KEGG   ORTHOLOGY: K28363
Entry
K28363                      KO                                     
Symbol
K28363
Name
basic helix-loop-helix transcription factor family protein
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K28363  K28363; basic helix-loop-helix transcription factor family protein
Transcription factors [BR:ko03000]
 Eukaryotic type
  Basic helix-loop-helix (bHLH)
   HLH domain only
    K28363  K28363; basic helix-loop-helix transcription factor family protein
Genes
OSA: 107275794 4323849 4323850 4336634 4336636 4350228
DOSA: Os04g0557200 Os04g0557800
OBR: 102700541 102706469 102706748 102710936 102717978
OGL: 127755101 127769717 127769718 127769916 127778457 127778644 127780386
BDI: 100838549 100839663
ATS: 109740362 109741209 109749032 109752648 109762939 109763567 109769828 109780354 141027697
TDC: 119273212 119292366 119293120 119303917 119350260 119356109 119359809 119365249
TAES: 123046354 123050842 123054208 123077791 123077799 123090455 123094075 123098945 123099260 123100078 123100823 123102692 123108266 123108603 123177137 123177333 123177748 123180465 123180469 123190100
TUA: 125511268 125513249 125528217 125531627 125539376 125552454
HVG: 123425070 123430672 123446715
LPER: 127300763 127335982 127335983 127335988
LRD: 124647492 124647500 124671494 124671650 124671651 124675634 124675819 124675821 124676366 124676451
SBI: 8056589 8056590 8056591 8069098
ZMA: 100126972(R-S) 103632119 103646088
MFLO: 136491185 136491272 136491274 136493374 136496730 136545465 136551193
SITA: 101757325 101759415 101781015
SVS: 117845495 117862856 140222755
PVIR: 120642752 120662399 120667911 120681544
PHAI: 112880827 112886872 112899281
PAUA: 133887749 133890214 133892003 133924737
TANG: 140762746 140776706
PDA: 103708013 103719368 120106511
EGU: 105033687 105036198 105042879
MUS: 103970344 103993256 135606522 135611580 135611582 135611583 135611814 135611815 135615292 135626571
ZOF: 121971831 121976873 121981764 121985621 122010082 122016048
DCT: 110097687 110111891 110114654
PEQ: 110029054 110031135 110032926
AOF: 109832464 109837143
ATH: AT1G63650(EGL3) AT4G00480(ATMYC1) AT4G09820(TT8) AT5G41315(GL3)
ALY: 9304677 9310658 9311092 9322461
CRB: 17880651 17883090 17883315 17894080
CSAT: 104703987 104705310 104707270 104711976 104714717 104719799 104721634 104728444 104729975 104736975 104737730 104753034 104754325 104778515
EUS: EUTSA_v10023356mg EUTSA_v10027709mg EUTSA_v10028584mg EUTSA_v10029523mg
BRP: 103836915 103838089 103838261(EGL3) 103838877(TT8) 103858868 103864070
BNA: 106360955 106366513 106388711 106390918 106392188 106393678 106424835 106434935 111215037 125593194
BOE: 106313615 106315722 106315886 106316105 106334332 106337763
RSZ: 108824151 108824417 108827262 108838184 108853880 130499747 130509528
THJ: 104801584 104814104 104817624 104817999 104823586
CPAP: 110814806 110820726
CIT: 102606766 102619013 102624378 127901489
CIC: CICLE_v10019118mg CICLE_v10019219mg CICLE_v10019338mg
PVY: 116122009 116134274 116136944 116142634
MINC: 123204430 123210251 123211651 123215681 123222968 123224188
TCC: 18606528 18613371 18614140
GRA: 105792224 105792257 105801914 105802696 105803102
GHI: 107904486 107911518 107912431 107922777 107922841 107934398 107936498 107936704
GAB: 108464775 108467406 108470159 108471035 108473678
HSYR: 120126003 120136118 120139886 120158345 120161351 120172019 120181541 120183142 120194094 120206162
DZI: 111287019 111291307 111304733 111305184 111306671 111314220
EGR: 104441743 104442098 104443817 104457006
RARG: 115746522 115748624 115756105 115756940
GMX: 100780422 100783746 100786815 100795524 100798122 100802733 100807157 100808167
GSJ: 114369898 114390147 114399700 114405745 114406850 114413382 114418440 114421017
PVU: 137812642 137814205 137818939 137829702
VRA: 106757183 106769304 106771187 106772905
VAR: 108321177 108323198 108326438 108346228
VUN: 114165112 114178756 114181570 114190521
VUM: 124827921 124830565 124832771 124838773
CCAJ: 109791575 109801246 109808676 109817840
APRC: 113850531 113854698 113862120 113868862 113872240
MTR: 11429566 25502049
TPRA: 123910439 123915944 123924603
CAM: 101498962 101506726
PSAT: 127096702 127105581
VVO: 131603639 131644403
LJA: 130714498 130717835 130746112
ADU: 107472380 107475781 107479936 107488130 107492985
AIP: 107621381 107627910 107630786 107640232 107645168
AHF: 112696201 112726262 112728421 112730361 112732736 112749663 112754542 112790889 112801471
LANG: 109332165 109341268 109346631 109349956 109355048 109359269
PCIN: 129284635 129290210 129297880 129305729 129310981
QSA: O6P43_007050 O6P43_010644 O6P43_017626 O6P43_027232 O6P43_034250
FVE: 101292858 101294992 101306913
AANS: 126782956 126796006 126801906
RCN: 112170399 112180015 112182591
PPER: 18767836 18776558 18784676
PMUM: 103331988 103334112 103337451
PAVI: 110744985 110747121 110749842 110762528
PDUL: 117618820 117628088 117636849
MDM: 103425271 103432522 103449015 103454760 114821796 114826062
MSYL: 126591005 126600625 126617331 126624943 126627685 126629639
PXB: 103932269 103938467 103947578 103954825 103954833 103957427
PCOX: 137710963 137712683 137715591 137720413 137733707 137742722
ZJU: 107407443 107423592 107426439
MNT: 21400285 21407019 21407775
CSAV: 115703590 115717045
HLP: 133778422 133792039 133796712
CSV: 101213187 101222463(GL3)
CMO: 103491332 103497716
BHJ: 120067702 120078068
MCHA: 111022687 111024343
CMAX: 111491262 111499229
CMOS: 111437375 111460355
CPEP: 111795671 111807332
RCU: 8261878 8272057 8287384
MEAN: 126686213
JCU: 105642985 105645803 105650007
HBR: 110644601 110645145 110656105 110658456 110660075 110660644
MESC: 110608970 110611785 110615767 110615885 110617727 110628618
POP: 18099644 7461769 7465866 7468710 7479311 7494081
PEU: 105124375 105124870 105126870 105129061 105131447 105133834
PALZ: 118028466 118033699 118041648 118049212 118057764 118061844
PNZ: 133677755 133692567 133692715 133694443 133702205
JRE: 108979206 108981321 108985192 108986109 109014468
CILL: 122280551 122289968 122309938 122315360 122318557
CAVE: 132168753 132175948 132186033
AGLU: 133852171 133854274 133864428
QSU: 111985424 111986568 112035245
QLO: 115956015 115971207 115971937
CSAA: 142613283 142614057 142640946
TWL: 119981073 119983159 119984810 119987168
VVI: 100233025(MYCA1) 100251098(MYC1) 100258234
VRI: 117905980 117917996 117932172
SLY: 101254527 101256795(JAF13)
SPEN: 107029047 107029254
SOT: 102583413(HLH1-1) 102597504(JAF13)
SSTN: 125841573 125871492
SDUL: 129882834 129890060
SVER: 125813567 125826505
CANN: 107842687 107865400
LBB: 132610999 132634906
NTA: 107764381 107771685 107791671 107826976
NSY: 104228885 104249116
NTO: 104095615 104097487
NAU: 109212579 109235278
INI: 109166712(InbHLH1) 109189629(InbHLH3) 109191325(InbHLH2)
ITR: 116001925 116004470 116029418
SIND: 105157923 105163253 105164084
OEU: 111375106 111388546 111393971 111398495
EGT: 105953362 105956914 105973651
SSPL: 121751200 121755728 121755754 121759235 121768797 121784578 121792965
SMIL: 130994775 130994838 131015675 131016218
SHIS: 125213807 125213901 125221665 125222578
APAN: 127255510 127258794 127265545
HPUM: 140871493 140879532
PHUA: 140973372 140982752 140989815
PEBU: 140807015 140816200 140831925
PTAB: 142524242 142532650 142545594
CARB: 113703597 113733739 140013611 140015479
HAN: 110864405 110922229
BHW: 143572356 143586510 143625389 143625814
ECAD: 122579695 122581536
LSV: 111892911(TT8) 111920837(EGL3)
CCAV: 112512174 112527896
DCR: 108204485 108205163 108210744
AGRV: 141671830 141684246 141686679
CSIN: 114257367 114281823 114284887 114287727 114294951
RVL: 131313529 131316547 131333228
AEW: 130752042 130752474 130753073 130753107 130769837 130784061 130793078
DLT: 127786723 127801775 127813675
BVG: 104890435(LOC104890435) 104898845(LOC104898845)
SOE: 110805097
CQI: 110694991 110714333 110731471
ATRI: 130813259 130824813
SLAF: 141607103 141639015 141647739
MOF: 131156711 131164823 131166428
NNU: 104586382 104596056 104596450 104612399
MING: 122080660 122087366 122091726
TSS: 122664374 122666735 122671256
PSOM: 113274545 113304253 113336870 113357352
MSIN: 131230356 131231117
ACAK: 137938955 137944016 137955527 137959138
NCOL: 116253643 116260563 116265702
ATR: 18423009 18440526
CJF: 131032206 131034047 131041572 131050101 131053764
SMO: SELMODRAFT_87033(GL3-2)
PPP: 112274231
 » show all
Reference
PMID:14627722
  Authors
Bernhardt C, Lee MM, Gonzalez A, Zhang F, Lloyd A, Schiefelbein J
  Title
The bHLH genes GLABRA3 (GL3) and ENHANCER OF GLABRA3 (EGL3) specify epidermal cell fate in the Arabidopsis root.
  Journal
Development 130:6431-9 (2003)
DOI:10.1242/dev.00880
  Sequence
[ath:AT5G41315 AT1G63650]
Reference
PMID:12917293
  Authors
Zhang F, Gonzalez A, Zhao M, Payne CT, Lloyd A
  Title
A network of redundant bHLH proteins functions in all TTG1-dependent pathways of Arabidopsis.
  Journal
Development 130:4859-69 (2003)
DOI:10.1242/dev.00681
  Sequence
[ath:AT1G63650]
Reference
PMID:19247443
  Authors
Morohashi K, Grotewold E
  Title
A systems approach reveals regulatory circuitry for Arabidopsis trichome initiation by the GL3 and GL1 selectors.
  Journal
PLoS Genet 5:e1000396 (2009)
DOI:10.1371/journal.pgen.1000396
  Sequence
[ath:AT5G41315 AT4G00480]
Reference
PMID:12911037
  Authors
Buck MJ, Atchley WR
  Title
Phylogenetic analysis of plant basic helix-loop-helix proteins.
  Journal
J Mol Evol 56:742-50 (2003)
DOI:10.1007/s00239-002-2449-3
Reference
PMID:12897250
  Authors
Toledo-Ortiz G, Huq E, Quail PH
  Title
The Arabidopsis basic/helix-loop-helix transcription factor family.
  Journal
Plant Cell 15:1749-70 (2003)
DOI:10.1105/tpc.013839
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system