KEGG   PATHWAY: pleu03040
Entry
pleu03040                   Pathway                                
Name
Spliceosome - Peromyscus leucopus (white-footed mouse)
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
pleu03040  Spliceosome
pleu03040

Other DBs
GO: 0005681
PDB: 5O9Z 5Z56 6FF7 8I0W
Organism
Peromyscus leucopus (white-footed mouse) [GN:pleu]
Gene
114680596  [KO:K14280]
114680601  [KO:K14280]
114680605  [KO:K14280]
114680626  Alyref; THO complex subunit 4 [KO:K12881]
114680648  [KO:K14280]
114680672  Sf1; splicing factor 1 isoform X1 [KO:K13095]
114680739  [KO:K14280]
114680752  Snrnp27; U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein [KO:K12846]
114680761  Pcbp1; poly(rC)-binding protein 1 [KO:K12889]
114680778  Thoc6; THO complex subunit 6 homolog [KO:K13175]
114680840  Snrpg; small nuclear ribonucleoprotein G isoform X1 [KO:K11099]
114680879  [KO:K14276]
114680880  [KO:K12870]
114680881  [KO:K14278]
114680882  [KO:K14280]
114680883  [KO:K14280]
114680924  Rbm8a; RNA-binding protein 8A isoform X1 [KO:K12876]
114680933  [KO:K14276]
114680934  [KO:K14280]
114680936  [KO:K14276]
114680937  [KO:K14276]
114680939  [KO:K14276]
114680940  [KO:K14280]
114680962  [KO:K14280]
114680972  [KO:K14280]
114681017  [KO:K14276]
114681030  [KO:K14280]
114681146  [KO:K14280]
114681162  Ppie; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E [KO:K09564] [EC:5.2.1.8]
114681175  [KO:K14280]
114681176  [KO:K14280]
114681263  [KO:K14280]
114681297  [KO:K14277]
114681324  Srsf9; serine/arginine-rich splicing factor 9 [KO:K21123]
114681354  Lsm3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3 [KO:K12622]
114681365  [KO:K14280]
114681366  [KO:K14280]
114681367  [KO:K14280]
114681387  [KO:K14280]
114681407  [KO:K12867]
114681453  [KO:K14280]
114681475  [KO:K14276]
114681529  Snrpa; U1 small nuclear ribonucleoprotein A [KO:K11091]
114681568  [KO:K14280]
114681569  [KO:K14280]
114681585  [KO:K14280]
114681595  Usp39; U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 [KO:K12847]
114681609  [KO:K14280]
114681619  Srsf7; serine/arginine-rich splicing factor 7 isoform X3 [KO:K12896]
114681630  [KO:K14276]
114681659  U2af1l4; splicing factor U2AF 26 kDa subunit isoform X1 [KO:K12836]
114681698  [KO:K14276]
114681700  [KO:K14280]
114681817  [KO:K14280]
114681818  [KO:K14280]
114681819  [KO:K14280]
114681863  [KO:K14280]
114681873  [KO:K14280]
114681880  [KO:K14276]
114681908  [KO:K12816]
114681913  [KO:K14276]
114681950  [KO:K14280]
114681995  [KO:K14280]
114682138  [KO:K14276]
114682139  [KO:K14280]
114682145  [KO:K14280]
114682180  [KO:K14276]
114682182  [KO:K14277]
114682197  [KO:K14280]
114682231  [KO:K14280]
114682233  Hnrnpc; heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 isoform X1 [KO:K12884]
114682345  Snrpd2; small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 [KO:K11096]
114682386  Prpf3; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 isoform X1 [KO:K12843]
114682399  Sf3b4; LOW QUALITY PROTEIN: splicing factor 3B subunit 4 [KO:K12831]
114682413  [KO:K14276]
114682414  [KO:K14276]
114682415  [KO:K14276]
114682416  [KO:K14276]
114682417  [KO:K14276]
114682418  [KO:K14276]
114682419  [KO:K14276]
114682494  [KO:K14280]
114682531  [KO:K14280]
114682532  [KO:K14280]
114682584  [KO:K14276]
114682617  [KO:K14278]
114682618  [KO:K14278]
114682627  [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
114682638  [KO:K14280]
114682734  [KO:K14276]
114682735  [KO:K14280]
114682747  [KO:K14280]
114682840  [KO:K14277]
114682865  Lsm4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 [KO:K12623]
114682924  [KO:K14277]
114682937  [KO:K14280]
114682938  Plrg1; pleiotropic regulator 1 [KO:K12862]
114682969  [KO:K14280]
114683024  [KO:K14280]
114683062  [KO:K14280]
114683063  [KO:K14280]
114683073  [KO:K14280]
114683074  [KO:K14280]
114683168  Xab2; pre-mRNA-splicing factor SYF1 isoform X1 [KO:K12867]
114683238  [KO:K14280]
114683264  [KO:K14280]
114683290  [KO:K14279]
114683334  [KO:K14280]
114683368  [KO:K14280]
114683375  [KO:K11099]
114683411  [KO:K14280]
114683490  [KO:K12836]
114683513  [KO:K14280]
114683514  [KO:K14280]
114683599  [KO:K14278]
114683600  [KO:K14280]
114683615  [KO:K14276]
114683634  [KO:K14280]
114683727  Prpf4; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 [KO:K12662]
114683766  [KO:K14280]
114683780  [KO:K14280]
114683807  [KO:K14276]
114683808  [KO:K14280]
114683848  [KO:K14280]
114683855  [KO:K14276]
114683856  [KO:K14280]
114683888  [KO:K14280]
114683983  [KO:K14280]
114684034  [KO:K14280]
114684036  [KO:K14280]
114684080  [KO:K14280]
114684145  [KO:K14280]
114684146  [KO:K14280]
114684174  [KO:K14280]
114684175  [KO:K14280]
114684205  [KO:K14276]
114684206  [KO:K14280]
114684207  [KO:K14280]
114684239  [KO:K14276]
114684265  [KO:K14280]
114684266  [KO:K14280]
114684502  [KO:K14280]
114684615  Snrnp70; U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [KO:K11093]
114684732  Puf60; poly(U)-binding-splicing factor PUF60 isoform X1 [KO:K12838]
114684759  [KO:K14276]
114684765  [KO:K14276]
114684774  [KO:K14280]
114684778  [KO:K14280]
114684781  [KO:K14280]
114684796  U2af2; splicing factor U2AF 65 kDa subunit isoform X1 [KO:K12837]
114684809  [KO:K14277]
114684874  [KO:K14280]
114684892  [KO:K14280]
114684921  [KO:K14280]
114684954  [KO:K14277]
114684998  [KO:K14280]
114685006  Cwc15; spliceosome-associated protein CWC15 homolog [KO:K12863]
114685043  [KO:K14280]
114685097  Yju2; splicing factor YJU2 [KO:K28527]
114685182  [KO:K14280]
114685287  [KO:K14280]
114685313  [KO:K14280]
114685314  [KO:K14280]
114685322  Hnrnpm; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M isoform X2 [KO:K12887]
114685330  [KO:K14280]
114685442  [KO:K14279]
114685630  [KO:K14280]
114685656  [KO:K14280]
114685668  [KO:K14280]
114685677  [KO:K14280]
114685712  [KO:K14280]
114685733  [KO:K14276]
114685828  [KO:K14276]
114685868  Magohb; protein mago nashi homolog 2 isoform X1 [KO:K12877]
114685886  [KO:K14280]
114685942  [KO:K14280]
114685962  [KO:K14276]
114685968  [KO:K14276]
114685979  [KO:K14280]
114686025  [KO:K14280]
114686056  [KO:K14280]
114686076  [KO:K14276]
114686118  [KO:K14280]
114686149  [KO:K14280]
114686226  [KO:K14280]
114686237  [KO:K14280]
114686313  [KO:K14280]
114686387  [KO:K14276]
114686388  [KO:K14276]
114686389  [KO:K14276]
114686523  Sf3a2; splicing factor 3A subunit 2 [KO:K12826]
114686563  [KO:K14278]
114686566  [KO:K14280]
114686679  [KO:K14280]
114686680  [KO:K14276]
114686704  [KO:K14280]
114686711  [KO:K14280]
114686739  [KO:K14276]
114686808  [KO:K14280]
114686833  [KO:K06063]
114686845  Lsm5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5 [KO:K12624]
114686847  [KO:K14280]
114686887  [KO:K14280]
114686888  [KO:K14280]
114686889  [KO:K14280]
114686934  [KO:K03283]
114686943  [KO:K14280]
114687003  Dhx16; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 isoform X1 [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
114687043  Ctnnbl1; beta-catenin-like protein 1 [KO:K12864]
114687086  Sf3b5; splicing factor 3B subunit 5 [KO:K12832]
114687157  [KO:K14280]
114687163  [KO:K14280]
114687253  [KO:K14280]
114687379  [KO:K14280]
114687380  [KO:K14280]
114687412  [KO:K14276]
114687519  [KO:K14280]
114687543  [KO:K14280]
114687658  [KO:K14280]
114687678  [KO:K14280]
114687819  Eif4a3; eukaryotic initiation factor 4A-III [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
114687937  [KO:K14280]
114687938  [KO:K14280]
114687939  [KO:K14280]
114688133  [KO:K14277]
114688154  [KO:K14280]
114688233  [KO:K14276]
114688250  [KO:K14280]
114688252  [KO:K14280]
114688306  [KO:K11099]
114688382  [KO:K14280]
114688397  [KO:K14276]
114688412  [KO:K14277]
114688425  [KO:K14280]
114688432  Prpf31; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 [KO:K12844]
114688439  [KO:K14280]
114688530  [KO:K14280]
114688542  [KO:K14280]
114688602  Hnrnpk; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K isoform X1 [KO:K12886]
114688615  [KO:K12849]
114688618  [KO:K12849]
114688847  [KO:K14277]
114688996  [KO:K14280]
114689001  Ddx46; probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 isoform X1 [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
114689068  [KO:K14277]
114689069  [KO:K14277]
114689070  [KO:K14277]
114689086  [KO:K14280]
114689147  [KO:K14277]
114689287  [KO:K12869]
114689291  [KO:K12869]
114689310  [KO:K14280]
114689335  [KO:K14280]
114689470  Thoc3; THO complex subunit 3 [KO:K12880]
114689550  [KO:K14280]
114689555  [KO:K14280]
114689556  [KO:K14280]
114689687  [KO:K14277]
114689693  [KO:K12876]
114689694  [KO:K14280]
114689695  [KO:K14280]
114689747  Tra2a; transformer-2 protein homolog alpha [KO:K12897]
114689807  [KO:K14277]
114689810  [KO:K14280]
114689811  [KO:K14280]
114689838  Slu7; pre-mRNA-splicing factor SLU7 [KO:K12819]
114689859  [KO:K14276]
114689865  [KO:K14276]
114689873  [KO:K14280]
114689880  [KO:K14280]
114689888  [KO:K14280]
114689909  [KO:K14276]
114689916  [KO:K14276]
114690011  [KO:K12837]
114690029  Hspa6; LOW QUALITY PROTEIN: heat shock 70 kDa protein 6 [KO:K03283]
114690033  [KO:K11095]
114690047  [KO:K14280]
114690143  [KO:K14280]
114690144  [KO:K14280]
114690149  [KO:K14276]
114690150  [KO:K14280]
114690151  [KO:K14280]
114690152  [KO:K14280]
114690216  [KO:K14280]
114690217  [KO:K14280]
114690218  [KO:K14280]
114690219  [KO:K14280]
114690384  [KO:K14280]
114690386  [KO:K14280]
114690388  [KO:K14280]
114690409  Ddx42; ATP-dependent RNA helicase DDX42 [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
114690423  Ddx5; probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
114690503  [KO:K14280]
114690504  [KO:K14280]
114690505  [KO:K14280]
114690511  [KO:K14276]
114690587  [KO:K14276]
114690589  [KO:K14280]
114690590  [KO:K14280]
114690591  [KO:K14280]
114690592  [KO:K14280]
114690604  [KO:K12836]
114690649  Hnrnpu; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U [KO:K12888]
114690757  [KO:K14276]
114690758  [KO:K14280]
114690759  [KO:K14277]
114690761  [KO:K14280]
114690762  [KO:K14280]
114690867  [KO:K14276]
114690871  [KO:K14280]
114690872  [KO:K14280]
114690873  [KO:K14280]
114690893  Dhx15; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
114690956  [KO:K12741]
114690963  [KO:K12842]
114691005  [KO:K14276]
114691007  [KO:K14280]
114691120  [KO:K14276]
114691121  [KO:K14276]
114691135  Hspa8; heat shock cognate 71 kDa protein [KO:K03283]
114691215  Bud13; BUD13 homolog isoform X1 [KO:K13106]
114691301  [KO:K14276]
114691302  [KO:K14280]
114691307  [KO:K14280]
114691402  [KO:K14276]
114691403  [KO:K14280]
114691434  Prpf8; LOW QUALITY PROTEIN: pre-mRNA-processing-splicing factor 8 [KO:K12856]
114691524  [KO:K12869]
114691609  [KO:K14280]
114691610  [KO:K14280]
114691611  [KO:K14280]
114691612  [KO:K14280]
114691613  [KO:K14280]
114691614  [KO:K14280]
114691615  [KO:K14280]
114691617  [KO:K14280]
114691619  [KO:K14280]
114691629  [KO:K14280]
114691630  [KO:K14280]
114691631  [KO:K14280]
114691753  [KO:K14276]
114691754  [KO:K14277]
114691792  [KO:K12879]
114691884  [KO:K14280]
114691885  [KO:K14280]
114691886  [KO:K14280]
114691887  [KO:K14280]
114691888  [KO:K14280]
114691894  [KO:K14276]
114691900  [KO:K14280]
114691901  [KO:K14280]
114691902  [KO:K14280]
114692020  [KO:K14276]
114692041  [KO:K14278]
114692045  [KO:K14280]
114692050  [KO:K14279]
114692054  [KO:K14279]
114692058  [KO:K14280]
114692064  [KO:K14280]
114692069  [KO:K14280]
114692075  [KO:K14280]
114692076  [KO:K14276]
114692080  [KO:K14280]
114692083  [KO:K14280]
114692088  [KO:K14280]
114692093  [KO:K14280]
114692097  [KO:K14280]
114692098  [KO:K14280]
114692102  [KO:K14280]
114692130  [KO:K14276]
114692133  [KO:K14280]
114692134  [KO:K14280]
114692180  [KO:K14276]
114692185  [KO:K14276]
114692243  [KO:K14280]
114692245  [KO:K14280]
114692248  [KO:K14276]
114692249  [KO:K14280]
114692250  [KO:K14280]
114692251  [KO:K14280]
114692293  [KO:K14276]
114692294  [KO:K14280]
114692295  [KO:K14277]
114692298  [KO:K14280]
114692299  [KO:K14280]
114692400  [KO:K14280]
114692401  [KO:K14280]
114692430  [KO:K14276]
114692431  [KO:K14276]
114692461  [KO:K14280]
114692462  [KO:K14280]
114692463  [KO:K14276]
114692464  [KO:K14276]
114692465  [KO:K14277]
114692515  [KO:K14276]
114692516  [KO:K14280]
114692518  [KO:K14280]
114692574  [KO:K14280]
114692585  Srsf6; serine/arginine-rich splicing factor 6 [KO:K12893]
114692713  [KO:K14280]
114692856  [KO:K14276]
114692862  [KO:K14280]
114692863  [KO:K14280]
114692864  [KO:K14280]
114692967  Cwc25; pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog [KO:K28450]
114692999  [KO:K14276]
114693003  [KO:K14280]
114693004  [KO:K14280]
114693005  [KO:K14280]
114693043  [KO:K11099]
114693089  [KO:K14276]
114693092  [KO:K14280]
114693094  [KO:K14280]
114693259  [KO:K14280]
114693260  [KO:K14280]
114693344  [KO:K14280]
114693414  [KO:K14276]
114693415  [KO:K14276]
114693416  [KO:K14276]
114693417  [KO:K14276]
114693420  [KO:K14280]
114693421  [KO:K14280]
114693422  [KO:K14280]
114693423  [KO:K14280]
114693424  [KO:K14276]
114693425  [KO:K14280]
114693427  [KO:K14280]
114693430  [KO:K14276]
114693431  [KO:K14276]
114693432  [KO:K14276]
114693499  [KO:K14276]
114693500  [KO:K14276]
114693585  [KO:K14280]
114693586  [KO:K14280]
114693588  [KO:K14280]
114693589  [KO:K14280]
114693590  [KO:K14280]
114693638  [KO:K14277]
114693639  [KO:K14280]
114693640  [KO:K14277]
114693643  [KO:K14280]
114693685  [KO:K11095]
114693717  [KO:K14280]
114693718  [KO:K14280]
114693798  [KO:K14280]
114693799  [KO:K14280]
114693905  [KO:K14276]
114693906  [KO:K14280]
114694001  Thoc5; THO complex subunit 5 homolog isoform X1 [KO:K13174]
114694011  Sf3a1; splicing factor 3A subunit 1 [KO:K12825]
114694117  [KO:K14276]
114694118  [KO:K14276]
114694120  [KO:K14280]
114694140  [KO:K14280]
114694141  [KO:K14280]
114694142  [KO:K14280]
114694306  Phf5a; PHD finger-like domain-containing protein 5A [KO:K12834]
114694313  Snu13; NHP2-like protein 1 [KO:K12845]
114694391  [KO:K14280]
114694392  [KO:K14280]
114694393  [KO:K14280]
114694394  [KO:K14280]
114694395  [KO:K14280]
114694401  [KO:K14276]
114694402  [KO:K14276]
114694475  [KO:K14276]
114694477  [KO:K14280]
114694625  [KO:K14280]
114694706  [KO:K14276]
114694709  [KO:K14280]
114694710  [KO:K14280]
114694713  Lsm8; LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated isoform X1 [KO:K12627]
114694753  [KO:K14276]
114694754  [KO:K14280]
114694755  [KO:K14280]
114694756  [KO:K14280]
114694757  [KO:K14280]
114694801  [KO:K14276]
114694803  [KO:K14280]
114694869  [KO:K14280]
114694907  Txnl4a; thioredoxin-like protein 4A isoform X1 [KO:K12859]
114694926  [KO:K12845]
114695023  Wbp11; WW domain-binding protein 11 [KO:K12866]
114695071  [KO:K14277]
114695072  [KO:K14280]
114695073  [KO:K14280]
114695093  [KO:K12741]
114695098  [KO:K11087]
114695101  [KO:K14280]
114695131  [KO:K14277]
114695133  [KO:K14280]
114695180  [KO:K14276]
114695181  [KO:K14280]
114695182  [KO:K14280]
114695267  Rp9; retinitis pigmentosa 9 protein [KO:K19604]
114695311  [KO:K14276]
114695312  [KO:K14276]
114695313  [KO:K14280]
114695411  [KO:K14280]
114695431  [KO:K14277]
114695436  [KO:K14280]
114695456  [KO:K14280]
114695464  [KO:K14280]
114695467  [KO:K14280]
114695482  Snrpa1; LOW QUALITY PROTEIN: U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [KO:K11092]
114695510  [KO:K11098]
114695521  [KO:K14280]
114695576  [KO:K14276]
114695577  [KO:K14276]
114695624  [KO:K14276]
114695657  [KO:K12845]
114695673  [KO:K14280]
114695674  [KO:K14280]
114695740  [KO:K12884]
114695760  [KO:K14280]
114695766  [KO:K14277]
114695767  [KO:K14277]
114695768  [KO:K14280]
114695847  [KO:K14276]
114695879  [KO:K12819]
114695897  [KO:K14280]
114695918  [KO:K12741]
114695947  [KO:K14280]
114695948  [KO:K14280]
114696060  [KO:K14276]
114696061  [KO:K14280]
114696062  [KO:K14280]
114696066  [KO:K14280]
114696067  [KO:K14280]
114696068  [KO:K14280]
114696129  [KO:K14280]
114696130  [KO:K14280]
114696243  [KO:K14276]
114696244  [KO:K14280]
114696278  [KO:K14280]
114696279  [KO:K14280]
114696280  [KO:K14280]
114696309  [KO:K14280]
114696377  [KO:K14276]
114696385  [KO:K14276]
114696440  [KO:K14280]
114696441  [KO:K14280]
114696486  Snrpd3; small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 [KO:K11088]
114696536  [KO:K14280]
114696605  Hnrnpa1; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 isoform X1 [KO:K12741]
114696694  Prpf40b; pre-mRNA-processing factor 40 homolog B isoform X1 [KO:K12821]
114696703  [KO:K14280]
114696704  [KO:K14280]
114696760  [KO:K14280]
114696783  [KO:K14280]
114696784  [KO:K14280]
114696785  [KO:K14280]
114696846  [KO:K11095]
114696973  [KO:K14276]
114696974  [KO:K14276]
114697022  [KO:K14276]
114697025  [KO:K14280]
114697044  Smndc1; survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X1 [KO:K12839]
114697076  [KO:K14276]
114697077  [KO:K14280]
114697078  [KO:K14280]
114697079  [KO:K14280]
114697121  Tra2b; transformer-2 protein homolog beta isoform X1 [KO:K12897]
114697130  [KO:K14280]
114697133  [KO:K14280]
114697148  [KO:K12741]
114697235  Srsf10; serine/arginine-rich splicing factor 10 isoform X1 [KO:K12900]
114697240  Sf3b6; splicing factor 3B subunit 6 [KO:K12833]
114697246  Syf2; pre-mRNA-splicing factor SYF2 isoform X1 [KO:K12868]
114697260  [KO:K14276]
114697264  [KO:K14276]
114697265  [KO:K14280]
114697266  [KO:K14280]
114697268  [KO:K11099]
114697305  [KO:K14276]
114697306  [KO:K14276]
114697307  [KO:K14276]
114697368  [KO:K14280]
114697369  [KO:K14280]
114697402  [KO:K14280]
114697431  [KO:K14276]
114697433  [KO:K14280]
114697498  [KO:K14280]
114697503  [KO:K14280]
114697504  Aqr; RNA helicase aquarius [KO:K12874]
114697509  [KO:K14280]
114697537  [KO:K14280]
114697541  [KO:K14280]
114697562  [KO:K14277]
114697614  Prpf40a; pre-mRNA-processing factor 40 homolog A isoform X1 [KO:K12821]
114697649  [KO:K14280]
114697650  [KO:K14280]
114697654  [KO:K12849]
114697695  [KO:K06063]
114697792  Srsf5; serine/arginine-rich splicing factor 5 isoform X1 [KO:K12893]
114697798  [KO:K14280]
114697799  [KO:K14280]
114697813  [KO:K11094]
114697817  [KO:K14280]
114697906  [KO:K14280]
114697907  [KO:K14280]
114697914  [KO:K14280]
114697916  [KO:K14280]
114697917  [KO:K14280]
114697963  [KO:K14280]
114697966  [KO:K12741]
114698023  [KO:K14276]
114698024  [KO:K14280]
114698025  [KO:K14280]
114698027  [KO:K14280]
114698094  Snrpe; small nuclear ribonucleoprotein E [KO:K11097]
114698137  [KO:K14280]
114698138  [KO:K14280]
114698139  [KO:K14280]
114698169  Snrpd1; small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 isoform X1 [KO:K11087]
114698174  Thoc1; THO complex subunit 1 [KO:K12878]
114698183  [KO:K14276]
114698238  [KO:K14276]
114698239  [KO:K14280]
114698290  [KO:K14276]
114698292  [KO:K14280]
114698337  [KO:K14276]
114698339  [KO:K14280]
114698360  [KO:K14276]
114698361  [KO:K14280]
114698454  Rbm25; RNA-binding protein 25 isoform X1 [KO:K12822]
114698456  [KO:K14280]
114698457  [KO:K14280]
114698459  [KO:K14276]
114698460  [KO:K14276]
114698478  [KO:K14276]
114698479  [KO:K14280]
114698480  [KO:K14276]
114698481  [KO:K14277]
114698484  [KO:K14280]
114698511  [KO:K14280]
114698584  Bcas2; pre-mRNA-splicing factor SPF27 isoform X1 [KO:K12861]
114698588  [KO:K14276]
114698592  [KO:K14277]
114698593  [KO:K14280]
114698749  [KO:K14276]
114698750  [KO:K14280]
114698815  [KO:K14276]
114698862  [KO:K14277]
114698866  [KO:K14280]
114698867  [KO:K14280]
114698942  [KO:K14280]
114698954  [KO:K14276]
114699013  [KO:K14276]
114699014  [KO:K14276]
114699037  [KO:K14276]
114699047  [KO:K14280]
114699058  [KO:K14276]
114699093  [KO:K14277]
114699100  [KO:K14280]
114699107  [KO:K14280]
114699115  [KO:K14280]
114699173  [KO:K14280]
114699174  [KO:K14280]
114699222  [KO:K14277]
114699223  [KO:K14280]
114699254  Srsf1; serine/arginine-rich splicing factor 1 [KO:K12890]
114699292  [KO:K14276]
114699296  [KO:K14280]
114699297  [KO:K14280]
114699298  [KO:K14280]
114699299  [KO:K14280]
114699300  [KO:K14280]
114699301  [KO:K14280]
114699302  [KO:K14280]
114699303  [KO:K14276]
114699308  [KO:K14276]
114699406  [KO:K14280]
114699416  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
114699424  [KO:K14280]
114699425  [KO:K14280]
114699454  [KO:K14276]
114699455  [KO:K14276]
114699456  [KO:K14280]
114699457  [KO:K14280]
114699485  Snrpb; small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' [KO:K11086]
114699540  [KO:K14276]
114699543  [KO:K14280]
114699617  [KO:K14280]
114699663  [KO:K14276]
114699664  [KO:K14280]
114699742  [KO:K14280]
114699758  [KO:K12741]
114699786  [KO:K14276]
114699787  [KO:K14280]
114699827  [KO:K14276]
114699888  [KO:K14280]
114699916  [KO:K14280]
114699917  [KO:K14280]
114699918  [KO:K14280]
114699919  [KO:K14280]
114699934  [KO:K14277]
114699963  Prpf38b; pre-mRNA-splicing factor 38B isoform X1 [KO:K12850]
114700014  [KO:K14280]
114700015  [KO:K14280]
114700034  [KO:K12884]
114700143  [KO:K14276]
114700144  [KO:K14276]
114700145  [KO:K14280]
114700226  [KO:K14280]
114700244  [KO:K14276]
114700246  [KO:K14280]
114700324  [KO:K14276]
114700325  [KO:K14280]
114700338  [KO:K14280]
114700339  [KO:K14280]
114700340  [KO:K14280]
114700381  [KO:K14276]
114700382  [KO:K14276]
114700434  [KO:K14280]
114700435  [KO:K14280]
114700436  [KO:K14280]
114700469  [KO:K14280]
114700501  [KO:K14280]
114700564  Snrpf; small nuclear ribonucleoprotein F [KO:K11098]
114700583  [KO:K14280]
114700584  [KO:K14280]
114700650  [KO:K14280]
114700652  [KO:K14277]
114700653  [KO:K14280]
114700771  [KO:K14280]
114700787  [KO:K14280]
114700788  [KO:K14280]
114700819  Hnrnpa3; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 isoform X1 [KO:K12741]
114700840  [KO:K14280]
114700841  [KO:K14280]
114700901  [KO:K14276]
114701007  [KO:K14280]
114701008  [KO:K14280]
114701043  [KO:K14280]
114701044  [KO:K14280]
114701077  [KO:K12741]
114701106  [KO:K14280]
114701113  [KO:K14280]
114701149  [KO:K12845]
114701185  [KO:K14276]
114701186  [KO:K14280]
114701206  [KO:K12741]
114701209  [KO:K14280]
114701288  Gpkow; G-patch domain and KOW motifs-containing protein [KO:K13101]
114701301  Pqbp1; polyglutamine-binding protein 1 isoform X1 [KO:K12865]
114701340  [KO:K14280]
114701501  [KO:K14280]
114701515  Thoc2; THO complex subunit 2 isoform X2 [KO:K12879]
114701570  [KO:K14280]
114701599  Tcerg1; transcription elongation regulator 1 isoform X2 [KO:K12824]
114701617  [KO:K14280]
114701618  [KO:K14280]
114701661  [KO:K14280]
114701706  Crnkl1; crooked neck-like protein 1 [KO:K12869]
114701712  [KO:K14276]
114701780  [KO:K14276]
114701825  [KO:K14280]
114701826  [KO:K14280]
114701912  [KO:K14276]
114701913  [KO:K14280]
114701972  [KO:K14276]
114701997  [KO:K14280]
114701999  [KO:K13108]
114702094  [KO:K14280]
114702116  [KO:K14280]
114702180  [KO:K14276]
114702181  [KO:K14280]
114702207  Dhx8; ATP-dependent RNA helicase DHX8 [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
114702226  [KO:K14280]
114702229  [KO:K14280]
114702235  [KO:K14280]
114702236  [KO:K14280]
114702242  [KO:K14280]
114702243  Eftud2; 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component isoform X1 [KO:K12852]
114702245  [KO:K14280]
114702273  [KO:K14276]
114702281  [KO:K14277]
114702282  [KO:K14277]
114702290  [KO:K14277]
114702292  [KO:K14277]
114702293  [KO:K14277]
114702294  [KO:K14277]
114702295  [KO:K14280]
114702313  [KO:K14276]
114702314  [KO:K14280]
114702359  Ncbp1; nuclear cap-binding protein subunit 1 isoform X1 [KO:K12882]
114702367  [KO:K14280]
114702422  [KO:K14279]
114702477  [KO:K14280]
114702479  [KO:K14280]
114702480  [KO:K14280]
114702481  [KO:K14280]
114702548  [KO:K14280]
114702557  [KO:K14276]
114702559  [KO:K14280]
114702579  [KO:K14280]
114702647  [KO:K14280]
114702801  [KO:K14277]
114702802  [KO:K14280]
114702916  [KO:K14276]
114702917  [KO:K14276]
114702918  [KO:K14280]
114702982  [KO:K14277]
114703020  [KO:K14280]
114703102  [KO:K14280]
114703103  [KO:K14280]
114703151  [KO:K14276]
114703190  [KO:K14280]
114703291  [KO:K14280]
114703292  [KO:K14280]
114703301  [KO:K14280]
114703302  [KO:K14280]
114703332  [KO:K14280]
114703409  Prpf19; pre-mRNA-processing factor 19 [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
114703512  [KO:K14280]
114703555  [KO:K14280]
114703576  [KO:K14276]
114703580  Snrpb2; U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' [KO:K11094]
114703652  [KO:K14280]
114703677  [KO:K14280]
114703697  [KO:K14276]
114703717  [KO:K14276]
114703719  [KO:K14280]
114703720  [KO:K14280]
114703741  [KO:K14280]
114703840  [KO:K14276]
114703843  [KO:K14280]
114703844  [KO:K14280]
114703963  [KO:K14276]
114703964  [KO:K14280]
114703965  [KO:K14280]
114703974  Ppil1; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
114704002  U2af1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit isoform X1 [KO:K12836]
114704010  [KO:K14280]
114704029  [KO:K14276]
114704065  [KO:K14276]
114704090  [KO:K14277]
114704127  [KO:K14279]
114704154  Prpf6; pre-mRNA-processing factor 6 isoform X1 [KO:K12855]
114704222  [KO:K14280]
114704231  [KO:K14280]
114704232  [KO:K14280]
114704233  [KO:K14280]
114704292  Snip1; smad nuclear-interacting protein 1 [KO:K13108]
114704306  Sf3a3; splicing factor 3A subunit 3 [KO:K12827]
114704318  [KO:K14280]
114704319  [KO:K14280]
114704401  Fus; RNA-binding protein FUS isoform X1 [KO:K13098]
114704440  [KO:K14276]
114704494  [KO:K14280]
114704573  [KO:K14276]
114704574  [KO:K14280]
114704576  [KO:K14280]
114704642  [KO:K14280]
114704679  [KO:K14280]
114704721  [KO:K14280]
114704832  [KO:K14280]
114704847  Sf3b1; splicing factor 3B subunit 1 isoform X1 [KO:K12828]
114704905  [KO:K14277]
114704906  [KO:K14280]
114704908  [KO:K14276]
114704909  [KO:K14276]
114704912  [KO:K14277]
114704938  Ppih; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H isoform X1 [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
114704969  [KO:K14276]
114704970  [KO:K14277]
114705000  [KO:K14276]
114705031  [KO:K14280]
114705072  [KO:K14276]
114705073  [KO:K14280]
114705074  [KO:K14280]
114705110  Zmat2; zinc finger matrin-type protein 2 [KO:K12848]
114705148  [KO:K14280]
114705173  Ccdc12; coiled-coil domain-containing protein 12 [KO:K12871]
114705175  [KO:K14280]
114705266  [KO:K14276]
114705289  [KO:K14280]
114705348  [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
114705373  [KO:K14276]
114705374  [KO:K14280]
114705375  [KO:K14280]
114705376  [KO:K14280]
114705396  [KO:K14276]
114705446  [KO:K14280]
114705448  [KO:K14280]
114705449  [KO:K14280]
114705457  [KO:K14276]
114705461  [KO:K14280]
114705476  Rbmx2; RNA-binding motif protein, X-linked 2 [KO:K13107]
114705478  [KO:K14276]
114705485  [KO:K14280]
114705488  [KO:K14276]
114705493  [KO:K14280]
114705500  [KO:K14280]
114705510  [KO:K14276]
114705515  [KO:K14280]
114705522  [KO:K14280]
114705563  [KO:K14280]
114705607  [KO:K14280]
114705608  [KO:K14280]
114705609  [KO:K14280]
114705629  [KO:K14280]
114705630  [KO:K14280]
114705631  [KO:K14280]
114705634  Srsf4; serine/arginine-rich splicing factor 4 [KO:K12893]
114705655  Snrnp40; U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein isoform X1 [KO:K12857]
114705730  [KO:K14280]
114705760  [KO:K14280]
114705798  Ddx39b; spliceosome RNA helicase DDX39B [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
114705867  Hspa1a; heat shock 70 kDa protein 1A [KO:K03283]
114705868  [KO:K03283]
114705870  Hspa1l; heat shock 70 kDa protein 1-like [KO:K03283]
114705891  Lsm2; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2 isoform X1 [KO:K12621]
114705930  [KO:K14276]
114706013  [KO:K14276]
114706027  [KO:K14280]
114706081  [KO:K14276]
114706083  [KO:K14280]
114706102  [KO:K14280]
114706119  Srsf3; serine/arginine-rich splicing factor 3 [KO:K12892]
114706155  Snrpc; U1 small nuclear ribonucleoprotein C [KO:K11095]
114706171  [KO:K14280]
114706172  [KO:K14280]
114706177  Magoh; protein mago nashi homolog [KO:K12877]
114706256  [KO:K14276]
114706276  [KO:K14280]
114706288  [KO:K14280]
114706289  [KO:K14280]
114706294  Prpf38a; pre-mRNA-splicing factor 38A [KO:K12849]
114706310  [KO:K14280]
114706366  [KO:K14276]
114706367  [KO:K14280]
114706368  [KO:K14280]
114706403  [KO:K14276]
114706406  [KO:K14276]
114706408  [KO:K14280]
114706409  [KO:K14280]
114706458  [KO:K14280]
114706459  [KO:K14280]
114706503  [KO:K14280]
114706570  [KO:K14280]
114706722  [KO:K14280]
114706735  [KO:K14277]
114706788  [KO:K14280]
114706799  [KO:K14276]
114706811  [KO:K14280]
114707010  Casc3; protein CASC3 [KO:K14323]
114707018  [KO:K14277]
114707019  [KO:K14280]
114707020  [KO:K14280]
114707115  Srsf2; serine/arginine-rich splicing factor 2 [KO:K12891]
114707126  [KO:K14280]
114707127  [KO:K14280]
114707220  Rbmx; RNA-binding motif protein, X chromosome [KO:K12885]
114707234  [KO:K14276]
114707236  [KO:K14280]
114707290  [KO:K14276]
114707291  [KO:K14280]
114707384  Rbm22; pre-mRNA-splicing factor RBM22 [KO:K12872]
114707411  [KO:K14280]
114707412  [KO:K14280]
114707439  [KO:K14276]
114707440  [KO:K14280]
114707448  [KO:K14280]
114707471  [KO:K14280]
114707472  [KO:K14280]
114707490  [KO:K14280]
114707506  Cdc40; pre-mRNA-processing factor 17 [KO:K12816]
114707568  Bud31; protein BUD31 homolog isoform X2 [KO:K12873]
114707585  [KO:K14280]
114707586  [KO:K14280]
114707595  [KO:K11095]
114707600  [KO:K14276]
114707601  [KO:K14277]
114707602  [KO:K14280]
114707693  [KO:K14276]
114707695  [KO:K14280]
114707717  [KO:K14280]
114707724  [KO:K14280]
114707731  [KO:K14280]
114707735  [KO:K14280]
114707757  [KO:K14280]
114707763  [KO:K14276]
114707786  [KO:K14280]
114707827  [KO:K14280]
114707837  Cdc5l; cell division cycle 5-like protein [KO:K12860]
114707961  [KO:K14276]
114707962  [KO:K14280]
114707963  [KO:K14280]
114707964  [KO:K14280]
114707966  [KO:K14276]
114707967  [KO:K14276]
114707968  [KO:K14280]
114707969  [KO:K14280]
114708027  [KO:K14280]
114708070  Dhx38; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
114708090  Sf3b3; splicing factor 3B subunit 3 [KO:K12830]
114708100  [KO:K14280]
114708154  [KO:K14280]
114708209  Rbm17; splicing factor 45 [KO:K12840]
114708216  [KO:K14280]
114708217  [KO:K14280]
114708218  [KO:K14280]
114708230  [KO:K14280]
114708298  [KO:K14280]
114708299  [KO:K14280]
114708342  [KO:K14277]
114708465  [KO:K14276]
114708481  [KO:K12625]
114708528  Ddx23; probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
114708752  Acin1; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus isoform X1 [KO:K12875]
114708835  [KO:K14280]
114708848  [KO:K14277]
114708850  [KO:K14280]
114708908  [KO:K14280]
114708986  [KO:K14280]
114708987  [KO:K14280]
114709014  [KO:K14280]
114709024  [KO:K14277]
114709025  [KO:K14280]
114709055  [KO:K14280]
114709074  Snrnp200; U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
114709095  [KO:K14276]
114709096  [KO:K14276]
114709097  [KO:K14280]
114709120  [KO:K14280]
114709121  [KO:K14280]
114709122  [KO:K14280]
114709148  Sart1; LOW QUALITY PROTEIN: U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 [KO:K11984]
114709159  Sf3b2; splicing factor 3B subunit 2 isoform X1 [KO:K12829]
114709210  Lsm6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6 [KO:K12625]
114709263  [KO:K14280]
114709404  [KO:K14279]
114709409  [KO:K14279]
114709410  [KO:K14279]
114709411  [KO:K14280]
114709426  [KO:K12622]
114709438  [KO:K14280]
114709465  [KO:K14280]
114709531  [KO:K14280]
114709564  [KO:K12841]
114709633  [KO:K14280]
114709634  [KO:K14280]
114709676  [KO:K14276]
114709710  [KO:K14280]
114709742  [KO:K14277]
114709762  [KO:K14280]
114709765  [KO:K14279]
114709766  [KO:K14280]
114709787  [KO:K14280]
114709807  [KO:K14280]
114709918  [KO:K14276]
114709929  [KO:K14280]
114709934  [KO:K14276]
114709951  [KO:K14280]
114709952  [KO:K14280]
114710018  [KO:K14280]
114710027  Ncbp2; nuclear cap-binding protein subunit 2 [KO:K12883]
114710049  [KO:K14276]
114710068  [KO:K14280]
114710173  [KO:K14276]
114710206  [KO:K14280]
114710247  [KO:K12836]
114710248  [KO:K12836]
114710286  [KO:K12836]
114710291  [KO:K14280]
114710333  [KO:K14276]
114710369  [KO:K14280]
114710372  Thoc7; THO complex subunit 7 homolog isoform X1 [KO:K13176]
114710382  [KO:K14280]
114710402  [KO:K14280]
114710403  [KO:K14280]
114710508  [KO:K14276]
114710509  [KO:K14276]
114710559  [KO:K14280]
114710593  [KO:K14280]
114710594  [KO:K14280]
114710677  [KO:K14280]
114710687  [KO:K14277]
114710704  [KO:K14280]
114710738  [KO:K14280]
114710743  [KO:K14276]
114710744  [KO:K14280]
114710808  Prpf18; pre-mRNA-splicing factor 18 isoform X1 [KO:K12817]
114710839  [KO:K12829]
114710997  [KO:K14280]
114711007  [KO:K14280]
114711009  [KO:K14280]
114711010  [KO:K14280]
114711025  [KO:K14280]
114711028  [KO:K14276]
119086687  [KO:K11099]
Reference
PMID:19239890
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
PMID:10978320
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
PMID:17537823
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
PMID:19733268
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
Reference
PMID:28781166
  Authors
Bertram K, Agafonov DE, Dybkov O, Haselbach D, Leelaram MN, Will CL, Urlaub H, Kastner B, Luhrmann R, Stark H
  Title
Cryo-EM Structure of a Pre-catalytic Human Spliceosome Primed for Activation.
  Journal
Cell 170:701-713.e11 (2017)
DOI:10.1016/j.cell.2017.07.011
Reference
PMID:29360106
  Authors
Zhang X, Yan C, Zhan X, Li L, Lei J, Shi Y
  Title
Structure of the human activated spliceosome in three conformational states.
  Journal
Cell Res 28:307-322 (2018)
DOI:10.1038/cr.2018.14
Reference
PMID:29361316
  Authors
Haselbach D, Komarov I, Agafonov DE, Hartmuth K, Graf B, Dybkov O, Urlaub H, Kastner B, Luhrmann R, Stark H
  Title
Structure and Conformational Dynamics of the Human Spliceosomal B(act) Complex.
  Journal
Cell 172:454-464.e11 (2018)
DOI:10.1016/j.cell.2018.01.010
Reference
PMID:39068178
  Authors
Zhan X, Lu Y, Shi Y
  Title
Molecular basis for the activation of human spliceosome.
  Journal
Nat Commun 15:6348 (2024)
DOI:10.1038/s41467-024-50785-0
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system