KEGG ORTHOLOGY: K28173

ORTHOLOGY: K28173

Entry

K28173                      KO

Symbol

LUX

Name

GARP family transcription factor, LUX subfamily

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K28173  LUX; GARP family transcription factor, LUX subfamily
Transcription factors [BR:ko03000]
Eukaryotic type
  Helix-turn-helix
   Tryptophan clusters Myb, Myb-like factors
    K28173  LUX; GARP family transcription factor, LUX subfamily

Genes

OSA:	4326391(OsJ_04927) 4327512 4338783

DOSA:

Os01g0971800 Os05g0412000

OBR:	102702158 107303470 121054508

OGL:	127764555 127773923 127775151

BDI:	100824981 100834697 100835635

ATS:	109750818 109783207 109786907

TDC:	119269565 119270744 119278953 119279235 119343667

TAES:

123055624 123062573 123063675 123072822 123079736 123080986 123132713 123182013

TUA:	125518004 125546316 125546323

HVG:	123440532 123441160 123442999

LPER:

127313878 127344479 127346222

LRD:	124662796 124665149 124697918 124706513

SBI:	110433282 8074136 8085135

ZMA:	103651023 107305672 107548110 109945291

MFLO:

136459408 136511824 136511825 136516481

SITA:

101766124 101767348 101777681

SVS:	117850222 117855098 117858068

PVIR:

120665474 120673902 120698692 120708634 120709373

PHAI:

112886379 112892151 112894104

PAUA:

133884529 133909138 133909693 133928876 133929573

TANG:

140765340 140775553 140777744

PDA:	103704148 103706270 103715698 103721790 103721848 113460905 120106304

EGU:	105032980 105035734 105044363 105052434 105057832

MUS:	103969721 103984147 103993740 135613095 135615803 135625455 135626376

ZOF:	121980399 121982100 121984299 121984300 121985978 122009119 122009887 122015727 122015916 122016107 122044434 122045390 122047373 122051876 122056406

DCT:	110094095 110096066 110096125 110096160 110112165

PEQ:	110022471 110022918 110024869 110028362

ATH:	AT2G40970(MYBC1) AT3G10760 AT3G46640(PCL1) AT5G05090 AT5G59570(BOA)

ALY:	9302413 9309261 9313566 9315966 9318761

CRB:	17875942 17884025 17884992 17888587 17891306

CSAT:

104708605 104711118 104726544 104734513 104736823 104745256 104762074 104764791 104768704 104770308 104780475 104782585 104785297 104790887 104793005

EUS:	EUTSA_v10002605mg EUTSA_v10014387mg EUTSA_v10017945mg EUTSA_v10021133mg

BRP:	103846867 103847329 103855608 103866525 103870437 103873296 103873783

BNA:	106347546 106376459 106386112 106395074 106408666 106413127 106415449 106418472 106419425 106434567 106440658 106442979 106452624 106452705 125608883

BOE:	106292750 106295937 106310400 106313629 106324512 106333111 106335466 106340248

RSZ:	108809676 108812787 108814659 108825195 108832758 108846069 108856935

THJ:	104799434 104810761 104814884 104816077 104823163 104824600 104826880 104827402

CPAP:

110811289 110812158

CIT:	102629795 102629958

CIC:	CICLE_v10012203mg CICLE_v10028658mg

PVY:	116107354 116146549

MINC:

123197175 123209359 123225258 123226168

TCC:	18507262 18590647

GRA:	105761564 105768867 105786246 105788788 105791482

GHI:	107886017 107906573 107922230 107925709 107925710 107942399 107950324 107954100 107959134 121203048

GAB:	108453013 108467289 108471079 108474643 108482450

HSYR:

120124567 120126321 120134648 120137182 120139844 120142049 120143073 120155651 120155689 120155705 120160014 120167941 120187979 120194037 120198359 120198360 120200362

DZI:	111286634 111295287 111296730 111301375 111311447

EGR:	104422477 104425394 104432696 104443834

RARG:

115729884 115736775 115737678 115746027

GMX:	100797237 100802217(LUXC) 100815363 100816634(LUXB) 100816747

GSJ:	114375664 114380550 114391451 114393751 114400235 114406603

PVU:	137813904 137829029 137830481

VRA:	106753981 106754173 106771029

VAR:	108319581 108324967 108343665

VUN:	114169405 114190020 114192576

VUM:	124830539 124833773 124834502

CCAJ:

109802866 109816315

APRC:

113858844 113861700 113872902

MTR:	11415024 11427644

TPRA:

123888262 123918598

CAM:	101494139 101515043(LUX)

PSAT:

127126472

VVO:	131621617 131622222 131639158

LJA:	130730043 130747274

ADU:	107461535 107471418 107476827

AIP:	107614257 107623693 107629079

AHF:	112706675 112736664 112770802 112783085 112788267

LANG:

109342962 109343311 109350339 109357718 109358871

PCIN:

129307491 129314552

QSA:	O6P43_000181 O6P43_006330 O6P43_010015 O6P43_028203

FVE:	101295024 101314104

AANS:

126787764 126798696

RCN:	112164967 112187557

PPER:

PMUM:

PAVI:

PDUL:

MDM:	103420541 103429909 103449853 103449881

MSYL:

126591137 126593686 126593860 126616828

PXB:	103954272 103964693

PCOX:

137716269 137743710 137745200 137745449

ZJU:	107411020 107431546

MNT:	21386214 21407993

CSAV:

115699303 115718944

HLP:	133791124 133823263

CSV:	101203812 101205712 101216059 101216969 116404543

CMO:	103486866 103495840 103497139 103502064

BHJ:	120074057 120083486 120088096 120091162

MCHA:

111017111 111019853

CMAX:

111465901 111467241 111469492 111469997 111482343 111493154 111499633

CMOS:

111432475 111439239 111442136 111449034 111451196 111452866 111459631 111464699

CPEP:

111776720 111781105 111783329 111784650 111787368 111791249 111794471 111800592 111803349

RCU:	8259679 8284128

MEAN:

126678159 126688277

JCU:	105629930 105647239

HBR:	110635226 110636982 110645572 110659686

MESC:

110608503 110621048 110621279 110623143

POP:	18106100 7465095 7468625 7495685

PEU:	105131133 105133129 105136921 105137363

PALZ:

118028042 118033298 118034647 118053009

PNZ:	133677251 133679167 133689579 133692243

JRE:	108983410 108989230 109017731 109019757

CILL:

122275546 122278114 122292823 122294484

CAVE:

132161952 132163818

AGLU:

133872862 133877827

QSU:	112004402 112032157

QLO:	115953574 115986502

CSAA:

142605604 142610902

TWL:	119991754 119995120 119998723 120001918

VVI:	100253567 100256764

VRI:	117915592 117920533

SLY:	101244879(PCL1) 101249222 101265183 113002614

SPEN:

107002353 107002683 107021734 107023898

SOT:	102580374 102585758 102588078 102600588(StPCL1)

SSTN:

125865479 125865788 125872602 125872753

SDUL:

129876363 129877362 129901283 129901354

SVER:

125806837 125806838 125807965 125809021 125834554

CANN:

107843761 107843997 107873494 107875524

LBB:	132605761 132605849 132607328 132607577

NTA:	107763213 107769728 107774049 107801556 107815099 107821427 107824744

NSY:	104223946 104224403 104228786 104237571

NTO:	104100802 104113694 104121444

NAU:	109214137 109226778 109238967 109239522

INI:	109156398 109159185 109173752 109182321

ITR:	116003712 116007405 116024479 116028424

SIND:

105155819 105162693 105170441

OEU:	111369120 111374005 111374728 111375325 111387960 111391178 111393537 111413006

EGT:	105949426 105956100 105976751

SSPL:

121744995 121746422 121748629 121750286 121753145 121790713

SMIL:

130990230 131003818 131006758 131006807

SHIS:

125186659 125187736 125214312 125223025

APAN:

127259166 127264237 127266672

HPUM:

140890607

PHUA:

140967927

PEBU:

140802956 140810162 140822505 140827194 140830993 140835657 140839485

PTAB:

142529584 142529954 142543092 142545116 142547193 142549547 142553438

CARB:

113694251 113697528 113710111 113742728

HAN:	110863939 110865332 110865519 110866268 110881116 110895265 110898861 110937949 110940067

BHW:	143542113 143552567 143564699 143579452 143582161 143613450 143619750 143636886

ECAD:

122581937 122582493 122592296 122606787

LSV:	111880374 111889242 111889404 111894441 111907267 111907478 128132382

CCAV:

112506938 112511961 112513196 112518461

DCR:	108208040 108211036 108215753 108215770 108222883 108225250

AGRV:

141688854 141693937 141696679 141698173 141707284 141713689 141720510

CSIN:

114272422 114282116 114290401 114318841

RVL:	131314688 131316627 131319079

AEW:	130757754 130790123 130791115 130794600

DLT:	127788838 127793357 127797524

CFLO:

132290091 132313511

BVG:	104889529 104900072 104904436

SOE:	110775181 110787693 110802850

CQI:	110683338 110710521 110711602 110722316 110733318

ATRI:

130803561 130826107 130827309 130827796

SLAF:

141600423 141604951 141617180 141627871 141643096

MOF:	131147636 131159987

NNU:	104589668 104597142 104601070 104601071 104607866

MING:

122058026 122060898 122066677 122087240

TSS:	122642044 122644255 122652869 122669204

PSOM:

113298832 113310820 113311079 113313271 113322652 113344714

MSIN:

131227029 131243776 131252833

ACAK:

137935063 137956931 137958881 137966476

NCOL:

116254855 116256885 116261571 116265349

ATR:	18427126 18436206

CJF:	131038900 131060993

SMO:	SELMODRAFT_36646

» show all

Reference

PMID:16006522

Authors

Hazen SP, Schultz TF, Pruneda-Paz JL, Borevitz JO, Ecker JR, Kay SA

Title

LUX ARRHYTHMO encodes a Myb domain protein essential for circadian rhythms.

Journal

Proc Natl Acad Sci U S A 102:10387-92 (2005)
DOI:10.1073/pnas.0503029102

Sequence

[ath:AT3G46640 AT5G59570 AT5G05090 AT3G10760 AT2G40970]

Reference

PMID:38190030

Authors

Ohama N, Yanagisawa S

Title

Role of GARP family transcription factors in the regulatory network for nitrogen and phosphorus acquisition.

Journal

J Plant Res 137:331-341 (2024)
DOI:10.1007/s10265-023-01513-0

LinkDB

DBGET integrated database retrieval system