KEGG   ORTHOLOGY: K19119
Entry
K19119                      KO                                     
Symbol
cas5d
Name
CRISPR-associated protein Cas5d
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19119  cas5d; CRISPR-associated protein Cas5d
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-C factors
    K19119  cas5d; CRISPR-associated protein Cas5d
Genes
DDD: Dda3937_02858
DDQ: DDI_1269
HAY: C3V42_05445(cas5c)
HSEM: L3077_03260(cas5c)
GLE: CJD39_01175(cas5c)
MSU: MS0988
BSUN: A4G13_02690
MHT: D648_15280(cas5c)
MHQ: D650_13810(cas5c)
MHAT: B824_16040(cas5c)
MHX: MHH_c16440(cas5)
MHAE: F382_02570
MHAM: J450_02065
MHAO: J451_02865
MHAL: N220_05430
MHAQ: WC39_05210
MHAY: VK67_05215
MVE: X875_6930
MPEG: HV560_08250(cas5c)
ASU: Asuc_1285
APOR: DDU33_05735(cas5c)
AART: NYR89_02860(cas5c)
AGK: NYR60_02580(cas5c)
BTO: WQG_14090
BTRE: F542_7950
BTRH: F543_9200
RHAE: IHV77_01100(cas5c)
XAC: XAC3838
XOM: XOO0797(XOO0797)
XOO: XOO0871
XOP: PXO_02700(cas5d)
XAL: XALC_2887
XVA: C7V42_19725(cas5c)
XHY: FZ025_06735(cas5c)
XCZ: EBN15_17095(cas5c)
XTH: G4Q83_19900(cas5c)
PSD: DSC_15240
DKO: I596_2484
LANH: KR767_04545(cas5c)
TAMN: N4264_21590(cas5c)
VAQ: FIV01_05805(cas1)
VNV: IF132_10385(cas5c)
PSA: PST_3746
AVN: Avin_31620(cas5d)
AVL: AvCA_31620(cas5d)
AVD: AvCA6_31620(cas5d)
PSYA: AOT82_970
PMAZ: R5H13_23415(cas5c)
PAEW: KIH87_07305(cas5)
FES: HER31_02025(cas5c)
CJA: CJA_2456
TTU: TERTU_3118(cas5d)
MBRG: PVT68_07405(cas5c)
MCA: MCA0656
METU: GNH96_05920(cas5c)
MRP: NM686_011840(cas5c)
MBUR: EQU24_10885(cas5c)
MMAI: sS8_2090
MSZE: MSZNOR_4860(cas5d)
MMOB: F6R98_05430(cas5c)
TMH: JX580_01340(cas5c)
TLO: J9253_05015(cas5c)
TANI: J8380_12735(cas5c)
TWN: L2Y54_13405(cas5c)
TDU: QJT80_01080(cas5c)
NHL: Nhal_1942
NWR: E3U44_12640(cas5c)
THIP: N838_13100(cas5c)
CJAP: GWK36_08020(cas5c)
TFRI: Thiofri_02332(cas5)
TWG: Thiowin_01401(cas5)
EPS: L0Y14_10010(cas5c)
HCH: HCH_02814
HAHH: O5O45_12665(cas5c)
CCAG: SR908_06970(cas5c)
HHH: CLM76_12635(cas5c)
HALW: B6N23_11090(cas5c)
HTT: HZS52_13755(cas5c)
TOL: TOL_2236
MGEO: CFI10_16470(cas5c)
EEI: NX720_18730(cas5c)
NLA: NLA_7340
NSI: A6J88_08875(cas5c)
NMJ: NM96_03465(cas5c)
NEI: BG910_09495(cas5c)
NEK: CGZ77_00805(cas5c)
NFV: FAH67_02755(cas5c)
NSF: FAH66_02870(cas5c)
NBL: GJV52_08255(cas5c)
NWD: H3L96_00065(cas5c)
NSG: H3L94_07185(cas5c)
NSC: J7445_05180(cas5c)
NWX: CGZ65_10470(cas5c)
NDU: LVJ88_11485(cas5c)
NAW: LVJ86_10835(cas5c)
NMB: MON40_08850(cas5c)
NLS: PJU73_04165(cas5c)
KOA: H3L93_01465(cas5c)
AFF: H3L97_07270(cas5c)
CKH: LVJ77_05235(cas5c)
MCER: MON37_04230(cas5c)
USU: LVJ78_08905(cas5c)
CVI: CV_1225
CHRB: DK843_01195(cas5c)
CKS: H9L41_09040(cas5c)
CABA: SBC2_01090(cas5d)
ACHR: C2U31_01395(cas5c)
TEA: KUI_0229
OUE: I6G29_04970(cas5c)
RFR: Rfer_3902
ACRA: BSY15_1472(cas5)
AAA: Acav_3870
DLA: I6G47_12650(cas5c)
RTA: Rta_34700
OTD: J1M35_02180(cas5c)
MELA: C6568_09065(cas5c)
MJE: LVC68_16800(cas5c)
CBAA: SRAA_1390
ATER: MW290_08735(cas5c)
LCH: Lcho_1160
JAJ: EKL02_13560(cas5c)
OAL: NB647_05960(cas5c)
NPV: OHM77_01605(cas5c)
MFA: Mfla_0602
NIM: W01_03110(Cas5)
NARC: NTG6680_1334(cas5d)
EBA: ebA3290
AZR: CJ010_02260(cas5c)
THAU: C4PIVTH_1058(cas5d)
TCL: Tchl_1458
THK: CCZ27_11475(cas5c)
NWI: Nwi_1940
MET: M446_1724
MNO: Mnod_0797
MICO: GDR74_04890(cas5c)
RVA: Rvan_1216
RLAC: QMO75_02320(cas5c)
MPAR: F7D14_11820(cas5c)
THD: BHV28_05910(cas5)
SIW: GH266_09205(cas5c)
KVL: KVU_1368
KVU: EIO_1911
CEH: CEW89_10215(cas5c)
PAMN: JCM7685_2867(cas5)
GFU: KM031_15450(cas5c)
MON: G8E03_12575(cas5c)
HDH: G5B40_15215(cas5c)
ZMN: Za10_1899
SDON: M9980_12245(cas5c)
SSY: SLG_17390
SPZR: G5C33_10940(cas5c)
GDI: GDI0063
GDJ: Gdia_1629
APOM: CPF11_03355(cas5c)
ACET: DS739_04320(cas5c)
ROS: CTJ15_13960(cas5c)
RMUC: FOB66_05235(cas5c)
RCV: PFY06_10155(cas5c)
ACIM: GT370_10590(cas5c)
AZM: DM194_12285(cas5c)
AOZ: HUE56_15130(cas5c)
AARE: D3093_11935(cas5c)
NCB: C0V82_20455(cas5c)
SKT: IGS68_19125(cas5c)
RRU: Rru_A0829
RRF: F11_04275
MAGQ: MGMAQ_2141
TMO: TMO_c0388
MGM: Mmc1_3520
GME: Gmet_1065(cas5d)
GEF: FO488_05635(cas5c)
GEO: Geob_3415(cas5d)
TAMM: GEAMG1_0910(cas5d)
GHC: L9S41_08375(cas5c)
DEU: DBW_1330(cas5)
DSB: LN040_05230(cas5c)
DMA: DMR_14360
DCB: C3Y92_07090(cas5c)
DMS: E8L03_15655(cas5c)
PSEL: GM415_02410(cas5c)
PTHE: LF599_04020(cas5c)
DVU: DVUA0130
DVL: Dvul_2977
DVM: DvMF_1972
DESU: NLA06_07210(cas5c)
DSF: UWK_03531
DOG: HP555_09960(cas5c)
DDU: GF1_28770
ECOM: QTN59_04575(cas5c)
DALK: DSCA_16080
DMM: dnm_098900(cas5c-1) dnm_098950(cas5c-2)
SAT: SYN_02477
DBR: Deba_1658
MXA: MXAN_7019
MYX: QEG98_39280(cas5c)
DHR: LGS26_03065(cas5c)
BTHI: BTK_32091
BTM: MC28_F267
BACA: FAY30_02670(cas5c)
BAQU: K6959_06505(cas5c)
BCAO: LC087_01190(cas5c)
BHA: BH0337
BCL: ABC3596
CSPG: LS684_10675(cas5c)
GEA: GARCT_02509(cas5)
LSP: Bsph_p119
LAGR: FJQ98_11675(cas5c)
LMAC: I6G82_06560(cas5c)
LLB: R6U77_15300(cas5c)
HAMY: MUO15_09015(cas5c)
VNT: OLD84_04830(cas5c)
SCIA: HUG15_03845(cas5c)
BCOA: BF29_1602 BF29_1613(cas5) BF29_2895(cas5)
BVJ: I5776_17725(cas5c)
SLMS: MM221_10570(cas5c)
PUK: PU629_19880(cas5c)
MEQU: KFV11_04605(cas5c)
ESI: Exig_0148
EAUR: NMQ00_13500(cas5c)
BAGR: BA6348_25015(cas5c)
BCOP: JD108_08750(cas5c)
BRUM: NDK47_09070(cas5c)
PPOL: X809_10790
PRI: PRIO_1407
PLEN: EIM92_11620(cas5c)
PPRT: ET464_02040(cas5c)
PBAC: HUB98_22210(cas5c)
PLYC: GXP70_26875(cas5c)
PTRI: KDC22_05830(cas5c)
PALR: HGI30_20250(cas5c)
PTHI: NDS46_08800(cas5c)
PDY: QJQ58_13370(cas5c)
PMAE: LMZ02_07000(cas5c) LMZ02_07185(cas5c)
PWN: QNH46_17105(cas5c)
PKP: SK3146_04735(cas5_1) SK3146_04777(cas5_2)
SACA: FFV09_01705(cas5c)
SPOS: DV702_10860(cas5c)
UTH: DKZ56_07905(cas5c)
SPY: SPy_1566
SPYA: A20_1323c(cas5)
SPB: M28_Spy1294(cas5)
SAGI: MSA_5450
SAGP: V193_02510
SAGC: DN94_02510
SAGG: EN73_02670
SMU: SMU_1763c
SMJ: SMULJ23_0380(cas5)
SMUA: SMUFR_1534
SEZ: Sez_0549(cas5)
SEQ: SZO_14420
SEZO: SeseC_00667(cas5)
SEQU: Q426_06535
SDA: GGS_1428
SDC: SDSE_1670
SCP: HMPREF0833_10396(cas5d)
SPEI: EHW89_02015(cas5c)
SRUN: LPB404_05130(cas5c)
LHE: lhv_1622
LHL: LBHH_0545
LCHI: KG086_05235(cas5c)
LZE: KG087_05880(cas5c)
LFE: LAF_1213
LFR: LC40_0788
MPS: MPTP_1687
MPX: MPD5_0371
TKR: C7K43_11785(cas5c)
ALOY: CJ190_005485(cas5c)
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FCT: NRE15_07525(cas5c)
CRW: CROST_016940(cas5d)
CTHD: CDO33_11190(cas5c)
ASF: SFBM_0689
ASM: MOUSESFB_0649(cas5)
ASB: RATSFB_0576(cas5)
HHJ: NQ487_23165(cas5)
CCE: Ccel_1477
RPAY: P0092_07020(cas5c)
ESR: ES1_15630
CCEL: CCDG5_2004(cas5)
RCH: RUM_17630
RUM: CK1_18630
RUS: RBI_II00216(cas5)
RUJ: E5Z56_03350(cas5c)
RGV: NQ502_04800(cas5c) NQ502_06895(cas5c)
FPR: FP2_21270
OBJ: EIO64_01310(cas5c)
CAML: H6X83_01870(cas5) H6X83_09570(cas5c)
CLF: GJQ69_04595(cas5c)
CARL: PXC00_03380(cas5c) PXC00_08755(cas5c)
TMEL: NOG13_07535(cas5c)
CFEM: HCR03_13435(cas5c)
AGAT: RWV98_07875(cas5c)
STH: STH310
SWO: Swol_0476
SLP: Slip_1547
DHD: Dhaf_2183
SGY: Sgly_0902
PTH: PTH_1993
DRM: Dred_1003
DAE: Dtox_3650
THEF: E1B22_11320(cas5c)
CTHM: CFE_0058
CEV: LK421_12400(cas5c)
BLIQ: INP51_02790(cas5c)
BLAR: LC508_15820(cas5c)
CSCI: HDCHBGLK_01982(cas5d)
CSO: CLS_03900
HSD: SD1D_0532
RGN: RGna_16740(cas5c)
RLR: NQ541_08025(cas5c)
CBOL: CGC65_02895(cas5c)
CASP: NQ535_22755(cas5c)
SSUN: H9Q77_13320(cas5c)
QDO: H9Q78_09510(cas5c)
WHJ: H9Q79_00965(cas5c) H9Q79_06625(cas5c)
MFOR: NQ534_09050(cas5c)
ERT: EUR_26440
ERA: ERE_07670
AMIJ: EQM06_09480(cas5c)
AMT: Amet_1663
FAA: HMPREF0389_01170(cas5d)
MTA: Moth_0497
MTHO: MOTHE_c04340(cas5)
MTHZ: MOTHA_c05240(cas5)
PEQU: O6R05_07965(cas5c)
MED: MELS_1994
MEG: DKB62_06425(cas5c)
MMAX: LCQ47_00710(cas5c)
STED: SPTER_37230(cas5d)
EHN: H9Q80_01820(cas5c)
CIU: G4D55_19225(cas5c)
ELE: Elen_1978
CBAC: JI75_00360
MMAM: K3U93_09850(cas5c)
NHU: H0264_18450(cas5c)
SGB: WQO_34340
SANL: KZO11_33995(cas5c)
SSOI: I1A49_15585(cas5c)
SLE: sle_60890(sle_60890)
SALU: DC74_6136
SLX: SLAV_00335(cas1) SLAV_39055(cas2)
SLK: SLUN_01410(cas5c)
SCAL: I6J39_34550(cas5c)
SPRA: CP972_03485(cas5c)
SRUG: F0345_28870(cas5c)
YIA: LO772_16225(cas5c)
SAIU: J4H86_06455(cas5c)
AGRA: AGRA3207_002432(cas5c)
SESP: BN6_20150
ACTI: UA75_13860
ACAD: UA74_13775
AHG: AHOG_12975(cas1)
ACTA: C1701_23035(cas5c)
ACTU: Actkin_04369(cas5)
UME: RM788_43220(cas5c)
DFU: Dfulv_21340(cas5c)
SNA: Snas_3581
GLY: K3N28_15405(cas5c)
BAD: BAD_1185
BDE: BDP_1642(cas5)
BDN: BBDE_1558
BBRU: Bbr_1410
BBRJ: B7017_1614
BBRC: B7019_1597
BBRN: B2258_1389
BBRS: BS27_1433
BTP: D805_0637
BPSC: BBPC_1362
BEU: BE0216_10615(cas5c)
BSUE: BS3272_02820(cas5c)
PDO: PSDT_1099
BAPK: KIMH_13410
WNA: KA717_30500(cas5c)
AFLO: HEQ12_10740(cas5c)
STOQ: K2F26_01665(cas5c)
DMD: dcmb_96
ATM: ANT_12270
DGE: Dgeo_0238
DRD: LMT64_12245(cas5c)
DMB: E5F05_03495(cas5c)
TRA: Trad_1660
TTH: TT_P0133
TBC: A0O31_02381(cas5d)
MRB: Mrub_1488
SLOM: PXH66_20600(cas5c)
AGL: PYTT_2356
AMAK: J5W79_10455(cas5c)
LUO: HHL09_07995(cas5c)
VBS: EGM51_01800(cas5c)
MFF: MFFC18_51590(cas5)
RUV: EC9_25740(cas5)
RLC: K227x_25320(cas5)
SNEP: Enr13x_35790(cas5)
AMUC: Pan181_32300(cas5)
PND: Pla175_17850(cas5)
GIM: F1728_25075(cas5c)
ACAF: CA12_25160(cas5)
ULI: ETAA1_32350(cas5)
PBOR: BSF38_04791(cas5d)
AGV: OJF2_05440(cas5)
BROC: IPI25_05615(cas5)
BPIT: BPIT_07850
JET: L3J17_09415(cas5c)
MCAD: Pan265_24980(cas5)
PBP: STSP1_01047(cas5)
ALUS: STSP2_01884(cas5)
TAER: GT409_09535(cas5c)
TSK: HRI97_12520(cas5c)
ECUL: PVA46_02740(cas5c)
LIL: LA_0688
LIE: LIF_A0559
LIC: LIC_12912
LIS: LIL_13005
LNO: MAL08_14665(cas5c)
LKR: FH602_02805(cas5c)
ACA: ACP_0781
EDA: GWR55_16845(cas5c)
EPO: Epro_1086(cas5)
ETI: RSTT_194(cas5)
RSD: TGRD_216
PYY: RAH42_00170(cas5c) RAH42_11430(cas5c)
BZG: C4H11_01370(cas5c)
PCOP: I6J50_00200(cas5c)
PEND: LA319_01635(cas5c)
PDI: BDI_1179
PARC: CI960_09615(cas5c)
PGOL: K6V26_02750(cas5c)
PII: NF347_01660(cas5c)
CTE: CT1134
CCH: Cag_1009
PVI: Cvib_1301
PLT: Plut_1296
PPH: Ppha_1658
RLO: GQ464_014995(cas5c)
SCHV: BRCON_2349
MLA: Mlab_0849
MRC: R6Y96_04335(cas5c)
MEFW: F1737_08155(cas5c)
MAQE: RJ40_11500(cas5c)
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Reference
  Authors
Punetha A, Sivathanu R, Anand B
  Title
Active site plasticity enables metal-dependent tuning of Cas5d nuclease activity in CRISPR-Cas type I-C system.
  Journal
Nucleic Acids Res 42:3846-56 (2014)
DOI:10.1093/nar/gkt1335
  Sequence
[bha:BH0337]
Reference
  Authors
Nam KH, Haitjema C, Liu X, Ding F, Wang H, DeLisa MP, Ke A
  Title
Cas5d protein processes pre-crRNA and assembles into a cascade-like interference complex in subtype I-C/Dvulg CRISPR-Cas system.
  Journal
Structure 20:1574-84 (2012)
DOI:10.1016/j.str.2012.06.016
  Sequence
[bha:BH0337]
LinkDB

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