KEGG   PATHWAY: obi03040
Entry
obi03040                    Pathway                                
Name
Spliceosome - Octopus bimaculoides (California two-spot octopus)
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
obi03040  Spliceosome
obi03040

Other DBs
GO: 0005681
Organism
Octopus bimaculoides (California two-spot octopus) [GN:obi]
Gene
106867236  [KO:K11088]
106867281  [KO:K12882]
106867349  [KO:K12826]
106867362  [KO:K12881]
106867573  [KO:K12865]
106867643  [KO:K12850]
106867716  [KO:K12830]
106867796  [KO:K12852]
106868620  [KO:K12819]
106868731  [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
106868824  [KO:K12827]
106868844  [KO:K12896]
106868965  [KO:K12862]
106869362  [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
106869620  [KO:K12829]
106870024  [KO:K12816]
106870208  [KO:K12622]
106870639  [KO:K12867]
106870699  [KO:K12872]
106870841  [KO:K12627]
106870847  [KO:K12822]
106871005  [KO:K12883]
106871043  [KO:K12870]
106871239  [KO:K12886]
106871245  [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
106871304  [KO:K12836]
106871454  [KO:K12843]
106871470  [KO:K12871]
106871512  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
106871612  [KO:K12891]
106871729  [KO:K12624]
106871744  [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
106871774  [KO:K12741]
106871927  [KO:K12859]
106872282  [KO:K12897]
106872744  [KO:K12844]
106872767  [KO:K12662]
106872884  [KO:K13098]
106872978  [KO:K12869]
106873054  [KO:K12896]
106873080  [KO:K12842]
106873134  [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
106873214  [KO:K12860]
106873382  [KO:K12893]
106873513  [KO:K12834]
106873544  [KO:K12741]
106873934  [KO:K11093]
106874279  [KO:K12741]
106874661  [KO:K12825]
106875044  [KO:K12840]
106875096  [KO:K12828]
106875354  [KO:K12873]
106875419  [KO:K12885]
106875499  [KO:K12839]
106876131  [KO:K11099]
106876133  [KO:K12824]
106876251  [KO:K12623]
106876317  [KO:K12855]
106876386  [KO:K12900]
106876598  [KO:K12876]
106876661  [KO:K12833]
106876771  [KO:K12890]
106876850  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
106876964  [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
106877118  [KO:K12846]
106877223  [KO:K11095]
106877386  [KO:K12863]
106877797  [KO:K11097]
106877945  [KO:K12875]
106878018  [KO:K12741]
106878040  [KO:K12874]
106878146  [KO:K12878]
106878204  [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
106878321  [KO:K12896]
106878391  [KO:K03283]
106878466  [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
106878535  [KO:K11091]
106878732  [KO:K12861]
106878808  [KO:K12822]
106878851  [KO:K12879]
106879226  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
106879519  [KO:K06063]
106879627  [KO:K03283]
106879653  [KO:K12877]
106879912  [KO:K12625]
106879966  [KO:K12837]
106880024  [KO:K12857]
106880108  [KO:K12864]
106880297  [KO:K11984]
106880505  [KO:K12848]
106880622  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
106880741  [KO:K12866]
106880809  [KO:K12847]
106880849  [KO:K12886]
106881112  [KO:K11096]
106881150  [KO:K12821]
106881232  [KO:K03283]
106881452  [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
106881753  [KO:K12741]
106881825  [KO:K12626]
106882140  [KO:K12845]
106882518  [KO:K12838]
106882627  [KO:K12817]
106882765  [KO:K12621]
106882823  [KO:K12741]
106882865  [KO:K12896]
106882936  [KO:K12880]
106883575  [KO:K12856]
106883615  [KO:K11098]
106883966  [KO:K12831]
106884302  [KO:K09564] [EC:5.2.1.8]
106884303  [KO:K11086]
106884364  [KO:K12868]
106884478  [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
128247136  [KO:K14277]
128247140  [KO:K14278]
128247144  [KO:K14278]
128247145  [KO:K14280]
128247146  [KO:K14280]
128247147  [KO:K14280]
128247149  [KO:K14280]
128247150  [KO:K14280]
128247151  [KO:K14280]
128247152  [KO:K14280]
128247153  [KO:K14280]
128247154  [KO:K14280]
128247156  [KO:K14280]
128247157  [KO:K14280]
128247158  [KO:K14280]
128247161  [KO:K14280]
128247162  [KO:K14280]
128247163  [KO:K14280]
128247164  [KO:K14280]
128247165  [KO:K14280]
128247166  [KO:K14280]
128247169  [KO:K14280]
128247171  [KO:K14280]
128247175  [KO:K14280]
128247179  [KO:K14280]
128247180  [KO:K14280]
128247182  [KO:K14280]
128247184  [KO:K14280]
128247185  [KO:K14280]
128247186  [KO:K14280]
128247187  [KO:K14280]
128247188  [KO:K14280]
128247431  [KO:K14277]
128247432  [KO:K14277]
128247433  [KO:K14277]
128247434  [KO:K14277]
128247435  [KO:K14277]
128247439  [KO:K14278]
128247441  [KO:K14278]
128247444  [KO:K14280]
128247445  [KO:K14280]
128247446  [KO:K14280]
128247448  [KO:K14280]
128247449  [KO:K14280]
128247451  [KO:K14280]
128247455  [KO:K14280]
128247456  [KO:K14280]
128247457  [KO:K14280]
128247459  [KO:K14280]
128247462  [KO:K14280]
128247466  [KO:K14280]
128247467  [KO:K14280]
128247699  [KO:K14278]
128247701  [KO:K14278]
128247704  [KO:K14280]
128247705  [KO:K14280]
128247706  [KO:K14280]
128247707  [KO:K14280]
128247708  [KO:K14280]
128247710  [KO:K14280]
128247713  [KO:K14280]
128247715  [KO:K14280]
128247716  [KO:K14280]
128247717  [KO:K14280]
128247718  [KO:K14280]
128247719  [KO:K14280]
128247720  [KO:K14280]
128247721  [KO:K14280]
128247724  [KO:K14280]
128247726  [KO:K14280]
128247727  [KO:K14280]
128247728  [KO:K14280]
128247754  [KO:K14277]
128247930  [KO:K14277]
128247931  [KO:K14277]
128247936  [KO:K14280]
128247937  [KO:K14280]
128247939  [KO:K14280]
128247940  [KO:K14280]
128247941  [KO:K14280]
128247942  [KO:K14280]
128247943  [KO:K14280]
128247944  [KO:K14280]
128247945  [KO:K14280]
128247946  [KO:K14280]
128247947  [KO:K14280]
128248185  [KO:K14280]
128248186  [KO:K14280]
128248187  [KO:K14280]
128248189  [KO:K14280]
128248206  [KO:K14276]
128248207  [KO:K14277]
128248210  [KO:K14277]
128248212  [KO:K14278]
128248214  [KO:K14278]
128248215  [KO:K14280]
128248216  [KO:K14280]
128248217  [KO:K14280]
128248218  [KO:K14280]
128248220  [KO:K14280]
128248222  [KO:K14280]
128248224  [KO:K14280]
128248225  [KO:K14280]
128248226  [KO:K14280]
128248227  [KO:K14280]
128248228  [KO:K14280]
128248229  [KO:K14280]
128248231  [KO:K14280]
128248234  [KO:K14280]
128248235  [KO:K14280]
128248401  [KO:K14277]
128248402  [KO:K14277]
128248404  [KO:K14277]
128248409  [KO:K14277]
128248412  [KO:K14278]
128248413  [KO:K14278]
128248415  [KO:K14279]
128248416  [KO:K14280]
128248418  [KO:K14280]
128248419  [KO:K14280]
128248420  [KO:K14280]
128248421  [KO:K14280]
128248422  [KO:K14280]
128248423  [KO:K14280]
128248424  [KO:K14280]
128248425  [KO:K14280]
128248443  [KO:K14277]
128248444  [KO:K14277]
128248445  [KO:K14277]
128248616  [KO:K14277]
128248620  [KO:K14280]
128248625  [KO:K14280]
128248626  [KO:K14280]
128248629  [KO:K14280]
128248630  [KO:K14280]
128248631  [KO:K14280]
128248634  [KO:K14280]
128248636  [KO:K14280]
128248782  [KO:K14277]
128248783  [KO:K14277]
128248784  [KO:K14277]
128248785  [KO:K14277]
128248786  [KO:K14277]
128248790  [KO:K14280]
128248792  [KO:K14280]
128248793  [KO:K14280]
128248795  [KO:K14280]
128248796  [KO:K14280]
128248797  [KO:K14280]
128248799  [KO:K14280]
128248801  [KO:K14280]
128248803  [KO:K14280]
128248807  [KO:K14280]
128248954  [KO:K14276]
128248955  [KO:K14276]
128248957  [KO:K14277]
128248961  [KO:K14278]
128248962  [KO:K14280]
128248963  [KO:K14280]
128248965  [KO:K14280]
128248966  [KO:K14280]
128248967  [KO:K14280]
128248968  [KO:K14280]
128248969  [KO:K14280]
128248970  [KO:K14280]
128248971  [KO:K14280]
128248973  [KO:K14280]
128248974  [KO:K14280]
128248977  [KO:K14280]
128248978  [KO:K14280]
128248979  [KO:K14280]
128248980  [KO:K14280]
128249130  [KO:K14277]
128249131  [KO:K14278]
128249132  [KO:K14280]
128249133  [KO:K14280]
128249134  [KO:K14280]
128249135  [KO:K14280]
128249136  [KO:K14280]
128249137  [KO:K14280]
128249141  [KO:K14280]
128249142  [KO:K14280]
128249145  [KO:K14280]
128249220  [KO:K14280]
128249221  [KO:K14280]
128249225  [KO:K14280]
128249226  [KO:K14280]
128249227  [KO:K14280]
128249228  [KO:K14280]
128249229  [KO:K14280]
128249327  [KO:K14280]
128249328  [KO:K14280]
128249331  [KO:K14280]
128249332  [KO:K14280]
128249333  [KO:K14280]
128249334  [KO:K14280]
128249335  [KO:K14280]
128249337  [KO:K14280]
128249340  [KO:K14280]
128249453  [KO:K14278]
128249454  [KO:K14280]
128249455  [KO:K14280]
128249456  [KO:K14280]
128249457  [KO:K14280]
128249458  [KO:K14280]
128249459  [KO:K14280]
128249460  [KO:K14280]
128249464  [KO:K14280]
128249557  [KO:K14277]
128249558  [KO:K14277]
128249559  [KO:K14280]
128249560  [KO:K14280]
128249562  [KO:K14280]
128249563  [KO:K14280]
128249564  [KO:K14280]
128249565  [KO:K14280]
128249566  [KO:K14280]
128249649  [KO:K14280]
128249650  [KO:K14280]
128249651  [KO:K14280]
128249652  [KO:K14280]
128249724  [KO:K14280]
128249725  [KO:K14280]
128249726  [KO:K14280]
128249728  [KO:K14280]
128249729  [KO:K14280]
128249969  [KO:K14276]
128249971  [KO:K14276]
128249972  [KO:K14276]
128249973  [KO:K14276]
128249974  [KO:K14276]
128249975  [KO:K14276]
128249976  [KO:K14276]
128249977  [KO:K14276]
128249978  [KO:K14276]
128249979  [KO:K14276]
128249980  [KO:K14276]
128249982  [KO:K14276]
128249984  [KO:K14276]
128249985  [KO:K14276]
128249986  [KO:K14276]
128249987  [KO:K14277]
128249988  [KO:K14278]
128249989  [KO:K14280]
128249990  [KO:K14280]
128249991  [KO:K14280]
128249992  [KO:K14280]
128249994  [KO:K14280]
128249997  [KO:K14280]
128250046  [KO:K14277]
128250048  [KO:K14277]
128250054  [KO:K14277]
128250064  [KO:K14278]
128250066  [KO:K14278]
128250068  [KO:K14278]
128250069  [KO:K14280]
128250070  [KO:K14280]
128250071  [KO:K14280]
128250073  [KO:K14280]
128250079  [KO:K14280]
128250080  [KO:K14280]
128250081  [KO:K14280]
128250086  [KO:K14280]
128250087  [KO:K14280]
128250089  [KO:K14280]
128250090  [KO:K14280]
128250091  [KO:K14280]
128250092  [KO:K14280]
128250094  [KO:K14280]
128250096  [KO:K14280]
128250098  [KO:K14280]
128250099  [KO:K14280]
128250101  [KO:K14280]
128250102  [KO:K14280]
128250105  [KO:K14280]
128250107  [KO:K14280]
128250111  [KO:K14280]
128250114  [KO:K14280]
128250121  [KO:K14280]
128250124  [KO:K14280]
128250127  [KO:K14280]
128250131  [KO:K14280]
128250136  [KO:K14280]
128250140  [KO:K14280]
128250142  [KO:K14280]
128250145  [KO:K14280]
128250147  [KO:K14280]
128250150  [KO:K14280]
128250171  [KO:K14276]
128250173  [KO:K14277]
128250174  [KO:K14277]
128250177  [KO:K14280]
128250179  [KO:K14280]
128250181  [KO:K14280]
128250182  [KO:K14280]
128250184  [KO:K14280]
128250185  [KO:K14280]
128250189  [KO:K14280]
128250379  [KO:K14280]
128250380  [KO:K14280]
128250381  [KO:K14280]
128250382  [KO:K14280]
128250383  [KO:K14280]
128250488  [KO:K14278]
128250489  [KO:K14280]
128250491  [KO:K14280]
128250493  [KO:K14280]
128250495  [KO:K14280]
128250496  [KO:K14280]
128250567  [KO:K14276]
128250569  [KO:K14280]
128250570  [KO:K14280]
128250571  [KO:K14280]
128250638  [KO:K12841]
128250646  [KO:K14280]
128250647  [KO:K14280]
128250734  [KO:K14280]
128250832  [KO:K14277]
128250833  [KO:K14277]
128250839  [KO:K14279]
128250840  [KO:K14279]
128250841  [KO:K14279]
128250843  [KO:K14279]
128250844  [KO:K14279]
128250845  [KO:K14279]
128250846  [KO:K14279]
128250847  [KO:K14280]
128250848  [KO:K14280]
128250849  [KO:K14280]
128250850  [KO:K14280]
128250851  [KO:K14280]
128250854  [KO:K14280]
128250937  [KO:K14280]
128250939  [KO:K14280]
128251015  [KO:K14280]
128251017  [KO:K14280]
128251018  [KO:K14280]
128251019  [KO:K14280]
128251197  [KO:K14277]
128251198  [KO:K14277]
128251199  [KO:K14277]
128251201  [KO:K14280]
128251202  [KO:K14280]
128251204  [KO:K14280]
128251310  [KO:K14280]
128251321  [KO:K14277]
128251322  [KO:K14280]
128251330  [KO:K14280]
128251367  [KO:K14277]
128251370  [KO:K14276]
128251376  [KO:K14280]
128251398  [KO:K14280]
128251404  [KO:K14280]
128251418  [KO:K14277]
128251439  [KO:K14280]
128251442  [KO:K14280]
128251473  [KO:K14280]
128251482  [KO:K14280]
128251484  [KO:K14279]
128251485  [KO:K14279]
128251486  [KO:K14279]
128251505  [KO:K14280]
128251514  [KO:K14276]
128251532  [KO:K14279]
128251540  [KO:K14280]
128251558  [KO:K14280]
Reference
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system