KEGG   ORTHOLOGY: K08311
Entry
K08311                      KO                                     
Symbol
nudH
Name
putative (di)nucleoside polyphosphate hydrolase [EC:3.6.1.-]
Pathway
map03018  RNA degradation
Reaction
R10816  5'-triphospho-[mRNA] diphosphatase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K08311  nudH; putative (di)nucleoside polyphosphate hydrolase
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K08311  nudH; putative (di)nucleoside polyphosphate hydrolase
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     K08311  nudH; putative (di)nucleoside polyphosphate hydrolase
Other DBs
COG: COG0494
Genes
OLU: OSTLU_26314
OTA: OT_ostta10g03435
BPG: Bathy11g03670
MIS: MICPUN_59826
MPP: MICPUCDRAFT_50548(JGI:MicpuC2_50548)
ACAN: ACA1_283280
TPS: THAPSDRAFT_261112
GTT: GUITHDRAFT_64091
ECO: b2830(rppH)
ECJ: JW2798(nudH)
ECD: ECDH10B_3000(nudH)
EBW: BWG_2565(rppH)
ECOK: ECMDS42_2336(nudH)
ECOC: C3026_15535
ECE: Z4147(ygdP)
ECS: ECs_3687(rppH)
ECF: ECH74115_4096(nudH)
ETW: ECSP_3782(nudH)
ELX: CDCO157_3442
EOI: ECO111_3558(rppH)
EOJ: ECO26_3902(rppH)
EOH: ECO103_3389(rppH)
ECOO: ECRM13514_3693(ygdP)
ECOH: ECRM13516_3557(ygdP)
ESL: O3K_05360
ESO: O3O_20290
ESM: O3M_05405
ECK: EC55989_3106(nudH)
ECG: E2348C_3099(nudH)
EOK: G2583_3484(nudH)
ELR: ECO55CA74_16605
ELH: ETEC_3017
ECW: EcE24377A_3150(nudH)
EUN: UMNK88_3514
ECP: ECP_2843
ENA: ECNA114_2888(ygdP)
ECOS: EC958_3129(nudH)
ECV: APECO1_3675(ygdP)
ECOA: APECO78_17755
ECX: EcHS_A2976(nudH)
ECM: EcSMS35_2977(nudH)
ECY: ECSE_3087
ECR: ECIAI1_2938(nudH)
ECQ: ECED1_3286(nudH)
EUM: ECUMN_3157(nudH)
ECT: ECIAI39_3249(nudH)
EOC: CE10_3257(rppH)
EBR: ECB_02678(ygdP)
ECOB: C3029_18120
EBL: ECD_02678(rppH)
EBE: B21_02639(rppH)
EBD: ECBD_0895
ECI: UTI89_C3232(nudH)
EIH: ECOK1_3234(nudH)
ECZ: ECS88_3125(nudH)
ECC: c3425(ygdP)
ELO: EC042_3027(nudH)
ELN: NRG857_13980
ESE: ECSF_2645
ECL: EcolC_0885
EKO: EKO11_0911
EKF: KO11_08655(rppH)
EAB: ECABU_c31270(nudH)
EDH: EcDH1_0861
EDJ: ECDH1ME8569_2737(nudH)
ELU: UM146_02275
ELW: ECW_m3072(rppH)
ELL: WFL_15005(rppH)
ELC: i14_3146(ygdP)
ELD: i02_3146(ygdP)
ELP: P12B_c2923(ygdP)
ELF: LF82_1534(nudH)
ECOL: LY180_14530
ECOI: ECOPMV1_03117(rppH)
ECOJ: P423_15650
EFE: EFER_2763(nudH)
EAL: EAKF1_ch3186(nudH)
EMA: C1192_21425
ESZ: FEM44_04070(rppH)
ERUY: OSH18_17600(rppH)
STY: STY3145
STT: t2913
SEX: STBHUCCB_30710
SENT: TY21A_14725
STM: STM3004(ygdP)
SEO: STM14_3621(ygdP)
SEV: STMMW_29651
SEY: SL1344_2982(nudH)
SEM: STMDT12_C30540
SEJ: STMUK_2992(ygdP)
SEB: STM474_3150(ygdP)
SEF: UMN798_3264(rppH)
SETU: STU288_15185
SETC: CFSAN001921_02045
SENR: STMDT2_29031(nudH)
SEND: DT104_30001(nudH)
SENI: CY43_15665
SEEN: SE451236_21120
SPT: SPA2869(ygdP)
SEK: SSPA2674
SPQ: SPAB_03737
SEI: SPC_3062(ygdP)
SEC: SCH_2943(ygdP)
SEH: SeHA_C3217(nudH)
SHB: SU5_03492
SENH: CFSAN002069_17195
SEEH: SEEH1578_01075
SEE: SNSL254_A3232(nudH)
SENN: SN31241_41150
SEW: SeSA_A3168(nudH)
SEA: SeAg_B3151(nudH)
SENS: Q786_14530
SED: SeD_A3331(nudH)
SEG: SG2912(ygdP)
SEL: SPUL_3014
SEGA: SPUCDC_3000
SET: SEN2846(ygdP)
SENA: AU38_14465
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SENV: AU39_14470
SENQ: AU40_16285
SENL: IY59_15065
SENJ: CFSAN001992_18550
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SEEB: SEEB0189_005100
SEEP: I137_14325
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SENE: IA1_14465
SENC: SEET0819_21890
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SBZ: A464_3020
SBV: N643_12780
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SFL: SF2840(ygdP)
SFX: S3038(ygdP)
SFV: SFV_2908(ygdP)
SFE: SFxv_3114(rppH)
SFN: SFy_4047
SFS: SFyv_4125
SFT: NCTC1_03125(nudH)
SSN: SSON_2987(ygdP)
SBO: SBO_2722(ygdP)
SBC: SbBS512_E3032(nudH)
SDY: SDY_3047(ygdP)
SDZ: Asd1617_04080
SHQ: A0259_17755
ENC: ECL_04152
ENL: A3UG_18300
ECLG: EC036_35730
ECLE: ECNIH2_18475
ECLN: ECNIH4_04665
ECLI: ECNIH5_17250
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EXF: BFV63_17785
ECLA: ECNIH3_17335
ECLC: ECR091_17270
EAU: DI57_01185
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ENO: ECENHK_18000
EEC: EcWSU1_03630(rppH)
ECAN: CWI88_04360
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ECLS: LI67_019320
ECHG: FY206_19830(rppH)
ESH: C1N69_18525
EPT: HWQ17_17930(rppH)
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ENX: NI40_017920
ENF: AKI40_0934
LNI: CWR52_16935
EBG: FAI37_11065(rppH)
END: A4308_02745
ENS: HWQ15_03525(rppH)
ENK: LOC22_06300(rppH)
EHU: D5067_0004570(rppH)
EMOR: L6Y89_17480(rppH)
ENB: ELK40_18585
EQU: OM418_17780(rppH)
EPU: QVH39_18815(rppH)
ESA: ESA_00479
CSK: ES15_0745(nudH)
CSZ: CSSP291_02475
CSJ: CSK29544_01736
CCON: AFK62_15945
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CSI: P262_01108
CMJ: AFK66_003565
CUI: AFK65_15710
CMW: AFK63_02550
CTU: CTU_33790(rppH)
KPN: KPN_03239(ygdP)
KPU: KP1_4509(ygdP)
KPM: KPHS_43020
KPP: A79E_0871
KPH: KPNIH24_07280
KPZ: KPNIH27_20850
KPV: KPNIH29_21620
KPW: KPNIH30_21640
KPY: KPNIH31_20905
KPG: KPNIH32_22500
KPC: KPNIH10_21435
KPQ: KPR0928_20925
KPT: VK055_4286(nudH)
KPO: KPN2242_19145
KPR: KPR_1794(rppH)
KPJ: N559_0999
KPI: D364_16440
KPA: KPNJ1_01005
KPS: KPNJ2_01036
KPX: PMK1_00720(rppH)
KPB: FH42_12155
KPNE: KU54_004930
KPNU: LI86_04940
KPNK: BN49_0869(rppH)
KVA: Kvar_0831
KPE: KPK_0876(nudH)
KPK: A593_06325
KVD: KR75_03775
KVQ: SP68_10320
KOX: KOX_01620
KOE: A225_4791
KOY: J415_08075
KOM: HR38_00080
KMI: VW41_19360
KOK: KONIH1_24065
KOC: AB185_12330
EAE: EAE_02150
EAR: CCG33560
KQV: B8P98_04855
KLL: BJF97_23895
KLW: DA718_05280
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KLC: K7H21_04975(rppH)
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REE: electrica_00877(rppH)
ROR: RORB6_23370
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RTG: NCTC13098_01287(rppH)
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KLU: K7B04_09645(rppH)
KCY: RIN60_04405(rppH)
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SPE: Spro_3824
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SOF: NCTC11214_02802(rppH)
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RAA: Q7S_03910
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RBON: QNM34_04240(rppH)
RIU: I2123_06125(rppH)
GQU: AWC35_16580
FSM: CCS41_13335
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RBAD: H2866_04085(rppH)
RCB: O1V66_21345(rppH)
CARU: P0E69_04090(rppH)
NIG: C1N62_03135
PROD: PCO85_05820(rppH)
SERA: Ser39006_019675
SERQ: CWC46_19675
ECA: ECA0985(nudH)
PATR: EV46_05030
PATO: GZ59_10200
PCT: PC1_0904
PCC: PCC21_009270
PCV: BCS7_04780
PWA: Pecwa_3399
PPAR: A8F97_01655
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Reference
PMID:18202662
  Authors
Deana A, Celesnik H, Belasco JG
  Title
The bacterial enzyme RppH triggers messenger RNA degradation by 5' pyrophosphate removal.
  Journal
Nature 451:355-8 (2008)
DOI:10.1038/nature06475
  Sequence
[eco:b2830]
LinkDB

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