KEGG   ORTHOLOGY: K19125
Entry
K19125                      KO                                     
Symbol
casD, cse5
Name
CRISPR system Cascade subunit CasD
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19125  casD, cse5; CRISPR system Cascade subunit CasD
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-E factors
    K19125  casD, cse5; CRISPR system Cascade subunit CasD
Genes
ECO: b2757(casD)
ECJ: JW5844(ygcI)
ECD: ECDH10B_2925(ygcI)
EBW: BWG_2493(ygcI)
ECOK: ECMDS42_2262(ygcI)
ECOC: C3026_15155
ECE: Z4066
ECS: ECs_3611(casD)
ECF: ECH74115_4010(cas5e)
ETW: ECSP_3705
ELX: CDCO157_3371
EOI: ECO111_3481
EOJ: ECO26_3826
EOH: ECO103_3299
ESL: O3K_05745
ESO: O3O_19905
ESM: O3M_05790
ECK: EC55989_3030
EOK: G2583_3405(ygcI)
ELR: ECO55CA74_16215
ELH: ETEC_2948
ECW: EcE24377A_3059(cas5e)
EUN: UMNK88_3436
ECOA: APECO78_17385
ECX: EcHS_A2896
ECM: EcSMS35_2885(cas5e)
ECY: ECSE_3012
ECR: ECIAI1_2860
EUM: ECUMN_3084
ELO: EC042_2952
ECL: EcolC_0955
EKO: EKO11_1012
EKF: KO11_09190(cas5e)
EDH: EcDH1_0931
EDJ: ECDH1ME8569_2667(ygcI)
ELW: ECW_m2964(cas5e)
ELL: WFL_14470(cas5e)
ECOL: LY180_14005
EFE: EFER_0306(ygcI)
ESZ: FEM44_03675(cas5e) FEM44_05330(cas5e)
STY: STY3067
STT: t2841
SEX: STBHUCCB_29910
SENT: TY21A_14360
STM: STM2940
SEO: STM14_3544
SEV: STMMW_29031
SEY: SL1344_2919
SEM: STMDT12_C29900
SEJ: STMUK_2929
SEB: STM474_3081
SEF: UMN798_3192
SETU: STU288_14860
SETC: CFSAN001921_02375
SENR: STMDT2_28401
SEND: DT104_29381
SENI: CY43_15340
SEEN: SE451236_20795
SPT: SPA2796
SEK: SSPA2607
SEI: SPC_2984
SEC: SCH_2872(ygcI)
SEH: SeHA_C3134
SHB: SU5_03421
SENH: CFSAN002069_17570
SEEH: SEEH1578_00705
SEE: SNSL254_A3150(cas5e)
SENN: SN31241_40380
SEW: SeSA_A3094(cas5)
SEA: SeAg_B3068(cas5)
SENS: Q786_14170
SED: SeD_A3251(cas5)
SEG: SG2843
SEL: SPUL_2939
SEGA: SPUCDC_2925
SET: SEN2779
SENA: AU38_14115
SENO: AU37_14125
SENV: AU39_14125
SENQ: AU40_15890
SENL: IY59_14720
SEEC: CFSAN002050_21015
SEEB: SEEB0189_005455
SEEP: I137_13995
SENB: BN855_29900(cas5)
SENE: IA1_14090
SENC: SEET0819_21535
SBZ: A464_2962
SBV: N643_12500
SALZ: EOS98_04795(cas5e)
SSN: SSON_2906
SBO: SBO_2763
SBC: SbBS512_E3117(cas5e)
ESA: ESA_02834
CSK: ES15_2920(cas5)
CSZ: CSSP291_13475
CDM: AFK67_05215
CSI: P262_04217
CMJ: AFK66_022630
CTU: CTU_10480
KPU: KP1_3166(cas5e)
KPP: A79E_2165
KPZ: KPNIH27_20275
KPY: KPNIH31_20310
KPT: VK055_0384(cas5e)
KPR: KPR_4120
KPX: PMK1_04444(casD)
KPNK: BN49_1002
KVA: Kvar_0943
KOE: A225_4679
KQV: B8P98_12010(cas5e)
KAR: LGL98_05065(cas5e)
KGR: JJJ10_05860(cas5e)
KLM: BWI76_22730
RON: TE10_22460
CRO: ROD_30491
CYO: CD187_05040(cas5e)
CFQ: C2U38_19995(cas5e)
CIB: HF677_004855(cas5e)
EBT: EBL_c30650
KCO: BWI95_03645
LEH: C3F35_16495(cas5e)
AHN: NCTC12129_03754
ASUB: NLZ15_05755(cas5e)
METY: MRY16398_10410
IZH: FEM41_00190(cas5e)
PROD: PCO85_20480(cas5e)
SERA: Ser39006_005070(cas5e)
SERQ: CWC46_05070(cas5e)
PCC: PCC21_003750
PWA: Pecwa_0401
PPAR: A8F97_16425
PEC: W5S_0413
PWS: A7983_10020
PPOA: BJK05_18585
PBRA: B5S52_19975
PPUJ: E2566_02100(cas5e)
PARI: I2D83_20060(cas5e)
PAQU: DMB82_0001765(cas5e)
PVZ: OA04_04150(casD)
PPAV: LOZ86_19930(cas5e)
PPOO: LW347_02150(cas5e)
PCAC: OI450_02530(cas5e)
DZE: Dd1591_0907
DDC: Dd586_0352
DZC: W909_01840
CED: LH89_10315
DFN: CVE23_01940(cas5e)
DDQ: DDI_3192
DAQ: DAQ1742_00450
DIC: Dpoa569_003595(cas5e)
DLC: O1Q98_09560(cas5e)
DDA: Dd703_3587
EAM: EAMY_2816(ygcI)
EAY: EAM_0766
EPY: EpC_08110(cas5)
EPR: EPYR_00856(ygcI)
ERJ: EJP617_02860(cas5)
MINT: C7M51_00064(casD)
MTHI: C7M52_02650(casD)
PLU: plu0749
PLUM: A4R40_03740
PAY: PAU_00710
PTT: VY86_03920
PAKH: B0X70_04215
PLUI: CE143_04145(cas5e)
PVL: AOB99_10870
PHAU: PH4a_00610(cas5e)
XBO: XBJ1_3753
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XNE: XNC1_3721
XNM: XNC2_3576
XDO: XDD1_0594
XPO: XPG1_0517
XGR: QL128_02940(cas5e)
ETE: ETEE_2631
EDW: QY76_16245
EDL: AAZ33_04150(cas5e)
EHO: A9798_03780
LPV: HYN51_03145(cas5e)
PRAG: EKN56_10340(cas5e)
LRI: NCTC12151_00614
VCO: VC0395_A2675(cas5e)
VCR: VC395_0326
VHR: AL538_00330(cas5e)
VGA: BSQ33_17920
VSR: Vspart_03914(casD)
PPR: PBPRC0036
SCOT: HBA18_15020(cas5e)
SPRO: N7E60_16975(cas5e)
PRP: M062_06755
PMY: Pmen_3757
PPSE: BN5_0771
PBM: CL52_18045
AVN: Avin_17210
AVL: AvCA_17210
AVD: AvCA6_17210
ACX: Achr_14840 Achr_14900 Achr_800
PPHA: BVH74_05380
SCHK: GII14_19570(cas5e)
SPSR: EGC80_19915(cas5e)
THAT: H3N35_02245(cas5e)
TVD: SG34_027130(cas5e)
PSEN: PNC201_20245(casD)
PVB: J5X90_23195(cas5e)
PFLI: CTT31_22090(cas5e)
AMC: MADE_1014395
HMI: soil367_17140(cas5e)
PIN: Ping_1590
FES: HER31_06680
CEB: B0D95_06080
STAW: NCG89_16310(cas5e)
MTHD: A3224_03160
MII: BTJ40_18110(cas5e)
MCEL: LPW13_11275(cas5e)
KIM: G3T16_03680(cas5e)
MCA: MCA0932
MDN: JT25_007530
MDH: AYM39_06430
MKO: MKLM6_1304
METL: U737_02365(cas5e)
MPAD: KEF85_14990(cas5e)
MMOT: QZJ86_02075(cas5e)
MAH: MEALZ_3715
MBUR: EQU24_20280(cas5e)
MMAI: sS8_4539
MSZE: MSZNOR_2251(casD)
MMOB: F6R98_00795(cas5e)
MOZ: MoryE10_22540
MISZ: MishRS11D_33110
MESL: KKZ03_17510(cas5e)
MEIY: MIN45_P2350
MCAU: MIT9_P2184 MIT9_P2615
CZA: CYCME_2154
TSE: THMIRHAS_17850
TSB: HMY34_15645(cas5e)
TLC: RCF98_02085(cas5e)
NWA: Nwat_1400
ALV: Alvin_0650
ATEP: Atep_23450
TVI: Thivi_0460 Thivi_1075
MPUR: MARPU_07385
NTT: TAO_1711
TSY: THSYN_14330
TTP: E6P07_10975(cas5e)
TBOG: LT988_05115(cas5e)
TLR: Thiosp_02481(casD) Thiosp_03483
TFRI: Thiofri_02425(casD)
AEH: Mlg_0951
HHK: HH1059_07250
HHC: M911_01395
HAZ: A9404_08080
GHL: GM160_08040(cas5e)
TBN: TBH_C1503
EPS: L0Y14_13245(cas5e)
TTC: FOKN1_2814
CSA: Csal_0230
HAK: KO116_04133
HAM: HALO4332
HALO: BWR19_18120
HBE: BEI_3527
HPIS: P1P91_02465(cas5e)
HALK: CUU95_04735(cas5e)
KMA: B9H00_06470
SAJS: QO259_15965(cas5e)
ALCA: ASALC70_00277(casD)
MMW: Mmwyl1_3544
NIK: F5I99_01700(cas5e)
EEI: NX720_12485(cas5e)
EMP: EZMO1_3784(cas5)
GAP: GAPWK_2359
SOK: D0B54_08905(cas5e)
SINI: GT972_11615(cas5e)
GBI: PG2T_01360
GPB: HDN1F_07620
VFF: VITFI_CDS0402
CVC: BKX93_19900
CHRI: DK842_14510(cas5e)
CHRB: DK843_20070(cas5e)
PSE: NH8B_0693
AMAH: DLM_2391
JES: JHS3_15440
AQL: BXU06_04415
MAER: DAI18_12495(cas5e)
RSC: RCFBP_11061
RSN: RSPO_c01087
RSG: JK151_17195(cas5e)
BYI: BYI23_B012690
BUE: BRPE67_BCDS16500
LMIR: NCTC12852_00243
TCAR: U0034_23830(cas5e)
BGM: CAL15_21610
PIG: EGT29_03875(cas5e)
PACR: FXN63_18880(cas5e)
CKE: B5M06_08945
CSER: CCO03_06700
HPSE: HPF_16005
CBAA: SRAA_1197
CBAB: SMCB_1596
RGE: RGE_06850(cas5)
ROI: N4261_17345(cas5e)
IDC: LRM40_02495(cas5e) LRM40_19430(cas5e)
JAG: GJA_3177(cas5)
JAB: VN23_00710
SUTT: SUTMEG_16370
TTW: LCC91_08370(cas5e)
NST: Nstercoris_01452
NLC: EBAPG3_008195(cas5e)
DOE: DENOEST_0917
NIM: W01_09250(casD)
NARC: NTG6680_1120
SULF: CAP31_12630
SPLB: SFPGR_12000
ABRE: pbN1_19770(cas5)
RBH: B4966_14745
QAU: KI612_17775(cas5e)
AZD: CDA09_21045(cas5e)
TMZ: Tmz1t_2232
TCL: Tchl_1800
ACOM: CEW83_06425(cas5e)
ZPA: C3497_14085(cas5e)
APP: CAP2UW1_2253
BEB: AEM42_05780
KMN: HW532_21070(cas5e)
BOS: BSY19_4792(cas5e)
MNO: Mnod_3201 Mnod_5411
MEE: DA075_08060(cas5e)
MTEA: DK419_15605(cas5e)
MIND: mvi_16050
MOC: BB934_40305
RLAC: QMO75_03040(cas5e)
FIL: BN1229_v1_2364
FIY: BN1229_v1_3551
NOH: G5V57_09465(cas5e) G5V57_21910(cas5e)
PSTG: E8M01_22905(cas5e)
DSH: Dshi_3218(cas5)
PABY: Ga0080574_TMP2622
RCP: RCAP_rcc01345
RBL: B6K69_16105
PKD: F8A10_12745(cas5e)
PAEX: JHW48_15710(cas5e)
RHM: B5V46_07735
DAA: AKL17_3p0044
GEH: HYN69_12320(cas5e)
HML: HmaOT1_18370(cas5e)
MON: G8E03_16980(cas5e)
PGV: SL003B_2843
ZMP: Zymop_1011
SECH: B18_17930
SHAN: PPZ50_06645(cas5e)
HGN: E6W36_14915(cas5e)
GOH: B932_0094
GTI: FXF46_10000(cas5e)
GBE: GbCGDNIH1_1377 GbCGDNIH1_1696
GBH: GbCGDNIH2_1377 GbCGDNIH2_1696
GBC: GbCGDNIH3_1377 GbCGDNIH3_1696
GBS: GbCGDNIH4_1377 GbCGDNIH4_1696
ACR: Acry_1810 Acry_3318
GDI: GDI2206
GDJ: Gdia_0424
GXY: GLX_07790
APT: APA01_41070
APW: APA42C_41070
APF: APA03_41070
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APQ: APA22_41070
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APZ: APA32_41070
APER: A0U91_15920
AOY: EOV40_007485(cas5e)
RMUC: FOB66_01595(cas5e)
RMT: IAI58_22120(cas5e)
NEH: E3E11_02170(cas5e)
SWF: E3E12_03295(cas5e)
BOB: GN304_00785(cas5e)
BOMB: GT348_01855(cas5e)
EBLA: JGUZn3_21180
PARZ: DTQ13_05060(cas5e)
RAP: RHOA_5001(cas5e)
SVC: STVA_22930
STEL: STAQ_18410
AZZ: DEW08_03430(cas5e)
AARE: D3093_33315(cas5e)
SROE: JL101_013310(cas5e)
RRU: Rru_A0171 Rru_A0345
RRF: F11_00855 F11_01755
RCE: RC1_3336
RPM: RSPPHO_01290 RSPPHO_02012
HYO: NNO_1912
GSU: GSU1388(cas5e)
GSK: KN400_1354(cas5e)
GAO: A2G06_10055
GBZ: JZM60_11015(cas5e)
GUR: Gura_0831
GLO: Glov_2476
PCA: Pcar_0960(cas5e)
PACE: A6070_04050
PPD: Ppro_2339
DDS: Ddes_0927
DEF: CNY67_05515(cas5e)
DCB: C3Y92_05840(cas5e)
DDE: Dde_0861
DMS: E8L03_03340(cas5e)
DSX: GD604_14775(cas5e)
DEO: CAY53_04860
DOL: Dole_2987
DAL: Dalk_4938
DTI: Desti_4557
SFU: Sfum_2828
ACP: A2cp1_0782
ANK: AnaeK_0782
APAU: AMPC_32070
BSED: DN745_02410(cas5e)
SAQI: AXG55_02215
HYI: K2M58_01340(cas5e)
LPAA: BHS01_03855
SMC: SmuNN2025_0607
SMUT: SMUGS5_06720
STHE: T303_06230
SSR: SALIVB_1073
STF: Ssal_01144
SPAT: A0O21_05660
SRAT: FY406_10310(cas5e)
STRG: SRT_06180
SCHJ: DDV21_004825(cas5e)
LDB: Ldb0872
LBU: LBUL_0797
LDE: LDBND_0801
LHH: LBH_1243
LHD: HUO_04725
LCR: LCRIS_01210
LAY: LAB52_05105
LXO: KIM322_08380
LCA: LSEI_0353
LPX: ASU28_06300
LPG: BB562_09755
LARG: LPA65_05995(cas5e)
LFE: LAF_0695
LFF: LBFF_1326
LMU: LBLM1_06085
LSN: LSA_2p00330
LBN: LBUCD034_0105(casD)
LPAR: FAM21731_00951
LKO: ABN16_13105
LSUA: H3M12_03745(cas5e)
LAH: LA20533_05320
OSI: DLJ48_08410(cas5e)
XAK: KIMC2_15990
XAP: XA3_14090
TEY: GLW17_02290(cas5e)
TOO: C7K38_10755(cas5e)
AUN: AWM73_00840
AUI: APT62_03360
ASAN: AWM72_05600
ACG: AWM71_06240
AUH: AWM75_08310
AMIT: DBT49_0001070(cas5e)
ABAE: CL176_04470(cas5e)
CLS: CXIVA_19950
PROQ: P6M73_16355(cas5e)
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MPL: Mpal_1604
RCI: RCIX1151
MARC: AR505_1093
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Reference
PMID:21255106
  Authors
Perez-Rodriguez R, Haitjema C, Huang Q, Nam KH, Bernardis S, Ke A, DeLisa MP
  Title
Envelope stress is a trigger of CRISPR RNA-mediated DNA silencing in Escherichia coli.
  Journal
Mol Microbiol 79:584-99 (2011)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2010.07482.x
  Sequence
[eco:b2757]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system