ferguson KL, Boyer DR, Lin XN, Marsh EN   Title Isofunctional enzymes PAD1 and UbiX catalyze formation of a novel cofactor required by ferulic acid decarboxylase and 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoic acid decarboxylase.   Journal ACS Chem Biol 10:1137-44 (2015) DOI:10.1021/cb5008103   Sequence [sce:YDR538W] Reference PMID:18388975   Authors Lupa B, Lyon D, Shaw LN, Sieprawska-Lupa M, Wiegel J   Title Properties of the reversible nonoxidative vanillate/4-hydroxybenzoate decarboxylase from Bacillus subtilis.   Journal Can J Microbiol 54:75-81 (2008) DOI:10.1139/w07-113   Sequence [bsu:BSU03630] LinkDB All DBs

ENZYME: 2.5.1.129 Help Entry EC 2.5.1.129                Enzyme                                  Name flavin prenyltransferase; ubiX (gene name); PAD1 (gene name); dimethylallyl-phosphate:FMNH2 prenyltransferase Class Transferases; Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups; Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date) BRITE hierarchy Sysname prenyl-phosphate:FMNH2 prenyltransferase Reaction(IUBMB) prenyl phosphate + FMNH2 = prenylated FMNH2 + phosphate [RN:R11225] Reaction(KEGG) R11225 Reaction Substrate prenyl phosphate [CPD:C21214]; FMNH2 [CPD:C01847] Product prenylated FMNH2 [CPD:C21215]; phosphate [CPD:C00009] Comment The enzyme produces the modified flavin cofactor prenylated FMNH2, which is required by EC 4.1.1.98, 4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase, and EC 4.1.1.102, phenacrylate decarboxylase. The enzyme acts as a flavin prenyltransferase, linking a prenyl moiety to the flavin N-5 and C-6 atoms and thus adding a fourth non-aromatic ring to the flavin isoalloxazine group. History EC 2.5.1.129 created 2015 Pathway ec00740   Riboflavin metabolism ec01100   Metabolic pathways Orthology K03186   flavin prenyltransferase Genes MPHA:  105827991 SCE:  YDR538W(PAD1) SEUB:  DI49_4415 SPAO:  SPAR_D07090 ZRO:  ZYRO0E10406g ZMK:  HG535_0A09020 DHA:  DEHA2G00704g CAL:  CAALFM_C603630WA(PAD1) CDU:  CD36_64170 TMN:  UCRPA7_1729 FGR:  FGSG_06435 FGSG_12202 FPU:  FPSE_08155 FVN:  FVRRES_04321 FVRRES_11089 FVR:  FVEG_03406 FVEG_15727 FVEG_16811 FVEG_17112 FOX:  FOXG_02623 FOXG_04718 FOXG_21159 FOXG_21689 FOXG_21997 NHE:  NECHADRAFT_97489 NECHADRAFT_98161 FFC:  NCS54_00354600 NCS54_00475500 NCS54_00783700 NCS54_01378500 FKR:  NCS57_00360400 NCS57_00826000 NCS57_01359100 FMU:  J7337_001958(PAD1) TRE:  TRIREDRAFT_72549 TRR:  M419DRAFT_134240 TATV:  25784320(TrAtP1_013173) MAW:  19252414(PAD1_3) MAJ:  MAA_01632 MAA_06753 MBRN:  26246246(PAD1_1) 26247794(PAD1_0) PLJ:  28886287(PLICBS_007771) CFJ:  CFIO01_10373 CLUP:  CLUP02_14533 CHIG:  CH63R_09746 ELA:  UCREL1_1237 PFY:  PFICI_01972 PFICI_11104 BFU:  BCIN_15g05160 NFI:  NFIA_026000 AOR:  AO090001000094 AO090003000423 ANG:  An03g06570 An09g00010 An12g09330 AFV:  AFLA_001268 AFLA_008429 ALUC:  AKAW2_51010A(PAD1) AKAW2_61243A ACHE:  ACHE_11505A ACHE_80176A(PAD1) APUU:  APUU_80778A(PAD1) PCS:  N7525_005877 PDP:  PDIP_44210 TRG:  TRUGW13939_02307 TRUGW13939_08272 PTE:  PTT_20195 BZE:  COCCADRAFT_108287 BSC:  COCSADRAFT_199437 BOR:  COCMIDRAFT_8125 NPA:  UCRNP2_4414 CNG:  CNAG_03518 CGI:  CGB_G5615C CDEU:  CNBG_2096 MRR:  Moror_16771 PSOJ:  PHYSODRAFT_310787 ECO:  b2311(ubiX) ECJ:  JW2308(ubiX) ECD:  ECDH10B_2473(ubiX) EBW:  BWG_2085(ubiX) ECOK:  ECMDS42_1882(ubiX) ECOC:  C3026_12885 ECE:  Z3573(ubiX) Z4047 ECS:  ECs_3195(ubiX) ECs_3593(kpdB) ECF:  ECH74115_3451(ubiX) ECH74115_3990(kpdB) ETW:  ECSP_3186(ubiX) ECSP_3687 ELX:  CDCO157_2959 CDCO157_3353 EOI:  ECO111_3059(ubiX) ECO111_3463 EOJ:  ECO26_3299(ubiX) ECO26_3808 EOH:  ECO103_2775(ubiX) ECO103_3281 ECOO:  ECRM13514_3068(ubiX) ECRM13514_3590 ECOH:  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REACTION: R11225 Help Entry R11225                      Reaction                                Name dimethylallyl-phosphate:FMNH2 prenyltransferase Definition Dimethylallyl phosphate + Reduced FMN <=> Prenylated FMNH2 + Orthophosphate Equation C21214 + C01847 <=> C21215 + C00009 Reaction class RC03392   C01847_C21215 Enzyme 2.5.1.129 Pathway rn00740   Riboflavin metabolism rn01100   Metabolic pathways Brite Enzymatic reactions [BR:br08201]  2. Transferase reactions   2.5  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups    2.5.1  Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)     2.5.1.129      R11225  Dimethylallyl phosphate + Reduced FMN <=> Prenylated FMNH2 + Orthophosphate BRITE hierarchy Orthology K03186   flavin prenyltransferase [EC:2.5.1.129] Other DBs RHEA:  37746 LinkDB All DBs

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