KEGG   ORTHOLOGY: K12845
Entry
K12845                      KO                                     
Symbol
SNU13, NHP2L
Name
U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Pathway
map03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
   03009 Ribosome biogenesis
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6 snRNP specific factors
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Sno RNPs
   Box C/D snoRNPs
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Other DBs
COG: COG1358
Genes
HSA: 4809(SNU13)
PTR: 458869(SNU13)
PPS: 100968235(SNU13)
GGO: 101129194(SNU13)
PON: 100447181(SNU13)
NLE: 100600266 115830397
MCC: 708283(SNU13)
MCF: 101926085(SNU13)
CSAB: 103223391(SNU13)
CATY: 105572315(NHP2L1)
PANU: 101005413(SNU13)
TGE: 112633412(SNU13)
RRO: 104671607(SNU13)
TFN: 117082687 117096406(SNU13)
PTEH: 111548947(SNU13)
CJC: 100390384(SNU13)
SBQ: 101028525(NHP2L1)
CSYR: 103264359(SNU13)
MMUR: 105858514(SNU13)
OGA: 100958325(SNU13)
MMU: 20826(Snu13)
MCAL: 110310556(Snu13)
MPAH: 110334528(Snu13)
RNO: 100359574 300092(Snu13)
MUN: 110554106(Snu13)
NGI: 103743470(Snu13)
HGL: 101703114(Snu13)
CPOC: 100717558(Snu13)
CCAN: 109689387(Snu13)
DORD: 105992122(Nhp2l1)
DSP: 122123576(Snu13)
NCAR: 124983179
OCU: 100351699(SNU13)
OPI: 101516674(SNU13) 105942511
TUP: 102492648 102497810(SNU13)
CFA: 119870192 474484(SNU13) 609886
VVP: 112934036(SNU13)
AML: 100478368(SNU13)
UMR: 103674077(SNU13)
UAH: 113241721(SNU13)
UAR: 123780813(SNU13)
ELK: 111157457
LLV: 125107184
MPUF: 101679049(NHP2L1)
ORO: 101383074(NHP2L1)
EJU: 114218510(SNU13)
MLX: 117998626(SNU13)
FCA: 101081647(SNU13)
PYU: 121040265(SNU13)
PBG: 122472824(SNU13)
PTG: 102961087(SNU13)
PPAD: 109265638(SNU13)
AJU: 106979937(SNU13)
HHV: 120233043 120235122(SNU13)
BTA: 767931(SNU13)
BOM: 102276892(SNU13)
BIU: 109559866(SNU13)
BBUB: 102400154(SNU13)
CHX: 102168897(SNU13)
OAS: 101112386(SNU13) 105613621
ODA: 120857588(SNU13)
CCAD: 122423060(SNU13)
SSC: 100155420(SNU13)
CFR: 102521603(SNU13)
CBAI: 105073066(NHP2L1)
CDK: 105091892(SNU13)
VPC: 102532447(SNU13)
BACU: 103003350(SNU13) 103004724
LVE: 103082397 103089777(SNU13)
OOR: 101275200(NHP2L1)
DLE: 111186396(SNU13)
PCAD: 102977483(SNU13)
ECB: 100070695(SNU13)
EPZ: 103562701(SNU13)
EAI: 106848514(SNU13)
MYB: 102244468 102256910(SNU13)
MYD: 102756919(SNU13)
MMYO: 118650390(SNU13)
MLF: 102425789(SNU13)
MNA: 107534975(SNU13)
PKL: 118712062(SNU13) 118716968
HAI: 109377513(SNU13)
DRO: 112321729(SNU13)
SHON: 119002472(SNU13)
AJM: 119060483(SNU13) 119063939
PDIC: 114513391(SNU13)
PHAS: 123816149(SNU13)
MMF: 118623574(SNU13)
RFQ: 117028531(SNU13)
PALE: 102889833(SNU13)
PGIG: 120602953(SNU13)
PVP: 105298036(SNU13)
RAY: 107505582(SNU13) 107507484
MJV: 108399626(SNU13)
TOD: 119247209(SNU13)
SARA: 101550686(NHP2L1)
LAV: 100655775(SNU13)
TMU: 101361106
DNM: 101435381(SNU13)
MDO: 100021588 100028876(SNU13)
GAS: 123250299(SNU13)
SHR: 100924060(SNU13)
PCW: 110205847(SNU13)
OAA: 100076480(SNU13)
GGA: 417986(SNU13)
PCOC: 116233403(SNU13)
MGP: 100546935(SNU13)
CJO: 107313195(SNU13)
NMEL: 110392140(SNU13)
APLA: 106020692(SNU13)
ACYG: 106045249(SNU13)
AFUL: 116500595(SNU13)
TGU: 100221514(SNU13)
LSR: 110483117(SNU13)
SCAN: 103813303(SNU13)
PMOA: 120509959(SNU13)
OTC: 121342334(SNU13)
PRUF: 121361108(SNU13)
GFR: 102039006(SNU13)
FAB: 101806665(SNU13)
PHI: 102106194(SNU13)
PMAJ: 107204597(SNU13)
CCAE: 111934460(SNU13)
CCW: 104692300 104696539(SNU13)
ETL: 114058053(SNU13)
ZAB: 102069827(SNU13)
FPG: 101923234(SNU13)
FCH: 102046835(SNU13)
EGZ: 104134256(NHP2L1)
NNI: 104021703(NHP2L1)
ACUN: 113488070(SNU13)
TALA: 104358528(SNU13)
PADL: 103915793(NHP2L1)
ACHC: 115352632(SNU13)
AAM: 106488871(SNU13)
AROW: 112967710(SNU13)
NPD: 112946467(SNU13)
DNE: 112983962(SNU13)
ASN: 102368710(SNU13)
AMJ: 102558074(SNU13)
CPOO: 109316742(SNU13)
GGN: 109295938(SNU13)
PSS: 102445152(SNU13)
CMY: 102946830(SNU13)
CPIC: 101945752(SNU13)
TST: 117879829(SNU13)
CABI: 116828775(SNU13)
MRV: 120380376(SNU13)
ACS: 100552266(snu13)
PVT: 110076064(SNU13)
SUND: 121930851(SNU13)
PBI: 103054140(SNU13)
PMUR: 107285352(SNU13) 107301260
TSR: 106537810(SNU13)
PGUT: 117655337(SNU13)
VKO: 123036216(SNU13)
PMUA: 114606006(SNU13)
ZVI: 118091064(SNU13)
GJA: 107117165(SNU13)
STOW: 125434403(SNU13)
XLA: 380416(snu13.L) 495253(snu13.S)
XTR: 394590(snu13)
NPR: 108793020(SNU13)
RTEM: 120945475(SNU13)
BBUF: 120978719(SNU13)
BGAR: 122943532(SNU13)
DRE: 321114(snu13b) 393282(snu13a)
PPRM: 120463966(snu13b)
MAMB: 125254946(snu13b) 125267566(snu13a)
IPU: 100528760(snu13b) 108273948
SMEO: 124388981(snu13b) 124396885
TFD: 113638054 113662525(snu13b)
TRU: 101079948(snu13)
LCO: 104918064(snu13)
NCC: 104958529(nhp2l1)
CGOB: 115024648(snu13)
ELY: 117247413(snu13b)
PLEP: 121959239
SLUC: 116044247(snu13b)
ECRA: 117937043
PFLV: 114548194(snu13)
GAT: 120818923
PPUG: 119213328(snu13b)
MSAM: 119915662(snu13b)
CUD: 121528456(snu13b)
ALAT: 119009704(snu13b)
MZE: 101484437(snu13)
ONL: 100708852(snu13)
OAU: 116320140
OLA: 101175271(snu13)
OML: 112154545(snu13b)
XMA: 102217383(snu13)
XCO: 114151423(snu13)
XHE: 116727631(snu13)
PRET: 103481973(snu13)
PFOR: 103143035(snu13)
PLAI: 106961746(snu13)
PMEI: 106925832(snu13)
GAF: 122823723
CVG: 107099871(snu13)
CTUL: 119793256(snu13b)
GMU: 124875256
NFU: 107388175(snu13)
KMR: 108237140(snu13b)
ALIM: 106531816(snu13)
NWH: 119423389(snu13b)
AOCE: 111575377(snu13)
CSEM: 103382356(snu13)
POV: 109626638(snu13)
SSEN: 122759351(snu13b)
HHIP: 117753115
LCF: 108880776(snu13)
SDU: 111220234(snu13)
SLAL: 111672008(snu13)
XGL: 120794830
HCQ: 109516574(snu13)
BPEC: 110159671(snu13)
MALB: 109969181(snu13)
BSPL: 114845923
SASA: 106589607(NH2L1) 106601742(NH2L1) 106606728 106609990
SFM: 108939966(snu13)
AANG: 118221066(snu13b)
LOC: 102683569 102689282(snu13)
LCM: 102367071(SNU13)
CMK: 103178742
RTP: 109913147(snu13)
BFO: 118429722
BBEL: 109463307
CIN: 100182620
SCLV: 120325762
APLC: 110981887
SKO: 100371232
DME: Dmel_CG3949(hoip)
DER: 6540856
DSE: 6611840
DSI: Dsimw501_GD23622(Dsim_GD23622)
DAN: 6505442
DSR: 110177893
DPE: 6589887
DMN: 108163004
DWI: 6643749
DGR: 6570122
DAZ: 108611567
DNV: 108650002
DHE: 111594661
DVI: 6628804
CCAT: 101456846
BOD: 106618558
MDE: 101888628
SCAC: 106083865
LCQ: 111680289
ACOZ: 120958318
AARA: 120900547
AAG: 5577910
AALB: 109429944
CPII: 120423988
CNS: 116343727
AME: 102655272
ACER: 108000118
ALAB: 122713637
BIM: 105681017
BBIF: 117214386
BVK: 117231477
BVAN: 117166539
BTER: 105666221
BPYO: 122572942
CCAL: 108631296
OBB: 114881728
MGEN: 117220868
NMEA: 116432627
CGIG: 122397181
SOC: 105205201
MPHA: 105837492
AEC: 105152628
ACEP: 105621762
PBAR: 105426119
VEM: 105566113
CFO: 105249083
FEX: 115235905
LHU: 105671353
PGC: 109851868
PCF: 106793426
PFUC: 122516481
VPS: 122628760
NVI: 103317617
CSOL: 105366974
MDL: 103569123
CGLO: 123268801
FAS: 105270828
DAM: 107040968
CCIN: 107265634
TCA: 664143
DPA: 109544783
SOY: 115875211
ATD: 109604783
CSET: 123317148
AGB: 108912258
LDC: 111503192
NVL: 108566492
APLN: 108737177
PPYR: 116173661
OTU: 111419739
BMOR: 692972(RpL7Ae)
BMAN: 114251531
MSEX: 115447802
BANY: 112045674
PMAC: 106720749
PPOT: 106101689
PXU: 106121432
PRAP: 111003458
ZCE: 119840839
HAW: 110375590
TNL: 113497867
SLIU: 111358749
OFU: 114363654
PXY: 105383607
API: 100164236
RMD: 113547919
BTAB: 109041454
DCI: 103516126
CLEC: 106663036
HHAL: 106678469
NLU: 111048447
FOC: 113208114
ZNE: 110837339
CSEC: 111862784
FCD: 110842222
DMK: 116927347
PVM: 113828659
PJA: 122245549
PTRU: 123503586
HAZT: 108680336
EAF: 111700551
LSM: 121127322
DSV: 119453225
RSAN: 119399956
RMP: 119179901
VDE: 111243187
VJA: 111260640
DFR: 124494172
CSCU: 111625735
PTEP: 107445859
SDM: 118183615
CEL: CELE_M28.5(M28.5)
CBR: CBG_03041
BMY: BM_BM14055(Bm14055)
PCAN: 112575648
BGT: 106079625
GAE: 121378440
HRF: 124141173
HRJ: 124259834
CRG: 105348805
MYI: 110453768
PMAX: 117329327
MMER: 123564209
OBI: 106882140
OSN: 115211870
LAK: 106156251
NVE: 5508307
EPA: 110240820
ATEN: 116304264
AMIL: 114956675
PDAM: 113679330
SPIS: 111321604
DGT: 114541724
XEN: 124448769
HMG: 100207378
AQU: 100636318
CPAP: 110812736
TCC: 18588745
LJA: Lj0g3v0120989.1(Lj0g3v0120989.1) Lj1g3v0672680.1(Lj1g3v0672680.1)
AIP: 107620074
FVE: 101301807
RCN: 112188400
ZJU: 107404143
CSV: 101222939
RCU: 8275870
QLO: 115977057
SIND: 105170591
BVG: 104902053
NCOL: 116263326
DOSA: Os03t0241200-00(Os03g0241200) Os10t0124000-01(Os10g0124000)
OBR: 102722656
ATS: 109740262
SITA: 101781743
SVS: 117838153
PHAI: 112873489
DCT: 110093060
MNG: MNEG_1179
APRO: F751_2002
SCE: YEL026W(SNU13)
SEUB: DI49_1366
ERC: Ecym_1375
KMX: KLMA_10721(SNU13)
NCS: NCAS_0A08350(NCAS0A08350)
NDI: NDAI_0G04810(NDAI0G04810)
TPF: TPHA_0B04030(TPHA0B04030)
TBL: TBLA_0D01990(TBLA0D01990)
TDL: TDEL_0B05380(TDEL0B05380)
KAF: KAFR_0F01320(KAFR0F01320)
KNG: KNAG_0I00390(KNAG0I00390)
CAL: CAALFM_C304380CA(CaO19.5885)
SLB: AWJ20_3897(SNU13)
BNN: FOA43_003704(SNU13)
BBRX: BRETT_002953(SNU13)
NCR: NCU01331
NTE: NEUTE1DRAFT115856(NEUTE1DRAFT_115856)
MGR: MGG_02467
SSCK: SPSK_03688
MAW: MAC_03411
MAJ: MAA_02009
CMT: CCM_00301
MBE: MBM_04703
ANI: AN1319.2
ANG: ANI_1_1980024(An02g14340)
ALUC: AKAW2_11203S(SNU13)
ACHE: ACHE_80272S(SNU13)
APUU: APUU_50391S(SNU13)
ABE: ARB_02998
TVE: TRV_01714
PNO: SNOG_10693(SNOG_10692)
PTE: PTT_16812
SPO: SPAC607.03c(snu13)
CNE: CNG01500
CNB: CNBG3280
MRR: Moror_841
MORE: E1B28_009016(SNU13)
MGL: MGL_0793
MRT: MRET_0023
DDI: DDB_G0282243(nhp2l1)
DFA: DFA_07073(nhp2l1)
EHI: EHI_053440(59.t00026) EHI_104600(415.t00007)
PCB: PCHAS_092000(PC000674.04.0)
TAN: TA11075
BBO: BBOV_III009740(17.m07845)
CPV: cgd6_3850
SMIN: v1.2.021437.t1(symbB.v1.2.021437.t1)
TPS: THAPSDRAFT_28570(L7Ae)
NGD: NGA_0448500(SNU13)
SPAR: SPRG_04028
 » show all
Reference
  Authors
Dobbyn HC, McEwan PA, Krause A, Novak-Frazer L, Bella J, O'Keefe RT
  Title
Analysis of pre-mRNA and pre-rRNA processing factor Snu13p structure and mutants.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 360:857-62 (2007)
DOI:10.1016/j.bbrc.2007.06.163
  Sequence
[sce:YEL026W]
Reference
  Authors
Liu S, Li P, Dybkov O, Nottrott S, Hartmuth K, Luhrmann R, Carlomagno T, Wahl MC
  Title
Binding of the human Prp31 Nop domain to a composite RNA-protein platform in U4 snRNP.
  Journal
Science 316:115-20 (2007)
DOI:10.1126/science.1137924
  Sequence
[hsa:4809]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system