KEGG   ORTHOLOGY: K23841
Entry
K23841                      KO                                     
Symbol
CLRN
Name
clarin
Disease
H00527  Retinitis pigmentosa
H00605  Deafness, autosomal recessive
H00779  Usher syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   03037 Cilium and associated proteins
    K23841  CLRN; clarin
Cilium and associated proteins [BR:ko03037]
 Primary cilia and associated proteins
  USH complex and associated proteins
   K23841  CLRN; clarin
Other DBs
TC: 9.A.46.1
Genes
HSA: 119467(CLRN3) 645104(CLRN2) 7401(CLRN1)
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ORO: 101365808(CLRN3) 101365944(CLRN2) 101377788(CLRN1)
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NSU: 110571290(CLRN2) 110576769(CLRN1) 110592759(CLRN3)
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PCOO: 112850280(CLRN1) 112854859(CLRN3) 112859056(CLRN2)
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LGF: 123577211(CLRN3) 123583598(CLRN2) 123611394(CLRN1)
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PUC: 125921242 125922665 125933037
PLEZ: 122198385(CLRN1) 122202495(CLRN3) 122217234(CLRN2)
HHV: 120221347(CLRN2) 120237609(CLRN1) 120244323(CLRN3)
BTA: 100125941(CLRN3) 538836(CLRN1) 617290(CLRN2)
BOM: 102280332(CLRN1) 102282105(CLRN2) 102286085(CLRN3)
BIU: 109564506(CLRN1)
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BKE: 129636826(CLRN3) 129644970(CLRN1) 129657328(CLRN2)
BBIS: 104985286(CLRN1) 105001139(CLRN2) 105002514(CLRN3)
CHX: 102168772(CLRN1) 102176314(CLRN2) 102183036(CLRN3)
OAS: 101108133(CLRN2) 101117462(CLRN3) 101118841(CLRN1)
BTAX: 128050082(CLRN2) 128055720(CLRN1) 128068035(CLRN3)
CSUM: 138070106(CLRN3) 138081696(CLRN2) 138089563(CLRN1)
ODA: 120858663(CLRN1) 120861781(CLRN2) 120873828(CLRN3)
CCAD: 122428269(CLRN2) 122445192(CLRN1) 122446752(CLRN3)
MREE: 136152672(CLRN2) 136158368(CLRN3) 136173720(CLRN1)
OVR: 110128515(CLRN3) 110132930(CLRN1) 110148607(CLRN2)
MBEZ: 129546596(CLRN1) 129555940(CLRN3)
SSC: 100156267(CLRN3) 100623011(CLRN1) 100739515(CLRN2)
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CDK: 105094718(CLRN1) 105098346(CLRN2) 105104535(CLRN3)
VPC: 102533193(CLRN2) 102534266(CLRN3) 102535733(CLRN1)
BACU: 103009832(CLRN1) 103012089(CLRN3) 103018784(CLRN2)
BMUS: 118882311(CLRN3) 118894892(CLRN1) 118895187(CLRN2)
LVE: 103077064(CLRN3) 103082464(CLRN2) 103084360(CLRN1)
OOR: 101279180(CLRN2) 101281801(CLRN3) 101284017(CLRN1)
LALB: 132507524(CLRN3) 132519415(CLRN2) 132520376(CLRN1)
GMF: 115839780(CLRN3) 115857360(CLRN2) 115862118(CLRN1)
DDP: 132424306(CLRN1) 132425513(CLRN2) 132439250(CLRN3)
DLE: 111171561(CLRN2) 111172592(CLRN3) 111179176(CLRN1)
PCAD: 102979936(CLRN3) 102981959(CLRN1) 102995126(CLRN2)
PSIU: 116741184(CLRN3) 116753514(CLRN1) 116754764(CLRN2)
PPHC: 136122752(CLRN1) 136123919(CLRN2) 136136658(CLRN3)
NASI: 112397534(CLRN2) 112403833(CLRN3) 112415929(CLRN1)
ECB: 100049935(CLRN3) 100050427(CLRN1) 100068682(CLRN2)
EPZ: 103541231(CLRN2) 103551443(CLRN1) 103554817(CLRN3)
EAI: 106825643(CLRN3) 106829428(CLRN1) 106829600(CLRN2)
MYB: 102246516(CLRN3) 102248374(CLRN2) 102262779(CLRN1)
MYD: 102751659(CLRN3) 102763567(CLRN2) 102766318(CLRN1)
MMYO: 118667013(CLRN2) 118669641(CLRN3) 118675080(CLRN1)
MLF: 102427150(CLRN1) 102435588(CLRN2) 102440807(CLRN3)
MDT: 132214441(CLRN3) 132221087(CLRN2) 132229340(CLRN1)
MYUM: 139002058(CLRN1) 139007513(CLRN2) 139021404(CLRN3)
PKL: 118708648(CLRN2) 118719588(CLRN3) 118723475(CLRN1)
EFUS: 103294475(CLRN2) 103299303(CLRN3) 103302121(CLRN1)
MNA: 107527124(CLRN2) 107530364(CLRN3) 107540026(CLRN1)
DRO: 112300157(CLRN3) 112309902(CLRN1) 112316648(CLRN2)
SHON: 118986445(CLRN2) 118990561(CLRN3) 118997915(CLRN1)
AJM: 119039910(CLRN2) 119042408(CLRN1) 119059463(CLRN3)
PDIC: 114491119(CLRN1) 114493202(CLRN2) 114496015(CLRN3)
PHAS: 123815588(CLRN2) 123827301(CLRN1) 123828867(CLRN3)
MMF: 118617817(CLRN1) 118619842(CLRN2) 118632791(CLRN3)
PPAM: 129077355(CLRN3) 129077692(CLRN2) 129080010(CLRN1)
HAI: 109377430(CLRN2) 109383520(CLRN3) 109392691(CLRN1)
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PALE: 102878316(CLRN3) 102883752(CLRN2) 102896500(CLRN1)
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SFUM: 130015993(CLRN3) 130030737(CLRN1) 130038514(CLRN2)
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Reference
PMID:11524702
  Authors
Joensuu T, Hamalainen R, Yuan B, Johnson C, Tegelberg S, Gasparini P, Zelante L, Pirvola U, Pakarinen L, Lehesjoki AE, de la Chapelle A, Sankila EM
  Title
Mutations in a novel gene with transmembrane domains underlie Usher syndrome type 3.
  Journal
Am J Hum Genet 69:673-84 (2001)
DOI:10.1086/323610
  Sequence
[hsa:7401]
Reference
PMID:31448880
  Authors
Dunbar LA, Patni P, Aguilar C, Mburu P, Corns L, Wells HR, Delmaghani S, Parker A, Johnson S, Williams D, Esapa CT, Simon MM, Chessum L, Newton S, Dorning J, Jeyarajan P, Morse S, Lelli A, Codner GF, Peineau T, Gopal SR, Alagramam KN, Hertzano R, Dulon D, Wells S, Williams FM, Petit C, Dawson SJ, Brown SD, Marcotti W, El-Amraoui A, Bowl MR
  Title
Clarin-2 is essential for hearing by maintaining stereocilia integrity and function.
  Journal
EMBO Mol Med 11:e10288 (2019)
DOI:10.15252/emmm.201910288
LinkDB

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