KEGG   ORTHOLOGY: K00768
Entry
K00768                      KO                                     
Symbol
E2.4.2.21, cobU, cobT
Name
nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase [EC:2.4.2.21]
Pathway
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map01100  Metabolic pathways
map01240  Biosynthesis of cofactors
Module
M00122  Cobalamin biosynthesis, cobyrinate a,c-diamide => cobalamin
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00860 Porphyrin metabolism
    K00768  E2.4.2.21, cobU, cobT; nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.4  Glycosyltransferases
   2.4.2  Pentosyltransferases
    2.4.2.21  nicotinate-nucleotide---dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
     K00768  E2.4.2.21, cobU, cobT; nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
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VNK: VEIT17_14250(cobT_1) VEIT17_14260(cobT_2) VEIT17_16090(cobT_3) VEIT17_16230(cobT_4)
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PFAC: PFJ30894_01709(cobT_1) PFJ30894_01711(cobT_2)
TSG: HLK68_07605(cobT)
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MRA: MRA_2223(cobT)
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MTUR: CFBS_2336(cobT)
MTO: MTCTRI2_2242(cobT)
MTD: UDA_2207(cobT)
MTN: ERDMAN_2425(cobT)
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MBO: BQ2027_MB2230(cobT)
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MBM: BCGMEX_2210(cobT)
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MCX: BN42_40123(cobT)
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MGI: Mflv_2942
MPHL: MPHLCCUG_03339(cobT)
MVQ: MYVA_3519(cobT)
MTHN: 4412656_01830(cobT)
MHAS: MHAS_01500(cobT)
MDU: MDUV_08600(cobT)
MCHT: MCHIJ_34240(cobT)
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MMAG: MMAD_34720(cobT)
MMOR: MMOR_30160(cobT)
MFX: MFAL_12840(cobT)
MAIC: MAIC_33520(cobT)
MIJ: MINS_31790(cobT)
MALV: MALV_02820(cobT)
MTY: MTOK_55230(cobT)
MPSC: MPSYJ_30870(cobT)
MARZ: MARA_04910(cobT)
MGAD: MGAD_04270(cobT)
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MANY: MANY_18400(cobT)
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CPG: CP316_07375(cobT)
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CPK: CP1002_05935(cobT)
CPQ: CPC231_07215(cobT)
CPX: CPI19_04305(cobT)
CPZ: CpPAT10_1427(cobT)
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MEAM: MU439_06335(cobT)
AG: AAA25788(cobU)
 » show all
Reference
PMID:7883701
  Authors
Chen P, Ailion M, Weyand N, Roth J
  Title
The end of the cob operon: evidence that the last gene (cobT) catalyzes synthesis of the lower ligand of vitamin B12, dimethylbenzimidazole.
  Journal
J Bacteriol 177:1461-9 (1995)
DOI:10.1128/jb.177.6.1461-1469.1995
  Sequence
[stm:STM2016]
Reference
  Authors
Cheong CG, Bauer CB, Brushaber KR, Escalante-Semerena JC, Rayment I
  Title
Three-dimensional structure of the L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase (CobD) enzyme from Salmonella enterica.
  Journal
Biochemistry 41:4798-808 (2002)
DOI:10.1021/bi012111w
LinkDB

KEGG   ENZYME: 2.4.2.21
Entry
EC 2.4.2.21                 Enzyme                                 
Name
nicotinate-nucleotide---dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase;
nicotinate mononucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase;
nicotinate ribonucleotide:benzimidazole (adenine) phosphoribosyltransferase;
nicotinate-nucleotide:dimethylbenzimidazole phospho-D-ribosyltransferase;
CobT;
nicotinate mononucleotide (NaMN):5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Class
Transferases;
Glycosyltransferases;
Pentosyltransferases
Sysname
nicotinate-nucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phospho-D-ribosyltransferase
Reaction(IUBMB)
beta-nicotinate D-ribonucleotide + 5,6-dimethylbenzimidazole = nicotinate + alpha-ribazole 5'-phosphate [RN:R04148]
Reaction(KEGG)
R04148
Substrate
beta-nicotinate D-ribonucleotide [CPD:C01185];
5,6-dimethylbenzimidazole [CPD:C03114]
Product
nicotinate [CPD:C00253];
alpha-ribazole 5'-phosphate [CPD:C04778]
Comment
Also acts on benzimidazole, and the clostridial enzyme acts on adenine to form 7-alpha-D-ribosyladenine 5'-phosphate. The product of the reaction, alpha-ribazole 5'-phosphate, forms part of the corrin-biosynthesis pathway and is a substrate for EC 2.7.8.26, adenosylcobinamide-GDP ribazoletransferase [4]. It can also be dephosphorylated to form alpha-ribazole by the action of EC 3.1.3.73, alpha-ribazole phosphatase.
History
EC 2.4.2.21 created 1972
Pathway
ec00860  Porphyrin metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K00768  nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Genes
ECOb1991(cobT)
ECJJW1969(cobT)
ECDECDH10B_2135(cobT)
EBWBWG_1785(cobT)
ECOKECMDS42_1619(cobT)
ECEZ3151(cobT)
ECSECs_2786(cobT)
ECFECH74115_2836(cobT)
ETWECSP_2656(cobT)
ELXCDCO157_2570(cobT)
EOIECO111_2637(cobT)
EOJECO26_2881(cobT)
EOHECO103_2452(cobT)
ECOOECRM13514_2623(cobT)
ECOHECRM13516_2551(cobT)
ESLO3K_09615(cobT)
ESOO3O_16010(cobT)
ESMO3M_09580(cobT)
ECKEC55989_2225(cobT)
ECGE2348C_2124(cobT)
EOKG2583_2501(cobT)
ELRECO55CA74_12020(cobT)
ELHETEC_2101
ECWEcE24377A_2273(cobT)
EUNUMNK88_2513(cobT)
ECPECP_1989
ENAECNA114_2062(cobT)
ECOSEC958_2307(cobT)
ECVAPECO1_1072(cobT)
ECOAAPECO78_13750(cobT)
ECXEcHS_A2114(cobT)
ECMEcSMS35_1133(cobT)
ECYECSE_2275
ECRECIAI1_2072(cobT)
ECQECED1_2327(cobT)
EUMECUMN_2327(cobT)
ECTECIAI39_1056(cobT)
EOCCE10_2282(cobT)
EBRECB_01900(cobT)
EBLECD_01900(cobT)
EBEB21_01889(cobT)
EBDECBD_1658
ECIUTI89_C2229(cobT)
EIHECOK1_2190(cobT)
ECZECS88_2056(cobT)
ECCc2477(cobT)
ELOEC042_2229(cobT)
ELNNRG857_10120(cobT)
ESEECSF_1849
ECLEcolC_1637
EKOEKO11_1790
EKFKO11_12780(cobT)
EABECABU_c22860(cobT)
EDHEcDH1_1665
EDJECDH1ME8569_1927(cobT)
ELUUM146_07045(cobT)
ELWECW_m2163(cobT)
ELLWFL_10590(cobT)
ELCi14_2287(cobT)
ELDi02_2287(cobT)
ELPP12B_c1027(cobT)
ELFLF82_0336(cobT)
ECOLLY180_10315(cobT)
ECOIECOPMV1_02114(cobT)
ECOJP423_11160(cobT)
EALEAKF1_ch4326(cobT)
EMAC1192_01980(cobT)
ESZFEM44_24860(cobT)
STYSTY2219(cobT)
STTt0858(cobT)
SEXSTBHUCCB_9150
SENTTY21A_04365(cobT)
STMSTM2016(cobT)
SEOSTM14_2504(cobT)
SEVSTMMW_20471
SEYSL1344_1992(cobT)
SEMSTMDT12_C20380(cobT)
SEJSTMUK_2046(cobT)
SEBSTM474_2101(cobT)
SEFUMN798_2181(cobT)
SETUSTU288_06470(cobT)
SETCCFSAN001921_06705(cobT)
SENRSTMDT2_19891(cobT)
SENDDT104_20741(cobT)
SENICY43_10895(cobT)
SEENSE451236_16290(cobT)
SPTSPA0855(cobT)
SEKSSPA0800
SPQSPAB_01089
SEISPC_1699(cobT)
SECSCH_2024(cobT)
SEHSeHA_C2238(cobT)
SHBSU5_02610
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SEESNSL254_A2192(cobT)
SENNSN31241_31170
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SEGSG2040(cobT)
SELSPUL_0884(cobT)
SEGASPUCDC_0884(cobT)
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SENAAU38_10165(cobT)
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SENVAU39_10175(cobT)
SENQAU40_11420(cobT)
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SENJCFSAN001992_01355(cobT)
SEECCFSAN002050_17040(cobT)
SEEBSEEB0189_009385(cobT)
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SENEIA1_10060(cobT)
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SESSARI_00872
SALZEOS98_08930(cobT)
SFLSF2059(cobT)
SFXS2169(cobT)
SFVSFV_2063(cobT)
SFESFxv_2293(cobT)
SFNSFy_2940
SFSSFyv_3011
SFTNCTC1_02252(cobT)
SSNSSON_2052(cobT)
SBOSBO_1212(cobT)
SBCSbBS512_E0967(cobT)
SDYSDY_2242(cobT)
SDZAsd1617_03035
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ESHC1N69_08040(cobT)
ENRH650_05785(cobT)
ENFAKI40_1806(cobT)
CCONAFK62_16850(cobT)
KPNKPN_02463(cobT) KPN_03182(cobT)
KPUKP1_3667(cobT) KP1_4446(cobT)
KPMKPHS_35230 KPHS_42460
KPPA79E_0928 A79E_1643
KPHKPNIH24_07565(cobT) KPNIH24_11010(cobT)
KPZKPNIH27_16855(cobT) KPNIH27_20565(cobT)
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KPWKPNIH30_17795(cobT) KPNIH30_21355(cobT)
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KPGKPNIH32_18120(cobT) KPNIH32_22215(cobT)
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KPQKPR0928_17225(cobT) KPR0928_20630(cobT)
KPTVK055_4344(cobT) VK055_5057(cobT2)
KPOKPN2242_15375(cobT) KPN2242_18860(cobT)
KPRKPR_1640(cobT) KPR_1853(cobT)
KPJN559_1059 N559_1795
KPID364_12565(cobT) D364_16155(cobT)
KPAKPNJ1_01064 KPNJ1_01913
KPSKPNJ2_01095 KPNJ2_01877
KPXPMK1_00663(cobT_1) PMK1_04906(cobT_2)
KPBFH42_08430(cobT) FH42_11870(cobT)
KPNEKU54_005215(cobT) KU54_008810(cobT)
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KOMHR38_27475(cobT)
KOKKONIH1_23780(cobT)
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EAEEAE_23295(cobT)
EARCCG29214
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KGRJJJ10_05600(cobT)
RORRORB6_02270(cobT)
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XOOXOO1351(cobT)
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