KEGG   ORTHOLOGY: K11086
Entry
K11086                      KO                                     

Name
SNRPB, SMB
Definition
small nuclear ribonucleoprotein B and B'
Pathway
ko03040  Spliceosome
ko05322  Systemic lupus erythematosus
Disease
H01843  Cerebrocostomandibular syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
 09160 Human Diseases
  09163 Immune disease
   05322 Systemic lupus erythematosus
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
   03032 DNA replication proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U1 snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
 Complex B
  U1 snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
 Complex C
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   Sm proteins
    K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Termination Factors
   Telomerase complex (fungi)
    Sm core complex
     K11086  SNRPB, SMB; small nuclear ribonucleoprotein B and B'
Other DBs
GO: 0030532
Genes
HSA: 6628(SNRPB)
PTR: 470014(SNRPB)
PPS: 100995656(SNRPB)
GGO: 101138354(SNRPB)
PON: 100452933(SNRPB)
NLE: 100591564(SNRPB)
MCC: 716578(SNRPB)
MCF: 102133511(SNRPB)
CSAB: 103215680(SNRPB)
CATY: 105582168(SNRPB)
RRO: 104674631(SNRPB)
RBB: 108529984(SNRPB)
TFN: 117068557(SNRPB) 117096216
CJC: 100401360(SNRPB)
SBQ: 101049442(SNRPB)
MMUR: 105865953(SNRPB)
MMU: 20638(Snrpb)
MCAL: 110311547(Snrpb)
MPAH: 110318180(Snrpb)
RNO: 171365(Snrpb)
MCOC: 116090924(Snrpb)
MUN: 110553285(Snrpb)
CGE: 100751537(Snrpb)
PLEU: 114699485(Snrpb)
NGI: 103751141(Snrpb)
HGL: 101700785 101708266(Snrpb)
CCAN: 109692892(Snrpb)
OCU: 100341600(SNRPB)
TUP: 102492258(SNRPB) 102502188
CFA: 100684393 485806(SNRPB)
VVP: 112930111(SNRPB)
AML: 100466329(SNRPB)
UMR: 103674510(SNRPB)
UAH: 113258415(SNRPB)
ORO: 101379888(SNRPB)
ELK: 111141746
MPUF: 101675891(SNRPB)
EJU: 114220780(SNRPB)
FCA: 101099709(SNRPB)
PTG: 102948471(SNRPB)
PPAD: 109274802(SNRPB)
AJU: 106986042(SNRPB)
BTA: 613304(SNRPB)
BOM: 102269358(SNRPB)
BIU: 109567218(SNRPB)
BBUB: 102389694(SNRPB)
CHX: 102173400(SNRPB)
OAS: 101104770(SNRPB)
CFR: 102505727(SNRPB)
CDK: 105096045(SNRPB)
BACU: 102997676
LVE: 103071512(SNRPB)
OOR: 101274409(SNRPB)
DLE: 111184368(SNRPB)
PCAD: 102985982(SNRPB)
ECB: 100053021(SNRPB)
EPZ: 103541037(SNRPB)
EAI: 106823085(SNRPB)
MYB: 102260822(SNRPB)
MYD: 102758343(SNRPB)
MMYO: 118663105(SNRPB)
MNA: 107539351(SNRPB)
HAI: 109371461 109384366(SNRPB)
DRO: 112303832(SNRPB)
SHON: 118985612(SNRPB)
AJM: 119046235(SNRPB)
MMF: 118619016(SNRPB)
PALE: 102880449(SNRPB)
RAY: 107511327(SNRPB)
MJV: 108409299(SNRPB)
LAV: 100670616(SNRPB)
TMU: 101340317
MDO: 554245(SNRPB)
SHR: 100925653(SNRPB)
PCW: 110193709(SNRPB)
OAA: 100086605(SNRPB) 114806186
GGA: 395298(SNRPN)
MGP: 100548671(SNRPB)
CJO: 107323119(SNRPB)
NMEL: 110408133(SNRPB)
APLA: 101791610(SNRPB)
ACYG: 106047179(SNRPB)
TGU: 100190618(SNRPB)
LSR: 110476161(SNRPB)
SCAN: 103818813(SNRPB)
GFR: 102039419(SNRPB)
FAB: 101818869(SNRPB)
PHI: 102111392
PMAJ: 107213057
CCAE: 111938189
CCW: 104687733(SNRPB)
FPG: 101913676(SNRPB)
FCH: 102059479
CLV: 102086456
EGZ: 104127950
NNI: 104018327(SNRPB)
ACUN: 113487716(SNRPB)
PADL: 103921876
AAM: 106497591(SNRPB)
ASN: 102372925(SNRPB)
AMJ: 102563761(SNRPB)
PSS: 102445521(SNRPB)
CMY: 102941207(SNRPB)
CPIC: 101932999
ACS: 100565606
PVT: 110086242
PBI: 103059702(SNRPB)
PMUR: 107296127(SNRPB)
TSR: 106555543(SNRPB)
PMUA: 114599912(SNRPB)
GJA: 107108034(SNRPB)
XLA: 379853(snrpb.S) 734887(snrpb.L)
XTR: 407857(snrpb)
NPR: 108793372(SNRPB)
DRE: 402966(snrpb)
SRX: 107740291(snrpb) 107744347
SANH: 107681274(snrpb)
SGH: 107553909(snrpb) 107587634
IPU: 108272150(SNRPB)
PHYP: 113540458(snrpb)
AMEX: 103031946(snrpb)
EEE: 113571669(snrpb)
TRU: 101068957(snrpb)
LCO: 104933132
MZE: 101483588(snrpb)
ONL: 100700782(snrpb)
OLA: 101173217
XMA: 102234652
XCO: 114135291
PRET: 103460354
CVG: 107103549
NFU: 107384872
KMR: 108250717(snrpb)
ALIM: 106531753
AOCE: 111571414(snrpb)
CSEM: 103386822(snrpb)
POV: 109643066
LCF: 108890716(snrpb)
SDU: 111219419(snrpb)
SLAL: 111656512(snrpb) 111656884
HCQ: 109522681(snrpb)
BPEC: 110153571(snrpb)
MALB: 109966897
SASA: 100196021(rsmb)
OTW: 112255033
SALP: 111970514
ELS: 105016713(snrpb)
SFM: 108936420(snrpb)
PKI: 111835870
LCM: 102356228(SNRPB)
CMK: 103176319 103191448(snrpb)
RTP: 109916426(snrpb) 109936115
BFO: 118418531
CIN: 100178781
DME: Dmel_CG5352(SmB)
DER: 6543149
DSE: 6611998
DSI: Dsimw501_GD22258(Dsim_GD22258)
DYA: Dyak_GE25943(Dyak_SmB)
DAN: 6496926
DSR: 110183314
DPE: 6588960
DMN: 108163979
DWI: 6641941
DAZ: 108610918
DNV: 115562490
DHE: 111592563
DVI: 6628092
MDE: 101901060
LCQ: 111678998
AAG: 5574494
AME: 409356(Smb)
BIM: 100749945
BTER: 100644325
CCAL: 108631387
OBB: 114881805
SOC: 105205397
MPHA: 105833381
AEC: 105148566
ACEP: 105624645
PBAR: 105422547
VEM: 105559657
HST: 105190597
DQU: 106742609
CFO: 105259070
LHU: 105674272
PGC: 109862310
OBO: 105276680
PCF: 106790121
NVI: 100114940
CSOL: 105366164
MDL: 103570969
TCA: 663178
DPA: 109534723
ATD: 109601795
NVL: 108561034
BMOR: 778458
BMAN: 114248970
PMAC: 106713304
PRAP: 110998058
HAW: 110376929
TNL: 113493298
PXY: 105392214
DNX: 107173796
BTAB: 109031299
CLEC: 106665739
ZNE: 110837488
FCD: 110863224
PVM: 113824065
CSCU: 111617830
CEL: CELE_W08E3.1(snr-2)
CBR: CBG20368(Cbr-snr-2)
BMY: Bm1_49460
PCAN: 112553152
MYI: 110450792
OBI: 106884303
NVE: 5500936
EPA: 110232217
AMIL: 114968644
PDAM: 113670502
SPIS: 111339284
DGT: 114532689
HMG: 100207593
ATH: AT4G20440(smB) AT5G44500
CPAP: 110826058
CIT: 102630807
TCC: 18595105
GHI: 107930376
DZI: 111275394
EGR: 104428006
VRA: 106765182
VUN: 114195286
CCAJ: 109810629
CAM: 101489488
LJA: Lj0g3v0204049.1(Lj0g3v0204049.1) Lj0g3v0204049.2(Lj0g3v0204049.2) Lj2g3v3133960.1(Lj2g3v3133960.1)
ADU: 107496490
AIP: 107608686
FVE: 101313018
RCN: 112177121
PPER: 18776035
PMUM: 103337917
PXB: 103952971
CSV: 101207463
CMO: 103484284
MCHA: 111015803
RCU: 8283921
JCU: 105636798
HBR: 110638313
MESC: 110617723
POP: 18095770
PEU: 105111266
JRE: 109000676
VVI: 100257709
SLY: 101262959
SPEN: 107008587
CANN: 107839180
NTA: 107825164
NSY: 104222971
NTO: 104107656
NAU: 109239274
HAN: 110885822
DCR: 108208745
BVG: 104886497
OSA: 9270807
BDI: 106865937
ATS: 109741594
SBI: 8081170
SITA: 101764245
DCT: 110095769
PEQ: 110024309
ATR: 18421525
APRO: F751_5020
SCE: YER029C(SMB1)
ERC: Ecym_1209
KMX: KLMA_40616(SMB1)
NCS: NCAS_0F03750(NCAS0F03750)
NDI: NDAI_0B06030(NDAI0B06030)
TPF: TPHA_0D03410(TPHA0D03410)
TBL: TBLA_0C04890(TBLA0C04890)
TDL: TDEL_0D05870(TDEL0D05870)
KAF: KAFR_0I02400(KAFR0I02400)
CAL: CAALFM_CR07510WA(CaO19.2621)
SLB: AWJ20_3381(smb1)
NCR: NCU02508
NTE: NEUTE1DRAFT126545(NEUTE1DRAFT_126545)
MGR: MGG_16920
SSCK: SPSK_04486
MAW: MAC_05247
MAJ: MAA_03982
CMT: CCM_06170
BFU: BCIN_01g09610(Bcsmb1)
MBE: MBM_02544
ANI: AN4476.2
ANG: ANI_1_448184(An04g02130)
ABE: ARB_01084
TVE: TRV_02854
PTE: PTT_14550
SPO: SPAC26A3.08(smb1)
CNE: CNJ02650
CNB: CNBJ0810
ABP: AGABI1DRAFT112159(AGABI1DRAFT_112159)
ABV: AGABI2DRAFT136942(AGABI2DRAFT_136942)
MGL: MGL_2602
MRT: MRET_0486
DDI: DDB_G0272320(snrpb)
EHI: EHI_060400(89.t00010)
PCB: PCHAS_102870(PC000448.04.0)
TAN: TA12755
TPV: TP02_0362
BBO: BBOV_III006010(17.m07530)
CPV: cgd1_2910
SMIN: v1.2.038273.t1(symbB.v1.2.038273.t1)
SPAR: SPRG_04704
TCR: 507209.10
 » show all
Reference
  Authors
Yang XC, Torres MP, Marzluff WF, Dominski Z
  Title
Three proteins of the U7-specific Sm ring function as the molecular ruler to determine the site of 3'-end processing in mammalian histone pre-mRNA.
  Journal
Mol Cell Biol 29:4045-56 (2009)
DOI:10.1128/MCB.00296-09
  Sequence
[mmu:20638]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system