KEGG   ORTHOLOGY: K06968
Entry
K06968                      KO                                     
Symbol
rlmM
Name
23S rRNA (cytidine2498-2'-O)-methyltransferase [EC:2.1.1.186]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K06968  rlmM; 23S rRNA (cytidine2498-2'-O)-methyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.186  23S rRNA (cytidine2498-2'-O)-methyltransferase
     K06968  rlmM; 23S rRNA (cytidine2498-2'-O)-methyltransferase
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic type
  rRNA modification factors
   23S rRNA modification factors
    K06968  rlmM; 23S rRNA (cytidine2498-2'-O)-methyltransferase
Other DBs
COG: COG2933
GO: 0070677
Genes
ECO: b2806(rlmM)
ECJ: JW2777(ygdE)
ECD: ECDH10B_2975(ygdE)
EBW: BWG_2544(ygdE)
ECOK: ECMDS42_2311(ygdE)
ECOC: C3026_15425
ECE: Z4123(ygdE)
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ETW: ECSP_3758(ygdE)
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EOJ: ECO26_3876(rlmM)
EOH: ECO103_3349(rlmM)
ECOO: ECRM13514_3670(ygdE)
ECOH: ECRM13516_3534(ygdE)
ESL: O3K_05465
ESO: O3O_20185
ESM: O3M_05510
ECK: EC55989_3085(ygdE)
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EOK: G2583_3459(ygdE)
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ECP: ECP_2789
ENA: ECNA114_2846(ygdE)
ECOS: EC958_3076(ygdE)
ECV: APECO1_3725(ygdE)
ECY: ECSE_3066
ECR: ECIAI1_2916(ygdE)
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EUM: ECUMN_3135(ygdE)
ECT: ECIAI39_3228(ygdE)
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EBR: ECB_02657(ygdE)
EBL: ECD_02657(rlmM)
EBE: B21_02618(rlmM)
EBD: ECBD_0916
ECI: UTI89_C3178(ygdE)
ECZ: ECS88_3075(ygdE)
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EDJ: ECDH1ME8569_2716(ygdE)
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ELL: WFL_14735(ygdE)
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STY: STY3120(ygdE)
STT: t2888(ygdE)
STM: STM2980(ygdE)
SEO: STM14_3594(ygdE)
SEY: SL1344_2960(ygdE)
SEJ: STMUK_2968(ygdE)
SEB: STM474_3126(ygdE)
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SEND: DT104_29781(ygdE)
SENI: CY43_15545
SPT: SPA2844(ygdE)
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SEI: SPC_3039(ygdE)
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SFE: SFxv_3093(ygdE)
SFN: SFy_4016
SFS: SFyv_4094
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EHU: D5067_0004690(rlmM)
EMOR: L6Y89_17360(rlmM)
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EQU: OM418_17660(rlmM)
EPU: QVH39_18695(rlmM)
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CSK: ES15_0766(rlmM)
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KPU: KP1_4437(ygdE)
KPP: A79E_0937
KPT: VK055_4354(mtfA)
KPR: KPR_4171(rlmM)
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KPX: PMK1_00640(rlmM)
KPNU: LI86_05280
KPNK: BN49_0955(rlmM)
KVA: Kvar_0896
KPE: KPK_0960
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KOE: A225_4721
EAE: EAE_02050
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KLW: DA718_05630(rlmM)
KAR: LGL98_04780(rlmM)
KGR: JJJ10_05655(rlmM)
KPAS: LUW96_01380(rlmM)
KLC: K7H21_05320(rlmM)
REE: electrica_00906(rlmM)
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CRO: ROD_28511(mtfA)
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CPOT: FOB25_16155(rlmM)
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CITZ: E4Z61_21440(rlmM)
CARS: E1B03_21350(rlmM)
CIX: M4I31_04645(rlmM)
CIB: HF677_004550(rlmM)
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EBT: EBL_c08240(ygdE)
CLAP: NCTC11466_00704(rlmM)
KOR: AWR26_04720(rlmM)
KOT: EH164_04135(rlmM)
KPSE: IP581_18510(rlmM)
KOB: HF650_19380(rlmM)
KOO: O9K67_04730(rlmM)
KIE: NCTC12125_04893(rlmM)
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KLU: K7B04_09860(rlmM)
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LEA: GNG26_17825(rlmM)
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YRE: HEC60_13630(rlmM)
SGOE: A8O29_004905(rlmM)
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METY: MRY16398_10100(rlmM)
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PSHI: SAMEA2665130_2410(rlmM)
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PVJ: LMA04_16380(rlmM)
SUPE: P0H77_17320(rlmM)
TOE: QMG90_05370(rlmM)
EBF: D782_0915
EBB: F652_2492(rlmM)
PSTS: E05_46370
YPE: YPO1031
YPK: y3152
YPH: YPC_1065(ygdE)
YPA: YPA_0502
YPN: YPN_2971
YPM: YP_2820
YPZ: YPZ3_0938
YPD: YPD4_0896
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YPW: CH59_830
YPJ: CH55_3780
YPV: BZ15_2539
YPL: CH46_4113
YPS: YPTB3015
YPO: BZ17_3605
YPY: YPK_1054
YPB: YPTS_3136
YPQ: DJ40_3466(rlmM)
YPU: BZ21_2329
YPR: BZ20_3150
YPC: BZ23_2609
YPF: BZ19_2393
YEN: YE3298
YEY: Y11_40881
YEW: CH47_247(rlmM)
YET: CH48_748
YAL: AT01_1613
YFR: AW19_2278(rlmM)
YIN: CH53_2708
YKR: CH54_3508
YRO: CH64_1685
YRU: BD65_1207
YHI: D5F51_17270(rlmM)
YCA: F0T03_17105(rlmM)
YMO: HRD69_00470(rlmM)
YAS: N0H69_07790(rlmM)
YKI: HRD70_00060(rlmM)
SMAR: SM39_3405(mtfA)
SMAC: SMDB11_3194(mtfA)
SMW: SMWW4_v1c39240(rlmM)
SPE: Spro_3803
SRL: SOD_c37680(rlmM)
SPLY: Q5A_020065(rlmM)
SMAF: D781_3542
SERF: L085_09070
SQU: E4343_21415(rlmM)
SFJ: SAMEA4384070_3921(rlmM)
SOF: NCTC11214_02835(rlmM)
SURI: J0X03_04375(rlmM)
SRHZ: FO014_15625(rlmM)
SENP: KHA73_19090(rlmM)
SNEM: NLX84_19755(rlmM)
SNEV: OI978_12375(rlmM)
RACE: JHW33_20930(rlmM)
RAA: Q7S_04000
RVC: J9880_11880(rlmM)
RBON: QNM34_04345(rlmM)
RIU: I2123_06230(rlmM)
EAME: GXP68_03515(rlmM)
RBAD: H2866_03965(rlmM)
RCB: O1V66_21465(rlmM)
CARU: P0E69_04210(rlmM)
PROD: PCO85_05945(rlmM)
ECA: ECA1017
PATR: EV46_05200
PATO: GZ59_10550
PCT: PC1_0929
PEC: W5S_3374
PPUJ: E2566_05355(rlmM)
PARI: I2D83_17315(rlmM)
PAQU: DMB82_0015800(rlmM)
PVZ: OA04_10730(rlmM)
PPAV: LOZ86_16980(rlmM)
PQU: IG609_015415(rlmM)
PPOO: LW347_05315(rlmM)
PCAC: OI450_04060(rlmM)
PACB: M9782_07225(rlmM)
DDD: Dda3937_04309(ygdE)
DDQ: DDI_0763
DAQ: DAQ1742_03337(rlmM)
DIC: Dpoa569_002808(rlmM)
DLC: O1Q98_16695(rlmM)
BRB: EH207_03685(rlmM)
BNG: EH206_17570(rlmM)
BIZ: HC231_17975(rlmM)
LPOP: I6N93_04335(rlmM)
SGL: SG1954
SOD: Sant_0880(rlmM)
SLIG: GTU79_05025(rlmM)
EAM: EAMY_0723(ygdE)
EAY: EAM_2717(mtfA)
ETA: ETA_27340(mtfA)
EPY: EpC_28530(mtfA)
EPR: EPYR_03087(ygdE)
EBI: EbC_35650
ERJ: EJP617_18840(mtfA)
ERWI: GN242_04135(rlmM)
ETP: LU633_18480(rlmM)
ERP: LJN55_18290(rlmM)
ETO: RIN69_17950(rlmM)
EGE: EM595_2838(rlmM)
PAM: PANA_3095(mtfA)
PLF: PANA5342_0938(mtfA)
PAJ: PAJ_2370(mtfA)
PVA: Pvag_2478(ygdE)
PSTW: DSJ_05040
PANS: FCN45_15090(rlmM)
PEY: EE896_04120(rlmM)
PDIS: D8B20_13715(rlmM)
PER: LAC65_12705(rlmM)
PJI: KTJ90_04010(rlmM)
PANO: OJ965_06465(rlmM)
KPIE: N5580_14295(rlmM)
PALF: K6R05_04055(rlmM)
MINT: C7M51_02562(rlmM)
MTHI: C7M52_00294(rlmM)
MHAN: K6958_16475(rlmM)
TPTY: NCTC11468_00875(rlmM)
PLU: plu0654
PAY: PAU_00604(ygdE)
PMR: PMI2299
PHAU: PH4a_03745
PCOL: F1325_14940(rlmM)
PCIB: F9282_15385(rlmM)
PPEE: I6G31_12850(rlmM)
XBO: XBJ1_0492(ygdE)
XBV: XBW1_4195(rlmM)
XNE: XNC1_4026(ygdE)
XNM: XNC2_3879(ygdE)
XDO: XDD1_3346(rlmM)
XPO: XPG1_0283(rlmM)
XBU: HGO23_16795(rlmM)
XGR: QL128_17955(rlmM)
PSI: S70_14950
PSX: DR96_305(rlmM)
PTHA: OI982_08625(rlmM)
PRG: RB151_035630(rlmM)
PHEI: NCTC12003_03071(rlmM)
PRQ: CYG50_20690(rlmM)
PRJ: NCTC6933_03171(rlmM)
PVC: G3341_15665(rlmM)
PMAG: JI723_15830(rlmM)
PHAG: PZ638_15990(rlmM)
MMK: MU9_920
ANS: ArsFIN_06060(rlmM)
AED: E3U36_11640(rlmM)
AET: LDL57_03720(rlmM)
AAPC: QG404_03690(rlmM)
MWI: MNY66_02680(rlmM)
ETR: ETAE_0721
ETD: ETAF_0663
ETE: ETEE_2486
EDL: AAZ33_03425(rlmM)
PRAG: EKN56_03960(rlmM)
LRI: NCTC12151_00694(rlmM)
GKN: PVT67_13060(rlmM)
HIN: HI_1195
HIT: NTHI1366
HIU: HIB_13530
HIE: R2846_1149(rlmM)
HIZ: R2866_1208(rlmM)
HIK: HifGL_000897(rlmM)
HIA: H733_1260(rlmM)
HIW: NTHI477_00543(rlmM)
HIC: NTHIC486_01550(rlmM)
HIX: NTHI723_00452(rlmM)
HDU: HD_1396
HPIT: NCTC13334_01150(rlmM)
HHZ: NCTC10839_01740(rlmM)
HAEG: NCTC8502_01322(rlmM)
HPAA: E5Q53_00550(rlmM)
HSEM: L3077_05110(rlmM)
HSO: HS_0496
HSM: HSM_1775
PMU: PM0568
PMP: Pmu_06350
PMUL: DR93_1347(rlmM)
PDAG: 4362423_00904(rlmM)
PATL: KGI96_03800(rlmM)
PCAI: K7G93_000650(rlmM)
MSU: MS0894
MHAT: B824_13320
MHX: MHH_c20310(rlmM)
MHAE: F382_01390
MHAM: J450_00825
MHAO: J451_01980
MHAL: N220_06770
MHAQ: WC39_07035
MHAY: VK67_07035
MVG: X874_9820
MBOS: ICJ55_07840(rlmM)
MPEG: HV560_07600(rlmM)
MANN: GM695_07725(rlmM)
APL: APL_0685(mtfA)
APJ: APJL_0683(mtfA)
APA: APP7_0727(mtfA)
ASU: Asuc_1696
AIO: EXH44_00275(rlmM)
ADP: NCTC12871_00198(rlmM)
ALIG: NCTC10568_00752(mtfA)
AART: NYR89_03765(rlmM)
AGP: NYR63_03520(rlmM)
AAT: D11S_1110
AAN: D7S_00231
AACN: AANUM_1963
ASEG: NCTC10977_01572(rlmM)
AGJ: J5A60_05395(rlmM)
GSS: NYR30_02135(rlmM)
BTO: WQG_12610
BTRE: F542_9430
BTRH: F543_10770
BTRA: F544_12990
AVT: NCTC3438_01575(rlmM)
RPNE: NCTC8284_01529(rlmM_1)
RHEY: FEE42_03395(rlmM)
RHAE: IHV77_02170(rlmM)
PAET: NCTC13378_00447(rlmM)
XFA: XF_0748
XFT: PD_1906
XCC: XCC0816
XCB: XC_3414
XCP: XCR_0997
XCV: XCV0924
XAX: XACM_0870
XAC: XAC0889
XFU: XFF4834R_chr08950(rlmM)
XOM: XOO3514(XOO3514)
XOO: XOO3721
XOP: PXO_04620
XOR: XOC_0941
XAL: XALC_2748(mtfA)
XPH: XppCFBP6546_07065(rlmM)
XHY: FZ025_04980(rlmM)
XCZ: EBN15_03410(rlmM)
XTH: G4Q83_22000(rlmM)
XEU: XSP_000875(rlmM)
XHD: LMG31886_34520(rlmM)
XPR: MUG10_05630(rlmM)
XDY: NYR95_05130(rlmM)
SML: Smlt0828
SMT: Smal_0678
SMZ: SMD_0709
SINC: DAIF1_07380(rlmM)
SPAQ: STNY_R07430(rlmM)
STEQ: ICJ04_15235(rlmM)
SGEN: RKE57_03280(rlmM)
PSUW: WQ53_11895
PSD: DSC_05495
PMEX: H4W19_17535(rlmM)
PJP: LAG73_13045(rlmM)
PDD: MNQ95_10410(rlmM)
PWI: MWN52_07060(rlmM)
LAB: LA76x_4024(mtfA)
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KKO: Kkor_0724
KGE: TQ33_1657
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Reference
  Authors
Purta E, O'Connor M, Bujnicki JM, Douthwaite S
  Title
YgdE is the 2'-O-ribose methyltransferase RlmM specific for nucleotide C2498 in bacterial 23S rRNA.
  Journal
Mol Microbiol 72:1147-58 (2009)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2009.06709.x
LinkDB

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