KEGG   ORTHOLOGY: K03051
Entry
K03051                      KO                                     
Symbol
rpoF
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit F [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03051  rpoF; DNA-directed RNA polymerase subunit F
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03051  rpoF; DNA-directed RNA polymerase subunit F
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03051  rpoF; DNA-directed RNA polymerase subunit F
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03051  rpoF; DNA-directed RNA polymerase subunit F
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03051
Other DBs
COG: COG1460
GO: 0003899
Genes
SKT: IGS68_35105
DTP: JZK55_01140
MJA: MJ_0039
MFE: Mefer_0570
MVU: Metvu_1545
MFS: MFS40622_0940
MIF: Metin_1076
MJH: JH146_1545
MESG: MLAUSG7_1330
MESA: MLASG1_0874
MIG: Metig_0653
MMP: MMP0092(rpoF)
MMQ: MmarC5_1584
MMX: MmarC6_0855
MMZ: MmarC7_1091
MMD: GYY_00470
MMAK: MMKA1_00970(rpoF)
MMAO: MMOS7_01220(rpoF)
MMAD: MMJJ_10020
MAE: Maeo_0056
MVN: Mevan_1104
MVO: Mvol_1445
MOK: Metok_0971
METF: CFE53_03820
MTH: MTH_1324
MMG: MTBMA_c17100
MWO: MWSIV6_1713
MTEE: MTTB_01180
METC: MTCT_1201
METE: tca_01278
METZ: METMT2_1316
METK: FVF72_04955
MTHM: FZP57_08390
METJ: FZP68_02380
MST: Msp_1543
METB: AW729_07555
MEIS: PXD04_03490
MRU: mru_0161(rpoF)
MSI: Msm_1376
MEB: Abm4_1659(rpoF)
MMIL: sm9_2209(rpoF)
MEYE: TL18_00785
MOL: YLM1_1516
MARO: MarbSA_13210
METV: K4897_04430
MEL: Metbo_0193
MEW: MSWAN_2289
METH: MBMB1_1935
MFC: BRM9_2275(rpoF)
MFI: DSM1535_1209
MCUB: MCBB_2213
MSUB: BK009_08860
METN: BK008_04500
METT: CIT01_04840
METO: CIT02_07855
MEME: HYG87_05835
MFEG: GCM10025860_05880
MFV: Mfer_1008
MKA: MK1659
AFU: AF_1530
AFG: AFULGI_00017840
APO: Arcpr_1233
AVE: Arcve_0383
AST: Asulf_00573
FPL: Ferp_0275
GAC: GACE_1387
GAH: GAH_01075
PFU: PF1036
PFI: PFC_04415
PHO: PH1127(PH1127)
PAB: PAB0732
PYN: PNA2_1782
PYA: PYCH_05990
PYS: Py04_0953
PYC: TQ32_06085
TKO: TK0901
TON: TON_0407
TGA: TGAM_0906(rpoF)
TSI: TSIB_0604
TBA: TERMP_00393
THE: GQS_03175
THA: TAM4_823
THM: CL1_0282
TLT: OCC_04555
THS: TES1_0457
TNU: BD01_0299
TEU: TEU_07220
TGY: X802_08155
THV: ADU37_CDS05530
TCH: CHITON_1466
TPEP: A0127_00585
TPIE: A7C91_08045
TGG: A3K92_04435
TCE: A3L02_09315
TBS: A3L01_02730
THH: CDI07_02685
TSL: A3L11_06685
TTD: A3L14_04290
TPRF: A3L09_08210
TRL: A3L10_03850
TPAF: A3L08_05725
THY: A3L12_06020
TCQ: TIRI35C_0774
THEM: FPV09_04115
THEI: K1720_06090
PPAC: PAP_03520
MBA: Mbar_A3232
MBY: MSBRM_1394
MBW: MSBRW_1499
MBAR: MSBR2_1013
MBAK: MSBR3_0434
MAC: MA_1444
MMA: MM_2537
MMAZ: MmTuc01_2591
MMJ: MSMAS_2167
MMAC: MSMAC_2286
MVC: MSVAZ_2178
MEK: MSKOL_2171
MLS: MSLAZ_0886
METM: MSMTP_2026
MEF: MSWH1_1373
MEQ: MSWHS_3211
MSJ: MSSAC_1499
MSZ: MSSIH_1460
MSW: MSSIT_1516
MTHR: MSTHT_0615
MTHE: MSTHC_0105
MHOR: MSHOH_2774
MFZ: AOB57_013840
MBU: Mbur_0904(rpoF)
MMET: MCMEM_1264
MELO: J7W08_04940
MMH: Mmah_1030
MHAZ: BHR79_08420
MPOT: BKM01_04670
MEV: Metev_1631
MZH: Mzhil_1271
MPY: Mpsy_2774
MZI: HWN40_08780
MMAV: RE476_01385
MSEB: RE474_11075
MHZ: Metho_0718
MEHF: MmiHf6_08030
MEES: MmiEs2_02120
MTP: Mthe_0994
MCJ: MCON_2752(rpoF)
MHI: Mhar_0817
MHU: Mhun_3027
MRTJ: KHC33_01760
MLA: Mlab_1569
MEM: Memar_1960
MBG: BN140_0306(rpoF)
MEMA: MMAB1_0384(rpoF)
MCHK: MchiMG62_22720
MSUM: OH143_04055
MRC: R6Y96_00140
MPI: Mpet_1858
MEND: L6E24_01105
MEFW: F1737_03125
MAQE: RJ40_04095
MFK: E2N92_04260
MOU: OU421_09775
MESB: L1S32_00980
MANQ: L1994_03975
MBN: Mboo_1873
MFO: Metfor_1113
MESK: METHP_01342
MPL: Mpal_0548
MPD: MCP_0724
MEZ: Mtc_2249(rpoF)
RCI: RCIX2350(rpoF)
MJK: N2V74_02040 N2V74_03820
HAL: VNG_1169C
HSL: OE_2678R(rpoF)
HANR: LJ422_04775
HDL: HALDL1_11815
HHB: Hhub_2791(rpoF)
HAGS: JT689_06080
HABO: JRZ79_04545
HNO: LT974_10840
HLU: LT972_04535
HALH: HTSR_0746(rpoF)
HHSR: HSR6_0772(rpoF)
HSU: HLASF_1661(rpoF)
HSF: HLASA_1648(rpoF)
HAHS: HSRCO_2016(rpo4)
SALR: FQU85_08220
HALR: EFA46_010180
HJE: HacjB3_08615
HDO: MUK72_09540
HALX: M0R89_16105
HAXZ: M0R88_16450
HAYC: NGM10_14685
HAXY: NGM07_03290
SALI: L593_01405
SAIM: K0C01_01500
HARA: AArcS_1505(rpo4)
HMA: rrnAC0259(rpb4)
HHI: HAH_1003(rpoF)
HHN: HISP_05160
HAB: SG26_12830
HTA: BVU17_04905
HALJ: G9465_09575
HSIN: KDQ40_08485
NPH: NP_3682A(rpoF)
NMO: Nmlp_2732(rpoF)
NHO: HWV23_01000
NSAL: HWV07_02480
HUT: Huta_0623
HTI: HTIA_0370
HALA: Hrd1104_02495
HASV: SVXHr_1971(rpoF)
HABN: HBNXHr_1958(rpoF)
HMU: Hmuk_2673
HALZ: E5139_00655
HALL: LC1Hm_2020(rpoF)
HAZP: GBQ70_00655
HALI: BV210_01370
HSN: DV733_04935
HDS: HSR122_0031(rpo4)
HRR: HZS55_18895
HPEL: HZS54_22335
HLT: I7X12_16485
HARC: HARCEL1_11180
SSAI: N0B31_05850
HAAD: MW046_01465
HWA: HQ_2895A(rpoF)
HWC: Hqrw_3295(rpoF)
HVO: HVO_2748(rpoF)
HALE: G3A49_17430
HLN: SVXHx_1853(rpoF)
HME: HFX_2759(rpoF)
HGI: ABY42_13765
HLS: KU306_14815
HBO: Hbor_12160
HAQ: DU484_12895
HAJ: DU500_13010
HAER: DU502_10135
HRA: EI982_02160
HLM: DV707_05495
HALM: FCF25_05175
HLA: Hlac_2278
HALP: DOS48_11445
HALB: EKH57_13850
HEZZ: EO776_12535
HALQ: Hrr1229_009540
HSS: J7656_03790
HSAI: HPS36_09110
HAZZ: KI388_11080
SRUB: C2R22_12430
HAE: halTADL_0184
HALN: B4589_005475
HALG: HUG10_03055
HALU: HUG12_13815
HMP: K6T50_01495
HRE: K6T36_01295
HRM: K6T25_00035
HACB: Hbl1158_08400
HDF: AArcSl_0985(rpoF)
HAH: Halar_1831
HTU: Htur_2389
HSAL: JMJ58_16925
HAKZ: J0X25_00900
NMG: Nmag_1097(rpoF)
HXA: Halxa_4073
NAT: NJ7G_1168
NPE: Natpe_1417
NVR: FEJ81_07450
NPL: FGF80_03390
NAY: HYG81_03120
HALY: HYG82_05025
HJT: DVR14_16255 DVR14_20375
HLO: J0X27_03580
NGE: Natgr_2148
HRU: Halru_1382
SAWL: NGM29_13510
HALV: NGM15_04910
NOU: Natoc_2592
HLR: HALLA_14230
HLC: CHINAEXTREME09995
NAJ: B1756_13620
NAG: AArcMg_2689
NAN: AArc1_1016
NARA: QQ977_09620
NBG: DV706_11270
NAS: GCU68_00875
HDA: BB347_08390
NAC: AQV86_04145
MELU: MTLP_04340
MEAM: MU439_05655
MEAE: QEN48_04505
TAC: Ta1298
TVO: TVG0322900(TVG0322900)
PTO: PTO0388
CDIV: CPM_0337
TAR: TALC_01428
MAX: MMALV_15380
MER: MMINT_13760
MEAR: Mpt1_c01070
MEUZ: KRP56_07400
MARC: AR505_0134
ABI: Aboo_0764
ACF: AciM339_0302
APE: APE_0549.1(rpoF)
ACJ: ACAM_0421(rpoF)
SMR: Smar_0776
SHC: Shell_0021
IHO: Igni_0988
TAG: Tagg_0029
PFM: Pyrfu_0168
PDL: Pyrde_0528
SAI: Saci_0625(rpoF)
SULL: EWF20_03600
MSE: Msed_0062
MEMJ: MJ1HA_0160
MCN: Mcup_1994
MHK: DFR87_06660
MPRU: DFR88_06355
MTEN: GWK48_05465
MJN: MjAS7_0652
AHO: Ahos_0816
AAMB: D1866_11955
ACIH: HS5_21900
CSTY: KN1_19040
SAHS: HS7_06970
PAI: PAE3335
PIS: Pisl_0579
PCL: Pcal_0432
PAS: Pars_1749
PYR: P186_1282
POG: Pogu_0383
PYW: PYWP30_01638
CMA: Cmaq_1982
TTN: TTX_2080(rpoF)
TUZ: TUZN_1390
VDI: Vdis_0541
VMO: VMUT_1216
TPE: Tpen_0352
THB: N186_02780
TCB: TCARB_1624
THF: MA03_08220
THEL: IG193_05810
KCR: Kcr_1593
NEQ: NEQ411
FLT: Sv326_1182
MIY: Micr_00848
NCON: LC1Nh_0440(rpoF)
NOCC: SVXNc_0405(rpoF)
WAR: HYS32_03060
PSYT: DSAG12_00891
AGW: QT03_C0001G0520
ARG: QT11_C0001G0842
 » show all
Reference
PMID:10400604 (M.thermoautotrophicum)
  Authors
Darcy TJ, Hausner W, Awery DE, Edwards AM, Thomm M, Reeve JN
  Title
Methanobacterium thermoautotrophicum RNA polymerase and transcription in vitro.
  Journal
J Bacteriol 181:4424-9 (1999)
DOI:10.1128/JB.181.14.4424-4429.1999
Reference
PMID:19880312
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system