KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
KEGG は分子レベルの情報から細胞、個体、エコシステムといった高次生命システムレベルの機能や有用性を理解するためのリソースです。とくにゲノムをはじめとしたハイスループットデータの生物学的意味解釈に広く利用されています。また KEGG MEDICUS では医薬品添付文書など社会的ニーズの高いデータとの統合も行われています。
新規・更新等の内容は英文の Release notes (January 1, 2025) をご覧ください。
新規・更新等の内容は英文の Release notes (January 1, 2025) をご覧ください。
Announcement: Updated procedure to generate organism-specific pathways
KEGG の主要エントリーポイント
- KEGG2
- KEGG の目次のページ [Update notes | Release history]
データタイプごとのエントリーポイント
- KEGG PATHWAY
- KEGG パスウェイマップ
- KEGG BRITE
- BRITE 機能階層・テーブル
- KEGG MODULE
- KEGG モジュール
- KEGG ORTHOLOGY
- KO 機能オーソログ
- KEGG GENES
- 遺伝子・タンパク質 [KEGG Virus]
- KEGG GENOME
- ゲノム [Taxonomy | Synteny]
- KEGG COMPOUND
- 化合物
- KEGG GLYCAN
- 糖鎖
- KEGG REACTION
- 化学反応 [RModule]
- KEGG ENZYME
- 酵素
- KEGG NETWORK
- 疾患関連のネットワーク多様性
- KEGG DISEASE
- 疾患 (日本語)
- KEGG DRUG
- 医薬品 (日本語) [日米欧の新薬]
- KEGG MEDICUS
- 疾患・医薬品の統合リソース (日本語) [添付文書検索]
生物種ごとのエントリーポイント
解析ツール
- KEGG Mapper
- PATHWAY/BRITE/MODULE 等へのマッピングツール群
- KEGG Web Apps
- Pathway viewer の色付け機能など
- KEGG Syntax
- 保存された遺伝子, 遺伝子セット, 遺伝子の並びの解析
- KEGG Annotation
- KO アノテーションとバリデーション
- BlastKOALA
- BLAST による KO アノテーションと KEGG マッピング
- GhostKOALA
- GHOSTX による KO アノテーションと KEGG マッピング
- BLAST/FASTA
- 類似配列検索
- SIMCOMP
- 類似化学構造検索