KEGG   ORTHOLOGY: K12839
Entry
K12839                      KO                                     
Symbol
SMNDC1, SPF30
Name
survival of motor neuron-related-splicing factor 30
Pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12839  SMNDC1, SPF30; survival of motor neuron-related-splicing factor 30
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12839  SMNDC1, SPF30; survival of motor neuron-related-splicing factor 30
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U2 snRNP components
   U2 related factors
    K12839  SMNDC1, SPF30; survival of motor neuron-related-splicing factor 30
 Complex B
  U2 snRNP components
   U2 related factors
    K12839  SMNDC1, SPF30; survival of motor neuron-related-splicing factor 30
 Other splicing related proteins
  Proteins involved in snRNP biogenesis
   Other proteins involved in snRNP biogenesis
    K12839  SMNDC1, SPF30; survival of motor neuron-related-splicing factor 30
Genes
HSA: 10285(SMNDC1)
PTR: 450730(SMNDC1)
PPS: 100975383(SMNDC1)
GGO: 101131875(SMNDC1)
PON: 100173826(SMNDC1)
NLE: 100582421(SMNDC1)
MCC: 694761(SMNDC1)
MCF: 102135509(SMNDC1)
CSAB: 103216501(SMNDC1)
CATY: 105577890(SMNDC1)
PANU: 101018359(SMNDC1)
TGE: 112631389(SMNDC1)
RRO: 104667768(SMNDC1)
RBB: 108538858(SMNDC1)
TFN: 117064526 117067087(SMNDC1)
PTEH: 111538886(SMNDC1)
CJC: 100410864(SMNDC1)
SBQ: 101035523(SMNDC1)
CSYR: 103264194(SMNDC1)
MMUR: 105874900(SMNDC1)
LCAT: 123650329(SMNDC1)
OGA: 100948501(SMNDC1)
MMU: 76479(Smndc1)
MCAL: 110285507(Smndc1)
MPAH: 110323572(Smndc1)
RNO: 287768(Smndc1)
MCOC: 116103994(Smndc1)
MUN: 110557681(Smndc1)
CGE: 100758118(Smndc1)
MAUA: 101838894(Smndc1)
PLEU: 114697044(Smndc1)
AAMP: 119820941(Smndc1)
NGI: 103741079(Smndc1)
HGL: 101726695(Smndc1)
CPOC: 100732041(Smndc1)
CCAN: 109698738(Smndc1)
DORD: 105986763(Smndc1)
DSP: 122115950(Smndc1)
NCAR: 124985859
OCU: 100353047(SMNDC1)
OPI: 101529105(SMNDC1)
TUP: 102483595(SMNDC1)
CFA: 477817(SMNDC1)
VVP: 112915977(SMNDC1)
VLG: 121485309(SMNDC1)
AML: 100464124(SMNDC1)
UMR: 103656959(SMNDC1)
UAH: 113251918(SMNDC1)
UAR: 123795948(SMNDC1)
ELK: 111144898
LLV: 125084639
MPUF: 101670766(SMNDC1)
ORO: 101381781(SMNDC1)
EJU: 114202445(SMNDC1)
ZCA: 113921010(SMNDC1)
MLX: 118026051(SMNDC1)
FCA: 101092962(SMNDC1)
PYU: 121037215(SMNDC1)
PBG: 122493235(SMNDC1)
PTG: 102968874(SMNDC1)
PPAD: 109272885(SMNDC1)
AJU: 106984768(SMNDC1)
HHV: 120244304(SMNDC1)
BTA: 520500(SMNDC1)
BOM: 102285250(SMNDC1)
BIU: 109553017(SMNDC1)
BBUB: 102410430(SMNDC1)
CHX: 100861041(SMNDC1)
OAS: 101118493(SMNDC1)
ODA: 120873620(SMNDC1)
CCAD: 122445923(SMNDC1)
SSC: 100127466(SMNDC1)
CFR: 102509849(SMNDC1)
CBAI: 105080722(SMNDC1)
CDK: 105091706(SMNDC1)
VPC: 102528480(SMNDC1)
BACU: 103003836(SMNDC1)
LVE: 103086867
OOR: 101272417(SMNDC1)
DLE: 111172316(SMNDC1)
PCAD: 102979164(SMNDC1)
PSIU: 116741912(SMNDC1)
ECB: 111773244(SMNDC1)
EPZ: 103564695(SMNDC1)
EAI: 106846743(SMNDC1)
MYB: 102252709(SMNDC1)
MYD: 102761668(SMNDC1)
MMYO: 118669755(SMNDC1)
MLF: 102422164(SMNDC1)
MNA: 107536446(SMNDC1)
PKL: 118719471(SMNDC1)
HAI: 109384893(SMNDC1)
DRO: 112300328(SMNDC1)
SHON: 118999428(SMNDC1)
AJM: 119060814 119064021(SMNDC1)
PDIC: 114496773(SMNDC1)
PHAS: 123828961(SMNDC1)
MMF: 118632465(SMNDC1)
RFQ: 117036401(SMNDC1)
PALE: 102883685(SMNDC1)
PGIG: 120609107(SMNDC1)
PVP: 105294518(SMNDC1)
RAY: 107511383(SMNDC1)
MJV: 108407907(SMNDC1)
TOD: 119233678(SMNDC1)
SARA: 101549199(SMNDC1)
LAV: 100673372(SMNDC1)
TMU: 101342237
DNM: 101443037(SMNDC1)
MDO: 100021868(SMNDC1)
GAS: 123236267(SMNDC1)
SHR: 100931083(SMNDC1)
PCW: 110209493(SMNDC1)
OAA: 100082104(SMNDC1)
GGA: 423889(SMNDC1)
PCOC: 116231632(SMNDC1)
MGP: 100545023(SMNDC1)
CJO: 107316064(SMNDC1)
NMEL: 110399376(SMNDC1)
APLA: 101791521(SMNDC1)
ACYG: 106031873(SMNDC1)
AFUL: 116491533(SMNDC1)
TGU: 100219868(SMNDC1)
LSR: 110473623(SMNDC1)
SCAN: 103813833(SMNDC1)
PMOA: 120502069(SMNDC1)
OTC: 121341780(SMNDC1)
PRUF: 121350210(SMNDC1)
GFR: 102034379(SMNDC1)
FAB: 101811651(SMNDC1)
PHI: 102108383(SMNDC1)
PMAJ: 107206807(SMNDC1)
CCAE: 111931301(SMNDC1)
CCW: 104695307(SMNDC1)
ETL: 114058404(SMNDC1)
ZAB: 102065692(SMNDC1)
FPG: 101914117(SMNDC1)
FCH: 102048785(SMNDC1)
CLV: 102092601(SMNDC1)
EGZ: 104130419(SMNDC1)
NNI: 104022324(SMNDC1)
PLET: 104621513(SMNDC1)
ACUN: 113481435(SMNDC1)
TALA: 104359517(SMNDC1)
PADL: 103918581(SMNDC1)
ACHC: 115348621(SMNDC1)
AAM: 106495403(SMNDC1)
AROW: 112967912(SMNDC1)
NPD: 112957150(SMNDC1)
DNE: 112993647(SMNDC1)
ASN: 102367859(SMNDC1)
AMJ: 102574143(SMNDC1)
CPOO: 109324187(SMNDC1)
GGN: 109287604(SMNDC1)
PSS: 102444099(SMNDC1)
CMY: 102932720(SMNDC1)
CPIC: 101952895(SMNDC1)
TST: 117880141(SMNDC1)
CABI: 116832662(SMNDC1)
MRV: 120369089(SMNDC1)
ACS: 100561949(smndc1)
PVT: 110071953(SMNDC1)
SUND: 121924882(SMNDC1)
PBI: 103051598(SMNDC1)
PMUR: 107290001(SMNDC1)
TSR: 106545556(SMNDC1)
PGUT: 117678695(SMNDC1)
VKO: 123027529(SMNDC1)
PMUA: 114597495(SMNDC1)
ZVI: 118093664(SMNDC1)
GJA: 107121826(SMNDC1)
STOW: 125437727(SMNDC1)
XLA: 108695999(smndc1.L) 108697303(smndc1.S)
XTR: 448621(smndc1)
NPR: 108791935(SMNDC1)
RTEM: 120946853(SMNDC1)
BBUF: 121003665(SMNDC1)
BGAR: 122923920 122941496(SMNDC1)
DRE: 572679(smndc1)
CCAR: 109053708(smndc1)
PPRM: 120478555(smndc1)
MAMB: 125268560(smndc1)
IPU: 108269805(smndc1)
PHYP: 113534228(smndc1)
SMEO: 124390488(smndc1)
TFD: 113651289(smndc1)
AMEX: 103046212(smndc1)
EEE: 113571368(smndc1)
TRU: 101078596(smndc1)
LCO: 104929500(smndc1)
NCC: 104956669(smndc1)
CGOB: 115020326(smndc1)
ELY: 117248436(smndc1)
PLEP: 121954532(smndc1)
SLUC: 116055372(smndc1)
ECRA: 117960862(smndc1)
PFLV: 114572211(smndc1)
GAT: 120820363(smndc1)
PPUG: 119214271(smndc1)
MSAM: 119917166(smndc1)
CUD: 121511383(smndc1)
ALAT: 119033429(smndc1)
MZE: 101483474(smndc1)
ONL: 100697211(smndc1)
OAU: 116333679(smndc1)
OLA: 101170118(smndc1)
OML: 112161747(smndc1)
XMA: 102224496(smndc1)
XCO: 114138313(smndc1)
XHE: 116713487(smndc1)
PRET: 103476777(smndc1)
PFOR: 103133550(smndc1)
PLAI: 106947694(smndc1)
PMEI: 106914134(smndc1)
GAF: 122842538(smndc1)
CVG: 107093569(smndc1)
CTUL: 119797035(smndc1)
GMU: 124858628(smndc1)
NFU: 107395485(smndc1)
KMR: 108242339(smndc1)
ALIM: 106513351(smndc1)
NWH: 119412872(smndc1)
AOCE: 111566899(smndc1)
CSEM: 103387644(smndc1)
POV: 109633411(smndc1)
SSEN: 122782284(smndc1)
HHIP: 117775440(smndc1)
HSP: 118119025(smndc1)
LCF: 108897322(smndc1)
SDU: 111235287(smndc1)
SLAL: 111649554(smndc1)
XGL: 120796889(smndc1)
HCQ: 109510185(smndc1)
BPEC: 110157116(smndc1)
MALB: 109962493(smndc1)
BSPL: 114870665(smndc1)
SASA: 100195756(spf30) 106607287
OTW: 112253053(smndc1) 112254656
OMY: 100301720(smndc1) 110502481
OGO: 124038263 124041242(smndc1)
SNH: 120017663(smndc1) 120045635
ELS: 105010581(smndc1)
SFM: 108918865(smndc1)
PKI: 111848350(smndc1)
AANG: 118218287(smndc1) 118220345
LOC: 102694542(smndc1)
LCM: 102367508(SMNDC1)
CMK: 103185224(smndc1)
RTP: 109910752(smndc1)
BFO: 118404573
BBEL: 109483100
CIN: 100182397
SCLV: 120332188
APLC: 110979534
SKO: 100370753
DME: Dmel_CG17454(CG17454)
DER: 26526215
DSE: 116800898
DSI: Dsimw501_GD27629(Dsim_GD27629) Dsimw501_GD29188(Dsim_GD29188) Dsimw501_GD29372(Dsim_GD29372)
DSR: 110178690
DPE: 6592134
DMN: 108155708
DWI: 6651032
DGR: 6569997
DAZ: 108608858
DNV: 108659796
DHE: 111598538
DVI: 6635264
CCAT: 101453061
BOD: 106624937
MDE: 101895277
SCAC: 106093529
LCQ: 111686035
LSQ: 119616167
HIS: 119647117
ACOZ: 120951562
AARA: 120896430
ASTE: 118509452
AAG: 5576040
CPII: 120423606
CNS: 116350159
BCOO: 119079391
AME: 410027
ACER: 107998075
ALAB: 122712300
BIM: 100744996
BBIF: 117209239
BVK: 117239610
BVAN: 117165940
BTER: 100646101
BPYO: 122566121
CCAL: 108627359
OBB: 114871382
MGEN: 117218711
NMEA: 116432170
CGIG: 122398394
SOC: 105204376
MPHA: 105840340
AEC: 105143488
ACEP: 105617399
PBAR: 105422602
VEM: 105558751
HST: 105189454
DQU: 106752395
CFO: 105254252
FEX: 115233272
LHU: 105672196
PGC: 109862904
OBO: 105286245
PCF: 106784679
PFUC: 122523520
VPS: 122636385
NVI: 100116215
CSOL: 105366293
TPRE: 106660381
MDL: 103577806
CGLO: 123272155
FAS: 105270596
AGIF: 122858431
CCIN: 107271842
TCA: 663500
DPA: 109536813
CSET: 123318052
AGB: 108906912
LDC: 111513052
NVL: 108556904
APLN: 108733625
PPYR: 116179249
OTU: 111426343
BMOR: 101736899
BMAN: 114249395
MSEX: 115448366
BANY: 112051272
PMAC: 106709002
PPOT: 106100448
PXU: 106123998
PRAP: 110994817
HAW: 110374095
TNL: 113496415
OFU: 114349862
API: 100162543
DNX: 107166152
AGS: 114120784
RMD: 113551797
BTAB: 109042437
DCI: 103509841
CLEC: 106665146
HHAL: 106677495
NLU: 111046438
FOC: 113214050
TPAL: 117652292
ZNE: 110827224
CSEC: 111874360
FCD: 110846124
DMK: 116929830
PVM: 113821676
PJA: 122257749
PCHN: 125041763
HAME: 121875444
PCLA: 123744852
PTRU: 123520329
HAZT: 108682083
EAF: 111702830
LSM: 121132556
PPOI: 119103499
DSV: 119450148
RSAN: 119383367
RMP: 119170307
VDE: 111250925
VJA: 111262528
TUT: 107363111
DPTE: 113791547
DFR: 124491845
CSCU: 111621768
PTEP: 107447022
SDM: 118184510
CEL: CELE_Y71D11A.2(smr-1)
CBR: CBG_11727(Cbr-smr-1)
BMY: BM_BM7028(Bma-smr-1)
TSP: Tsp_00870
PCAN: 112561551
BGT: 106068645
GAE: 121376811
HRF: 124125419
HRJ: 124265747
CRG: 105347375
MYI: 110445363
PMAX: 117316669
MMER: 123541589
OBI: 106875499
OSN: 115215502
EGL: EGR_01101
NVE: 5511452
EPA: 110249353
ATEN: 116298160
ADF: 107355181
AMIL: 114968932
PDAM: 113676093
SPIS: 111345037
DGT: 114528544
XEN: 124447500
AQU: 100641803
ATH: AT2G02570
ALY: 9311205
CRB: 17884999
RSZ: 108848302
THJ: 104824089
CPAP: 110807410
CIT: 102621258
PVY: 116143929
TCC: 18595229
GRA: 105773285
GAB: 108486270
EGR: 104420030
VRA: 106769460
VAR: 108347500
VUN: 114178149
CCAJ: 109811382
APRC: 113846791
CAM: 101495555
LJA: Lj4g3v0013170.1(Lj4g3v0013170.1) Lj4g3v0013170.2(Lj4g3v0013170.2) Lj4g3v0013170.3(Lj4g3v0013170.3)
ADU: 107465583
AIP: 107635848
FVE: 101311866
PPER: 18788669
PMUM: 103318950
PAVI: 110765757
PDUL: 117634310
MNT: 21394252
CSV: 101206291
CMO: 103499374
BHJ: 120068948
MCHA: 111022290
CMAX: 111493029
CMOS: 111439780
CPEP: 111793056
RCU: 8262560
JCU: 105629729
POP: 18098370
PEU: 105128440
PALZ: 118031104
QLO: 115977650
VVI: 100257533
VRI: 117926866
SLY: 101256129
SPEN: 107008362
SOT: 102603397
CANN: 107839826
NSY: 104214530
NTO: 104106288
NAU: 109242138
INI: 109165279
ITR: 116033682
EGT: 105962565
HAN: 110910660
ECAD: 122591115
LSV: 111886146
CCAV: 112505758
DCR: 108204434
CSIN: 114257956
BVG: 104897016
SOE: 110783844
NNU: 104593939
NCOL: 116246375
OSA: 4344474
DOSA: Os08t0109900-01(Os08g0109900)
OBR: 102713758
BDI: 100831866
ATS: 109743347
TUA: 125528438
SBI: 8068537
ZMA: 103653151
SITA: 101764907
SVS: 117862204
PHAI: 112897167
PDA: 103717256
EGU: 105049768
DCT: 110116097
PEQ: 110030998
ATR: 18427792
APRO: F751_3763
SLB: AWJ20_997
NCR: NCU04794
NTE: NEUTE1DRAFT131741(NEUTE1DRAFT_131741)
MGR: MGG_08894
SSCK: SPSK_04295
MAW: MAC_04747
MAJ: MAA_02308
CMT: CCM_04452
MBE: MBM_06449
ANG: ANI_1_1028094(An11g08010)
ABE: ARB_05351
TVE: TRV_04393
PTE: PTT_06949
SPO: SPCC1281.02c(spf30)
CNE: CNC03210
CNB: CNBC4000
TASA: A1Q1_03913
MGL: MGL_3304
MRT: MRET_2389
DFA: DFA_07053
EHI: EHI_036840(283.t00003)
TAN: TA10430
BBO: BBOV_III007940(17.m07696)
CPV: cgd4_270
SPAR: SPRG_02017
 » show all
Reference
  Authors
Rappsilber J, Ajuh P, Lamond AI, Mann M
  Title
SPF30 is an essential human splicing factor required for assembly of the U4/U5/U6 tri-small nuclear ribonucleoprotein into the spliceosome.
  Journal
J Biol Chem 276:31142-50 (2001)
DOI:10.1074/jbc.M103620200
  Sequence
[hsa:10285]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system