KEGG   PATHWAY: ssen03040
Entry
ssen03040                   Pathway                                
Name
Spliceosome - Solea senegalensis (Senegalese sole)
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
ssen03040  Spliceosome
ssen03040

Other DBs
GO: 0005681
Organism
Solea senegalensis (Senegalese sole) [GN:ssen]
Gene
122757982  hnrpkl; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, like isoform X1 [KO:K12886]
122758089  srsf9; serine/arginine-rich splicing factor 9 [KO:K21123]
122758133  [KO:K11088]
122758260  prpf4; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 [KO:K12662]
122758265  [KO:K12836]
122758803  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
122758804  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
122759116  sf3b1; splicing factor 3B subunit 1 isoform X1 [KO:K12828]
122759351  snu13b; SNU13 homolog, small nuclear ribonucleoprotein b (U4/U6.U5) [KO:K12845]
122759615  srsf2a; serine and arginine rich splicing factor 2a isoform X1 [KO:K12891]
122759746  [KO:K14276]
122759747  [KO:K14279]
122759974  snrpg; small nuclear ribonucleoprotein G [KO:K11099]
122760164  tra2a; transformer-2 protein homolog alpha isoform X1 [KO:K12897]
122760213  ddx5; probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 isoform X1 [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
122760217  [KO:K14276]
122760218  [KO:K14276]
122760219  [KO:K14277]
122760220  [KO:K14277]
122760221  [KO:K14276]
122760222  [KO:K14276]
122760223  [KO:K14276]
122760225  [KO:K14276]
122760389  [KO:K14278]
122760391  [KO:K14278]
122760392  [KO:K14278]
122760393  [KO:K14278]
122760394  [KO:K14278]
122760395  [KO:K14278]
122760396  [KO:K14278]
122760397  [KO:K14278]
122760398  [KO:K14278]
122760399  [KO:K14278]
122760400  [KO:K14278]
122760401  [KO:K14278]
122760402  [KO:K14278]
122760405  [KO:K14278]
122760406  [KO:K14278]
122760407  [KO:K14278]
122760409  [KO:K14278]
122760410  [KO:K14278]
122760411  [KO:K14278]
122760422  [KO:K14276]
122760423  [KO:K14276]
122760444  [KO:K14278]
122760445  [KO:K14278]
122760446  [KO:K14278]
122760447  [KO:K14278]
122760448  [KO:K14278]
122760449  [KO:K14278]
122760450  [KO:K14278]
122760451  [KO:K14278]
122760452  [KO:K14278]
122760471  [KO:K14276]
122760472  [KO:K14276]
122760473  [KO:K14276]
122760474  [KO:K14276]
122760476  [KO:K14276]
122760484  [KO:K14277]
122760485  [KO:K14277]
122760489  [KO:K14279]
122760497  [KO:K14279]
122760715  xab2; pre-mRNA-splicing factor SYF1 [KO:K12867]
122760733  [KO:K14278]
122760932  [KO:K14280]
122760933  [KO:K14280]
122760934  [KO:K14280]
122760935  [KO:K14280]
122760937  [KO:K14280]
122760938  [KO:K14280]
122760939  [KO:K14280]
122760940  [KO:K14280]
122761037  lsm8; LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated [KO:K12627]
122761249  ppie; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E [KO:K09564] [EC:5.2.1.8]
122761454  phf5a; PHD finger-like domain-containing protein 5A [KO:K12834]
122761606  [KO:K14276]
122761607  [KO:K14276]
122761608  [KO:K14276]
122761609  [KO:K14276]
122761611  [KO:K14276]
122761612  [KO:K14276]
122761618  [KO:K14277]
122761636  [KO:K14276]
122761654  [KO:K03283]
122761677  [KO:K14276]
122761682  [KO:K14276]
122762049  [KO:K14276]
122762118  [KO:K12892]
122762170  [KO:K14276]
122762222  [KO:K14276]
122762223  [KO:K14276]
122762264  [KO:K14276]
122762279  [KO:K14276]
122762399  [KO:K14276]
122762579  [KO:K14276]
122762580  [KO:K14276]
122762581  [KO:K14277]
122762582  [KO:K14277]
122762589  [KO:K14276]
122762597  snrpa1; U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [KO:K11092]
122762689  [KO:K14276]
122762792  [KO:K14276]
122762795  [KO:K14277]
122762796  [KO:K14277]
122762797  [KO:K14276]
122762798  [KO:K14276]
122762799  [KO:K14276]
122762800  [KO:K14276]
122762920  [KO:K14276]
122762939  [KO:K14276]
122762940  [KO:K14276]
122762941  [KO:K14276]
122762945  [KO:K14277]
122762961  [KO:K14276]
122762962  [KO:K14276]
122762963  [KO:K14276]
122762964  [KO:K14276]
122763039  [KO:K14276]
122763040  [KO:K14276]
122763041  [KO:K14276]
122763084  [KO:K14276]
122763085  [KO:K14276]
122763086  [KO:K14276]
122763090  [KO:K14277]
122763109  [KO:K14276]
122763110  [KO:K14276]
122763111  [KO:K14276]
122763112  [KO:K14276]
122763113  [KO:K14277]
122763137  [KO:K14276]
122763138  [KO:K14276]
122763139  [KO:K14276]
122763141  [KO:K14276]
122763145  [KO:K14277]
122763174  [KO:K14276]
122763175  [KO:K14276]
122763176  [KO:K14276]
122763187  [KO:K14276]
122763188  [KO:K14276]
122763189  [KO:K14276]
122763191  [KO:K14277]
122763193  [KO:K14277]
122763208  [KO:K14276]
122763209  [KO:K14276]
122763225  [KO:K14276]
122763226  [KO:K14276]
122763227  [KO:K14276]
122763228  [KO:K14276]
122763229  [KO:K14276]
122763256  [KO:K14276]
122763257  [KO:K14276]
122763258  [KO:K14276]
122763272  [KO:K14276]
122763281  [KO:K14276]
122763282  [KO:K14276]
122763284  [KO:K14276]
122763285  [KO:K14276]
122763294  [KO:K14276]
122763305  [KO:K14276]
122763306  [KO:K14276]
122763307  [KO:K14276]
122763308  [KO:K14276]
122763309  [KO:K14276]
122763328  [KO:K14276]
122763329  [KO:K14276]
122763330  [KO:K14276]
122763331  [KO:K14276]
122763347  [KO:K14276]
122763348  [KO:K14276]
122763349  [KO:K14276]
122763371  [KO:K14276]
122763372  [KO:K14276]
122763378  [KO:K14276]
122763379  [KO:K14276]
122763380  [KO:K14276]
122763381  [KO:K14276]
122763383  [KO:K14276]
122763384  [KO:K14276]
122763388  [KO:K14277]
122763399  [KO:K14276]
122763404  [KO:K14276]
122763425  [KO:K14276]
122763427  [KO:K14277]
122763434  [KO:K14276]
122763435  [KO:K14276]
122763439  [KO:K14276]
122763440  [KO:K14276]
122763441  [KO:K14276]
122763442  [KO:K14276]
122763444  [KO:K14277]
122763445  [KO:K14277]
122763446  [KO:K14277]
122763448  [KO:K14279]
122763464  [KO:K14276]
122763470  [KO:K14276]
122763482  [KO:K14276]
122763483  [KO:K14276]
122763484  [KO:K14276]
122763485  [KO:K14276]
122763497  [KO:K14276]
122763498  [KO:K14276]
122763499  [KO:K14276]
122763500  [KO:K14276]
122763504  [KO:K14277]
122763513  [KO:K14276]
122763514  [KO:K14276]
122763516  [KO:K14276]
122763534  [KO:K14276]
122763536  [KO:K14277]
122763542  [KO:K14276]
122763546  [KO:K14276]
122763547  [KO:K14276]
122763548  [KO:K14276]
122763549  [KO:K14276]
122763569  [KO:K14276]
122763571  [KO:K14276]
122763575  [KO:K14276]
122763576  [KO:K14276]
122763577  [KO:K14276]
122763584  [KO:K14277]
122763595  [KO:K14276]
122763597  [KO:K14276]
122763598  [KO:K14276]
122763599  [KO:K14276]
122763603  [KO:K14277]
122763615  [KO:K14276]
122763616  [KO:K14276]
122763627  [KO:K14276]
122763634  [KO:K14276]
122763635  [KO:K14276]
122763642  [KO:K14276]
122763643  [KO:K14276]
122763650  [KO:K14276]
122763652  [KO:K14276]
122763660  [KO:K14276]
122763662  [KO:K14276]
122763663  [KO:K14276]
122763664  [KO:K14276]
122763665  [KO:K14276]
122763689  [KO:K14277]
122763694  [KO:K14276]
122763695  [KO:K14276]
122763697  [KO:K14276]
122763702  [KO:K14276]
122763705  [KO:K14276]
122763707  [KO:K14276]
122763708  [KO:K14276]
122763709  [KO:K14276]
122763711  [KO:K14277]
122763724  [KO:K14276]
122763725  [KO:K14276]
122763729  [KO:K14277]
122763735  [KO:K14276]
122763736  [KO:K14276]
122763737  [KO:K14277]
122763743  [KO:K14276]
122763745  [KO:K14276]
122763746  [KO:K14276]
122763747  [KO:K14276]
122763748  [KO:K14276]
122763752  [KO:K14277]
122763761  [KO:K14276]
122763762  [KO:K14276]
122763763  [KO:K14276]
122763773  [KO:K14279]
122763777  [KO:K14276]
122763778  [KO:K14276]
122763779  [KO:K14276]
122763782  [KO:K14277]
122763788  [KO:K14279]
122763799  [KO:K14276]
122763800  [KO:K14276]
122763876  [KO:K14276]
122763877  [KO:K14276]
122763892  [KO:K14279]
122763894  [KO:K14276]
122763899  [KO:K14276]
122763925  [KO:K14276]
122763926  [KO:K14276]
122763940  [KO:K14276]
122763941  [KO:K14276]
122763942  [KO:K14276]
122763943  [KO:K14276]
122763963  [KO:K14276]
122763964  [KO:K14276]
122763988  [KO:K14276]
122763989  [KO:K14276]
122763990  [KO:K14276]
122763991  [KO:K14276]
122764087  [KO:K14276]
122764088  [KO:K14276]
122764089  [KO:K14276]
122764090  [KO:K14276]
122764091  [KO:K14276]
122764092  [KO:K14276]
122764093  [KO:K14276]
122764094  [KO:K14276]
122764095  [KO:K14276]
122764097  [KO:K14276]
122764098  [KO:K14276]
122764099  [KO:K14276]
122764102  [KO:K14277]
122764103  [KO:K14277]
122764104  [KO:K14277]
122764105  [KO:K14277]
122764106  [KO:K14276]
122764107  [KO:K14276]
122764108  [KO:K14276]
122764109  rp9; retinitis pigmentosa 9 protein [KO:K19604]
122764117  [KO:K14276]
122764124  [KO:K14278]
122764125  [KO:K14278]
122764126  [KO:K14278]
122764127  [KO:K14278]
122764128  [KO:K14278]
122764129  [KO:K14278]
122764130  [KO:K14278]
122764131  [KO:K14278]
122764132  [KO:K14278]
122764133  [KO:K14278]
122764134  [KO:K14278]
122764135  [KO:K14278]
122764136  [KO:K14278]
122764137  [KO:K14278]
122764138  [KO:K14278]
122764139  [KO:K14278]
122764140  [KO:K14278]
122764141  [KO:K14278]
122764142  [KO:K14278]
122764200  [KO:K14276]
122764201  [KO:K14276]
122764308  [KO:K14276]
122764309  [KO:K14276]
122764310  [KO:K14276]
122764311  [KO:K14276]
122764312  [KO:K14276]
122764329  [KO:K14276]
122764330  [KO:K14276]
122764336  [KO:K14279]
122764339  [KO:K14276]
122764348  [KO:K14276]
122764351  [KO:K14276]
122764352  [KO:K14276]
122764353  [KO:K14276]
122764356  [KO:K14277]
122764370  [KO:K14280]
122764371  [KO:K14280]
122764372  [KO:K14280]
122764373  [KO:K14280]
122764374  [KO:K14280]
122764381  [KO:K14276]
122764382  [KO:K14276]
122764384  [KO:K14276]
122764385  [KO:K14276]
122764386  [KO:K14276]
122764413  [KO:K14276]
122764414  [KO:K14276]
122764423  [KO:K14276]
122764425  [KO:K14277]
122764431  [KO:K14276]
122764473  [KO:K14276]
122764474  [KO:K14276]
122764476  [KO:K14276]
122764477  [KO:K14276]
122764478  [KO:K14276]
122764479  [KO:K14276]
122764480  [KO:K14276]
122764481  [KO:K14276]
122764490  [KO:K14277]
122764535  [KO:K14276]
122764536  [KO:K14276]
122764537  [KO:K14276]
122764546  [KO:K14276]
122764547  [KO:K14276]
122764548  [KO:K14276]
122764549  [KO:K14276]
122764562  [KO:K14277]
122764566  [KO:K14276]
122764570  [KO:K14276]
122764571  [KO:K14276]
122764572  [KO:K14276]
122764577  [KO:K14277]
122764578  [KO:K14277]
122764588  [KO:K14276]
122764589  [KO:K14276]
122764590  [KO:K14276]
122764601  [KO:K14276]
122764602  [KO:K14276]
122764605  [KO:K14277]
122764613  [KO:K14276]
122764620  [KO:K14276]
122764621  [KO:K14276]
122764622  [KO:K14276]
122764623  [KO:K14276]
122764637  [KO:K14276]
122764638  [KO:K14276]
122764639  [KO:K14276]
122764640  [KO:K14277]
122764658  [KO:K14276]
122764659  [KO:K14276]
122764701  [KO:K14276]
122764702  [KO:K14276]
122764703  [KO:K14276]
122764734  [KO:K14279]
122764735  [KO:K14279]
122765293  prpf40a; pre-mRNA-processing factor 40 homolog A isoform X1 [KO:K12821]
122765451  u2af1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit [KO:K12836]
122765536  tra2b; transformer-2 protein homolog beta isoform X1 [KO:K12897]
122765661  [KO:K14280]
122765662  [KO:K14280]
122765770  rbm17; splicing factor 45 isoform X1 [KO:K12840]
122765992  dhx15; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
122766139  acin1b; apoptotic chromatin condensation inducer 1b isoform X1 [KO:K12875]
122766459  sf3b2; splicing factor 3B subunit 2 [KO:K12829]
122766631  [KO:K12884]
122766825  snrpf; small nuclear ribonucleoprotein F [KO:K11098]
122767017  rbm25b; RNA-binding protein 25b isoform X1 [KO:K12822]
122767629  snrpc; U1 small nuclear ribonucleoprotein C [KO:K11095]
122767705  lsm3; snRNA-associated Sm-like protein LSm3 [KO:K12622]
122767708  isy1; pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog [KO:K12870]
122767997  snrpe; small nuclear ribonucleoprotein E [KO:K11097]
122768021  sf3a2; splicing factor 3A subunit 2 [KO:K12826]
122768084  srsf3a; serine/arginine-rich splicing factor 3a [KO:K12892]
122768167  snrpb; small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' [KO:K11086]
122768217  ppil1; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
122768296  srsf6b; serine and arginine rich splicing factor 6b [KO:K12893]
122768640  [KO:K12892]
122769089  snrnp27; U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein [KO:K12846]
122769233  [KO:K12842]
122769238  snrnp200; U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
122769320  sf3a1; splicing factor 3A subunit 1 [KO:K12825]
122769694  usp39; U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 [KO:K12847]
122770017  hnrnpk; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K [KO:K12886]
122770226  [KO:K14276]
122770227  [KO:K14279]
122770443  lsm6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6 [KO:K12625]
122770567  sart1; U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 [KO:K11984]
122770582  eif4a3; eukaryotic initiation factor 4A-III [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
122770841  snrpb2; U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' [KO:K11094]
122770875  [KO:K12838]
122770896  [KO:K12881]
122771033  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
122771184  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
122771346  [KO:K12884]
122771510  plrg1; pleiotropic regulator 1 isoform X1 [KO:K12862]
122771719  [KO:K14278]
122771720  [KO:K14278]
122771721  [KO:K14278]
122771722  [KO:K14278]
122771723  [KO:K14278]
122771725  [KO:K14278]
122771726  [KO:K14278]
122771727  [KO:K14278]
122771728  [KO:K14278]
122771729  [KO:K14278]
122771730  [KO:K14278]
122771731  [KO:K14278]
122771735  [KO:K14278]
122771741  [KO:K14278]
122771742  [KO:K14278]
122771743  [KO:K14278]
122771744  [KO:K14278]
122771745  [KO:K14278]
122771746  [KO:K14278]
122771747  [KO:K14278]
122771748  [KO:K14278]
122771750  [KO:K14278]
122771751  [KO:K14278]
122771752  [KO:K14278]
122771753  [KO:K14278]
122771754  [KO:K14278]
122771755  [KO:K14278]
122771757  [KO:K14278]
122771758  [KO:K14278]
122771759  [KO:K14278]
122771760  [KO:K14278]
122771763  [KO:K14278]
122771764  [KO:K14278]
122771765  [KO:K14278]
122771766  [KO:K14278]
122771767  [KO:K14278]
122771768  [KO:K14278]
122771769  [KO:K14278]
122771770  [KO:K14278]
122771771  [KO:K14278]
122771772  [KO:K14278]
122771774  [KO:K14278]
122771775  [KO:K14278]
122771776  [KO:K14278]
122771777  [KO:K14278]
122771779  [KO:K14278]
122771780  [KO:K14278]
122771781  [KO:K14278]
122771782  [KO:K14278]
122771783  [KO:K14278]
122771784  [KO:K14278]
122771786  [KO:K14278]
122771787  [KO:K14278]
122771788  [KO:K14278]
122771789  [KO:K14278]
122771790  [KO:K14278]
122772080  dhx38; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
122773056  snrpd2; small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 [KO:K11096]
122773397  taf15; TATA-binding protein-associated factor 2N isoform X1 [KO:K13098]
122773399  prpf8; pre-mRNA-processing-splicing factor 8 [KO:K12856]
122773455  snrpa; U1 small nuclear ribonucleoprotein A [KO:K11091]
122773588  srsf7a; serine and arginine rich splicing factor 7a isoform X1 [KO:K12896]
122773765  srsf1a; serine/arginine-rich splicing factor 1A [KO:K12890]
122773775  [KO:K12875]
122773856  acin1a; calponin homology domain-containing protein DDB_G0272472 isoform X1 [KO:K12875]
122774034  [KO:K14276]
122774035  [KO:K14276]
122774036  [KO:K14276]
122774037  [KO:K14276]
122774039  [KO:K14276]
122774040  [KO:K14276]
122774041  [KO:K14276]
122774042  [KO:K14276]
122774043  [KO:K14276]
122774045  [KO:K14277]
122774046  [KO:K14276]
122774047  [KO:K14277]
122774048  [KO:K14277]
122774058  [KO:K14276]
122774059  [KO:K14276]
122774060  [KO:K14276]
122774215  rbm8a; RNA-binding protein 8A [KO:K12876]
122774509  srsf10a; serine/arginine-rich splicing factor 10 [KO:K12900]
122774532  prpf31; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 [KO:K12844]
122774548  hsc70; heat shock cognate 71 kDa protein [KO:K03283]
122774588  dhx16; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 isoform X1 [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
122774618  [KO:K12837]
122775128  lsm5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5 [KO:K12624]
122775151  ccdc12; coiled-coil domain-containing protein 12 [KO:K12871]
122775173  prpf38b; pre-mRNA-splicing factor 38B [KO:K12850]
122775209  prpf3; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 [KO:K12843]
122775309  [KO:K14276]
122775321  [KO:K14276]
122775322  [KO:K14277]
122775323  [KO:K14277]
122775681  sf3b3; splicing factor 3B subunit 3 [KO:K12830]
122776236  [KO:K12824]
122776261  puf60a; poly(U)-binding-splicing factor PUF60a isoform X1 [KO:K12838]
122776285  prpf18; pre-mRNA-splicing factor 18 isoform X1 [KO:K12817]
122776555  [KO:K14276]
122776792  [KO:K11099]
122776798  syf2; pre-mRNA-splicing factor syf2 isoform X1 [KO:K12868]
122776975  hnrnpa1b; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1b isoform X1 [KO:K12741]
122777046  ddx23; probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
122777177  [KO:K12893]
122777489  ctnnbl1; beta-catenin-like protein 1 [KO:K12864]
122777498  prpf6; pre-mRNA-processing factor 6 [KO:K12855]
122777501  bcas2; pre-mRNA-splicing factor SPF27 [KO:K12861]
122777522  pqbp1; polyglutamine-binding protein 1 [KO:K12865]
122777774  ppih; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
122777906  [KO:K14278]
122777914  [KO:K14278]
122777915  [KO:K14278]
122777916  [KO:K14279]
122777917  [KO:K14279]
122778159  rbmx; RNA-binding motif protein, X chromosome isoform X1 [KO:K12885]
122778433  prpf19; pre-mRNA-processing factor 19 [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
122778570  thoc3; THO complex subunit 3 [KO:K12880]
122778712  [KO:K12882]
122778830  slu7; pre-mRNA-splicing factor SLU7 [KO:K12819]
122778874  rbm22; pre-mRNA-splicing factor RBM22 [KO:K12872]
122779003  [KO:K14279]
122779196  [KO:K03283]
122779204  cwc15; protein CWC15 homolog [KO:K12863]
122779205  [KO:K03283]
122779249  zmat2; zinc finger matrin-type protein 2 [KO:K12848]
122779338  zgc:163098; U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein [KO:K12842]
122779371  thoc2; THO complex subunit 2 isoform X1 [KO:K12879]
122779510  ddx46; probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
122779708  [KO:K03283]
122779887  srsf1b; serine/arginine-rich splicing factor 1B [KO:K12890]
122779896  [KO:K12824]
122780336  magoh; protein mago nashi homolog [KO:K12877]
122780406  ncbp2; nuclear cap-binding protein subunit 2 [KO:K12883]
122780412  lsm4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 [KO:K12623]
122780444  smx5; smx5 [KO:K12621]
122780805  hnrnpm; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M isoform X1 [KO:K12887]
122780955  lsm7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7 [KO:K12626]
122780963  [KO:K12841]
122781008  prpf38a; pre-mRNA-splicing factor 38A [KO:K12849]
122781128  thoc1; THO complex subunit 1 [KO:K12878]
122781779  cdc5l; cell division cycle 5-like protein [KO:K12860]
122781980  sf3b5; splicing factor 3B subunit 5 [KO:K12832]
122782284  smndc1; survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [KO:K12839]
122782709  [KO:K14280]
122782710  [KO:K12897]
122782805  rbm25a; RNA-binding protein 25 isoform X1 [KO:K12822]
122782838  aqr; RNA helicase aquarius [KO:K12874]
122783494  srsf5a; serine and arginine rich splicing factor 5a [KO:K12893]
122783695  [KO:K03283]
122783942  hnrnpub; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Ub [KO:K12888]
122784136  cdc40; pre-mRNA-processing factor 17 [KO:K12816]
122784173  srsf5b; serine and arginine rich splicing factor 5b [KO:K12893]
122784262  crnkl1; crooked neck-like protein 1 [KO:K12869]
122784391  sf3b6; splicing factor 3B subunit 6 [KO:K12833]
122784487  snw1; SNW domain-containing protein 1 [KO:K06063]
122784614  [KO:K14276]
122784615  [KO:K14277]
122784616  [KO:K14277]
122784637  [KO:K14276]
122784821  [KO:K03283]
122784974  ddx42; ATP-dependent RNA helicase DDX42 [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
122785177  bud31; protein BUD31 homolog [KO:K12873]
122785313  fus; RNA-binding protein FUS [KO:K13098]
122785314  [KO:K03283]
122785473  snrnp70; U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [KO:K11093]
122785625  eftud2; 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component [KO:K12852]
122785788  alyref; THO complex subunit 4 isoform X1 [KO:K12881]
122785834  [KO:K12866]
122785923  [KO:K12837]
122785935  [KO:K14280]
122785944  [KO:K14280]
122785945  [KO:K14280]
122785946  [KO:K14280]
122786042  sf3b4; splicing factor 3B subunit 4 [KO:K12831]
122786046  snrpd1; small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 [KO:K11087]
122786224  srsf4; serine/arginine-rich splicing factor 4 [KO:K12893]
122786640  snrnp40; U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein [KO:K12857]
122786686  hnrnpa3; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 [KO:K12741]
122786702  [KO:K12900]
122786878  txnl4a; thioredoxin-like protein 4A [KO:K12859]
122786954  sf3a3; splicing factor 3A subunit 3 [KO:K12827]
122786957  [KO:K14280]
122786958  [KO:K14280]
122786959  [KO:K14280]
122786960  [KO:K14280]
122786961  [KO:K14280]
122786962  [KO:K14280]
122786963  [KO:K14280]
122786964  [KO:K14280]
122786986  [KO:K14280]
122786987  [KO:K14280]
Reference
PMID:19239890
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
PMID:10978320
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
PMID:17537823
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
PMID:19733268
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system