KEGG   ORTHOLOGY: K06204
Entry
K06204                      KO                                     
Symbol
dksA
Name
RNA polymerase-binding transcription factor
Pathway
map02026  Biofilm formation - Escherichia coli
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02026 Biofilm formation - Escherichia coli
    K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
   03021 Transcription machinery
    K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
   03009 Ribosome biogenesis
    K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
Transcription factors [BR:ko03000]
 Prokaryotic type
  Other transcription factors
   Others
    K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   Other transcription-related factors
    Transcription elongation factors
     K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic type
  rRNA transcription factors
   K06204  dksA; RNA polymerase-binding transcription factor
Other DBs
COG: COG1734
Genes
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PAEC: M802_4725 M802_4884(dksA) M802_5721(dksA)
PAEO: M801_4592 M801_4751(dksA) M801_5588(dksA)
PCQ: PcP3B5_01080(dksA_1) PcP3B5_10190(dksA_2) PcP3B5_53900(dksA_3)
PAP: PSPA7_5217 PSPA7_5439(dksA2) PSPA7_6338(dksA1)
PPU: PP_2220 PP_4693(dksA)
PPX: T1E_2118(dksA) T1E_2952
PPUN: PP4_27390(dksA3) PP4_35970(dksA2) PP4_46710(dksA1)
PSP: PSPPH_0764(dksA1) PSPPH_0861(dksA2) PSPPH_3182
PAST: N015_05080(dksA) N015_10745
PPRC: PFLCHA0_c26610(dksA1) PFLCHA0_c52420(dksA2) PFLCHA0_c61350(dksA3)
PMUD: NCTC8068_00793(dksA2) NCTC8068_02978(dksA1) NCTC8068_05392(dksA)
PLUL: FOB45_05015(dksA) FOB45_22840(dksA)
PKC: PKB_4816 PKB_4940(dksA)
PADE: C3B55_00383(dksA)
PSEJ: HNQ25_06780(dksA)
PMAO: PMYSY11_0167(dksA) PMYSY11_3621(dksA)
PDW: BV82_1132 BV82_4828(dksA)
PTW: TUM18999_52450(dksA_1) TUM18999_61120(dksA_2)
PTAE: NCTC10697_01809(dksA1) NCTC10697_03777(dksA2)
PSOA: PSm6_12360(dksA_1) PSm6_19840(dksA_2)
PSOB: ACSC9U_30045(dksA)
PBEN: V6W80_02030(dksA) V6W80_17800(dksA)
PVQ: WOB24_05410(dksA)
PSTP: ACOAPY_05140(dksA)
PCIM: ACOCLD_16805(dksA)
PPSE: BN5_0951(dksA1) BN5_3154 BN5_4350(dksA3)
ECOP: L0Y47_20060(dksA)
PSA: PST_3289(dksA) PST_3603
PCHL: LLJ08_03305(dksA) LLJ08_04140(dksA)
PKG: LW136_03295(dksA) LW136_04805(dksA)
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ENTO: MTZ49_00360(dksA)
HPEG: EAO82_04880(dksA)
HARR: HV822_11795(dksA)
MAQ: Maqu_0674
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MARJ: MARI_23600(dksA)
MALL: PBN92_02830(dksA) PBN92_14640(dksA)
MSHE: MAALD49_06520(dksA) MAALD49_29110(dksA)
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ABY: ABAYE3521(dksA)
ABN: AB57_0337
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ABH: M3Q_514
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AID: CTZ23_14055(dksA)
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ACIC: IOD65_18425(dksA)
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AYU: ABLB98_01205(dksA)
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MCS: DR90_1534(dksA) DR90_25
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MNS: LU293_06140(dksA)
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SVO: SVI_3620(dksA) SVI_3668
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SMAV: CFF01_15740(dksA)
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SLJ: EGC82_18695(dksA)
SMAI: EXU30_06340(dksA)
SPOL: FH971_17010(dksA)
SKH: STH12_00301(dksA_1)
SAES: HBH39_03280(dksA)
SLIT: JQC75_03675(dksA)
SDK: KHX94_05025(dksA)
SCAA: TUM17387_30350(dksA)
SYK: KDN34_03540(dksA)
SCYP: JYB88_14230(dksA)
SAVI: JYB87_15305(dksA)
SSEM: JYB85_14600(dksA)
SGLA: FJ709_16305(dksA)
SINV: K8B83_05900(dksA)
SXM: MKD32_16985(dksA)
SVM: KDH10_003794(dksA)
SSEH: N7V09_06225(dksA)
SCHK: GII14_17310(dksA)
SACH: K0H61_14375(dksA)
SAEG: K0H80_16040(dksA)
SMES: K0I73_15820(dksA)
SHAO: K0H81_16320(dksA)
SZH: K0H63_04290(dksA)
SSPA: K0I31_16265(dksA)
SHNS: K0J45_16075(dksA)
SRHS: K0I63_16210(dksA)
SPSJ: K0I62_15925(dksA)
SMAY: K0H60_17040(dksA)
SOG: RA178_04145(dksA)
SHEA: GUY17_17460(dksA)
SHEL: JM642_16700(dksA)
SHEH: ABIS04_15840(dksA)
SYOU: RGE70_02125(dksA)
SHEY: FS418_05470(dksA)
SHEN: FJD32_019060(dksA)
ILO: IL2250(dksA)
IPI: CEW91_01875(dksA) CEW91_01965(dksA)
IDI: CWC33_07480(dksA)
IDT: C5610_11735(dksA)
IAB: K5X84_10635(dksA)
IDP: U0358_11565(dksA)
IDX: UM402_10985(dksA)
CPS: CPS_0007 CPS_4306(dksA)
COLW: A3Q33_11300(dksA)
COLA: DBO93_02895(dksA)
CBER: B5D82_11460(dksA)
PHA: PSHAa0606(dksAA) PSHAa1194(dksAB)
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PSPO: PSPO_a0585(dksA) PSPO_a1385
PART: PARC_a3169(dksA)
PNG: PNIG_a0725(dksA)
PSEN: PNC201_06225(dksA1) PNC201_14835(dksA2)
PAGA: PAGA_a0773(dksA) PAGA_a1512
PXI: J5O05_06605(dksA)
PSAZ: PA25_27160(dksA)
PFLI: CTT31_15075(dksA)
PMAZ: R5H13_15700(dksA)
PSKA: KAN5_01100(dksA)
PSPS: PS1M3_24960(dksA)
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AAUS: EP12_17845(dksA)
ASQ: AVL57_18990(dksA)
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APEL: CA267_011945(dksA)
ALTO: AltI4_36470(dksA)
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ALTA: D1814_09625(dksA)
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SALK: FBQ74_02020(dksA)
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GNI: GNIT_0523(dksA)
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PAT: Patl_3937
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HMI: soil367_02575(dksA)
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AGAZ: ACRRSZ_03585(dksA)
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ALKM: NKI27_17765(dksA)
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CATT: OLW01_01720(dksA)
ALII: QR722_17720(dksA)
PMAW: MACH26_02210(dksA)
HARO: R50071_11800(dksA_1) R50071_12620(dksA_2)
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NIX: PN836_016290(dksA)
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MICC: AUP74_01673(dksA)
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RCA: Rcas_0280
TTR: Tter_1346
TLI: Tlie_0934
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Reference
  Authors
Paul BJ, Barker MM, Ross W, Schneider DA, Webb C, Foster JW, Gourse RL
  Title
DksA: a critical component of the transcription initiation machinery that potentiates the regulation of rRNA promoters by ppGpp and the initiating NTP.
  Journal
Cell 118:311-22 (2004)
DOI:10.1016/j.cell.2004.07.009
Reference
PMID:9555902
  Authors
Mohr CD, MacKichan JK, Shapiro L
  Title
A membrane-associated protein, FliX, is required for an early step in Caulobacter flagellar assembly.
  Journal
J Bacteriol 180:2175-85 (1998)
DOI:10.1128/JB.180.8.2175-2185.1998
  Sequence
[ccr:CC_2580]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system