KEGG   ORTHOLOGY: K15334
Entry
K15334                      KO                                     
Symbol
NCL1, TRM4
Name
multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)-methyltransferase [EC:2.1.1.202]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis
    K15334  NCL1, TRM4; multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)-methyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.202  multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)-methyltransferase
     K15334  NCL1, TRM4; multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)-methyltransferase
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic type
  tRNA modification factors
   Methyltransferases
    K15334  NCL1, TRM4; multisite-specific tRNA:(cytosine-C5)-methyltransferase
Other DBs
COG: COG0144
GO: 0016428
Genes
LSM: 121130158
ATH: AT2G22400 AT4G40000
ALY: 9302975 9316509
CRB: 17880038 17888772
CSAT: 104702776 104713682 104720928 104751878
EUS: EUTSA_v10000050mg EUTSA_v10024482mg
BRP: 103837897 103854554 103864345
BNA: 106363702 106406275 106415936 106439372 106446409 111215813
BOE: 106292165 106312686 106342432
RSZ: 108813377 108839838 108855463
THJ: 104807678
CPAP: 110814304
CIT: 102621904
CIC: CICLE_v10024895mg
PVY: 116119486
MINC: 123210171
TCC: 18611524
GRA: 105787805
GHI: 107950435 107951730
GAB: 108467056
HSYR: 120122418 120195582
DZI: 111291693
EGR: 104415765 104418316
RARG: 115738841 115739349
GMX: 100808598 100808859
GSJ: 114382634 114413089 114421850
PVU: 137812377 137815172
VRA: 106756522 106768123
VAR: 108329541 108342131
VUN: 114177680 114184678
VUM: 124825441 124825443 124828169
CCAJ: 109798068 109813507
APRC: 113849527 113873888
MTR: 11422681 25501876
TPRA: 123906248 123908167 123917005
CAM: 101488656 101488989
PSAT: 127082943 127096483 127107671
VVO: 131603250 131661462 131661472
LJA: 130711311 130724305
ADU: 107481819
AIP: 107631683
AHF: 112734371 112792192
LANG: 109343679 109361180 109362630
PCIN: 129309217 129320546
QSA: O6P43_023175 O6P43_030487
FVE: 101312383
AANS: 126789672
RCN: 112188467
PPER: 18772788
PMUM: 103333881
PAVI: 110758772
PDUL: 117633099
MDM: 103444818 114826987
MSYL: 126628212
PXB: 103936336
PCOX: 137721183 137735705
ZJU: 107425311
MNT: 21402707
CSAV: 115712258
HLP: 133805778
CSV: 101206452
CMO: 103484954
BHJ: 120073410
MCHA: 111005554
CMAX: 111478413 111496800
CMOS: 111453515 111463320
CPEP: 111781403 111803463
RCU: 8273526
MEAN: 126655466
JCU: 105641640
HBR: 110633522 110666662
MESC: 110628195
POP: 7490197
PEU: 105124485
PALZ: 118043431
PNZ: 133673171
JRE: 109014563
CILL: 122303650
CAVE: 132165871 132166529
AGLU: 133857751
QSU: 111994621 112012653
QLO: 115994386
CSAA: 142625626
TWL: 119990528 119998203
VVI: 100247473
VRI: 117918010
SLY: 101256287 101259902
SPEN: 107004815 107020788
SOT: 102590670 102597730
SSTN: 125845188 125867306
SDUL: 129880797 129898434
SVER: 125831028 125837171
CANN: 107850803 107870980
LBB: 132615602 132640530
NTA: 107766522 107802160 107808849 107822797
NSY: 104229518 104244701
NTO: 104095937 104112456
NAU: 109206988 109225240
INI: 109167634 109172654
ITR: 116013441 116020590
SIND: 105178292
OEU: 111367543
EGT: 105965170
SSPL: 121768532 121772257
SMIL: 131001458
SHIS: 125214806
APAN: 127258243
PEBU: 140826309
PTAB: 142546512
CARB: 113700089 113702356
HAN: 110868434
BHW: 143608608
ECAD: 122610056
LSV: 111901523
CCAV: 112512371
DCR: 108204226
AGRV: 141671344
CSIN: 114315520
RVL: 131302354
AEW: 130778213
DLT: 127798767
BVG: 104896018
SOE: 110791853
CQI: 110692707 110723427
ATRI: 130820701
SLAF: 141594202 141622302
MOF: 131159581
NNU: 104604502
MING: 122065319
TSS: 122640802 122669376
PSOM: 113286760 113312090 113343297 113357906
OSA: 4345871 4347343
DOSA: Os08g0484400 Os09g0471900
OBR: 102699527 102704358
OGL: 127783320 127784771
BDI: 100833836 100841242
ATS: 109733225 109751909
TDC: 119286785 119294937 119301908 119310338
TAES: 123086996 123090971 123095993 123104052 123112276 123121800
TUA: 125509634 125550515
HVG: 123399035 123447663
LPER: 127301950 127323960
LRD: 124653455 124657109 124685168
SBI: 8063738 8067041
ZMA: 100272508 103641349
MFLO: 136476721 136499080 136546410
SITA: 101758722 101760456
SVS: 117844881 117860686
PVIR: 120660973 120678763 120681975 120712694
PHAI: 112879702 112897214
PAUA: 133897208 133898879
TANG: 140760534
PDA: 103707955
EGU: 105058442
MUS: 135584442
ZOF: 121967103 122052297
DCT: 110094233
PEQ: 110025636
AOF: 109832768
MSIN: 131234303
ACAK: 137936702
NCOL: 116258757
ATR: 18423173
CJF: 131072564
SMO: SELMODRAFT_120643 SELMODRAFT_418525
PPP: 112292744
CVR: CHLNCDRAFT_54732
APRO: F751_0192
OLU: OSTLU_27152 OSTLU_31007 OSTLU_36629
OTA: OT_ostta13g01810
BPG: Bathy17g01520
MIS: MICPUN_59410
MPP: MICPUCDRAFT_45780
SCE: YBL024W(NCL1)
SEUB: DI49_0157
SPAO: SPAR_B00820
AGO: AGOS_AFR179C
ERC: Ecym_2353
KLA: KLLA0_F12562g
KMX: KLMA_30139(NCL1)
LTH: KLTH0H08096g
VPO: Kpol_1002p109
ZRO: ZYRO0G08998g
CGR: 2890330(GVI51_K01837)
NCS: NCAS_0B05640(NCAS0B05640)
NDI: NDAI_0B01830(NDAI0B01830) NDAI_0B02980(NDAI0B02980)
TPF: TPHA_0C02870(TPHA0C02870) TPHA_0H00150(TPHA0H00150)
TBL: TBLA_0A08740(TBLA0A08740)
TGB: HG536_0D02370
TDL: TDEL_0B04390(TDEL0B04390)
KAF: KAFR_0B02220(KAFR0B02220)
KNG: KNAG_0D02050(KNAG0D02050) KNAG_0G01510(KNAG0G01510)
ZMK: HG535_0E03120
SLUD: SCDLUD_001597
DHA: DEHA2F21384g
PIC: PICST_37206
PGU: PGUG_00345
SPAA: SPAPADRAFT_49297
LEL: PVL30_002677(NCL1)
LBG: 92206916(LODBEIA_P17200)
CAL: CAALFM_CR04300WA(CaO19.518)
CTP: CTRG_00396
COT: CORT_0D05300
CDU: CD36_29640
CTEN: 18245353(NCL1)
CLU: CLUG_05640
CLUS: A9F13_05g03201
CAUR: CJI96_0004748
ASAU: 88173184(PUMCH_002119)
PPA: PAS_chr4_0445
PKZ: C5L36_0E04630
BNN: FOA43_002211
BBRX: BRETT_004979
OPA: HPODL_04347
YLI: 2912410(YALI2_E00149g)
SLB: AWJ20_2842(NCL1)
NCR: NCU05301
NTE: NEUTE1DRAFT80343(NEUTE1DRAFT_80343)
SMP: 10806132(SMAC4_01688)
PAN: PODANSg6223
PBEL: QC761_304030(NCL1)
PPSD: QC762_304030(NCL1)
PPSP: QC763_304030(NCL1)
PPSA: QC764_304030(NCL1)
TTT: THITE_2115779
MTM: MYCTH_2299308
RTHE: 98125926(VTJ83DRAFT_4758)
MGR: MGG_13217
PPEI: PpBr36_02907
PGRI: PgNI_01794
TMN: UCRPA7_7915
SSCK: SPSK_01433
FGR: FGSG_09744
FPU: FPSE_02277
FPOA: FPOAC1_011893
FVN: FVRRES_12959
FVR: FVEG_06362
FOX: FOXG_08314
NHE: NECHADRAFT_76439
FFC: NCS54_00259700
FKR: NCS57_00255100
FMU: J7337_004428
TRE: TRIREDRAFT_55981
TRR: M419DRAFT_135872
TATV: 25779733(TrAtP1_001535)
TASP: 36612967(TrAFT101_000990)
MAW: 19245694(NCL1_1)
MAJ: MAA_06410
MBRN: 26237741(trm4b)
PCHM: VFPPC_05168
UVI: 66061886(UV8b_01108)
AMUS: LMH87_006913
PLJ: 28883234(PLICBS_000778)
PTKZ: JDV02_007568(NCL1)
DCON: 63713161(DCS_00518)
VDA: VDAG_00687
CFJ: CFIO01_11685
CLUP: CLUP02_15192
CHIG: CH63R_04760
CDET: 87941830(CDEST_05327)
SAPO: SAPIO_CDS7162
ELA: UCREL1_8820
PFY: PFICI_04470
SSL: SS1G_03008
BFU: BCIN_06g07260(Bcncl1)
MBE: MBM_04174
PSCO: LY89DRAFT_718717
GLZ: GLAREA_04093
ANI: ANIA_00757
AFM: AFUA_1G14180
ACT: ACLA_021230
NFI: NFIA_011240
AOR: AO090012000444
ANG: An01g12180
AFV: AFLA_002162
ALUC: AKAW2_10395S
ACHE: ACHE_30558A
APUU: APUU_11248S
PCS: N7525_010489
PDP: PDIP_66890
POU: POX_c03746
PPSF: 300796029(PFLUO_LOCUS962)
TMF: EYB26_006127
TRG: TRUGW13939_08954
CIM: CIMG_03343
CPW: 9694315(D8B26_002911)
URE: UREG_07171
ABE: ARB_00062
TVE: TRV_01308
PBL: PAAG_02188
PBN: PADG_11157
AJE: HCAG_06738
BGH: BDBG_03044
PNO: SNOG_06412
PTE: PTT_10834
PTRR: 6340621(PtrM4_059160)
BZE: COCCADRAFT_35273
BSC: COCSADRAFT_133594
BOR: COCMIDRAFT_5709
AALT: CC77DRAFT_998680
ADAC: 96082012(ACET3X_001690)
ARAB: EKO05_0006015
ZTR: MYCGRDRAFT_52269
PFJ: MYCFIDRAFT_154036
FFU: CLAFUR5_11869
CBET: CB0940_07840
BCOM: BAUCODRAFT_20558
NPA: UCRNP2_1607
TML: GSTUM_00006649001
SPO: 2541917(trm402) 2542264(trm401)
SOM: SOMG_01788(trm402) SOMG_03864(trm401)
CNE: CND00130
CNB: CNBD6080
CNG: CNAG_00874
CGI: CGB_J2420C
CDEU: CNBG_6084
CDEC: 89993264(IAS62_006496)
CTEG: 91993376(I308_106521)
CBAS: 91986851(I312_106808)
CDEP: 91085040(L203_100826)
KMG: 30161971(I203_107406)
KNE: 92183217(IAR55_005959)
KDJ: 28965609(I303_101954)
KBI: 30208359(I302_100585)
KPIN: 30174685(I206_101717)
KSH: 87953968(IL334_001837)
KER: 91104747(V865_005946)
KSN: 43591699(CI109_106670)
KEP: 91092600(L201_001928)
TMS: TREMEDRAFT_44583
TASA: A1Q1_07962
CCAC: CcaHIS019_0705920(NCL1)
TVS: TRAVEDRAFT_74804
DSQ: DICSQDRAFT_105532
PCO: PHACADRAFT_172372
SHS: STEHIDRAFT_121240
PSQ: PUNSTDRAFT_143767
FME: FOMMEDRAFT_152652
GTR: GLOTRDRAFT_116964
RSX: RhiXN_08541
LBC: LACBIDRAFT_319126
CCI: CC1G_10971
MRR: Moror_4753
MORE: E1B28_002398
SCM: SCHCO_02512227(SCHCODRAFT_02512227)
CPUT: CONPUDRAFT_168161
SLA: SERLADRAFT_345585
WSE: WALSEDRAFT_34219
WIC: J056_003196
UMA: UMAG_05126
PFP: PFL1_03144
SGRA: EX895_004523
MGL: MGL_1048
MRT: MRET_3107
MSYM: MSY001_0811
PTRC: PtA15_8A474
PSTR: Pst134EA_015785
MLR: MELLADRAFT_85533
SRE: PTSG_03137
EIV: EIN_183240 EIN_373320
PTM: GSPATT00013766001 GSPATT00018463001
TVA: 4749134(TVAGG3_0615400)
SSAO: 94300013(SS50377_25990)
 » show all
Reference
PMID:10445884
  Authors
Motorin Y, Grosjean H
  Title
Multisite-specific tRNA:m5C-methyltransferase (Trm4) in yeast Saccharomyces cerevisiae: identification of the gene and substrate specificity of the enzyme.
  Journal
RNA 5:1105-18 (1999)
DOI:10.1017/s1355838299982201
  Sequence
[sce:YBL024W]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system