KEGG   PATHWAY: hsp03040
Entry
hsp03040                    Pathway                                
Name
Spliceosome - Hippoglossus stenolepis (Pacific halibut)
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
hsp03040  Spliceosome
hsp03040

Other DBs
GO: 0005681
PDB: 5O9Z 5Z56 6FF7 8I0W
Organism
Hippoglossus stenolepis (Pacific halibut) [GN:hsp]
Gene
118098449  lsm5; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5 [KO:K12624]
118098490  puf60b; poly(U)-binding-splicing factor PUF60-B isoform X1 [KO:K12838]
118098687  [KO:K12842]
118099138  cdc40; pre-mRNA-processing factor 17 [KO:K12816]
118099316  hnrnpub; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Ub [KO:K12888]
118099470  srsf5b; serine and arginine rich splicing factor 5b [KO:K12893]
118099547  crnkl1; crooked neck-like protein 1 [KO:K12869]
118099682  snw1; SNW domain-containing protein 1 [KO:K06063]
118099897  sf3b6; splicing factor 3B subunit 6 [KO:K12833]
118099912  rbm25b; RNA-binding protein 25b isoform X1 [KO:K12822]
118099957  [KO:K14277]
118099963  [KO:K14277]
118100178  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
118100179  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
118100336  phf5a; PHD finger-like domain-containing protein 5A [KO:K12834]
118100416  [KO:K12881]
118100431  srsf2a; serine and arginine rich splicing factor 2a [KO:K12891]
118101077  snu13b; SNU13 homolog, small nuclear ribonucleoprotein b (U4/U6.U5) [KO:K12845]
118101142  [KO:K14279]
118101143  [KO:K14279]
118101547  snrpf; small nuclear ribonucleoprotein F [KO:K11098]
118101937  rbm17; splicing factor 45 [KO:K12840]
118102014  lsm8; LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated [KO:K12627]
118102026  [KO:K14277]
118102030  [KO:K14277]
118102031  [KO:K14277]
118102032  [KO:K14277]
118102626  dhx15; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
118102751  hnrnpc; heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 isoform X1 [KO:K12884]
118102823  acin1b; apoptotic chromatin condensation inducer 1b [KO:K12875]
118102832  sf1; splicing factor 1 isoform X1 [KO:K13095]
118102853  sf3b2; splicing factor 3B subunit 2 [KO:K12829]
118103611  [KO:K12836]
118104083  [KO:K14276]
118104087  [KO:K14276]
118104088  [KO:K14276]
118104089  [KO:K14276]
118104090  [KO:K14276]
118104091  [KO:K14276]
118104092  [KO:K14276]
118104093  [KO:K14276]
118104094  [KO:K14276]
118104095  [KO:K14276]
118104096  [KO:K14276]
118104097  [KO:K14276]
118104413  snrpb; small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' [KO:K11086]
118104423  snrpc; U1 small nuclear ribonucleoprotein C [KO:K11095]
118104425  srsf3b; serine/arginine-rich splicing factor 3b [KO:K12892]
118104535  snrpe; small nuclear ribonucleoprotein E [KO:K11097]
118104615  srsf3a; serine/arginine-rich splicing factor 3a [KO:K12892]
118104671  [KO:K13176]
118104941  [KO:K12893]
118105189  ppil1; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
118105278  lsm3; snRNA-associated Sm-like protein LSm3 [KO:K12622]
118105481  isy1; pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog [KO:K12870]
118105533  [KO:K14280]
118105797  prpf8; pre-mRNA-processing-splicing factor 8 [KO:K12856]
118105922  taf15; TATA-binding protein-associated factor 2N isoform X1 [KO:K13098]
118106188  srsf7a; serine and arginine rich splicing factor 7a [KO:K12896]
118106471  srsf1a; serine/arginine-rich splicing factor 1A isoform X1 [KO:K12890]
118106653  snrpa; U1 small nuclear ribonucleoprotein A [KO:K11091]
118106682  snrpd2; small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 [KO:K11096]
118108368  [KO:K14276]
118108369  [KO:K14276]
118108370  [KO:K14276]
118108371  [KO:K14276]
118108372  [KO:K14277]
118108373  [KO:K14277]
118108375  [KO:K14277]
118108376  [KO:K14277]
118108377  [KO:K14277]
118108378  [KO:K14277]
118109355  prpf18; pre-mRNA-splicing factor 18 isoform X1 [KO:K12817]
118109803  sf3b3; splicing factor 3B subunit 3 [KO:K12830]
118110279  dhx38; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 isoform X1 [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
118110286  [KO:K14278]
118110288  [KO:K14278]
118110289  [KO:K14278]
118110290  [KO:K14278]
118110291  [KO:K14278]
118110309  [KO:K14278]
118110332  [KO:K14278]
118110396  [KO:K03283]
118110398  [KO:K03283]
118110501  ddx23; probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
118110712  srsf6a; serine and arginine rich splicing factor 6a [KO:K12893]
118110738  hnrnpa1b; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1b isoform X1 [KO:K12741]
118110885  snrpa1; U2 small nuclear ribonucleoprotein A' isoform X1 [KO:K11092]
118110971  ctnnbl1; beta-catenin-like protein 1 [KO:K12864]
118110976  gpkow; G-patch domain and KOW motifs-containing protein [KO:K13101]
118110977  pqbp1; polyglutamine-binding protein 1 isoform X1 [KO:K12865]
118111103  [KO:K03283]
118111288  prpf6; pre-mRNA-processing factor 6 [KO:K12855]
118111420  ppih; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
118111555  bcas2; pre-mRNA-splicing factor SPF27 [KO:K12861]
118111634  snrpg; small nuclear ribonucleoprotein G [KO:K11099]
118111694  [KO:K14279]
118111695  [KO:K14279]
118111717  [KO:K14279]
118112189  rbm22; pre-mRNA-splicing factor RBM22 [KO:K12872]
118112277  [KO:K12882]
118112285  rbmx; RNA-binding motif protein, X chromosome [KO:K12885]
118112384  [KO:K12819]
118112616  prpf19; pre-mRNA-processing factor 19 [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
118112619  [KO:K12819]
118112705  [KO:K12872]
118112732  thoc3; THO complex subunit 3 [KO:K12880]
118112824  [KO:K14277]
118112832  [KO:K14280]
118112852  [KO:K14280]
118112853  [KO:K14280]
118113197  u2af2a; U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2a isoform X1 [KO:K12837]
118113376  snip1; smad nuclear-interacting protein 1 [KO:K13108]
118113395  srsf10a; serine/arginine-rich splicing factor 10 isoform X1 [KO:K12900]
118113598  prpf31; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 [KO:K12844]
118113603  [KO:K03283]
118113862  ccdc12; coiled-coil domain-containing protein 12 [KO:K12871]
118113925  dhx16; pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
118114008  prpf3; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 [KO:K12843]
118114272  rbm8a; RNA-binding protein 8A [KO:K12876]
118114543  [KO:K14280]
118114780  hnrnpk; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K isoform X1 [KO:K12886]
118114873  sf3a1; splicing factor 3A subunit 1 [KO:K12825]
118114986  usp39; U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2 [KO:K12847]
118115352  snrnp200; U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
118115582  thoc5; THO complex subunit 5 homolog [KO:K13174]
118115588  snrnp27; U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein [KO:K12846]
118115890  aqr; RNA helicase aquarius isoform X1 [KO:K12874]
118115895  [KO:K12897]
118116116  srsf5a; serine and arginine rich splicing factor 5a [KO:K12893]
118116178  syf2; pre-mRNA-splicing factor syf2 [KO:K12868]
118116321  rbm25a; RNA-binding protein 25 isoform X1 [KO:K12822]
118116503  snrpb2; U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' isoform X1 [KO:K11094]
118116570  cwc25; pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog [KO:K28450]
118116840  lsm6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6 [KO:K12625]
118117004  ppie; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E [KO:K09564] [EC:5.2.1.8]
118117032  yju2; splicing factor YJU2 [KO:K28527]
118117094  [KO:K14276]
118117101  [KO:K14277]
118117117  [KO:K14279]
118117118  [KO:K14279]
118117119  [KO:K14276]
118117121  [KO:K14279]
118117131  [KO:K14276]
118117332  acin1a; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus [KO:K12875]
118117461  puf60a; poly(U)-binding-splicing factor PUF60a isoform X1 [KO:K12838]
118117555  [KO:K12884]
118117799  thoc1; THO complex subunit 1 [KO:K12878]
118117940  prpf38b; pre-mRNA-splicing factor 38B isoform X1 [KO:K12850]
118118256  sf3a2; splicing factor 3A subunit 2 [KO:K12826]
118118497  [KO:K14280]
118118498  [KO:K14280]
118119025  smndc1; survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [KO:K12839]
118119245  cdc5l; cell division cycle 5-like protein [KO:K12860]
118119303  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
118119497  sf3b5; splicing factor 3B subunit 5 [KO:K12832]
118119523  eif4a3; eukaryotic initiation factor 4A-III [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
118119677  u2af1; splicing factor U2AF 35 kDa subunit [KO:K12836]
118119729  sf3b1; splicing factor 3B subunit 1 isoform X1 [KO:K12828]
118119832  hnrnpa3; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 [KO:K12741]
118119975  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
118120017  tra2b; transformer-2 protein homolog beta isoform X1 [KO:K12897]
118120249  prpf40a; pre-mRNA-processing factor 40 homolog A isoform X1 [KO:K12821]
118120715  magoh; protein mago nashi homolog [KO:K12877]
118120870  sart1; U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 [KO:K11984]
118120910  smx5; smx5 [KO:K12621]
118120918  hnrnpm; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M isoform X1 [KO:K12887]
118121139  lsm7; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7 [KO:K12626]
118121294  prpf38a; pre-mRNA-splicing factor 38A isoform X1 [KO:K12849]
118121311  [KO:K12841]
118121470  lsm4; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 [KO:K12623]
118121558  ncbp2; nuclear cap-binding protein subunit 2 [KO:K12883]
118121919  [KO:K03283]
118121978  [KO:K03283]
118122144  rbmx2; RNA-binding motif protein, X-linked 2 [KO:K13107]
118122157  ddx46; probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
118122166  thoc2; THO complex subunit 2 isoform X1 [KO:K12879]
118122295  [KO:K12890]
118122299  zgc:163098; U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein [KO:K12842]
118122350  [KO:K12824]
118122462  bud13; BUD13 homolog [KO:K13106]
118122695  cwc15; protein CWC15 homolog [KO:K12863]
118122934  eftud2; 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component [KO:K12852]
118122962  [KO:K12837]
118123017  ddx42; ATP-dependent RNA helicase DDX42 [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
118123019  alyref; THO complex subunit 4 isoform X1 [KO:K12881]
118123163  [KO:K12866]
118123238  ddx5; probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 isoform X1 [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
118123264  bud31; protein BUD31 homolog [KO:K12873]
118123271  casc3; protein CASC3 [KO:K14323]
118123285  thoc6; THO complex subunit 6 homolog [KO:K13175]
118123708  snrnp70; U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa [KO:K11093]
118123741  xab2; pre-mRNA-splicing factor SYF1 [KO:K12867]
118123755  plrg1; pleiotropic regulator 1 [KO:K12862]
118123955  fus; LOW QUALITY PROTEIN: RNA-binding protein FUS [KO:K13098]
118123970  srsf2b; serine/arginine-rich splicing factor 2b isoform X1 [KO:K12891]
118124379  snrpd1; small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 [KO:K11087]
118124545  snrnp40; U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein [KO:K12857]
118124658  [KO:K12900]
118124693  tra2a; transformer-2 protein homolog alpha isoform X1 [KO:K12897]
118124727  sf3a3; splicing factor 3A subunit 3 [KO:K12827]
118124787  txnl4a; thioredoxin-like protein 4A [KO:K12859]
118125082  rp9; retinitis pigmentosa 9 protein [KO:K19604]
118125256  [KO:K12893]
118125312  sf3b4; splicing factor 3B subunit 4 [KO:K12831]
118125519  hnrpkl; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, like isoform X1 [KO:K12886]
118125550  snrpd3l; small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide, like [KO:K11088]
118125584  prpf4; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 [KO:K12662]
118125785  srsf9; serine/arginine-rich splicing factor 9 [KO:K21123]
118125940  [KO:K03283]
124851316  [KO:K14277]
124851391  [KO:K14279]
124851432  [KO:K14276]
124851433  [KO:K14276]
124851434  [KO:K14276]
124851435  [KO:K14276]
124851436  [KO:K14276]
124851437  [KO:K14276]
124851438  [KO:K14276]
124851439  [KO:K14276]
124851440  [KO:K14276]
124851441  [KO:K14276]
124851442  [KO:K14276]
124851443  [KO:K14276]
124851444  [KO:K14276]
124851445  [KO:K14276]
124851446  [KO:K14276]
124851447  [KO:K14276]
124851448  [KO:K14276]
124851449  [KO:K14276]
124851450  [KO:K14276]
124851452  [KO:K14276]
124851453  [KO:K14276]
124851454  [KO:K14276]
124851456  [KO:K14276]
124851457  [KO:K14276]
124851459  [KO:K14276]
124851460  [KO:K14276]
124851461  [KO:K14276]
124851462  [KO:K14276]
124851465  [KO:K14276]
124851466  [KO:K14276]
124851468  [KO:K14276]
124851472  [KO:K14276]
124851473  [KO:K14276]
124851474  [KO:K14276]
124851477  [KO:K14276]
124851479  [KO:K14276]
124851482  [KO:K14276]
124851493  [KO:K14276]
124851494  [KO:K14276]
124851495  [KO:K14276]
124851496  [KO:K14276]
124851497  [KO:K14276]
124851498  [KO:K14276]
124851499  [KO:K14276]
124851500  [KO:K14276]
124851501  [KO:K14276]
124851502  [KO:K14276]
124851503  [KO:K14276]
124851504  [KO:K14276]
124851506  [KO:K14276]
124851507  [KO:K14276]
124851508  [KO:K14276]
124851509  [KO:K14276]
124851511  [KO:K14276]
124851512  [KO:K14276]
124851513  [KO:K14276]
124851514  [KO:K14276]
124851515  [KO:K14276]
124851516  [KO:K14276]
124851517  [KO:K14276]
124851518  [KO:K14276]
124851519  [KO:K14276]
124851520  [KO:K14276]
124851521  [KO:K14276]
124851522  [KO:K14276]
124851523  [KO:K14276]
124851524  [KO:K14276]
124851525  [KO:K14276]
124851526  [KO:K14276]
124851727  [KO:K14276]
124852126  [KO:K14280]
124852129  [KO:K14280]
124852135  [KO:K14280]
124852296  [KO:K14276]
124852297  [KO:K14276]
124852298  [KO:K14276]
124852299  [KO:K14276]
124852300  [KO:K14276]
124852301  [KO:K14276]
124852302  [KO:K14276]
124852303  [KO:K14276]
124852304  [KO:K14276]
124852305  [KO:K14276]
124852306  [KO:K14276]
124852307  [KO:K14276]
124852308  [KO:K14276]
124852310  [KO:K14276]
124852311  [KO:K14276]
124852312  [KO:K14276]
124852314  [KO:K14276]
124852317  [KO:K14276]
124852318  [KO:K14276]
124852319  [KO:K14276]
124852320  [KO:K14276]
124852321  [KO:K14276]
124852322  [KO:K14276]
124852324  [KO:K14276]
124852327  [KO:K14276]
124852650  [KO:K14277]
124852652  [KO:K14277]
124852655  [KO:K14277]
124852656  [KO:K14277]
124852659  [KO:K14277]
124852664  [KO:K14277]
124852667  [KO:K14277]
124852671  [KO:K14277]
124852676  [KO:K14277]
124852677  [KO:K14277]
124852678  [KO:K14277]
124852681  [KO:K14277]
124852685  [KO:K14277]
124852686  [KO:K14277]
124852690  [KO:K14277]
124852693  [KO:K14277]
124852694  [KO:K14277]
124852695  [KO:K14277]
124852700  [KO:K14277]
124852701  [KO:K14277]
124852704  [KO:K14277]
124852707  [KO:K14276]
124852712  [KO:K14277]
124852713  [KO:K14277]
124852718  [KO:K14277]
124852724  [KO:K14277]
124852725  [KO:K14277]
124852735  [KO:K14277]
124852736  [KO:K14277]
124852737  [KO:K14277]
124852740  [KO:K14277]
124852742  [KO:K14277]
124852743  [KO:K14277]
124852746  [KO:K14277]
124852751  [KO:K14277]
124852752  [KO:K14277]
124852756  [KO:K14277]
124852757  [KO:K14277]
124852759  [KO:K14277]
124852762  [KO:K14277]
124852770  [KO:K14277]
124852779  [KO:K14277]
124852804  [KO:K14277]
124852805  [KO:K14277]
124852806  [KO:K14277]
124852809  [KO:K14277]
124852811  [KO:K14277]
124852813  [KO:K14277]
124852818  [KO:K14276]
124852819  [KO:K14277]
124852823  [KO:K14277]
124852830  [KO:K14277]
124852831  [KO:K14277]
124852849  [KO:K14277]
124852853  [KO:K14277]
124852880  [KO:K14277]
124852881  [KO:K14277]
124852885  [KO:K14277]
124852891  [KO:K14277]
124852898  [KO:K14277]
124852904  [KO:K14277]
124852917  [KO:K14277]
124852926  [KO:K14277]
124852929  [KO:K14276]
124852932  [KO:K14277]
124852941  [KO:K14277]
124852942  [KO:K14277]
124852948  [KO:K14277]
124852950  [KO:K14277]
124852969  [KO:K14277]
124852978  [KO:K14277]
124852981  [KO:K14277]
124852989  [KO:K14277]
124852996  [KO:K14277]
124853000  [KO:K14277]
124853001  [KO:K14277]
124853011  [KO:K14277]
124853012  [KO:K14277]
124853015  [KO:K14277]
124853021  [KO:K14277]
124853025  [KO:K14277]
124853032  [KO:K14277]
124853036  [KO:K14276]
124853041  [KO:K14277]
124853045  [KO:K14277]
124853053  [KO:K14277]
124853057  [KO:K14277]
124853059  [KO:K14277]
124853062  [KO:K14277]
124853065  [KO:K14277]
124853069  [KO:K14277]
124853077  [KO:K14277]
124853098  [KO:K14277]
124853100  [KO:K14277]
124853101  [KO:K14277]
124853116  [KO:K14277]
124853138  [KO:K14277]
124853151  [KO:K14279]
124853152  [KO:K14279]
124853153  [KO:K14279]
124853154  [KO:K14279]
124853156  [KO:K14279]
124853157  [KO:K14279]
124853158  [KO:K14279]
124853159  [KO:K14279]
124853160  [KO:K14279]
124853161  [KO:K14279]
124853162  [KO:K14279]
124853163  [KO:K14279]
124853164  [KO:K14279]
124853165  [KO:K14279]
124853167  [KO:K14279]
124853168  [KO:K14279]
124853169  [KO:K14279]
124853170  [KO:K14279]
124853171  [KO:K14279]
124853172  [KO:K14279]
124853173  [KO:K14279]
124853174  [KO:K14279]
124853175  [KO:K14279]
124853177  [KO:K14279]
124853178  [KO:K14279]
124853179  [KO:K14279]
124853180  [KO:K14279]
124853181  [KO:K14279]
124853182  [KO:K14279]
124853183  [KO:K14279]
124853184  [KO:K14279]
124853185  [KO:K14279]
124853186  [KO:K14279]
124853188  [KO:K14279]
124853189  [KO:K14279]
124853190  [KO:K14279]
124853191  [KO:K14279]
124853192  [KO:K14279]
124853193  [KO:K14279]
124853194  [KO:K14279]
124853195  [KO:K14279]
124853196  [KO:K14279]
124853197  [KO:K14279]
124853199  [KO:K14279]
124853200  [KO:K14279]
124853201  [KO:K14279]
124853202  [KO:K14279]
124853203  [KO:K14279]
124853204  [KO:K14279]
124853205  [KO:K14279]
124853206  [KO:K14279]
124853207  [KO:K14279]
124853208  [KO:K14279]
124853210  [KO:K14279]
124853211  [KO:K14279]
124853212  [KO:K14279]
124853213  [KO:K14279]
124853214  [KO:K14279]
124853215  [KO:K14279]
124853216  [KO:K14279]
124853217  [KO:K14279]
124853218  [KO:K14279]
124853219  [KO:K14279]
124853221  [KO:K14279]
124853222  [KO:K14279]
124853223  [KO:K14279]
124853224  [KO:K14279]
124853225  [KO:K14279]
124853226  [KO:K14279]
124853227  [KO:K14279]
124853228  [KO:K14279]
124853229  [KO:K14279]
124853230  [KO:K14279]
124853232  [KO:K14279]
124853233  [KO:K14279]
124853234  [KO:K14279]
124853235  [KO:K14279]
124853236  [KO:K14279]
124853237  [KO:K14279]
124853238  [KO:K14279]
124853239  [KO:K14279]
124853240  [KO:K14279]
124853241  [KO:K14279]
124853243  [KO:K14279]
124853245  [KO:K14279]
124853247  [KO:K14279]
124853248  [KO:K14276]
124853249  [KO:K14279]
124853250  [KO:K14279]
124853251  [KO:K14279]
124853254  [KO:K14277]
124853256  [KO:K14279]
124853257  [KO:K14279]
124853258  [KO:K14279]
124853259  [KO:K14279]
124853261  [KO:K14279]
124853262  [KO:K14279]
124853263  [KO:K14279]
124853264  [KO:K14279]
124853266  [KO:K14279]
124853267  [KO:K14279]
124853268  [KO:K14279]
124853269  [KO:K14279]
124853270  [KO:K14279]
124853271  [KO:K14279]
124853272  [KO:K14279]
124853273  [KO:K14279]
124853274  [KO:K14279]
124853275  [KO:K14279]
124853276  [KO:K14277]
124853277  [KO:K14279]
124853278  [KO:K14279]
124853279  [KO:K14279]
124853309  [KO:K14277]
124853315  [KO:K14279]
124853317  [KO:K14279]
124853318  [KO:K14279]
124853319  [KO:K14279]
124853320  [KO:K14277]
124853321  [KO:K14279]
124853322  [KO:K14279]
124853323  [KO:K14279]
124853324  [KO:K14279]
124853325  [KO:K14279]
124853326  [KO:K14279]
124853327  [KO:K14279]
124853330  [KO:K14279]
124853332  [KO:K14279]
124853333  [KO:K14279]
124853334  [KO:K14279]
124853335  [KO:K14279]
124853337  [KO:K14279]
124853345  [KO:K14279]
124853346  [KO:K14279]
124853348  [KO:K14279]
124853349  [KO:K14279]
124853350  [KO:K14279]
124853356  [KO:K14279]
124853357  [KO:K14279]
124853358  [KO:K14276]
124853360  [KO:K14279]
124853361  [KO:K14279]
124853362  [KO:K14279]
124853363  [KO:K14279]
124853364  [KO:K14277]
124853365  [KO:K14279]
124853367  [KO:K14279]
124853368  [KO:K14279]
124853369  [KO:K14279]
124853374  [KO:K14277]
124853378  [KO:K14279]
124853379  [KO:K14279]
124853380  [KO:K14279]
124853381  [KO:K14279]
124853382  [KO:K14279]
124853383  [KO:K14279]
124853384  [KO:K14279]
124853386  [KO:K14279]
124853387  [KO:K14279]
124853388  [KO:K14279]
124853389  [KO:K14279]
124853392  [KO:K14279]
124853393  [KO:K14279]
124853394  [KO:K14279]
124853395  [KO:K14279]
124853396  [KO:K14277]
124853397  [KO:K14279]
124853398  [KO:K14279]
124853399  [KO:K14279]
124853400  [KO:K14279]
124853401  [KO:K14279]
124853402  [KO:K14279]
124853403  [KO:K14279]
124853404  [KO:K14279]
124853405  [KO:K14279]
124853406  [KO:K14279]
124853407  [KO:K14277]
124853408  [KO:K14279]
124853409  [KO:K14279]
124853410  [KO:K14279]
124853411  [KO:K14279]
124853412  [KO:K14279]
124853413  [KO:K14279]
124853414  [KO:K14279]
124853415  [KO:K14279]
124853416  [KO:K14279]
124853417  [KO:K14279]
124853418  [KO:K14277]
124853419  [KO:K14279]
124853420  [KO:K14279]
124853421  [KO:K14279]
124853422  [KO:K14279]
124853423  [KO:K14279]
124853424  [KO:K14279]
124853426  [KO:K14279]
124853427  [KO:K14279]
124853428  [KO:K14279]
124853429  [KO:K14277]
124853430  [KO:K14279]
124853431  [KO:K14279]
124853433  [KO:K14279]
124853435  [KO:K14279]
124853436  [KO:K14279]
124853437  [KO:K14279]
124853438  [KO:K14279]
124853439  [KO:K14279]
124853440  [KO:K14279]
124853441  [KO:K14277]
124853442  [KO:K14279]
124853443  [KO:K14279]
124853444  [KO:K14279]
124853445  [KO:K14279]
124853446  [KO:K14279]
124853447  [KO:K14279]
124853448  [KO:K14279]
124853449  [KO:K14279]
124853450  [KO:K14279]
124853451  [KO:K14279]
124853452  [KO:K14277]
124853453  [KO:K14279]
124853454  [KO:K14279]
124853455  [KO:K14279]
124853456  [KO:K14279]
124853457  [KO:K14279]
124853458  [KO:K14279]
124853459  [KO:K14279]
124853460  [KO:K14279]
124853463  [KO:K14277]
124853464  [KO:K14279]
124853465  [KO:K14279]
124853467  [KO:K14279]
124853468  [KO:K14279]
124853470  [KO:K14279]
124853471  [KO:K14279]
124853472  [KO:K14279]
124853473  [KO:K14279]
124853475  [KO:K14277]
124853477  [KO:K14279]
124853480  [KO:K14279]
124853481  [KO:K14279]
124853482  [KO:K14279]
124853483  [KO:K14279]
124853484  [KO:K14279]
124853486  [KO:K14279]
124853489  [KO:K14279]
124853490  [KO:K14279]
124853491  [KO:K14279]
124853492  [KO:K14279]
124853497  [KO:K14279]
124853498  [KO:K14277]
124853500  [KO:K14279]
124853501  [KO:K14279]
124853503  [KO:K14279]
124853504  [KO:K14279]
124853505  [KO:K14279]
124853509  [KO:K14277]
124853519  [KO:K14279]
124853520  [KO:K14277]
124853521  [KO:K14279]
124853522  [KO:K14279]
124853523  [KO:K14279]
124853525  [KO:K14279]
124853528  [KO:K14279]
124853529  [KO:K14279]
124853531  [KO:K14277]
124853532  [KO:K14279]
124853533  [KO:K14279]
124853534  [KO:K14279]
124853535  [KO:K14279]
124853536  [KO:K14279]
124853538  [KO:K14279]
124853541  [KO:K14279]
124853543  [KO:K14279]
124853547  [KO:K14279]
124853548  [KO:K14279]
124853549  [KO:K14279]
124853550  [KO:K14279]
124853553  [KO:K14277]
124853554  [KO:K14279]
124853557  [KO:K14279]
124853559  [KO:K14279]
124853564  [KO:K14277]
124853566  [KO:K14279]
124853567  [KO:K14279]
124853568  [KO:K14279]
124853571  [KO:K14279]
124853572  [KO:K14279]
124853574  [KO:K14277]
124853575  [KO:K14279]
124853577  [KO:K14279]
124853578  [KO:K14279]
124853579  [KO:K14279]
124853580  [KO:K14276]
124853582  [KO:K14279]
124853583  [KO:K14279]
124853584  [KO:K14279]
124853586  [KO:K14277]
124853590  [KO:K14279]
124853591  [KO:K14279]
124853593  [KO:K14279]
124853595  [KO:K14279]
124853596  [KO:K14279]
124853597  [KO:K14277]
124853598  [KO:K14279]
124853599  [KO:K14279]
124853600  [KO:K14279]
124853601  [KO:K14279]
124853602  [KO:K14279]
124853603  [KO:K14279]
124853605  [KO:K14279]
124853606  [KO:K14279]
124853608  [KO:K14277]
124853611  [KO:K14279]
124853612  [KO:K14279]
124853613  [KO:K14279]
124853614  [KO:K14279]
124853615  [KO:K14279]
124853616  [KO:K14279]
124853618  [KO:K14279]
124853621  [KO:K14279]
124853622  [KO:K14279]
124853623  [KO:K14279]
124853625  [KO:K14279]
124853631  [KO:K14279]
124853632  [KO:K14279]
124853633  [KO:K14279]
124853634  [KO:K14279]
124853635  [KO:K14279]
124853636  [KO:K14279]
124853638  [KO:K14279]
124853639  [KO:K14279]
124853643  [KO:K14279]
124853644  [KO:K14279]
124853645  [KO:K14279]
124853646  [KO:K14279]
124853647  [KO:K14279]
124853648  [KO:K14279]
124853649  [KO:K14279]
124853651  [KO:K14279]
124853653  [KO:K14279]
124853654  [KO:K14279]
124853655  [KO:K14279]
124853656  [KO:K14279]
124853657  [KO:K14279]
124853658  [KO:K14279]
124853659  [KO:K14279]
124853661  [KO:K14279]
124853662  [KO:K14279]
124853663  [KO:K14277]
124853664  [KO:K14279]
124853665  [KO:K14279]
124853667  [KO:K14279]
124853668  [KO:K14279]
124853669  [KO:K14279]
124853671  [KO:K14279]
124853675  [KO:K14279]
124853676  [KO:K14279]
124853677  [KO:K14279]
124853679  [KO:K14279]
124853680  [KO:K14279]
124853684  [KO:K14279]
124853685  [KO:K14277]
124853686  [KO:K14279]
124853688  [KO:K14279]
124853691  [KO:K14276]
124853692  [KO:K14279]
124853693  [KO:K14279]
124853694  [KO:K14279]
124853695  [KO:K14279]
124853696  [KO:K14279]
124853697  [KO:K14277]
124853698  [KO:K14279]
124853699  [KO:K14279]
124853700  [KO:K14279]
124853701  [KO:K14279]
124853702  [KO:K14279]
124853703  [KO:K14279]
124853706  [KO:K14279]
124853709  [KO:K14279]
124853710  [KO:K14279]
124853712  [KO:K14279]
124853713  [KO:K14279]
124853714  [KO:K14279]
124853715  [KO:K14279]
124853717  [KO:K14279]
124853718  [KO:K14279]
124853720  [KO:K14279]
124853721  [KO:K14279]
124853722  [KO:K14279]
124853724  [KO:K14279]
124853733  [KO:K14279]
124853734  [KO:K14279]
124853736  [KO:K14279]
124853742  [KO:K14277]
124853745  [KO:K14279]
124853746  [KO:K14279]
124853747  [KO:K14279]
124853748  [KO:K14276]
124853749  [KO:K14279]
124853750  [KO:K14279]
124853752  [KO:K14279]
124853759  [KO:K14279]
124853760  [KO:K14279]
124853761  [KO:K14279]
124853765  [KO:K14277]
124853766  [KO:K14279]
124853768  [KO:K14279]
124853769  [KO:K14279]
124853770  [KO:K14279]
124853773  [KO:K14279]
124853774  [KO:K14279]
124853775  [KO:K14279]
124853776  [KO:K14277]
124853779  [KO:K14279]
124853780  [KO:K14279]
124853781  [KO:K14279]
124853782  [KO:K14279]
124853785  [KO:K14279]
124853786  [KO:K14279]
124853787  [KO:K14277]
124853788  [KO:K14279]
124853789  [KO:K14279]
124853790  [KO:K14279]
124853791  [KO:K14279]
124853793  [KO:K14279]
124853794  [KO:K14279]
124853795  [KO:K14279]
124853798  [KO:K14277]
124853799  [KO:K14279]
124853800  [KO:K14279]
124853801  [KO:K14279]
124853802  [KO:K14279]
124853804  [KO:K14276]
124853810  [KO:K14277]
124853811  [KO:K14279]
124853812  [KO:K14279]
124853815  [KO:K14279]
124853818  [KO:K14279]
124853821  [KO:K14277]
124853822  [KO:K14279]
124853827  [KO:K14279]
124853828  [KO:K14279]
124853830  [KO:K14279]
124853833  [KO:K14279]
124853839  [KO:K14279]
124853844  [KO:K14279]
124853845  [KO:K14279]
124853846  [KO:K14279]
124853847  [KO:K14279]
124853852  [KO:K14279]
124853853  [KO:K14277]
124853856  [KO:K14279]
124853857  [KO:K14279]
124853858  [KO:K14279]
124853860  [KO:K14279]
124853862  [KO:K14279]
124853863  [KO:K14279]
124853866  [KO:K14279]
124853868  [KO:K14279]
124853869  [KO:K14279]
124853870  [KO:K14279]
124853871  [KO:K14279]
124853872  [KO:K14279]
124853878  [KO:K14279]
124853879  [KO:K14279]
124853881  [KO:K14279]
124853882  [KO:K14279]
124853883  [KO:K14279]
124853884  [KO:K14279]
124853886  [KO:K14277]
124853887  [KO:K14279]
124853888  [KO:K14279]
124853889  [KO:K14279]
124853891  [KO:K14279]
124853898  [KO:K14279]
124853901  [KO:K14279]
124853903  [KO:K14279]
124853904  [KO:K14279]
124853905  [KO:K14279]
124853906  [KO:K14279]
124853907  [KO:K14279]
124853909  [KO:K14279]
124853912  [KO:K14279]
124853916  [KO:K14279]
124853917  [KO:K14279]
124853919  [KO:K14279]
124853922  [KO:K14279]
124853924  [KO:K14279]
124853928  [KO:K14279]
124853932  [KO:K14279]
124853933  [KO:K14279]
124853934  [KO:K14279]
124853935  [KO:K14279]
124853938  [KO:K14279]
124853939  [KO:K14279]
124853940  [KO:K14279]
124853942  [KO:K14277]
124853945  [KO:K14279]
124853946  [KO:K14279]
124853947  [KO:K14279]
124853948  [KO:K14279]
124853949  [KO:K14279]
124853953  [KO:K14277]
124853954  [KO:K14279]
124853957  [KO:K14279]
124853958  [KO:K14279]
124853959  [KO:K14279]
124853967  [KO:K14279]
124853970  [KO:K14279]
124853971  [KO:K14279]
124853978  [KO:K14279]
124853983  [KO:K14279]
124853994  [KO:K14279]
124853995  [KO:K14277]
124853996  [KO:K14279]
124853998  [KO:K14279]
124854004  [KO:K14279]
124854006  [KO:K14277]
124854007  [KO:K14279]
124854010  [KO:K14279]
124854013  [KO:K14279]
124854015  [KO:K14279]
124854016  [KO:K14277]
124854017  [KO:K14279]
124854022  [KO:K14276]
124854028  [KO:K14277]
124854036  [KO:K14279]
124854039  [KO:K14277]
124854041  [KO:K14279]
124854042  [KO:K14279]
124854047  [KO:K14279]
124854050  [KO:K14277]
124854058  [KO:K14279]
124854061  [KO:K14277]
124854062  [KO:K14279]
124854064  [KO:K14279]
124854074  [KO:K14279]
124854080  [KO:K14279]
124854082  [KO:K14279]
124854089  [KO:K14276]
124854090  [KO:K14277]
124854091  [KO:K14277]
124854092  [KO:K14277]
124854093  [KO:K14277]
124854094  [KO:K14277]
124854095  [KO:K14277]
124854096  [KO:K14277]
124854097  [KO:K14277]
124854099  [KO:K14277]
124854100  [KO:K14276]
124854101  [KO:K14277]
124854106  [KO:K14277]
124854107  [KO:K14277]
124854109  [KO:K14277]
124854111  [KO:K14276]
124854113  [KO:K14277]
124854114  [KO:K14277]
124854115  [KO:K14277]
124854117  [KO:K14277]
124854118  [KO:K14277]
124854122  [KO:K14276]
124854123  [KO:K14277]
124854124  [KO:K14277]
124854128  [KO:K14277]
124854129  [KO:K14277]
124854130  [KO:K14277]
124854131  [KO:K14277]
124854132  [KO:K14277]
124854133  [KO:K14276]
124854134  [KO:K14277]
124854137  [KO:K14277]
124854138  [KO:K14277]
124854140  [KO:K14277]
124854141  [KO:K14277]
124854143  [KO:K14277]
124854145  [KO:K14277]
124854146  [KO:K14277]
124854149  [KO:K14277]
124854151  [KO:K14277]
124854152  [KO:K14277]
124854155  [KO:K14276]
124854159  [KO:K14277]
124854160  [KO:K14277]
124854162  [KO:K14277]
124854163  [KO:K14277]
124854164  [KO:K14277]
124854165  [KO:K14277]
124854166  [KO:K14276]
124854168  [KO:K14277]
124854169  [KO:K14277]
124854170  [KO:K14277]
124854177  [KO:K14276]
124854179  [KO:K14277]
124854180  [KO:K14277]
124854185  [KO:K14277]
124854189  [KO:K14277]
124854190  [KO:K14277]
124854196  [KO:K14277]
124854197  [KO:K14277]
124854200  [KO:K14277]
124854203  [KO:K14277]
124854206  [KO:K14277]
124854208  [KO:K14277]
124854210  [KO:K14276]
124854211  [KO:K14277]
124854212  [KO:K14277]
124854213  [KO:K14277]
124854214  [KO:K14277]
124854215  [KO:K14277]
124854218  [KO:K14277]
124854224  [KO:K14277]
124854225  [KO:K14277]
124854227  [KO:K14277]
124854228  [KO:K14277]
124854231  [KO:K14277]
124854232  [KO:K14276]
124854235  [KO:K14277]
124854238  [KO:K14277]
124854239  [KO:K14277]
124854244  [KO:K14277]
124854249  [KO:K14277]
124854251  [KO:K14277]
124854253  [KO:K14277]
124854254  [KO:K14277]
124854256  [KO:K14277]
124854257  [KO:K14277]
124854258  [KO:K14277]
124854259  [KO:K14277]
124854261  [KO:K14277]
124854262  [KO:K14277]
124854265  [KO:K14277]
124854267  [KO:K14277]
124854271  [KO:K14276]
124854272  [KO:K14277]
124854275  [KO:K14277]
124854277  [KO:K14277]
124854282  [KO:K14277]
124854284  [KO:K14277]
124854288  [KO:K14277]
124854289  [KO:K14277]
124854295  [KO:K14277]
124854296  [KO:K14277]
124854297  [KO:K14277]
124854299  [KO:K14277]
124854302  [KO:K14277]
124854303  [KO:K14277]
124854306  [KO:K14277]
124854308  [KO:K14277]
124854310  [KO:K14277]
124854311  [KO:K14277]
124854316  [KO:K14277]
124854319  [KO:K14277]
124854321  [KO:K14277]
124854326  [KO:K14277]
124854327  [KO:K14277]
124854328  [KO:K14277]
124854332  [KO:K14277]
124854336  [KO:K14277]
124854343  [KO:K14277]
124854344  [KO:K14277]
124854350  [KO:K14277]
124854354  [KO:K14277]
124854356  [KO:K14277]
124854357  [KO:K14277]
124854358  [KO:K14277]
124854360  [KO:K14277]
124854363  [KO:K14277]
124854365  [KO:K14277]
124854366  [KO:K14277]
124854368  [KO:K14277]
124854369  [KO:K14277]
124854370  [KO:K14277]
124854371  [KO:K14277]
124854372  [KO:K14277]
124854377  [KO:K14277]
124854379  [KO:K14277]
124854381  [KO:K14277]
124854382  [KO:K14276]
124854385  [KO:K14277]
124854388  [KO:K14277]
124854389  [KO:K14277]
124854397  [KO:K14277]
124854399  [KO:K14277]
124854405  [KO:K14277]
124854406  [KO:K14277]
124854407  [KO:K14277]
124854410  [KO:K14277]
124854412  [KO:K14277]
124854418  [KO:K14277]
124854419  [KO:K14277]
124854420  [KO:K14277]
124854421  [KO:K14277]
124854423  [KO:K14277]
124854429  [KO:K14277]
124854432  [KO:K14277]
124854906  zmat2; zinc finger matrin-type protein 2 [KO:K12848]
Reference
PMID:19239890
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
PMID:10978320
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
PMID:17537823
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
PMID:19733268
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
Reference
PMID:28781166
  Authors
Bertram K, Agafonov DE, Dybkov O, Haselbach D, Leelaram MN, Will CL, Urlaub H, Kastner B, Luhrmann R, Stark H
  Title
Cryo-EM Structure of a Pre-catalytic Human Spliceosome Primed for Activation.
  Journal
Cell 170:701-713.e11 (2017)
DOI:10.1016/j.cell.2017.07.011
Reference
PMID:29360106
  Authors
Zhang X, Yan C, Zhan X, Li L, Lei J, Shi Y
  Title
Structure of the human activated spliceosome in three conformational states.
  Journal
Cell Res 28:307-322 (2018)
DOI:10.1038/cr.2018.14
Reference
PMID:29361316
  Authors
Haselbach D, Komarov I, Agafonov DE, Hartmuth K, Graf B, Dybkov O, Urlaub H, Kastner B, Luhrmann R, Stark H
  Title
Structure and Conformational Dynamics of the Human Spliceosomal B(act) Complex.
  Journal
Cell 172:454-464.e11 (2018)
DOI:10.1016/j.cell.2018.01.010
Reference
PMID:39068178
  Authors
Zhan X, Lu Y, Shi Y
  Title
Molecular basis for the activation of human spliceosome.
  Journal
Nat Commun 15:6348 (2024)
DOI:10.1038/s41467-024-50785-0
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system