KEGG   ORTHOLOGY: K12622
Entry
K12622                      KO                                     
Symbol
LSM3
Name
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Pathway
map03018  RNA degradation
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
   03041 Spliceosome
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
 Complex C
  U2 snRNP components
   LSm proteins
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Other DBs
COG: COG1958
Genes
HSA: 27258(LSM3)
PTR: 742889(LSM3)
PPS: 100993995(LSM3) 106633930
GGO: 101148856(LSM3)
PON: 100443823(LSM3)
NLE: 100589617(LSM3)
HMH: 116458699 116466768(LSM3) 116809667
MCC: 701060(LSM3)
MCF: 102138486 102146040(LSM3)
MTHB: 126943984 126949176 126951640
MNI: 105477752(LSM3)
CSAB: 103228048(LSM3)
CATY: 105585820(LSM3)
PANU: 101009004(LSM3)
TGE: 112618360(LSM3)
MLEU: 105542191(LSM3)
RRO: 104679026(LSM3)
RBB: 108544869(LSM3)
PTEH: 111529308(LSM3)
CANG: 105517906(LSM3)
CJC: 100389959(LSM3)
SBQ: 101054153(LSM3)
CSYR: 103273174(LSM3)
MMUR: 105861337(LSM3)
LCAT: 123625626(LSM3)
PCOQ: 105814903 105824676(LSM3)
OGA: 100960929(LSM3)
MMU: 67678(Lsm3)
MCAL: 110295715(Lsm3)
MPAH: 110317246(Lsm3)
RNO: 297455(Lsm3)
MCOC: 116099273(Lsm3)
ANU: 117714654(Lsm3)
CGE: 100765189(Lsm3) 100773124
MAUA: 101843944 121136919(Lsm3)
PROB: 127236012(Lsm3)
PLEU: 114681354(Lsm3) 114709426
MORG: 121441089(Lsm3)
AAMP: 119806199(Lsm3)
NGI: 103751469(Lsm3)
HGL: 101708310(Lsm3)
CPOC: 100723331(Lsm3)
CCAN: 109694028(Lsm3)
DORD: 105981290(Lsm3)
DSP: 122108017(Lsm3)
MMMA: 107150147(Lsm3)
OPI: 101535190(LSM3)
TUP: 102473763(LSM3)
GVR: 103604629(LSM3)
VVP: 112914455(LSM3)
AML: 100473950(LSM3)
UMR: 103668189 103669509(LSM3)
UAH: 113257226(LSM3)
UAR: 123802063(LSM3)
ELK: 111144211
MPUF: 101676925(LSM3)
MNP: 132011591(LSM3)
ORO: 101380364(LSM3)
EJU: 114207602(LSM3) 114221760
FCA: 101084470 101101627(LSM3)
PYU: 121041210(LSM3)
PCOO: 112858379(LSM3)
PBG: 122487552(LSM3) 122491801
PVIV: 125158681(LSM3) 125175054
PTG: 102969019(LSM3) 102970689
PPAD: 109257477(LSM3)
BTA: 614759(LSM3)
BOM: 102276281(LSM3)
BIU: 109576432(LSM3)
BBUB: 102401499(LSM3)
BBIS: 105004757(LSM3)
CHX: 102190828(LSM3)
OAS: 101105285(LSM3) 114111228
BTAX: 128048895(LSM3)
ODA: 120868087(LSM3)
CCAD: 122425168(LSM3)
MBEZ: 129547700(LSM3)
SSC: 100514071(LSM3)
CFR: 102521069(LSM3)
CBAI: 105067498(LSM3)
CDK: 105093076(LSM3)
VPC: 102537986(LSM3)
BACU: 103013829(LSM3)
BMUS: 118903426(LSM3)
LVE: 103070003 103090883(LSM3)
OOR: 101278135(LSM3) 117200418
DLE: 111168813(LSM3)
PCAD: 102979020(LSM3)
NASI: 112412001(LSM3)
ECB: 100629288(LSM3)
EPZ: 103559395(LSM3)
EAI: 106829369(LSM3)
MYB: 102246960(LSM3)
MYD: 102758071(LSM3) 102774183
MMYO: 118659831 118668102(LSM3)
MLF: 102424665(LSM3)
MNA: 107534712(LSM3)
DRO: 112301116(LSM3)
SHON: 118990660(LSM3)
AJM: 119044840(LSM3)
PDIC: 114501711(LSM3) 114506740
PHAS: 123814489(LSM3) 123824041
MMF: 118633272(LSM3)
PPAM: 129088451(LSM3)
HAI: 109384563(LSM3)
RFQ: 117029288 117037008(LSM3)
PALE: 102895065(LSM3)
PGIG: 120582168(LSM3)
PVP: 105290349(LSM3)
RAY: 107509406(LSM3)
SARA: 101536953(LSM3)
LAV: 100676033(LSM3)
TMU: 101340864
DNM: 101440955(LSM3)
MDO: 100016218(LSM3)
GAS: 123230715(LSM3)
SHR: 100918710(LSM3) 100924692
AFZ: 127552480
PCW: 110204912(LSM3)
OAA: 100075732(LSM3)
GGA: 416040(LSM3)
PCOC: 116237912(LSM3)
MGP: 100546610(LSM3)
CJO: 107319911(LSM3)
TPAI: 128078578(LSM3)
LMUT: 125698805(LSM3)
NMEL: 110404805(LSM3)
APLA: 101796253(LSM3)
ACYG: 106045074(LSM3)
CATA: 118248038(LSM3)
AFUL: 116493210(LSM3)
TGU: 100190009(LSM3)
LSR: 110471382(LSM3)
SCAN: 103817170(LSM3)
PMOA: 120514133(LSM3)
OTC: 121347429(LSM3)
PRUF: 121352472(LSM3)
GFR: 102042014(LSM3)
FAB: 101807977(LSM3)
OMA: 130258352(LSM3)
PHI: 102107832(LSM3)
PMAJ: 107210338(LSM3)
CCAE: 111935055(LSM3)
CCW: 104683307(LSM3)
CBRC: 103614324(LSM3)
ETL: 114056963(LSM3)
ZAB: 102063304(LSM3)
ZLE: 135453212(LSM3)
ACHL: 103806215(LSM3)
SVG: 106850681(LSM3)
MMEA: 130589113(LSM3)
HRT: 120758087(LSM3)
FPG: 101913641(LSM3)
FCH: 102058638(LSM3)
CLV: 102094969(LSM3)
EGZ: 104126623(LSM3)
NNI: 104016966(LSM3)
PCRI: 104036533(LSM3)
PLET: 104626579(LSM3)
EHS: 104508839(LSM3)
PCAO: 104052388(LSM3)
ACUN: 113485024(LSM3)
TALA: 104368848(LSM3)
PADL: 103921900(LSM3)
AFOR: 103903353(LSM3)
ACHC: 115353689(LSM3)
HALD: 104315958(LSM3)
HLE: 104834372(LSM3)
AGEN: 126049695
GCL: 127021614
CCRI: 104161065(LSM3)
CSTI: 104551497(LSM3)
CMAC: 104483972(LSM3)
MUI: 104547975(LSM3)
BREG: 104637068(LSM3)
FGA: 104083867(LSM3)
GSTE: 104264273(LSM3)
LDI: 104350923(LSM3)
MNB: 103770255(LSM3)
OHA: 104329968(LSM3)
NNT: 104412436(LSM3)
SHAB: 115614171(LSM3)
DPUB: 104308106(LSM3)
PGUU: 104462974(LSM3)
ACAR: 104527302(LSM3)
CPEA: 104390206(LSM3)
AVIT: 104274145(LSM3)
CVF: 104290744(LSM3)
RTD: 128915505(LSM3)
CUCA: 104068021(LSM3)
TEO: 104381289(LSM3)
BRHI: 104489314(LSM3)
AAM: 106498978(LSM3)
AROW: 112976600(LSM3)
NPD: 112958794(LSM3)
TGT: 104577990(LSM3)
DNE: 112979153(LSM3)
SCAM: 104140529(LSM3)
ASN: 102386899(LSM3)
AMJ: 102574303(LSM3)
CPOO: 109311251(LSM3)
GGN: 109289042(LSM3)
PSS: 102462854(LSM3)
CMY: 102938974(LSM3)
CCAY: 125640691(LSM3)
DCC: 119858505(LSM3)
CPIC: 101948934(LSM3)
TST: 117880694(LSM3)
CABI: 116827090(LSM3)
MRV: 120409017(LSM3)
ACS: 100553365(lsm3)
ASAO: 132769342(LSM3)
PVT: 110088150(LSM3)
SUND: 121921328(LSM3) 121926790
PBI: 103056626(LSM3)
CTIG: 120302818(LSM3)
TSR: 106549425(LSM3)
PGUT: 117673880(LSM3)
APRI: 131192949(LSM3)
PTEX: 113451679(LSM3)
NSS: 113419105(LSM3)
VKO: 123026618 123034319(LSM3)
PMUA: 114591765(LSM3)
PRAF: 128406090 128408392(LSM3)
ZVI: 118080766(LSM3)
HCG: 128344928(LSM3)
GJA: 107125915(LSM3)
STOW: 125430150(LSM3)
EMC: 129328775(LSM3)
XLA: 100049097(lsm3.S) 108714652(lsm3.L)
XTR: 100125161(lsm3)
NPR: 108795916(LSM3)
RTEM: 120945041(LSM3)
BBUF: 120979454(LSM3)
BGAR: 122943805(LSM3)
MUO: 115471820(LSM3)
GSH: 117351121(LSM3)
DRE: 100535720(lsm3)
SRX: 107710252 107720345(lsm3)
PTET: 122328064(lsm3)
LROH: 127153833(lsm3)
OMC: 131530759(lsm3)
PPRM: 120479947(lsm3)
RKG: 130094684(lsm3)
MAMB: 125253300(lsm3)
CIDE: 127521714
TROS: 130548796(lsm3)
TDW: 130430123(lsm3)
MANU: 129453575(lsm3)
IPU: 108255226
IFU: 128625218(lsm3)
PHYP: 113537808(lsm3)
SMEO: 124402000(lsm3)
TFD: 113639102(lsm3)
TVC: 132838003(lsm3)
TRN: 134301907(lsm3)
AMEX: 103043938(lsm3)
CMAO: 118799931(lsm3)
EEE: 113583715(lsm3)
CHAR: 105897871(lsm3)
TRU: 101063179(lsm3)
TFS: 130524868(lsm3)
LCO: 104936091(lsm3)
NCC: 104944783(lsm3)
TBEN: 117497883
CGOB: 115008335(lsm3)
PGEO: 117446505
GACU: 117554545
EMAC: 134883169(lsm3)
ELY: 117256399
EFO: 125903260(lsm3)
PLEP: 121948767(lsm3)
SLUC: 116047765
ECRA: 117943930
ESP: 116688246(lsm3)
PFLV: 114554404(lsm3)
GAT: 120835418(lsm3)
PPUG: 119230083(lsm3)
AFB: 129105989(lsm3)
CLUM: 117730447
PSWI: 130207748(lsm3)
MSAM: 119886437(lsm3)
SCHU: 122887885(lsm3)
CUD: 121507044(lsm3)
ALAT: 119021813(lsm3)
MZE: 101485712(lsm3)
OAU: 116313200(lsm3)
OLA: 101175071(lsm3)
OML: 112144528(lsm3)
CSAI: 133449238(lsm3)
XMA: 102216790(lsm3)
XCO: 114136093(lsm3)
XHE: 116710964(lsm3)
PRET: 103464300(lsm3)
PFOR: 103143240(lsm3)
PLAI: 106947334(lsm3)
PMEI: 106917934(lsm3)
GAF: 122834027(lsm3)
CVG: 107100835(lsm3)
CTUL: 119793543(lsm3)
GMU: 124856211(lsm3)
NFU: 107384980(lsm3)
KMR: 108243637(lsm3)
ALIM: 106528723(lsm3)
NWH: 119412713(lsm3)
AOCE: 111579967(lsm3)
MCEP: 125007467(lsm3)
CSEM: 103386519(lsm3)
POV: 109642615(lsm3)
SSEN: 122767705(lsm3)
HHIP: 117761117
HSP: 118105278(lsm3)
PPLT: 128460061(lsm3)
SMAU: 118309692(lsm3)
LCF: 108884373
SDU: 111231566(lsm3)
SLAL: 111645413(lsm3)
XGL: 120783449(lsm3)
HCQ: 109510258(lsm3)
SSCV: 125976955
SBIA: 133507979(lsm3)
PEE: 133409285(lsm3)
PTAO: 133483301(lsm3)
BPEC: 110162526(lsm3)
MALB: 109972402(lsm3)
BSPL: 114856227(lsm3)
SJO: 128356234(lsm3)
SASA: 100286430(lsm3)
STRU: 115150035(lsm3)
OTW: 112246288(lsm3)
OMY: 110528593(lsm3)
OGO: 124025692(lsm3)
ONE: 115144301(lsm3)
OKI: 109879094(lsm3)
OKE: 118400635(lsm3)
SALP: 111970535(lsm3)
SNH: 120065491(lsm3)
ELS: 105006270(lsm3)
SFM: 108931268(lsm3)
PKI: 111837172(lsm3)
AANG: 118210710
LOC: 102686541(lsm3)
PSEX: 120541130(lsm3)
LCM: 106703644(LSM3)
CMK: 103176687(lsm3)
CPLA: 122558786(lsm3)
HOC: 132822049(lsm3)
LERI: 129704656(lsm3)
PMRN: 116951278(LSM3)
LRJ: 133356549(LSM3)
BFO: 118416443
BBEL: 109477262
CIN: 100186320
SCLV: 120330132
SPU: 581166
LPIC: 129257577
APLC: 110988583
AJC: 117119568
SKO: 100370083
DME: Dmel_CG31184(LSm3)
DER: 6555006
DSE: 116801434
DSI: Dsimw501_GD21053(Dsim_GD21053)
DAN: 26514390
DSR: 110191310
DPE: 6587191
DWI: 26529536
DGR: 116805420
DAZ: 108609306
DNV: 108659901
DHE: 111602740
DVI: 26530673
CCAT: 101461968
BOD: 106617704
BDR: 105232496
RZE: 108376858
AOQ: 129251188
MDE: 101897462
SCAC: 106084921
LCQ: 111681549
LSQ: 119605721
GFS: 119635138
ECOE: 129941714
CLON: 129613985
HIS: 119657941
AGA: 11175944
ACOZ: 120953631
AARA: 120894278
AMER: 121603622
ASTE: 118505659
AFUN: 125765194
AMOU: 128299873
AALI: 118458632
AAG: 5572242
AALB: 109418266
ASUA: 134219383
CPII: 120427019
CNS: 116352497
BCOO: 119078791
AME: 725401
ACER: 108001874
ALAB: 122720554
ADR: 102680116
AFLR: 100863513
BIM: 100742499
BBIF: 117210644
BVK: 117237493
BVAN: 117164066
BTER: 100644665
BAFF: 126916167
BPYO: 122565843
BPAS: 132905526
FVI: 122534936
CCAL: 108629116
OBB: 114874965
OLG: 117608045
MGEN: 117227674
NMEA: 116435265
CGIG: 122398276
SOC: 105198728
MPHA: 105836350
AEC: 105149693
ACEP: 105618989
PBAR: 105433079
VEM: 105570626
HST: 105183337
DQU: 106748653
CFO: 105252535
FEX: 115233569
LHU: 105673106
PGC: 109856296
OBO: 105276098
PCF: 106792711
PFUC: 122513246
VPS: 122636887
VCRB: 124431255
VVE: 124957090
NVI: 100120443
CSOL: 105368560
TPRE: 106650058
LHT: 122499391
LBD: 127283629
MDL: 103571050
CGLO: 123272828
FAS: 105266108
DAM: 107048236
AGIF: 122854240
CINS: 118070901
VCAN: 122411618
CCIN: 107268443
DSM: 124411730
NPT: 124210760
NFB: 124174427
NLO: 107223841
NVG: 124296742
AROA: 105689092
TCA: 662059
DPA: 109544686
SOY: 115888708
AGRG: 126737494
ATD: 109598053
CSET: 123318063
AGB: 108913704
DVV: 114329048
NVL: 108566870
PPYR: 116178681
BMOR: 732955
BMAN: 114244146
MSEX: 115440202
BANY: 112045252
MJU: 123873952
NIQ: 126771988
VCD: 124536771
MCIX: 123660435
PMAC: 106721042
PPOT: 106110906
PXU: 106126690
PRAP: 110997245
PBX: 123711501
PNAP: 125063478
ZCE: 119839946
CCRC: 123698133
LSIN: 126977544
AAGE: 121735407
HAW: 110378099
HZE: 124638837
TNL: 113507679
SLIU: 111353811
OFU: 114356549
ATRA: 106134353
PGW: 126373621
LGLY: 125230956
CFEL: 113377987
CCRN: 123301638
API: 100167860
DNX: 107161401
AGS: 114124552
RMD: 113558227
ACOO: 126833340
DVT: 126903483
BTAB: 109031513
DCI: 103506458
CLEC: 106670408
HHAL: 106684769
HVI: 124368238
FOC: 113207501
TPAL: 117651010
ZNE: 110831066
CSEC: 111867679
SGRE: 126334948
BROR: 134542914
FCD: 110853948
PVM: 113804597
PMOO: 119578155
HAME: 121856167
PCLA: 123773143
CQD: 128692915
MNZ: 135215676
HAZT: 108680121
EAF: 111705457
TCF: 131886728
ISC: 120841470
DSV: 119466392
VDE: 111255556
VJA: 111265526
TUT: 107365189
DPTE: 113798537
DFR: 124490085
CSCU: 111621321
PTEP: 107452221
ABRU: 129957365
UDV: 129225107
SDM: 118187285
LPOL: 106457764
PMEO: 129581715
CEL: CELE_Y62E10A.12(lsm-3)
CBR: CBG_01776(Cbr-lsm-3)
BMY: BM_BM6953(Bma-lsm-3)
TSP: Tsp_00417
PVUL: 126828340
PCAN: 112571948
BGT: 106054071
GAE: 121369025
HRF: 124146140
HRJ: 124276517
CRG: 105323611
OED: 125656128
MYI: 110445371
PMAX: 117330728
MCAF: 127703034
MMER: 123528919
RPHI: 132730842
OBI: 106870208
OSN: 115221743
LJP: 135471590
LAK: 106155143
SHX: MS3_00006528(LSM3)
EGL: EGR_02158
LLON: 135491229
NVE: 5519089
EPA: 110236762
ATEN: 116289412
AMIL: 114965908
PDAM: 113671937
SPIS: 111324200
DGT: 114533509
XEN: 124435047
HMG: 105844489
HSY: 130646968
AQU: 100635851
ATH: AT1G21190(LSM3A) AT1G76860(LSM3B)
CPAP: 110808045
CIT: 102612141
PVY: 116143379
TCC: 18592602
EGR: 104449601
VRA: 106766048
VAR: 108344860
VUN: 114181805
VUM: 124842838
CCAJ: 109817296
APRC: 113868165
MTR: 11446185
CAM: 101510224
PSAT: 127104249
LJA: Lj0g3v0068179.1(Lj0g3v0068179.1) Lj1g3v3609490.1(Lj1g3v3609490.1)
ADU: 107491632
AIP: 107644933
PCIN: 129292927
FVE: 101296823
RCN: 112169342
MNT: 21399811
CSAV: 115709368
CMO: 103485621
BHJ: 120076562
MCHA: 111006032
RCU: 8262315
JCU: 105629113
HBR: 110648971
CILL: 122299291
CAVE: 132184604
VVI: 100253870
VRI: 117906796
SLY: 101264277
SPEN: 107004446
SOT: 102597966
SSTN: 125849819
CANN: 107851126
LBB: 132615134
NTO: 104118388
INI: 109193453
ITR: 115998130
ECAD: 122593598
LSV: 111897034
DCR: 108216357
CSIN: 114258679
BVG: 104895756
SOE: 110797006
ATRI: 130810139
MOF: 131153122
MING: 122092943
TSS: 122668034
OSA: 4325074
DOSA: Os01t0866700-01(Os01g0866700)
OBR: 102706052
OGL: 127774655
BDI: 100822834
SBI: 8060974
ZMA: 100194361
DCT: 110102905
PEQ: 110026532
MSIN: 131237391
NCOL: 116263571
ATR: 18444320
PPP: 112276367
APRO: F751_3145
MPP: MICPUCDRAFT_36568(JGI:MicpuC2_36568)
SCE: YLR438C-A(LSM3)
SEUB: DI49_3934
ERC: Ecym_1162
KMX: KLMA_50176(LSM3)
NCS: NCAS_0J01950(NCAS0J01950)
NDI: NDAI_0J02710(NDAI0J02710)
TPF: TPHA_0B00530(TPHA0B00530)
TBL: TBLA_0E04630(TBLA0E04630)
TDL: TDEL_0D00990(TDEL0D00990)
KAF: KAFR_0E04140(KAFR0E04140)
KNG: KNAG_0B06380(KNAG0B06380)
CAL: CAALFM_CR07330WA(SMX4)
NCR: NCU09512
NTE: NEUTE1DRAFT121723(NEUTE1DRAFT_121723)
PBEL: QC761_701530(LSM3)
PPSD: QC762_701530(LSM3)
PPSP: QC763_701530(LSM3)
PPSA: QC764_701530(LSM3)
MGR: MGG_16841
PGRI: PgNI_01285
SSCK: SPSK_06680
FPOA: FPOAC1_002874(LSM3)
FMU: J7337_005432(LSM3)
MAW: MAC_01618
MAJ: MAA_02450
CMT: CCM_07996
PTKZ: JDV02_003567(LSM3)
BFU: BCIN_08g06440(Bclsm3)
MBE: MBM_01032
ALUC: AKAW2_41273A(LSM3)
ACHE: ACHE_41285S(LSM3)
APUU: APUU_12105A(LSM3)
ABE: ARB_03397
TVE: TRV_08082
PTE: PTT_08854
SPO: SPBC9B6.05c(lsm3)
SOM: SOMG_03150(lsm3)
CNE: CNA07590
CNB: CNBA7410
CDEU: CNBG_1149
CCAC: CcaHIS019_0101440(CcaverHIS019_0101440)
ABP: AGABI1DRAFT72874(AGABI1DRAFT_72874)
ABV: AGABI2DRAFT203319(AGABI2DRAFT_203319)
SCM: SCHCO_02263073(SCHCODRAFT_02263073)
MGL: MGL_2961
MRT: MRET_3564
DDI: DDB_G0277107(lsm3)
DFA: DFA_01036(lsm3)
EHI: EHI_151310(2.t00032)
PMAL: PMUG01_05026200(LSM3)
PREL: PRELSG_0504100(LSM3)
TAN: TA15990
TPV: TP02_0106
CPV: cgd7_690
SPAR: SPRG_10785
 » show all
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YLR438C-A]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system