ORTHOLOGY: K03800 Help Entry K03800                      KO                                      Symbol lplA, lplJ, lipL1 Name lipoate---protein ligase [EC:6.3.1.20] Pathway map00785   Lipoic acid metabolism map01100   Metabolic pathways map01240   Biosynthesis of cofactors Reaction R07770   R07771   R11143   [lipoyl-carrier protein]-L-lysine:lipoate ligase (AMP-forming) R12429   [lipoyl-carrier protein E2]-L-lysine:octanoate ligase (AMP-forming) R12433   [glycine cleavage system H]-L-lysine:(R)-lipoate ligase (AMP-forming) R12434   R12449   [lipoyl-carrier protein E2]-L-lysine:(R)-lipoate ligase (AMP-forming) Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]  09100 Metabolism   09108 Metabolism of cofactors and vitamins    00785 Lipoic acid metabolism     K03800  lplA, lplJ, lipL1; lipoate---protein ligase Enzymes [BR:ko01000]  6. Ligases   6.3  Forming carbon-nitrogen bonds    6.3.1  Acid-D-ammonia (or amine) ligases (amide synthases)     6.3.1.20  lipoate---protein ligase      K03800  lplA, lplJ, lipL1; lipoate---protein ligase BRITE hierarchy Other DBs COG:  COG0095 GO:  0016979 Genes CLON:  129617595 CME:  CYME_CMQ023C NCR:  NCU05421 NTE:  NEUTE1DRAFT65646(NEUTE1DRAFT_65646) SMP:  10804112(SMAC4_04157) PAN:  PODANSg6825 PBEL:  QC761_309780 PPSD:  QC762_309780 PPSP:  QC763_309780 PPSA:  QC764_309780 TTT:  THITE_2124648 CTHR:  CTHT_0015490 RTHE:  98128285(VTJ83DRAFT_6881) MGR:  MGG_03282 PPEI:  PpBr36_06423 PGRI:  PgNI_00784 TMN:  UCRPA7_8187 FGR:  FGSG_01642 FPU:  FPSE_07455 FPOA:  FPOAC1_001766 FVN:  FVRRES_01980 FVR:  FVEG_09740 FOX:  FOXG_11060 NHE:  NECHADRAFT_30038 FFC:  NCS54_00017800 FKR:  NCS57_00015600 FMU:  J7337_000226 TRE:  TRIREDRAFT_82172 TRR:  M419DRAFT_39312 TATV:  25780047(TrAtP1_009359) TASP:  36610914(TrAFT101_004780) MAW:  19250100(J3458_011706) MAJ:  MAA_08600 MBRN:  26243943(lplA) PCHM:  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Molecular cloning and characterization of the lplA gene and gene product.   Journal J Biol Chem 269:16091-100 (1994)   Sequence [eco:b4386] Reference PMID:25116855   Authors Afanador GA, Matthews KA, Bartee D, Gisselberg JE, Walters MS, Freel Meyers CL, Prigge ST   Title Redox-dependent lipoylation of mitochondrial proteins in Plasmodium falciparum.   Journal Mol Microbiol 94:156-71 (2014) DOI:10.1111/mmi.12753   Sequence [pfa:PF3D7_1314600] LinkDB All DBs

ENZYME: 6.3.1.20 Help Entry EC 6.3.1.20                 Enzyme                                  Name lipoate---protein ligase; lplA (gene name); lplJ (gene name); lipoate protein ligase; lipoate-protein ligase A; LPL; LPL-B Class Ligases; Forming carbon-nitrogen bonds; Acid-D-ammonia (or amine) ligases (amide synthases) BRITE hierarchy Sysname [lipoyl-carrier protein]-L-lysine:lipoate ligase (AMP-forming) Reaction(IUBMB) ATP + (R)-lipoate + a [lipoyl-carrier protein]-L-lysine = a [lipoyl-carrier protein]-N6-(lipoyl)lysine + AMP + diphosphate (overall reaction)  [RN:R11143]; (1a) ATP + (R)-lipoate = lipoyl-AMP + diphosphate [RN:R07770]; (1b) lipoyl-AMP + a [lipoyl-carrier protein]-L-lysine = a [lipoyl-carrier protein]-N6-(lipoyl)lysine + AMP [RN:R07771] Reaction(KEGG) R11143 > R12433 R12449; R07770 R07771; (other) R12429 Reaction Substrate ATP [CPD:C00002]; (R)-lipoate [CPD:C16241]; [lipoyl-carrier protein]-L-lysine [CPD:C16240]; lipoyl-AMP [CPD:C16238] Product [lipoyl-carrier protein]-N6-(lipoyl)lysine [CPD:C16237]; AMP [CPD:C00020]; diphosphate [CPD:C00013]; lipoyl-AMP [CPD:C16238] Comment Requires Mg2+. This enzyme participates in lipoate salvage, and is responsible for lipoylation in the presence of exogenous lipoic acid [7]. The enzyme attaches lipoic acid to the lipoyl domains of certain key enzymes involved in oxidative metabolism, including pyruvate dehydrogenase (E2 domain), 2-oxoglutarate dehydrogenase (E2 domain), the branched-chain 2-oxoacid dehydrogenases and the glycine cleavage system (H protein) [6]. Lipoylation is essential for the function of these enzymes. The enzyme can also use octanoate instead of lipoate. History EC 6.3.1.20 created 2006 as EC 2.7.7.63, transferred 2016 to EC 6.3.1.20 Pathway ec00785   Lipoic acid metabolism ec01100   Metabolic pathways Orthology K03800   lipoate---protein ligase Genes CLON:  129617595 CME:  CYME_CMQ023C NCR:  NCU05421 NTE:  NEUTE1DRAFT65646(NEUTE1DRAFT_65646) SMP:  10804112(SMAC4_04157) PAN:  PODANSg6825 PBEL:  QC761_309780 PPSD:  QC762_309780 PPSP:  QC763_309780 PPSA:  QC764_309780 TTT:  THITE_2124648 CTHR:  CTHT_0015490 RTHE:  98128285(VTJ83DRAFT_6881) MGR:  MGG_03282 PPEI:  PpBr36_06423 PGRI:  PgNI_00784 TMN:  UCRPA7_8187 FGR:  FGSG_01642 FPU:  FPSE_07455 FPOA:  FPOAC1_001766 FVN:  FVRRES_01980 FVR:  FVEG_09740 FOX:  FOXG_11060 NHE:  NECHADRAFT_30038 FFC:  NCS54_00017800 FKR:  NCS57_00015600 FMU:  J7337_000226 TRE:  TRIREDRAFT_82172 TRR:  M419DRAFT_39312 TATV:  25780047(TrAtP1_009359) TASP:  36610914(TrAFT101_004780) MAW:  19250100(J3458_011706) MAJ:  MAA_08600 MBRN:  26243943(lplA) PCHM:  VFPPC_02334 CMT:  CCM_02165 AMUS:  LMH87_003253 PLJ:  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Determination of the lipoic acid-binding site.   Journal J Biol Chem 280:33645-51 (2005) DOI:10.1074/jbc.M505010200   Sequence [eco:b4386] Reference 6  [PMID:9218413]   Authors Jordan SW, Cronan JE Jr.   Title A new metabolic link. The acyl carrier protein of lipid synthesis donates lipoic acid to the pyruvate dehydrogenase complex in Escherichia coli and mitochondria.   Journal J Biol Chem 272:17903-6 (1997) DOI:10.1074/jbc.272.29.17903 Reference 7  [PMID:10966480]   Authors Perham RN   Title Swinging arms and swinging domains in multifunctional enzymes: catalytic machines for multistep reactions.   Journal Annu Rev Biochem 69:961-1004 (2000) DOI:10.1146/annurev.biochem.69.1.961 Other DBs ExplorEnz - The Enzyme Database:  6.3.1.20 IUBMB Enzyme Nomenclature:  6.3.1.20 ExPASy - ENZYME nomenclature database:  6.3.1.20 BRENDA, the Enzyme Database:  6.3.1.20 CAS:  144114-18-1 LinkDB All DBs

REACTION: R12429 Help Entry R12429                      Reaction                                Name [lipoyl-carrier protein E2]-L-lysine:octanoate ligase (AMP-forming) Definition ATP + Octanoic acid + Lipoyl-carrier protein E2 <=> [Lipoyl-carrier protein E2]-N6-octanoyl-L-lysine + AMP + Diphosphate Equation C00002 + C06423 + C22158 <=> C22160 + C00020 + C00013 Enzyme 6.3.1.20 Pathway rn00785   Lipoic acid metabolism rn01100   Metabolic pathways rn01240   Biosynthesis of cofactors Brite Enzymatic reactions [BR:br08201]  6. Ligase reactions   6.3  Forming carbon-nitrogen bonds    6.3.1  Acid-D-ammonia (or amine) ligases (amide synthases)     6.3.1.20      R12429  ATP + Octanoic acid + Lipoyl-carrier protein E2 <=> [Lipoyl-carrier protein E2]-N6-octanoyl-L-lysine + AMP + Diphosphate BRITE hierarchy Orthology K03800   lipoate---protein ligase [EC:6.3.1.20] LinkDB All DBs

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