KEGG   ORTHOLOGY: K03530
Entry
K03530                      KO                                     
Symbol
hupB
Name
DNA-binding protein HU-beta
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
   03036 Chromosome and associated proteins
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Initiation Factors
   Initiation factors (bacterial)
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Prokaryotic type
  Nucleoid associated proteins
   HU (heat unstable protein)
    K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
     Supressor
      K03530  hupB; DNA-binding protein HU-beta
Other DBs
COG: COG0776
Genes
ECO: b0440(hupB)
ECJ: JW0430(hupB)
ECD: ECDH10B_0396(hupB)
EBW: BWG_0322(hupB)
ECOK: ECMDS42_0339(hupB)
ECOC: C3026_02155
ECE: Z0547(hupB)
ECS: ECs_0494(hupB)
ECF: ECH74115_0526(hupB)
ETW: ECSP_0508(hupB)
EOI: ECO111_0473(hupB)
EOJ: ECO26_0475(hupB)
EOH: ECO103_0417(hupB)
ECOH: ECRM13516_0424(hupB)
ESL: O3K_19290
ESO: O3O_06010
ESM: O3M_19265
ECK: EC55989_0454(hupB)
ECG: E2348C_0375(hupB)
EOK: G2583_0552(hupB)
ELH: ETEC_0493
ECW: EcE24377A_0476(hupB)
ECP: ECP_0501
ENA: ECNA114_0418(hupB)
ECOS: EC958_0579(hupB)
ECV: APECO1_1571(hupB)
ECX: EcHS_A0517(hupB)
ECM: EcSMS35_0483(hupB)
ECY: ECSE_0466
ECR: ECIAI1_0444(hupB)
ECQ: ECED1_0464(hupB)
EUM: ECUMN_0480(hupB)
ECT: ECIAI39_0233(hupB)
EOC: CE10_0413(hupB)
EBR: ECB_00392(hupB)
EBL: ECD_00392(hupB)
EBE: B21_00396(hupB)
EBD: ECBD_3215
ECI: UTI89_C0468(hupB)
EIH: ECOK1_0422(hupB)
ECZ: ECS88_0437(hupB)
ECC: c0556(hupB)
ELO: EC042_0478(hupB)
ESE: ECSF_0401
EKF: KO11_21375(hupB)
EAB: ECABU_c05230(hupB)
EDJ: ECDH1ME8569_0425(hupB)
ELW: ECW_m0512(hupB)
ELL: WFL_02545(hupB)
ELC: i14_0534(hupB)
ELD: i02_0534(hupB)
ELP: P12B_c0454(hupB)
ELF: LF82_1048(hupB)
ECOI: ECOPMV1_00427(hupB)
ECOJ: P423_02240
EFE: EFER_2577(hupB)
EAL: EAKF1_ch0992c(hupB)
ESZ: FEM44_16740(hupB)
ERUY: OSH18_07285(hupB)
STY: STY0493(hupB)
STT: t2409(hupB)
STM: STM0451(hupB)
SEO: STM14_0534(hupB)
SEY: SL1344_0445(hupB)
SEJ: STMUK_0458(hupB)
SEB: STM474_0472(hupB)
SEF: UMN798_0495(hupB)
SENR: STMDT2_04481(hupB)
SENI: CY43_02595
SPT: SPA2271(hupB)
SEK: SSPA2113
SEI: SPC_0465(hupB)
SEC: SCH_0493(hupB)
SEH: SeHA_C0554(hupB)
SHB: SU5_01143
SEE: SNSL254_A0500(hupB) SNSL254_p_0022(hup)
SEW: SeSA_A0510(hupB)
SEA: SeAg_B0491(hupB)
SENS: Q786_02225
SED: SeD_A0493(hupB)
SEG: SG0462(hupB)
SEL: SPUL_2514(hupB)
SEGA: SPUCDC_2500(hupB)
SET: SEN0433(hupB)
SENA: AU38_02210
SENO: AU37_02205
SENV: AU39_02210
SENQ: AU40_02450
SENL: IY59_02260
SEEP: I137_11450
SENB: BN855_4490(hupB)
SENE: IA1_02405
SBG: SBG_0396(hupB)
SBZ: A464_404
SFL: SF0385(hupB)
SFX: S0391(hupB)
SFV: SFV_0414(hupB)
SFE: SFxv_0428(hupB)
SFN: SFy_0483
SFS: SFyv_0522
SFT: NCTC1_00397(hupB)
SSN: SSON_0423(hupB)
SBO: SBO_0334(hupB)
SBC: SbBS512_E0363(hupB)
SDY: SDY_0292(hupB)
ENC: ECL_01198
ECLX: LI66_04930
ECLY: LI62_05450
ECLZ: LI64_05135
EEC: EcWSU1_00964(hupB)
ECHG: FY206_06290(hupB)
EPT: HWQ17_07590(hupB)
EBG: FAI37_01540(hupB)
ENZ: G0034_04945(hupB)
ENS: HWQ15_13510(hupB)
ENK: LOC22_15815(hupB)
EHU: D5067_0017770(hupB)
EMOR: L6Y89_04815(hupB)
EQU: OM418_04810(hupB)
EPU: QVH39_04880(hupB)
ESA: ESA_02858
CSK: ES15_2943(hupB)
CTU: CTU_10200(hupB)
KPN: KPN_00402(hupB)
KPU: KP1_1273(hupB)
KPP: A79E_3881
KPT: VK055_2151(hupB)
KPR: KPR_4317(hupB)
KPJ: N559_4004
KPNU: LI86_20595
KPNK: BN49_1376(hupB)
KVA: Kvar_3979
KPE: KPK_4280(hupB)
KOX: KOX_12760
KOE: A225_1283
EAE: EAE_12780
KAR: LGL98_19335(hupB)
KGR: JJJ10_21460(hupB)
KPAS: LUW96_13095(hupB)
KLC: K7H21_21725(hupB)
REE: electrica_03916(hupB)
RTG: NCTC13098_05783(hupB)
CRO: ROD_04951(hupB)
CKO: CKO_02720
CPOT: FOB25_05570(hupB)
CAMA: F384_01945
CTEL: GBC03_23725(hupB)
CITZ: E4Z61_11365(hupB)
CARS: E1B03_06940(hupB)
CIX: M4I31_17720(hupB)
CIB: HF677_017695(hupB)
CENS: P2W74_17265(hupB)
BEN: BOBLI757_301(hupB)
BED: BTURN675_258(hupB)
HDE: HDEF_1162(hupB)
EBT: EBL_c28820(hupB)
CLAP: NCTC11466_03429(hupB)
KOR: AWR26_19235(hupB)
KPSE: IP581_05160(hupB)
KOB: HF650_05730(hupB)
KOO: O9K67_19200(hupB)
KIE: NCTC12125_02590(hupB)
KLU: K7B04_11260(hupB)
KCY: RIN60_17475(hupB)
LER: GNG29_05210(hupB)
LEA: GNG26_04765(hupB)
LPNU: KQ929_15925(hupB)
BFT: MNO13_18995(hupB)
SBW: TGUWTKB_6060(hupB)
DEN: MHIR_DE00108(hupB)
SYM: K6K13_05575(hupB)
AHN: NCTC12129_01249(hupB)
ASUB: NLZ15_16505(hupB)
YRE: HEC60_23040(hupB)
SGOE: A8O29_017770(hupB)
PDZ: HHA33_22145(hupB)
METY: MRY16398_44010(hupB)
IZH: FEM41_11010(hupB)
PTF: PROFFT_A_01990(hupB)
PSHI: SAMEA2665130_2033(hupB)
PSGC: G163CM_24050(hupB)
SCOL: KFZ77_04595(hupB)
PVJ: LMA04_07470(hupB)
SUPE: P0H77_06115(hupB)
TOE: QMG90_16400(hupB)
EBF: D782_3398
EBB: F652_2254
PSTS: E05_48760(hupB)
YPE: YPO3154(hopD)
YPK: y1030(hupB)
YPH: YPC_3438(hupB)
YPA: YPA_2649
YPN: YPN_0936
YPM: YP_0777(hupB)
YPG: YpAngola_A3051(hupB)
YPW: CH59_2905(hupB)
YPJ: CH55_1732(hupB)
YPV: BZ15_374(hupB)
YPL: CH46_1946(hupB)
YPS: YPTB0962(hupB)
YPO: BZ17_1585(hupB)
YPI: YpsIP31758_3089(hupB)
YPY: YPK_3231
YPB: YPTS_1003
YPQ: DJ40_1396(hupB)
YPU: BZ21_206(hupB)
YPR: BZ20_1084(hupB)
YPC: BZ23_482(hupB)
YPF: BZ19_319(hupB)
YEN: YE3131(hupB)
YEY: Y11_20511
YEW: CH47_2507(hupB)
YET: CH48_2704(hupB)
YEE: YE5303_35941(hopD)
YAL: AT01_1453(hupB)
YFR: AW19_2097(hupB)
YIN: CH53_2864(hupB)
YKR: CH54_3689
YRO: CH64_3581(hupB)
YRU: BD65_2835(hupB)
YCA: F0T03_16270(hupB)
YMO: HRD69_10640(hupB)
YAS: N0H69_19710(hupB)
YKI: HRD70_20915(hupB)
SMAR: SM39_0405(hupB)
SMAC: SMDB11_0345(hupB)
SMW: SMWW4_v1c10410(hupB)
SPE: Spro_1098
SRL: SOD_c09370(hupB)
SPLY: Q5A_004985(hupB)
SSZ: SCc_485(hupB)
SMAF: D781_1012
SERF: L085_23345
SQU: E4343_10960(hupB)
SURI: J0X03_18720(hupB)
SRHZ: FO014_04840(hupB)
SENP: KHA73_05255(hupB)
SNEM: NLX84_05110(hupB)
SNEV: OI978_01505(hupB)
RACE: JHW33_10960(hupB)
RAA: Q7S_16875
RVC: J9880_02495(hupB)
RBON: QNM34_17250(hupB)
RIU: I2123_18695(hupB)
EAME: GXP68_04580(hupB)
RBAD: H2866_12665(hupB)
RCB: O1V66_12925(hupB)
CARU: P0E69_15065(hupB)
PROD: PCO85_06515(hupB)
ECA: ECA1151(hupB)
PATR: EV46_05800
PATO: GZ59_11800(hupB)
PCT: PC1_1051
PEC: W5S_3258
PPUJ: E2566_05935(hupB)
PARI: I2D83_16720(hupB)
PAQU: DMB82_0015105(hupB)
PVZ: OA04_11990(hupB)
PPAV: LOZ86_15585(hupB)
PQU: IG609_014840(hupB)
PPOO: LW347_05880(hupB)
PCAC: OI450_04600(hupB)
PACB: M9782_07830(hupB)
DDD: Dda3937_03317(hupB)
DDQ: DDI_0895
DAQ: DAQ1742_03210(hupB)
DIC: Dpoa569_002697(hupB)
DLC: O1Q98_17190(hupB)
BIZ: HC231_17425(hupB)
LPOP: I6N93_04795(hupB)
SOD: Sant_2997(hupB)
PES: SOPEG_4003(hupB)
SLIG: GTU79_06830(hupB)
EAM: EAMY_0986(hupB)
EAY: EAM_0995(hupB)
ETA: ETA_25040(hopD)
EPY: EpC_26140(hopD)
EPR: EPYR_02836(hupB)
EBI: EbC_10110(hopD)
ERJ: EJP617_21160(hopD)
ERWI: GN242_16155(hupB)
ETP: LU633_06815(hupB)
ERP: LJN55_05155(hupB)
ETO: RIN69_05630(hupB)
EGE: EM595_0978(hupB)
PAM: PANA_0999(hupB)
PLF: PANA5342_3300(hupB)
PAJ: PAJ_0326(hupB)
PVA: Pvag_0380(hupB)
PSTW: DSJ_19155
PANS: FCN45_04820(hupB)
PEY: EE896_14700(hupB)
PER: LAC65_03835(hupB)
PJI: KTJ90_14560(hupB)
PANO: OJ965_16425(hupB)
KPIE: N5580_13675(hupB)
PALF: K6R05_14295(hupB)
MINT: C7M51_00410(hupB)
MHAN: K6958_05945(hupB)
TPTY: NCTC11468_01065(hupB)
PLU: plu3866(hupB)
PAY: PAU_03414
PMR: PMI0118(hupB)
PMIB: BB2000_0280(hupB)
PHAU: PH4a_10580
PCOL: F1325_03510(hupB)
PCIB: F9282_03350(hupB)
PPEE: I6G31_05945(hupB)
XBO: XBJ1_1634(hupB)
XBV: XBW1_0938(hupB)
XNE: XNC1_0979(hupB) XNC1_p0178(hupB)
XNM: XNC2_0961(hupB) XNC2_p0195(hupB)
XDO: XDD1_0879(hupB)
XPO: XPG1_0466(hupB)
XBU: HGO23_16110(hupB)
XGR: QL128_16705(hupB)
PSI: S70_06760
PSX: DR96_1904(hupB)
PRG: RB151_007600(hupB)
PHEI: NCTC12003_00765(hupB)
PRJ: NCTC6933_00832(hupB)
PMAG: JI723_04005(hupB)
PHAG: PZ638_03660(hupB)
MMK: MU9_3239
ANS: ArsFIN_34720(hupB_1) ArsFIN_43510(hup_1) ArsFIN_44240(hup_2) ArsFIN_45230(hup_3) ArsFIN_45380(hup_4) ArsFIN_46020(hup_5) ArsFIN_46520(hup_6) ArsFIN_46660(hup_7) ArsFIN_47280(hup_8) ArsFIN_47870(hup_9) ArsFIN_49350(hupB_2) ArsFIN_49500(hupB_3) ArsFIN_49600(hupB_4) ArsFIN_49930(hupB_5) ArsFIN_50770(hupB_6) ArsFIN_52770(hupB_7) ArsFIN_53880(hupB_8) ArsFIN_54780(hup_10) ArsFIN_55250(hup_11) ArsFIN_55700(hup_12)
MWI: MNY66_12905(hupB)
ETR: ETAE_0995(hupB)
ETD: ETAF_0928
ETE: ETEE_2938
EDL: AAZ33_18740(hupB)
LRI: NCTC12151_02333(hupB)
GKN: PVT67_10585(hupB)
XFA: XF_1190
XFT: PD_0475(hupB)
XCC: XCC0978(hupB)
XCB: XC_3262
XCP: XCR_1178
XCV: XCV1084(hupB)
XAX: XACM_1039(hupB)
XAC: XAC1081(hupB)
XCI: XCAW_01179(himA)
XFU: XFF4834R_chr10620(hupB)
XOM: XOO0935(XOO0935)
XOO: XOO1036(hupB)
XOP: PXO_02474
XOR: XOC_1136
XAL: XALC_0590(hupB)
XPH: XppCFBP6546_06160(XppCFBP6546P_06160)
XHD: LMG31886_32870(hupB)
SML: Smlt0992(hupB)
SMT: Smal_0839
SMZ: SMD_0873(hupB)
SACZ: AOT14_09500(ihfB_1)
SINC: DAIF1_09020(hupB)
PSUW: WQ53_02185
PSD: DSC_12040
LAQ: GLA29479_3141(hup)
LEZ: GLE_3415(hupB) GLE_4448
LEM: LEN_1702(hupB)
LHX: LYSHEL_02660(hupB)
LCAS: LYSCAS_02660(hupB)
LLZ: LYB30171_01816(hup)
DKO: I596_2134
RBD: ALSL_1175
VCH: VC_1919
VCS: MS6_1681
VCE: Vch1786_I1410(hupB)
VCI: O3Y_09295
VCO: VC0395_A1509(hupB)
VCR: VC395_2034(hupB)
VCM: VCM66_1843(hupB)
VVU: VV1_0019
VVY: VV1107
VPA: VP0920
VPB: VPBB_0878
VAG: N646_3070
VNI: VIBNI_A2425(hupB)
VAN: VAA_02294
VAU: VANGNB10_cI0984(hupB?)
VTA: A1996(hupB)
VAQ: FIV01_10115(hupB)
VSR: Vspart_01273(hupB)
VPL: SA104470976_01631(hupB)
VFI: VF_0799(hupB)
VSA: VSAL_I0822(hupB) VSAL_p840_66(hupA)
AWD: AWOD_I_0766(hupB)
PPR: PBPRA2634(YPO3154)
PGH: FH974_11125(hupB)
GKD: K6Q96_04660(hupB)
SALY: E8E00_03425(hupB)
SCOT: HBA18_09905(hupB)
SPRO: N7E60_10405(hupB)
ELUX: BTN50_0525
PAE: PA1804(hupB) PA3940
PAEV: N297_1858(hupB) N297_4069(hupA)
PAEI: N296_1858(hupB) N296_4069(hupA)
PAEC: M802_1856(hupB) M802_4067(hupA)
PAEO: M801_1857(hupB) M801_3935(hupA)
PRE: PCA10_19380(hupN) PCA10_36830(hupB) PCA10_p1140(hup)
PPSE: BN5_1752(hupB) BN5_2403
PCQ: PcP3B5_20590(hupB_1) PcP3B5_24040(hupB_2)
PPU: PP_0975(hupN) PP_2303(hupB)
PPB: PPUBIRD1_1026(hupN) PPUBIRD1_3382(hupB)
PPX: T1E_1952 T1E_5379(hupB)
PPUN: PP4_35150(hupB) PP4_43340(hupN)
PFL: PFL_1061(hupN) PFL_3984(hupB)
PPRC: PFLCHA0_c10800(hupN) PFLCHA0_c40430(hupB)
PFC: PflA506_1033(hupN) PflA506_3298(hupB)
PMAN: OU5_1273(hupB) OU5_2412
PMUD: NCTC8068_04298(hupB_1)
PFW: PF1751_v1c10080(hupN)
PEN: PSEEN1871(hupB) PSEEN4448(hupN)
PKC: PKB_1988 PKB_2033(hupN)
PADE: C3B55_00602(hupB)
PMAO: PMYSY11_2573(hupB) PMYSY11_2755(hupA)
PTAE: NCTC10697_03551(hupN)
PPHN: HU825_15490(hupB)
PSOA: PSm6_01670(hupB) PSm6_43230
PSA: PST_2064(hupB)
PSZ: PSTAB_1962(hupB)
PSR: PSTAA_2095(hupB)
PCHL: LLJ08_10880(hupB)
PKG: LW136_11670(hupB)
SDEG: GOM96_02480(hupB)
HAES: LO767_08810(hupB)
HARR: HV822_16890(hupB)
PNN: KEM63_09315(hupB)
MAQ: Maqu_1837
MHC: MARHY1466(hupB)
MAD: HP15_2182
MBS: MRBBS_2429(hupB)
MARJ: MARI_14980(hupB)
MSHE: MAALD49_15840(hupB) MAALD49_16590(hupB)
PAR: Psyc_1474(hupB)
PALI: A3K91_0860
PSYC: DABAL43B_1929(hupB)
PSYA: AOT82_2762
PKY: PKHYL_27670(hup)
ACB: A1S_1637
ABM: ABSDF1857(hupB)
ABY: ABAYE2017(hupB)
ABN: AB57_1860
ABB: ABBFA_01837(hupB)
ABD: ABTW07_1879(hup) ABTW07_3024(hup)
ABH: M3Q_2015
ABAD: ABD1_16230(hupB)
ABAZ: P795_9095
ABAA: IX88_10095
ACC: BDGL_001006(hup)
ACI: ACIAD1408(hupB)
AGU: AS4_20690(hupB)
AUG: URS_2665
AVB: RYU24_17530(hup)
ABOU: ACBO_14360(hup)
MCT: MCR_0612
MCS: DR90_1308(hupB)
MCAT: MC25239_00608(hupB)
MCUN: NCTC10297_01153(hupB)
SON: SO_0548 SO_1797(hupB)
SBK: SHEWBE_0976(hupB) SHEWBE_2117(hupB)
SKH: STH12_00009(hupB_1) STH12_00794(hupB_2)
ILO: IL1002(hupB)
IAB: K5X84_04165(hupB)
CPS: CPS_1873(hupB1) CPS_2063(hupB2) CPS_3781(hupB3)
THAP: FNC98_11020(hupB)
THAB: LP316_08400(hupB)
PHA: PSHAa2059(hupB) PSHAb0462(hupB)
PTN: PTRA_a2524(hupB) PTRA_b0665(hupB)
PSM: PSM_A2121(hupB) PSM_B0538(hupB)
PEA: PESP_a2681(hupB) PESP_b0745(hupB)
PSPO: PSPO_a2143(hupB) PSPO_b0913(hupB)
PART: PARC_a1217(hupB) PARC_b0713(hupB)
PTU: PTUN_a1329(hupB) PTUN_b0812(hupB)
PNG: PNIG_a2723(hupB) PNIG_b0625(hupB)
PTD: PTET_a2402(hupB) PTET_b0669(hupB)
PSEN: PNC201_09790(hup) PNC201_11525(hupB1) PNC201_19175(hupB2)
PAGA: PAGA_a1250(hupB) PAGA_b0847(hupB)
PSAZ: PA25_10110 PA25_12970(hupB_1) PA25_32890(hupB_2)
AMAL: I607_12860
AMAE: I876_13245
AMAO: I634_13105
AMAD: I636_13255
AMAI: I635_13610
AMAG: I533_12845
AMAC: MASE_12705
AAUS: EP12_13445
ASP: AOR13_815
ALR: DS731_14455(hupB)
APEL: CA267_015555(hupB)
SALK: FBQ74_05640(hupB)
SMAA: IT774_04765(hupB)
GNI: GNIT_1055(hupB)
GPS: C427_3800
PAT: Patl_3133
AGZ: M0C34_11925(hupB)
AGQ: LQZ07_15370(hupB)
ALKM: NKI27_11275(hupB)
PIN: Ping_1468
FBL: Fbal_2595
FES: HER31_09910(hupB)
MVS: MVIS_3422(hupB)
MYA: MORIYA_4061(hupB)
CJA: CJA_0153(hup) CJA_2003
GIL: NHM04_01900(hupB)
MICC: AUP74_02264(hupB)
MICT: FIU95_13010(hupB)
MICZ: GL2_29360(hupB)
MBRG: PVT68_03495(hupB)
CBU: CBU_1464(hupB)
CBD: CBUD_0508(hup)
CBG: CbuG_0544(hupB)
CBC: CbuK_1695(hupB)
CEY: CleRT_03560(hupB)
RVI: RVIR1_02780(hupB)
ALG: AQULUS_12290(hupB)
ASIP: AQUSIP_10720(hupB)
LPN: lpg1858(hupB)
LPH: LPV_2133(hubB)
LPO: LPO_1922(hubB)
LPM: LP6_1837
LPF: lpl1822(hubB)
LPP: lpp1826(hubB)
LPC: LPC_1303
LPA: lpa_02684
LPE: lp12_1797
LLO: LLO_1286(hubB) LLO_p0051(hupB)
LFA: LFA_2023(hupB)
LHA: LHA_0713(hupB)
LOK: Loa_00881
LCD: clem_11365(hupB)
LLG: 44548918_00604(hupB)
LJR: NCTC11533_00641(hupB)
LCJ: NCTC11976_02582(hupB)
LWA: SAMEA4504053_2057(hupB)
LSS: NCTC12082_02798(hupB)
LADL: NCTC12735_00350(hupB)
LANT: TUM19329_00790(hup_1) TUM19329_25650(hupB_1) TUM19329_36700(hup_2) TUM19329_37060(hupB_2)
TMC: LMI_2624(hupB)
MCA: MCA0532(hupB) MCA2947(hup)
MAH: MEALZ_3046(hupB)
MMAI: sS8_2592
MSZE: MSZNOR_2699(hupB)
MOZ: MoryE10_09620(hupB_2) MoryE10_17720(hupB_3)
MCAU: MIT9_P1895
FTU: FTT_0627(hupB)
FTQ: RO31_0716(hupB)
FTF: FTF0627(hupB)
FTW: FTW_1102(hup)
FTT: FTV_0587(hupB)
FTG: FTU_0671(hupB)
FTL: FTL_0895
FTH: FTH_0880
FTA: FTA_0946
FTS: F92_04940
FTI: FTS_0886(hupB)
FTC: DA46_1912(hupB)
FTV: CH67_1232(hupB)
FTZ: CH68_964(hupB)
FTM: FTM_0702(hupB)
FTN: FTN_1054(hupB)
FTX: AW25_954(hupB)
FTD: AS84_1468(hupB)
FTY: CH70_889
FPH: Fphi_1535
FPT: BZ13_451(hupB)
FPI: BF30_1807(hupB)
FPM: LA56_624(hupB)
FPX: KU46_1766(hupB)
FPZ: LA55_767(hupB)
FPJ: LA02_1704(hupB)
FNA: OOM_1322
FRC: KX01_1263(hupB)
TCX: Tcr_1180
HMAR: HVMH_1186(hopD)
MEJ: Q7A_2212
MEC: Q7C_2511
MMAF: GCM100_03810(hupB)
CYQ: Q91_0945(hupB)
TIB: THMIRHAM_11130(hup)
TSE: THMIRHAS_13760(hup)
TZO: THMIRHAT_12980(hup)
TIG: THII_0144
ATEP: Atep_21420
NTG: NSCAC_0141(hupA) NSCAC_1233(hupB) NSCAC_1256(ihfB)
THIP: N838_15615
TLR: Thiosp_04422(hupB)
TFRI: Thiofri_04567(hupB)
TWG: Thiowin_00574(hupB)
AEH: Mlg_2285
HHK: HH1059_05360(hupB)
TGR: Tgr7_0942
TKM: TK90_0576
TNI: TVNIR_2769(hupB_[H])
TVR: TVD_10330
GAI: IMCC3135_25580(hupB)
TBN: TBH_C0722
HCH: HCH_02163
HAHH: O5O45_05100(hupB)
CSA: Csal_2043
HEL: HELO_2349(hupB1) HELO_4074(hupB2)
HAM: HALO2314
HCO: LOKO_01402(hupB)
HBE: BEI_1724(hupB)
HBH: E4T21_08835(hupB)
HASH: HXW73_09305(hupB)
HOL: HORIV_33620(hupB)
HSR: HSBAA_35090(hupB)
PLC: PAD_212(hupB)
PLI: PLF_211(hupB)
COBE: CLAM6_24930(hupB)
KUY: FY550_07720(hupB)
PAUR: FGL86_12780(hupB)
SAJS: QO259_09260(hupB)
ABO: ABO_1213(dbh1)
ALCA: ASALC70_00215(hupB)
ADI: B5T_02378(dbh1)
AXE: P40_11430
APAC: S7S_09870
MPON: MACH16_12140(hup)
TOL: TOL_1850
NJP: NEJAP_2085(hupB)
AJP: AMJAP_1455(hupB)
EMP: EZMO1_2162(hupB1) EZMO1_2187(hupB2)
AHA: AHA_2014
ASA: ASA_1892(hupB) ASA_P4G030(hupB)
AVR: B565_2215
AMED: B224_2565
ASR: WL1483_3514(hupB)
ACAV: VI35_09925
ASIM: FE240_07510(hupB)
AALL: I6G90_03975(hupB)
AJD: I6H43_20350(hupB)
ARIV: KYK33_11105(hupB)
ASAA: KXJ75_10805(hupB)
AEJ: E5E97_17360(hupB)
ABES: IU367_12200(hupB)
OCE: GU3_08525
KKO: Kkor_1952
KGE: TQ33_0589
DNO: DNO_0226
CHJ: NCTC10426_01351(hupB)
SLIM: SCL_1870
SALN: SALB1_2431
CDIZ: CEDIAZO_02176(hupB)
RMA: Rmag_0380
VOK: COSY_0604(hupB)
ENM: EBS_1391(hupB)
NME: NMB1230(hupB)
NMP: NMBB_1315
NMQ: NMBM04240196_0974(hupB)
NMZ: NMBNZ0533_1196(hupB)
NMW: NMAA_0943(hupA) NMAA_1336(hupB)
NMX: NMA510612_1552(hupA) NMA510612_2098(hupB)
NMC: NMC1130(hupB)
NMN: NMCC_1111(hupB)
NMT: NMV_1200(hup)
NMI: NMO_1042(hupB)
NGO: NGO_0777
NGK: NGK_1099
NLA: NLA_10360(hupB) NLA_3100(hupB2)
NWE: SAMEA3174300_0808(hupB_1) SAMEA3174300_0932(hupB_2)
NZO: SAMEA4504057_1633(hupB)
NCI: NCTC10296_01622(hupB)
NCZ: NCTC10294_00713(hupB)
NANI: NCTC12227_00821(hupB)
KKI: KKKWG1_1364(hupA)
ECOR: SAMEA4412678_2032(hupB)
CVI: CV_2163(hupB2) CV_2554(hupB1) CV_3869
JES: JHS3_14480(hupB)
LHK: LHK_02180(hupB2) LHK_02345(hupB1)
RSO: RSc1714(hupB1) RSc2521(hupB2) RSc3359(dbhB)
RSC: RCFBP_10104(hupB) RCFBP_10875(hupB) RCFBP_11671(hupB) RCFBP_11689(hupB)
RSL: RPSI07_0083(hupB) RPSI07_0944(hupB) RPSI07_1757(hupB)
RSN: RSPO_c00081(dbhB) RSPO_c00930(hupB2) RSPO_c01750(hupB1)
RSM: CMR15_10109(hupB) CMR15_10854(hupB) CMR15_11727(hupB) CMR15_mp10395(hupB)
RSY: RSUY_01300(hupB_1) RSUY_10580(hup) RSUY_20430(hupB_2) RSUY_25920(hupB_3)
REH: H16_A3684(hupB2) H16_B1235(hupB3) PHG328(hupB)
CNC: CNE_1c36350(hupA) CNE_2c12060(hupB)
RME: Rmet_3538(hup) Rmet_4749(hupB) Rmet_6397(hupB)
CTI: RALTA_A3140(hupB1) RALTA_B1140(hupB2) pRALTA_0178(hupB3)
CGD: CR3_2842(hupB) CR3_3535(hupB)
BMA: BMA2913(hupB)
BMV: BMASAVP1_A3397(hupB)
BML: BMA10229_A1629(hupB)
BMN: BMA10247_2972(hupA)
BMAL: DM55_951(hupB)
BMAE: DM78_45(hupB)
BMAQ: DM76_926(hupB)
BMAI: DM57_1738
BMAF: DM51_2528
BMAZ: BM44_375(hupB)
BMAB: BM45_2989
BPS: BPSL0004(hupA)
BPL: BURPS1106A_0004(hupA)
BPD: BURPS668_0004(hupA)
BPSE: BDL_1941
BPSM: BBQ_3401(hupB)
BPSU: BBN_3522(hupB)
BPSD: BBX_332(hupB)
BPZ: BP1026B_I0005(hupA)
BPK: BBK_1428(hupB)
BPSH: DR55_1069(hupB)
BPSA: BBU_2099(hupB)
BPSO: X996_674(hupB)
BUT: X994_2663 X994_4402(hupB) X994_6524(hup)
BTE: BTH_I0004
BTQ: BTQ_23(hupB)
BTJ: BTJ_2422(hupB)
BTZ: BTL_365(hupB)
BTD: BTI_123(hupB)
BTV: BTHA_3318(hup) BTHA_419(hupB)
BTHE: BTN_1028(hupB)
BTHM: BTRA_539(hupB)
BTHA: DR62_1192
BTHL: BG87_539
BVE: AK36_5019(hup) AK36_691
BCJ: BCAL1585(hupB) BCAL3530(hupA) BCAS0551(BcepMu4)
BCEN: DM39_3339
BCEW: DM40_843
BCEO: I35_3310(hupA)
BAM: Bamb_0055
BMJ: BMULJ_00004(hupB)
BMU: Bmul_0066
BMK: DM80_1624
BMUL: NP80_196
BCED: DM42_1714
BDL: AK34_3020
BCON: NL30_19175
BUB: BW23_1643
BLAT: WK25_02355
BTEI: WS51_11165
BSEM: WJ12_00370
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BSTG: WT74_00480
BUK: MYA_0060
BUL: BW21_195
BXB: DR64_2179 DR64_4443(hupB) DR64_6277(hupB)
PDIO: PDMSB3_2032(hupB) PDMSB3_2198.1(hupB) PDMSB3_2495.1(hupB) PDMSB3_4335(hupB)
PNU: Pnuc_2026
PNE: Pnec_1743
PYT: PKF023_18790(hupB)
PLG: NCTC10937_04255(hupN)
HYF: DTO96_101005(hupB_1) DTO96_102165(hupB_2)
LMIR: NCTC12852_01161(hupB)
MYCO: MPB2EB_0039(hupA_1)
CABA: SBC2_16890(hupB_1) SBC2_35960(hupB_2) SBC2_37130(hupB_3) SBC2_77920(hup_1) SBC2_83730(hupB_4) SBC2_85160(hupB_5) SBC2_85760(hup_2)
VTR: MYVALT_G_00210(hupA)
VLA: GKR41_00011(hupB)
VCV: GJV44_00006(hupB)
BPE: BP3530(hupB)
BPC: BPTD_3477(hupB)
BPER: BN118_2729(hupB)
BPET: B1917_3309(hupB)
BPEU: Q425_5740(hupB)
BPAR: BN117_1859(hupB)
BPA: BPP2534(hupB)
BBH: BN112_1536(hupB)
BBR: BB1979(hupB) BB3653(hup)
BBM: BN115_3056(hupB)
BBX: BBS798_1880(hupB)
BPT: Bpet2703(hupB)
BAV: BAV2121(hupB)
BHO: D560_2675(hupB)
BHM: D558_2655(hupB)
BHZ: ACR54_02866(hupB)
BTRM: SAMEA390648703667(hopd)
AXY: AXYL_01959(hupB)
TEA: KUI_0753(hupB)
TEG: KUK_0591(hupB)
TAS: TASI_0931
TAT: KUM_0145(hupB)
PUT: PT7_0608
AMIM: MIM_c15620
BPSI: IX83_04210
AFQ: AFA_11230
ODI: ODI_R1737
RFR: Rfer_2248
PNA: Pnap_1633
PVAC: HC248_01384(hupB)
ACRA: BSY15_4110
AAV: Aave_1666
AAA: Acav_1696
VEI: Veis_2697
DAC: Daci_2879
CTEZ: CT3_27810(hupB)
RTA: Rta_24460(dbhB)
CBX: Cenrod_1492(hupB)
LIM: L103DPR2_02126(hupB)
LIH: L63ED372_01095(hupB)
HYB: Q5W_13185
HPSE: HPF_09685(hupB)
PBH: AAW51_0669(hupB) AAW51_0810(hupB) AAW51_2054(hupB)
MPT: Mpe_A1956
RGE: RGE_16250(hupB)
HAR: HEAR1749(hupB)
MMS: mma_1534(hupB)
JAG: GJA_2393(hupB)
JAH: JAB4_030260(hupB)
OFO: BRW83_0906(hupB)
UND: UNDKW_2078(hupB)
SUTT: SUTMEG_13610(hup_1) SUTMEG_17340(hup_2)
TIN: Tint_1133
THI: THI_1423(hupB)
NEU: NE2207(hupB)
NET: Neut_0661
MBAC: BN1209_0004(hupB) BN1209_1022(hupB)
MBAT: BN1208_1215(hupB)
MPAU: ZMTM_12050(hupB) ZMTM_25540(hup)
NIM: W01_04560(hup_1) W01_05130(hup_2)
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CCO: CCC13826_0021(hup)
CCOC: CCON33237_0816(hup)
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CLL: CONCH_1186(hup)
CCQ: N149_0887
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CCOF: VC76_04605(hup)
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CAVI: CAV_0371(hup)
CAMZ: CVIC12175_0768(hup)
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COJ: CORN_1297(hup)
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CCOR: CCORG_0730(hup)
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CINF: CINF_0877(hup)
CNV: CNZW441b_0661(hup)
CVU: CVULP_0638(hup)
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SMUL: SMUL_1597(hup) SMUL_1778
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ABT: ABED_1235
ABL: A7H1H_1318(hup)
ATP: ATR_1040(hup)
ACIB: ACBT_0190(hup1) ACBT_1384(hup2)
ACRE: ACRYA_1037(hup)
AFC: AFAEC_1257(hup)
ATHR: ATH_1096(hup1) ATH_1220(hup2)
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AAQI: AAQM_1174(hup)
ASUI: ASUIS_1222(hup)
ACLO: ACLO_1458(hup)
AVP: AVENP_1464(hup)
ADZ: ADFLV_1375(hup)
ARC: ABLL_1378
PACO: AACT_1404(hup)
ALK: ALEK_2080(hup)
AHS: AHALO_1544(hup)
AMYT: AMYT_1648(hup)
AMAR: AMRN_1567(hup)
ACAA: ACAN_1596(hup)
AMOL: AMOL_1607(hup)
APAI: APAC_1373(hup)
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HEBR: AEBR_1740(hup)
AANA: AANAER_1713(hup)
HYO: NNO_0825
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SUN: SUN_1882
NIS: NIS_0825(hup)
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GEO: Geob_3817(hup-1)
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GBM: Gbem_0188(hup-1) Gbem_1275(hup-2)
GBN: GEOBRER4_01740(hup_1) GEOBRER4_28510(hup_2)
PCA: Pcar_1686(hup)
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DVE: DESUT3_28440(hup)
DEP: AOP6_1158
DES: DSOUD_2421(lon-3) DSOUD_2626
DTR: RSDT_0019(hupB)
DHY: DESAM_20131(hbs) DESAM_22019(yonN)
DPI: BN4_10526(hupB) BN4_20321(hup)
PPRF: DPRO_0357(hupB) DPRO_3825(hupA)
PSEF: PSDVSF_04680(hup-3_1) PSDVSF_10500(hup-3_2)
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TFO: BFO_2499 BFO_2886(hup_2) BFO_2904(hup_3)
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DFE: Dfer_4435
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CHE: CAHE_0307(ihfB)
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CENG: CAOE_0140(ihfB)
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PPSV: PEPS_01740
GFO: GFO_1443(hupB) GFO_3575
FPS: FP1666(hupA) FP2008(hupB)
FBR: FBFL15_1088(hupB) FBFL15_3077(hupA)
FIN: KQS_02015(hupA) KQS_07495(hupB)
FCS: TRV642_0157(hupB) TRV642_1563(ihfA)
FAO: SHINM13_02970(hupA) SHINM13_11730(hupB)
FAN: GENT5_03080(hupA) GENT5_11170(hupB)
DDO: I597_0844 I597_1639(hupB)
ZGA: ZOBELLIA_1374(hupA) ZOBELLIA_3961(hupB)
NDO: DDD_1563 DDD_2844(hupB)
TMAR: MARIT_0114(hupA) MARIT_1404(hupB)
ELB: VO54_01245(hup) VO54_02118(hupB)
CHZ: CHSO_1247 CHSO_4082(hup)
CTAK: 4412677_02049(hupB) 4412677_02467(hup)
CSAL: NBC122_01716(hup) NBC122_01771(hupB)
BPOR: BPO_0098(hupB) BPO_2222(hupB)
BBL: BLBBGE_051(hupB) BLBBGE_543(hupA)
BPI: BPLAN_098 BPLAN_582(hupB)
BMM: MADAR_264 MADAR_554(hupB)
BCP: BLBCPU_050(hupB) BLBCPU_512(hupA)
BBG: BGIGA_096(hupA) BGIGA_575(hupB)
BLP: BPAA_095 BPAA_581(hupB)
CTE: CT0160(hupB) CT0295
PROC: Ptc2401_00272(hupB) Ptc2401_01884(hupA)
RMR: Rmar_1519
SRU: SRU_1377
SRM: SRM_01572(himA)
IAL: IALB_0305(hupB) IALB_2218
CPRV: CYPRO_1703
CACI: CLOAM0973(hupA) CLOAM1727
HTH: HTH_0513(himA)
TTK: TST_0149
TMA: TM0266
TMW: THMA_0273
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TLE: Tlet_1411
TME: Tmel_0429
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FNO: Fnod_0010
PMO: Pmob_1910
MARN: LN42_05170
MINF: MESINF_1858(hup) MESINF_2678(hup)
CEX: CSE_00700(hup) CSE_00740 CSE_02030(hup)
MSCH: N508_000332(hup)
CABY: Cabys_2157
DTU: Dtur_1514
NDE: NIDE0404(hupA) NIDE4047(hupB)
NMV: NITMOv2_0330(hupB) NITMOv2_4345(hupB)
NIO: NITINOP_0049(hupB) NITINOP_0763(hup)
NJA: NSJP_0592(hupB) NSJP_1457(hupB)
NIF: W02_20260(hupB) W02_26830(hupB)
LFC: LFE_2021
NWT: NSPWAT_0786(hup) NSPWAT_1356(ihfA)
ALAM: RT761_02004(hup)
BANA: BARAN1_0405(hup)
SRG: XF24_00197(hup)
MOX: DAMO_1382(hup) DAMO_2562(hupB)
DPB: BABL1_gene_113(hupA) BABL1_gene_783(hupB)
HLA: Hlac_2572
TAC: Ta0093
TVO: TVG0171266(TVG0171266)
PTO: PTO0375
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VG: 11295044(RcapMu21) 1261351(yonN) 26794851(AXJ14_gp005) 26797505(hupA) 2845937(BcepMu04) 4960741(BTHphiE255_0035) 6904202(KS10_gp23)
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Reference
  Authors
Bartosik AA, Jagura-Burdzy G
  Title
Bacterial chromosome segregation.
  Journal
Acta Biochim Pol 52:1-34 (2005)
Reference
  Authors
Dame RT
  Title
The role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin.
  Journal
Mol Microbiol 56:858-70 (2005)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2005.04598.x
Reference
  Authors
Azam TA, Ishihama A
  Title
Twelve species of the nucleoid-associated protein from Escherichia coli. Sequence recognition specificity and DNA binding affinity.
  Journal
J Biol Chem 274:33105-13 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.46.33105
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