KEGG   ORTHOLOGY: K06915
Entry
K06915                      KO                                     
Symbol
herA
Name
DNA double-strand break repair helicase HerA and related ATPase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K06915  herA; DNA double-strand break repair helicase HerA and related ATPase
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    Archaeal homologous recombinant proteins
     K06915  herA; DNA double-strand break repair helicase HerA and related ATPase
Other DBs
COG: COG0433
Genes
ECO: b4263(yjgR)
ECJ: JW4220(yjgR)
ECD: ECDH10B_4456(yjgR)
EBW: BWG_3969(yjgR)
ECOK: ECMDS42_3702(yjgR)
ECOC: C3026_22995
ECE: Z5875(yjgR)
ECS: ECs_5240(yjgR)
ECF: ECH74115_5785
ETW: ECSP_5364(yjgR)
EOI: ECO111_5147(yjgR)
EOJ: ECO26_5433(yjgR)
EOH: ECO103_5059(yjgR)
ESL: O3K_22325
ESO: O3O_03070
ESM: O3M_22220
ECK: EC55989_4821(yjgR)
ECG: E2348C_4587(yjgR)
EOK: G2583_5093(yjgR)
ELH: ETEC_4609
ECP: ECP_4512
ECOS: EC958_4758(yjgR)
ECV: APECO1_2131(yjgR)
ECY: ECSE_4569
ECR: ECIAI1_4494(yjgR)
ECQ: ECED1_5116(yjgR)
EUM: ECUMN_4795(yjgR)
ECT: ECIAI39_4736(yjgR)
EOC: CE10_5009(yjgR)
EBR: ECB_04129(yjgR)
EBL: ECD_04129(yjgR)
EBE: B21_04093(yjgR)
EBD: ECBD_3773
ECI: UTI89_C4870(yjgR)
ECZ: ECS88_4850(yjgR)
ECC: c5364(yjgR)
ESE: ECSF_4151
EKF: KO11_22955(yjgR)
EAB: ECABU_c48280(yjgR)
EDJ: ECDH1ME8569_4117(yjgR)
ELW: ECW_m4623(yjgR)
ELL: WFL_22515(yjgR)
ELC: i14_4867(yjgR)
ELD: i02_4867(yjgR)
ELF: LF82_3476(yjgR)
ECOJ: P423_23730
EFE: EFER_3113(yjgR)
SFL: SF4226(yjgR)
SFX: S4487(yjgR)
SFV: SFV_4230(yjgR)
SFE: SFxv_4608
SFN: SFy_6066
SFS: SFyv_6136
SSN: SSON_4448(yjgR)
SBO: SBO_4177(yjgR)
SDY: SDY_4287(yjgR)
ENC: ECL_04600
ECLX: LI66_20155
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KPN: KPN_04668(yjgR)
KPU: KP1_0550(yjgR)
KPP: A79E_4529
KPR: KPR_0645(yjgR)
KPJ: N559_4622
KPNU: LI86_23765
KPNK: BN49_4769(yjgR)
KVA: Kvar_4586
KPE: KPK_4999
KOX: KOX_09350
KOE: A225_0546
EAE: EAE_09785
EAR: CCG32080
CRO: ROD_33291
CKO: CKO_03535
CAMA: F384_17000
EBT: EBL_c34850(yjgR)
EBF: D782_3969
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YPE: YPO0168
YPK: y3952
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YPS: YPTB3733
YPO: BZ17_2854
YPY: YPK_0243
YPB: YPTS_3926
YPQ: DJ40_2663
YPU: BZ21_3065
YPR: BZ20_2362
YPC: BZ23_3353
YPF: BZ19_3214
YEN: YE3959
YEY: Y11_32511
YEW: CH47_3773
YET: CH48_1401
YAL: AT01_2718
YFR: AW19_3500
YIN: CH53_1525
YKR: CH54_2289
YRO: CH64_2375
SMAR: SM39_4032
SPE: Spro_4584
SRL: SOD_c43850(yjgR)
SPLY: Q5A_023870
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SERF: L085_02945
RAA: Q7S_01390
EAM: EAMY_0380(yjgR)
EAY: EAM_3039
ETA: ETA_03750(yjgR)
EPY: EpC_03880(yjgR)
EPR: EPYR_00406(yjgR)
EBI: EbC_39620(yjgR)
ERJ: EJP617_15520(yjgR)
PAM: PANA_0514(yjgR)
PLF: PANA5342_3785(yjgR)
PAJ: PAJ_3659(yjgR)
PVA: Pvag_3735(yjgR)
HDU: HD_1601
HPAZ: K756_04655
HPAS: JL26_04160
HPAK: JT17_01720
PMU: PM1435
PMV: PMCN06_1694(yjgR)
PMP: Pmu_16870(yjgR)
PMUL: DR93_290
PDAG: 4362423_01749(yjgR)
MSU: MS0034
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MHAE: F382_02735
MHAM: J450_02195
MHAO: J451_03040
MHAL: N220_08830
MHAQ: WC39_05050
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MVE: X875_9060
APL: APL_0562
APJ: APJL_0551
APA: APP7_0603
ASU: Asuc_0344
AAT: D11S_0670
AAN: D7S_01000
AACN: AANUM_0732
BTO: WQG_12450
BTRE: F542_9590
BTRH: F543_10940
BTRA: F544_12830
RPNE: NCTC8284_00118(yjgR_1)
PAET: NCTC13378_02063(yjgR)
XCC: XCC2558
XCB: XC_1560
XCP: XCR_2893
XCV: XCV2882
XAX: XACM_2671
XAC: XAC2730
XOM: XOO3094(XOO3094)
XOO: XOO3267
XOP: PXO_01254
XOR: XOC_2967
XPH: XppCFBP6546_22245(XppCFBP6546P_22245)
SML: Smlt3435
SMT: Smal_2862
SMZ: SMD_3011
PSUW: WQ53_01760
LEZ: GLE_2128
LEM: LEN_2904
DKO: I596_1665
PAE: PA4308
PAEV: N297_4449
PAEI: N296_4449
PAU: PA14_55980(yjgR)
PNC: NCGM2_1299(yjgR)
PAEB: NCGM1900_2133(yjgR)
PAEP: PA1S_23425
PAEM: U769_23210
PAEG: AI22_10630
PAEC: M802_4447
PAEO: M801_4315
PMY: Pmen_3308
PMK: MDS_3635
PPSE: BN5_1154
PPU: PP_1372
PPF: Pput_4351
PPT: PPS_4283
PPI: YSA_02919
PPX: T1E_0226(yjgR)
PPUH: B479_21540
PPUT: L483_26605
PPUN: PP4_09200
PPUD: DW66_4671
PMON: X969_21085
PMOT: X970_20720
PVD: CFBP1590__1257(yjgR)
PAST: N015_21235
PFL: PFL_4783
PPRO: PPC_4791
PFS: PFLU_4935
PFB: VO64_1787
PMAN: OU5_4854
PEN: PSEEN1155
PKC: PKB_4486(yjgR)
PCHP: C4K32_4885
PSES: PSCI_2944
PSEM: TO66_24470
PSEC: CCOS191_4280(yjgR)
PSOS: POS17_4759
PANR: A7J50_4704
PSET: THL1_1296
PSIL: PMA3_23345
PALL: UYA_17395
PDW: BV82_4567
PSEP: C4K39_4843
PSOA: PSm6_33790
PSA: PST_1167
PSTT: CH92_05160
MARJ: MARI_07800
ACB: A1S_3084
ABY: ABAYE0404
ABN: AB57_3534
ABX: ABK1_3332
ABH: M3Q_3514
ABAD: ABD1_29700
ABAZ: P795_1995
ABAU: IX87_12155
ABAA: IX88_00185
ACC: BDGL_002545(yjgR)
ACI: ACIAD3223
AGU: AS4_39200
AUG: URS_0594
AVB: RYU24_04470(yjgR)
ABOU: ACBO_03880(yjgR)
SON: SO_0459
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SBL: Sbal_0435
CJA: CJA_1322
CBU: CBU_1027
CBD: CBUD_1018
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LPN: lpg0269
LPH: LPV_0361(yjgR)
LPO: LPO_0318(yjgR)
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LPF: lpl0321
LPP: lpp0343
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LPE: lp12_0272
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LHA: LHA_0398
TMC: LMI_0495
METL: U737_03690
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MSZE: MSZNOR_3993(yjgR)
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TNI: TVNIR_1178(yjgR_[H])
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KKO: Kkor_0007
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KKI: KKKWG1_1309(yjgR)
RSO: RSc2189
RSE: F504_2146
RPI: Rpic_2387
REH: H16_A0917(h16_A0917)
RME: Rmet_0786(yjgR)
CGD: CR3_0747(yjgR)
PPNO: DA70_21900
PPNM: LV28_08405
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PAPI: SG18_02820
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BPC: BPTD_2266
BPER: BN118_0761
BPET: B1917_2215
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BBR: BB1872
BPT: Bpet3098
BHO: D560_0024
BHM: D558_0027
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AJS: Ajs_1897
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RTA: Rta_21210
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HPSE: HPF_13440
CBAA: SRAA_2348(yjgR)
CBAB: SMCB_2362(yjgR)
MPT: Mpe_A1336
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HAR: HEAR0562
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CARE: LT85_1197
TIN: Tint_0881
THI: THI_1134
NEU: NE1263
NET: Neut_1941
DOE: DENOEST_3415(yjgR)
TBD: Tbd_2221
MFA: Mfla_1668
MMB: Mmol_1010
MEH: M301_1216
MEP: MPQ_1577
SLT: Slit_2315
NIM: W01_22710
NARC: NTG6680_2695(yjgR)
SEME: MIZ01_2053
SDR: SCD_n00428(yjgR)
SLAC: SKTS_06870
DSU: Dsui_0490
EBA: ebA1881
ABRE: pbN1_24950
APET: ToN1_30140
DAR: Daro_4068
AZO: azo0576
AOA: dqs_0646
AZA: AZKH_0536
TCL: Tchl_0458
MLO: mlr7622
MHUA: MCHK_1088
MES: Meso_0858
AMIS: Amn_17260
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SMD: Smed_0578
SFD: USDA257_c06930(yjgR)
EAD: OV14_1944
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AVI: Avi_1204
RLE: RL1311
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BME: BMEI1370
BMEL: DK63_32
BMEE: DK62_838
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BABO: DK55_590
BABR: DO74_1298
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BABU: DK53_579
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BABC: DO78_497
BMS: BR0563
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BOV: BOV_0564
BCAR: DK60_640
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BMR: BMI_I562
BPP: BPI_I598
BPV: DK65_795
OAN: Oant_2697
OAH: DR92_2179
BJA: blr3062(blr3062)
BRA: BRADO2688
BBT: BBta_3029
BRS: S23_49350
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BRAD: BF49_1628
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RPD: RPD_1936
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KVU: EIO_1077
KRO: BVG79_00843(yjgR)
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LAQU: R2C4_08530
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SGI: SGRAN_3744(yjgR)
SPHU: SPPYR_3233(yjgR)
SWI: Swit_3542
SPHD: HY78_06570
SPHM: G432_09740
STAX: MC45_08350
SPHI: TS85_21270
SSAN: NX02_28535
SPKC: KC8_12040
SECH: B18_14825
SINB: SIDU_09115
SPMI: K663_03790
SPHT: K426_17570
BLAS: BSY18_3029
SMIC: SmB9_05910
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AAY: WYH_02080
ELI: ELI_11935
SHUM: STHU_41740
STEL: STAQ_06840
MGRY: MSR1_23550
GME: Gmet_0767
GLO: Glov_0088
PPD: Ppro_0732
DEU: DBW_2237
DEP: AOP6_2866
DBA: Dbac_0236
DSF: UWK_00605
DALK: DSCA_14350
SAT: SYN_00674
SFU: Sfum_3727
ADE: Adeh_0089
AORY: AMOR_26080
MAI: MICA_389
MAN: A11S_375
MCL: MCCL_1632
MCAK: MCCS_20880
SPY: SPy_0500
SPYA: A20_0456(yjgR)
SPS: SPs1505
SPF: SpyM51459
SPYH: L897_02240
SSI: SSU0250
SUP: YYK_01170
SSUY: YB51_1345
SSUT: TL13_0296
SSUI: T15_0257
SUB: SUB0520
SDS: SDEG_0534
SDA: GGS_0509
SDC: SDSE_0563
STK: STP_0324
SCF: Spaf_0709
SIK: K710_1465
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LCS: LCBD_1441
LCE: LC2W_1409
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BHU: bhn_I1022
CBAR: PATL70BA_1119(yjgR)
FMA: FMG_0284
ERH: ERH_1121
AEQ: AEQU_2136
CBAC: JI75_05105
MTU: Rv2510c
MTC: MT2585
MRA: MRA_2536
MTUR: CFBS_2659
MTD: UDA_2510c
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MTUL: TBHG_02447
MTUT: HKBT1_2650
MTUU: HKBT2_2653
MBB: BCG_2530c
MBT: JTY_2524
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NDV: NDEV_1226
CCAI: NAS2_0820
KCR: Kcr_0028
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Reference
  Authors
Blackwood JK, Rzechorzek NJ, Abrams AS, Maman JD, Pellegrini L, Robinson NP
  Title
Structural and functional insights into DNA-end processing by the archaeal HerA helicase-NurA nuclease complex.
  Journal
Nucleic Acids Res 40:3183-96 (2012)
DOI:10.1093/nar/gkr1157
  Sequence
[sso:SSO2251]
Reference
  Authors
Rzechorzek NJ, Blackwood JK, Bray SM, Maman JD, Pellegrini L, Robinson NP
  Title
Structure of the hexameric HerA ATPase reveals a mechanism of translocation-coupled DNA-end processing in archaea.
  Journal
Nat Commun 5:5506 (2014)
DOI:10.1038/ncomms6506
  Sequence
[sso:SSO2251]
LinkDB

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