KEGG   ORTHOLOGY: K09769
Entry
K09769                      KO                                     
Symbol
ymdB
Name
2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase [EC:3.1.4.16]
Pathway
map00230  Purine metabolism
map00240  Pyrimidine metabolism
map01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09104 Nucleotide metabolism
   00230 Purine metabolism
    K09769  ymdB; 2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase
   00240 Pyrimidine metabolism
    K09769  ymdB; 2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.4  Phosphoric-diester hydrolases
    3.1.4.16  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase
     K09769  ymdB; 2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase
Other DBs
RN: R03537 R03538 R03929 R05135
COG: COG1692
GO: 0008663
Genes
SLIM: SCL_2570
SVA: SVA_3641
ACII: C4901_01670
ATY: A9R16_001445
IGN: MMG00_09090
HAD: CDV25_03530
HET: BBW65_03345
HCL: NCTC13205_00654
HWI: A0Z60_04100
WSU: WS1238
SUA: Saut_0596
SULC: CVO_02185
SULR: B649_02645
CSPF: CSF_0755
CGEO: CGEO_0668
CCOR: CCORG_1140
CSHO: CSHOW_1280
SDL: Sdel_1612
SMUL: SMUL_2250
SHAL: SHALO_1992
SULJ: SJPD1_1998
ABU: Abu_0421
ABT: ABED_0396
ATP: ATR_1407
ACIB: ACBT_1811
ACRE: ACRYA_1331
APOC: APORC_1693
ATHR: ATH_1601
AELL: AELL_0561
AAQI: AAQM_0482
ASUI: ASUIS_0539
ACLO: ACLO_0544
ALK: ALEK_0687
AMYT: AMYT_0532
AMAR: AMRN_0556
ACAA: ACAN_0580
AMOL: AMOL_0471
APAI: APAC_0459
HBV: ABIV_0517
HEBR: AEBR_0619
PACO: AACT_0683
ARC: ABLL_0563
HYO: NNO_1846
SUN: SUN_2047
NIS: NIS_1459
NAM: NAMH_0367
GSU: GSU1138
GME: Gmet_1181
GEM: GM21_3292
GEB: GM18_0868
GUR: Gura_1101
GEO: Geob_3589
GLO: Glov_3501
GBM: Gbem_0969
PCA: Pcar_2349
PPD: Ppro_3311
DEU: DBW_2697
DVU: DVU_0952
DVL: Dvul_2034
DVM: DvMF_1357
DMA: DMR_04890
DGG: DGI_2288
DDE: Dde_0229
DHY: DESAM_21070(ymdB)
DAS: Daes_3102
DPI: BN4_12575
PPRF: DPRO_1512(ymdB)
DBA: Dbac_3372
ADE: Adeh_1045
MXA: MXAN_2977
SAT: SYN_02978
DBR: Deba_0296
PACA: ID47_10695
MLO: mll3953
MHUA: MCHK_5269
MES: Meso_3195
PLA: Plav_2112
SME: SMc03973
SMER: DU99_15265
SMD: Smed_2645
SFD: USDA257_c52200(ymdB)
EAD: OV14_0240
ATU: Atu3730
ARA: Arad_3706
AVI: Avi_3650
RLE: RL3980
RLG: Rleg_3506
RHT: NT26_2674
LAA: WSI_02670
LSO: CKC_02035
LAR: lam_025
SHZ: shn_15080
KAI: K32_35640
BME: BMEI0316
BMEL: DK63_1118
BMEE: DK62_1828
BMF: BAB1_1734
BABO: DK55_1685
BABR: DO74_204
BABT: DK49_1442
BABB: DK48_435
BABU: DK53_1668
BABS: DK51_1875
BABC: DO78_1589
BMS: BR1722
BSZ: DK67_612
BOV: BOV_1665
BCAR: DK60_1728
BCAS: DA85_08290
BMR: BMI_I1741
BPP: BPI_I1782
BPV: DK65_1781
OAN: Oant_1195
OAH: DR92_748
BJA: blr1528(blr1528)
BRA: BRADO1139
BBT: BBta_6913
BRS: S23_11050
AOL: S58_12450
BRAD: BF49_4306
BARH: WN72_06775
RPA: RPA4453
RPB: RPB_4288
RPC: RPC_4811
RPD: RPD_4179
RPE: RPE_4774
RPT: Rpal_4945
NWI: Nwi_2730
NHA: Nham_3527
OCA: OCAR_7306
BHE: BH14410
BQU: BQ11350
BQR: RM11_1048
BTR: BT_2077
BGR: Bgr_17300
BANC: PU02_0272
XAU: Xaut_3061
AZC: AZC_0509
SNO: Snov_3056
MDI: METDI3143
MEX: Mext_2362
MCH: Mchl_2639
MPO: Mpop_2318
MET: M446_3073
MNO: Mnod_4543
MOR: MOC_5932
META: Y590_11395
MIND: mvi_32720
BID: Bind_3472
MSL: Msil_2278
MTUN: MTUNDRAET4_3757(ymdB)
BBAR: RHAL1_00083(ymdB)
HDN: Hden_2442
RVA: Rvan_1587
MCG: GL4_3016
PHL: KKY_2462
BVR: BVIR_241
BLAG: BLTE_34970
MSC: BN69_1139
HDI: HDIA_3629
MMED: Mame_03750
TSO: IZ6_06070
RBM: TEF_16305
PSF: PSE_4691
CCR: CC_3244
CAK: Caul_0776
CSE: Cseg_0675
PZU: PHZ_c3185
SIL: SPO2953
JAN: Jann_3385
RDE: RD1_2012
DSH: Dshi_2768
KVL: KVU_1781
KVU: EIO_2237
PGD: Gal_01219
OTM: OSB_09070
LAQU: R2C4_11410
CID: P73_1531
MALG: MALG_00856
SINL: DSM14862_00910(ymdB)
RSP: RSP_0657
PDE: Pden_4509
PMAU: CP157_01391(ymdB)
RSU: NHU_03173
RHC: RGUI_3791
PAMO: BAR1_11275
PALW: PSAL_033490(ymdB)
GAK: X907_2351
HNE: HNE_3343
HBA: Hbal_2919
GOX: GOX0225
GOH: B932_2169
GOY: GLS_c02480(ymdB)
ACR: Acry_1463
GDI: GDI0517
GDJ: Gdia_1490
GXY: GLX_20980
GXL: H845_2876
ASZ: ASN_2273
EBLA: JGUZn3_18040(ymdB)
RAP: RHOA_5846(ymdB)
SHUM: STHU_49860
STEL: STAQ_45090
RRU: Rru_A1085
RRF: F11_05590
RCE: RC1_1809
MAG: amb3223
MGRY: MSR1_07000
MAGX: XM1_4132
MAGN: WV31_05185
TMO: TMO_0896
THAL: A1OE_499
EFK: P856_285
TXI: TH3_07105
MAGQ: MGMAQ_1387
MGM: Mmc1_0496
MAI: MICA_1174
MAN: A11S_1129
AFR: AFE_2139
ACU: Atc_0701
BSU: BSU16970(ymdB)
BSR: I33_1883
BSL: A7A1_3390
BSH: BSU6051_16970(ymdB)
BSUT: BSUB_01828
BSUL: BSUA_01828(ymdB)
BSUS: Q433_09645
BSO: BSNT_08211(ymdB)
BSQ: B657_16970(ymdB)
BSX: C663_1740
BSS: BSUW23_08725(ymdB)
BST: GYO_2051
BLI: BL03656(ymdB)
BLD: BLi01920(ymdB)
BLH: BaLi_c19540(ymdB)
BAQ: BACAU_1652(ymdB)
BYA: BANAU_1652(ymdB)
BAMP: B938_08715
BQY: MUS_1853
BAML: BAM5036_1618(ymdB)
BAMA: RBAU_1658(ymdB)
BAMN: BASU_1637(ymdB)
BAMT: AJ82_09550
BAMY: V529_16400
BAO: BAMF_1769(ymdB)
BAZ: BAMTA208_08655(ymdB)
BQL: LL3_01856
BXH: BAXH7_01765(ymdB)
BAMI: KSO_010945
BAMC: U471_17220
BAMF: U722_08890
BMOJ: HC660_17600(pdeB)
BTEQ: G4P54_08835(ymdB)
BAN: BA_3913
BAR: GBAA_3913
BAT: BAS3626
BAI: BAA_3938
BANT: A16_39210
BANR: A16R_39650
BANS: BAPAT_3749
BANV: DJ46_2616
BCE: BC3777
BCA: BCE_3812
BCQ: BCQ_3563
BCX: BCA_3874
BNC: BCN_3605
BCF: bcf_18740
BCER: BCK_16355
BTL: BALH_3405
BTT: HD73_4063
BTHI: BTK_19980
BTM: MC28_2946
BTG: BTB_c38500(ymdB)
BTI: BTG_00355
BTW: BF38_4947
BWW: bwei_1180(ymdB)
BMYO: BG05_2246
BMYC: DJ92_820
BPU: BPUM_1600
BPUM: BW16_08870
BPUS: UP12_08305
BMET: BMMGA3_06500(ymdB)
BGY: BGLY_2113
BCAB: EFK13_09305(ymdB)
BRY: M0696_09160(ymdB)
BJS: MY9_1843
BACW: QR42_08225
BACP: SB24_01300
BACB: OY17_11485
BACO: OXB_2119
BACY: QF06_07525
BALM: BsLM_1793
BMQ: BMQ_4117
BMD: BMD_4104
BMH: BMWSH_1109(ymdB)
BMEG: BG04_1034
BEO: BEH_17855
BAG: Bcoa_3324
BCOA: BF29_238
BHA: BH2376
BCL: ABC2193
OIH: OB1626
GKA: GK1298
GTN: GTNG_1152
GGH: GHH_c12230(ymdB)
AFL: Aflv_1528
AAMY: GFC30_1594
ANL: GFC29_470
AXL: AXY_14330
LSP: Bsph_1639
HLI: HLI_01305
PASA: BAOM_1740
PSYO: PB01_07015
BBEV: BBEV_1758
BSE: Bsel_1813
SAU: SA1130
SAV: SAV1288
SAW: SAHV_1278
SAM: MW1171
SAS: SAS1222
SAR: SAR1264
SAC: SACOL1307
SAE: NWMN_1197
SAD: SAAV_1263
SUE: SAOV_1290
SUZ: MS7_1246
SUG: SAPIG1290
SAUA: SAAG_01886
SAUS: SA40_1161
SAUU: SA957_1176
SAUG: SA268_1181
SAUF: X998_1291
SAB: SAB1150
SAUB: C248_1321
SAUC: CA347_1206
SAUR: SABB_03304
SAUI: AZ30_06205
SAUD: CH52_12645
SAMS: NI36_06290
SER: SERP0855
SEP: SE_0966
SEPP: SEB_00944
SEPS: DP17_2294
SHA: SH1625
SSP: SSP1477
SCA: SCA_0931
SDT: SPSE_1486
SPAS: STP1_2318
SSCH: LH95_07265
SSCZ: RN70_07785
SAGQ: EP23_02490
SARL: SAP2_15550
MCL: MCCL_0877
MCAK: MCCS_11140
LMO: lmo1401
LMOE: BN418_1647
LMOB: BN419_1642
LMOD: LMON_1464
LMOW: AX10_01085
LMOQ: LM6179_2145(ymdB)
LMR: LMR479A_1489(ymdB)
LMOM: IJ09_03000
LMOG: BN389_14270(ymdB)
LMP: MUO_07230
LMOX: AX24_04490
LMQ: LMM7_1487
LMS: LMLG_1724
LMOK: CQ02_07200
LIN: lin1438
LWE: lwe1417
LSG: lse_1318
LIV: LIV_1352
ESI: Exig_1028
EAN: Eab7_1000
BBE: BBR47_33930(ymdB)
PPY: PPE_01963
PPM: PPSC2_10260(ymdB)
PPO: PPM_1965(ymdB)
PPOL: X809_10600
PPOY: RE92_02025
PMS: KNP414_05734(ymdB)
PMW: B2K_26295
PSAB: PSAB_14385
PRI: PRIO_3997(ymdB)
PSWU: SY83_16420
PBK: Back11_21400(ymdB)
PALO: E6C60_2425
COHN: KCTCHS21_37540(ymdB)
BTS: Btus_1607
EFF: skT53_07280(ymdB)
SIV: SSIL_2914
JEO: JMA_17550
LPL: lp_2299
LPJ: JDM1_1923
LPZ: Lp16_1806
LSN: LSA_09100(ymdB)
LBH: Lbuc_0914
LHIL: G8J22_01200(ymdB_2)
LBR: LVIS_1234
LRM: LRC_14260
LSA: LCA_0361
EFA: EF3169
EFL: EF62_0240
EFS: EFS1_2593
EFQ: DR75_1884
EFM: M7W_360
EHR: EHR_04140
ECAS: ECBG_01463
EMU: EMQU_0159
EDU: LIU_00645
MPS: MPTP_0294
MPX: MPD5_1590
THL: TEH_22020
CRN: CAR_c06870(ymdB)
CARC: NY10_2391
CTH: Cthe_1090
HSC: HVS_07420
CCE: Ccel_0606
CSD: Clst_1412
CCEL: CCDG5_0500(ymdB)
RCH: RUM_02380
OVA: OBV_13190
PFAA: MM59RIKEN_08250(ymdB)
STH: STH1777
SWO: Swol_1251
SLP: Slip_1052
SALQ: SYNTR_1043
DSY: DSY1939
DHD: Dhaf_3102
SGY: Sgly_2207
PTH: PTH_1304
DRM: Dred_1917
DAE: Dtox_3099
DAU: Daud_1062
AACX: DEACI_3165
HMO: HM1_2381
ELM: ELI_1217
TMR: Tmar_1067
SAY: TPY_1653
CTHM: CFE_1366
TTE: TTE1371
THX: Thet_1276
TIT: Thit_1165
CHY: CHY_1170
MTA: Moth_1083
ADG: Adeg_1474
CSC: Csac_2135
ATE: Athe_0989
TTM: Tthe_1383
TSH: Tsac_1854
TACI: TDSAC_0141
TAE: TepiRe1_1409(ymdB)
TOC: Toce_1208
KME: H0A61_02572(ymdB_2)
PUF: UFO1_2167
PFT: JBW_02309
ERH: ERH_0665
AARG: Aargi30884_07310(ymdB)
ABSI: A9CBEGH2_09150(ymdB)
FIT: Fi14EGH31_05980(ymdB)
EBM: SG0102_09850(ymdB)
LCG: L3BBH23_15810(ymdB)
MGE: MG_246
MGU: CM5_01430
MGC: CM9_01450
MGQ: CM3_01545
MGX: CM1_01460
MPN: MPN_349
MPM: MPNA3490
MPJ: MPNE_0406
MPB: C985_0354
MGA: MGA_1309
MGH: MGAH_1309
MGF: MGF_3266
MGZ: GCW_02135
MMY: MSC_0491
MMYM: MMS_A0540
MMYI: mycmycITA_00529(ymdB)
MML: MLC_4710
MCP: MCAP_0479
MCAC: MCCP01_0563(pdeB)
MCAI: MCCG_0563
MLC: MSB_A0492
MFER: D500_00477
MCD: MCRO_0174
MHA: HF1_00670(ymdB)
MHF: MHF_0077(ymdB)
MSS: MSU_0867(ymdB)
MPF: MPUT_0254
MHE: MHC_00330
MWE: WEN_03340
MHB: MHM_05300(ymdB)
MPV: PRV_03020
MOV: OVS_00245
MYT: MYE_02655
MMO: MMOB5140
MHY: mhp449
MHJ: MHJ_0447
MHYO: MHL_3075
MHR: MHR_0247
MHH: MYM_0339
MHM: SRH_00710
MHS: MOS_278
MHV: Q453_0369
MBC: MYB_01870
MFQ: MYF_01300
MCM: MCAL160_0653(ymdB)
MGLY: NCTC10194_00147(ymdB)
MCOM: NCTC10178_00463(ymdB)
MPU: MYPU_6710(MYPU_6710)
MSY: MS53_0560
MAA: MAG5510
MAL: MAGa6150
MFR: MFE_05640
MFP: MBIO_0830
MBH: MMB_0594
MBI: Mbov_0634
MCY: MCYN_0045(MCYN0045)
MARG: MARG145_0398(ymdB)
MFEL: JPM2_0280
MGAL: NCTC10186_00779(ymdB)
MMAU: NCTC10168_00011(ymdB)
MMEL: NCTC10153_00167(ymdB)
UUR: UU500
UPA: UPA3_0526
UPR: UP3_c0236
POY: PAM_273
AYW: AYWB_447
PML: ATP_00126
PAL: PA0639
NZS: SLY_0451
PSOL: S284_04790
ACL: ACL_0885
ABRA: BN85310120
APAL: BN85407160
MFL: Mfl239
SCR: SCHRY_v1c01020(ymdB)
SSYR: SSYRP_v1c01230(ymdB)
SDI: SDIMI_v3c06680(ymdB)
STAI: STAIW_v1c09200(ymdB)
SAPI: SAPIS_v1c08100(ymdB)
SMIR: SMM_0118
SMIA: P344_00725
SCQ: SCULI_v1c08240(ymdB)
SSAB: SSABA_v1c06440(ymdB)
SATR: SATRI_v1c01250(ymdB)
SERI: SERIO_v1c01430(ymdB)
STUR: STURON_00200(ymdB)
SCLA: SCLARK_00582(ymdB)
SALX: SALLE_v1c06630(ymdB)
MPE: MYPE8900(MYPE8900)
MGJ: MGM1_4880
MHO: MHO_1200
MCAN: MCAN360_0067(ymdB)
MHYV: MHSN_01100
MSIM: MSIM_10270(ymdB)
SALU: DC74_7631
SALL: SAZ_39375
PSEH: XF36_21610
RXY: Rxyl_0516
CWO: Cwoe_5935
DET: DET1609
DEH: cbdbA1703
DMC: btf_1549
DMD: dcmb_1495
DMG: GY50_1503
OTE: Oter_2029
CAA: Caka_1070
AMU: Amuc_0072
AGL: PYTT_1189
MIN: Minf_0285
MKC: kam1_1874
MEAP: MTHMO_2271(ymdB)
RBA: RB2022
PSL: Psta_3982
RUL: UC8_09920
AHEL: Q31a_24330
TTF: THTE_1203
IPA: Isop_2494
SACI: Sinac_2252
BPIT: BPIT_02590
PCOR: KS4_36880
BBU: BB_0505
BBUR: L144_02465
BGA: BG0517
BGB: KK9_0526
BGN: BgCN_0524
BAFT: P612_02575
BAFE: BAFK78_506
BCHI: OY14_02510
BTU: BT0505
BHR: BH0505
BDU: BDU_508
BRE: BRE_511
BCW: Q7M_512
BMIY: RJ61_02485
BPAK: X966_02550
BANE: N187_02485
TDE: TDE_0965
TPED: TPE_0485
BRM: Bmur_0566
BPW: WESB_1687
BIP: Bint_2106
ACA: ACP_0277
ABAS: ACPOL_5236
SUS: Acid_1178
THYD: TTHT_0124
FNU: FN1609
LBA: Lebu_0692
SMF: Smon_0935
TAI: Taci_1261
TLI: Tlie_1299
SBR: SY1_00190
CTE: CT0357
CPC: Cpar_1683
CCH: Cag_1605
CLI: Clim_0556
PVI: Cvib_0508
PLT: Plut_0460
PPH: Ppha_2208
PAA: Paes_1675
CTS: Ctha_0815
IAL: IALB_1810
MRO: MROS_1908
CPRV: CYPRO_1760
CACI: CLOAM0538
AAE: aq_1794
HTH: HTH_0005
TAL: Thal_0451
TTK: TST_0703
CEX: CSE_04840
MSCH: N508_000104(ymdB)
DTU: Dtur_0799
NDE: NIDE3722
NJA: NSJP_0480
LFC: LFE_1710
CTHI: THC_1478
MOX: DAMO_1853
 » show all
Reference
  Authors
Diethmaier C, Newman JA, Kovacs AT, Kaever V, Herzberg C, Rodrigues C, Boonstra M, Kuipers OP, Lewis RJ, Stulke J
  Title
The YmdB phosphodiesterase is a global regulator of late adaptive responses in Bacillus subtilis.
  Journal
J Bacteriol 196:265-75 (2014)
DOI:10.1128/JB.00826-13
  Sequence
[bsu:BSU16970]
Reference
  Authors
Mamou G, Malli Mohan GB, Rouvinski A, Rosenberg A, Ben-Yehuda S
  Title
Early Developmental Program Shapes Colony Morphology in Bacteria.
  Journal
Cell Rep 14:1850-7 (2016)
DOI:10.1016/j.celrep.2016.01.071
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system