KEGG   ORTHOLOGY: K14415
Entry
K14415                      KO                                     
Symbol
RTCB, rtcB
Name
tRNA-splicing ligase RtcB (3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase) [EC:6.5.1.8]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis
    K14415  RTCB, rtcB; tRNA-splicing ligase RtcB (3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase)
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.5  Forming phosphoric-ester bonds
   6.5.1  Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.5.1.8  3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase
     K14415  RTCB, rtcB; tRNA-splicing ligase RtcB (3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase)
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic type
  tRNA spricing factors
   tRNA splicing ligase complex
    K14415  RTCB, rtcB; tRNA-splicing ligase RtcB (3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase)
 Prokaryotic type
  tRNA spricing factors
   tRNA splicing ligases
    K14415  RTCB, rtcB; tRNA-splicing ligase RtcB (3'-phosphate/5'-hydroxy nucleic acid ligase)
Other DBs
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Genes
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NSPH: BDGGKGIB_03275(rtcB)
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CCOS: Pan44_21010(rtcB_1) Pan44_34070(rtcB_2)
CCOP: Mal65_44530(rtcB)
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PBAS: SMSP2_00402(rtcB)
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BTHO: Btheta7330_01760(rtcB)
BFR: BF2711
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PHE: Phep_0086
SMIZ: 4412673_01206(rtcB_1) 4412673_01351(rtcB_2)
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FBR: FBFL15_1051(rtcB)
FIN: KQS_11450(rtcB)
WIN: WPG_1501
AALG: AREALGSMS7_03981(rtcB)
KOS: KORDIASMS9_00982(rtcB)
KAN: IMCC3317_30260(rtcB_2)
MESQ: C7H62_1147
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TAL: Thal_0159
TTK: TST_1313(rtcB)
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TMQ: THMB_1382
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TPT: Tpet_1426
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TRQ: TRQ2_1472
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DTU: Dtur_0127
DTP: JZK55_18670(rtcB)
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NMV: NITMOv2_3246(rtcB)
NIO: NITINOP_0749(rtcB)
NJA: NSJP_3890(rtcB)
NIF: W02_11500(rtcB)
NWT: NSPWAT_1641(rtcB)
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BANA: BARAN1_0885(rtcB)
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SCHV: BRCON_0344
MJA: MJ_0682
MMP: MMP1392
MMD: GYY_07790
MMAD: MMJJ_14470(rtcB)
MAE: Maeo_0134
MVO: Mvol_0961
MTH: MTH_1597
MWO: MWSIV6_0141(rtcB)
MTEE: MTTB_12520
METC: MTCT_1456
METE: tca_01546(rtcB)
MST: Msp_0641
MSI: Msm_0666
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MMIL: sm9_0302(rtcB)
MEYE: TL18_01295
MOL: YLM1_0096
METH: MBMB1_1440(rtcB)
MFC: BRM9_0668
MFI: DSM1535_0639(rtcB)
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MFV: Mfer_0490
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FPL: Ferp_1294
GAC: GACE_0692
GAH: GAH_02018
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PAB: PAB0383
PYN: PNA2_0188
PYS: Py04_1491
TKO: TK0358
TON: TON_0714
TGA: TGAM_1505
TSI: TSIB_1552
THE: GQS_01315
THA: TAM4_1534
THM: CL1_1978
TLT: OCC_11789
THS: TES1_0931
TNU: BD01_1004
TEU: TEU_10910
TCQ: TIRI35C_1128(rtcB)
PPAC: PAP_02800
MBAR: MSBR2_2031
MBAK: MSBR3_2141
MAC: MA_0266
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Reference
  Authors
Popow J, Englert M, Weitzer S, Schleiffer A, Mierzwa B, Mechtler K, Trowitzsch S, Will CL, Luhrmann R, Soll D, Martinez J
  Title
HSPC117 is the essential subunit of a human tRNA splicing ligase complex.
  Journal
Science 331:760-4 (2011)
DOI:10.1126/science.1197847
  Sequence
[hsa:51493]
Reference
  Authors
Englert M, Sheppard K, Aslanian A, Yates JR 3rd, Soll D
  Title
Archaeal 3'-phosphate RNA splicing ligase characterization identifies the missing component in tRNA maturation.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 108:1290-5 (2011)
DOI:10.1073/pnas.1018307108
  Sequence
[mka:MK1682] [pai:PAE0998]
Reference
  Authors
Tanaka N, Shuman S
  Title
RtcB is the RNA ligase component of an Escherichia coli RNA repair operon.
  Journal
J Biol Chem 286:7727-31 (2011)
DOI:10.1074/jbc.C111.219022
  Sequence
[eco:b3421]
LinkDB

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