KEGG   ORTHOLOGY: K00058
Entry
K00058                      KO                                     
Symbol
serA, PHGDH
Name
D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase [EC:1.1.1.95 1.1.1.399]
Pathway
map00260  Glycine, serine and threonine metabolism
map00270  Cysteine and methionine metabolism
map00680  Methane metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
map01200  Carbon metabolism
map01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00020  Serine biosynthesis, glycerate-3P => serine
Reaction
R01513  3-phospho-D-glycerate:NAD+ 2-oxidoreductase
Disease
H01079  3-Phosphoglycerate dehydrogenase (3-PGDH) deficiency
H02117  Neu-Laxova syndrome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
   00270 Cysteine and methionine metabolism
    K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.1  Acting on the CH-OH group of donors
   1.1.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.1.1.95  phosphoglycerate dehydrogenase
     K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
    1.1.1.399  2-oxoglutarate reductase
     K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
   K00058  serA, PHGDH; D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
Other DBs
COG: COG0111
GO: 0004617
Genes
HSA: 26227(PHGDH)
PTR: 739534(PHGDH)
PPS: 100985690(PHGDH)
GGO: 101143650(PHGDH)
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MCF: 102128351(PHGDH)
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OOR: 101284785(PHGDH)
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DDP: 132422322(PHGDH)
DLE: 111179962(PHGDH)
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SHON: 118981934(PHGDH)
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TACU: 119938499(PHGDH)
GGA: 424381(PHGDH)
PCOC: 116230519(PHGDH)
MGP: 100540490(PHGDH)
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LSR: 110478936(PHGDH)
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PND: Pla175_10680(serA_1) Pla175_40290
AMOB: HG15A2_07980(hprA_1) HG15A2_24150(serA_1) HG15A2_35490(serA_2)
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PLH: VT85_06310(serA_1) VT85_12510(serA_2)
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GAX: Pan161_30730(serA_3) Pan161_43950(hprA_1)
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SDYN: Mal52_04300(serA) Mal52_57520(vanH)
PLON: Pla110_07280(serA_1) Pla110_35780(hprA)
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TPOL: Mal48_42300(hprA_2) Mal48_46940(serA_2)
CHYA: V22_07400(serA_1) V22_24840(serA_2)
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DDT: AAY81_03875
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ERZ: ER308_10420
EUZ: DVS28_a3633
MTU: Rv0728c(serA2) Rv2996c(serA1)
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MTF: TBFG_10742 TBFG_13011
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MTE: CCDC5079_0674 CCDC5079_2751
MTUR: CFBS_0764(serA2) CFBS_3159(serA1)
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MTO: MTCTRI2_0744(serA2) MTCTRI2_3057(serA1)
MTD: UDA_0728c(serA2) UDA_2996c(serA1)
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MTJ: J112_03890 J112_16035
MTUB: MT7199_0747 MT7199_3032
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MTX: M943_03790 M943_15440
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MTUL: TBHG_00722 TBHG_02926
MTUT: HKBT1_0764(serA2) HKBT1_3146(serA1)
MTUU: HKBT2_0765(serA2) HKBT2_3151(serA1)
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MBO: BQ2027_MB0749C(serA2) BQ2027_MB3020C(serA1)
MBB: BCG_0778c(serA2) BCG_3017c(serA1)
MBT: JTY_0748(serA2) JTY_3012(serA1)
MBM: BCGMEX_0749c(serA2) BCGMEX_3013c(serA1)
MBK: K60_007760 K60_031060
MBX: BCGT_0522 BCGT_2836
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MMIC: RN08_0809 RN08_3306
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MCQ: BN44_10806(serA) BN44_60480(serA)
MCV: BN43_20170(serA) BN43_40705(serA)
MCX: BN42_20487(serA) BN42_41003(serA)
MCZ: BN45_10835(serA) BN45_51416(serA)
MORY: MO_000775(serA) MO_003134(serA)
MLE: ML1692(serA)
MLB: MLBr01692(serA)
MPA: MAP_3033c(serA) MAP_4194c
MAO: MAP4_0767 MAP4_4319
MAVI: RC58_03750 RC58_21455
MAVU: RE97_03755 RE97_21505
MAV: MAV_3847(serA) MAV_4438
MAVM: MAA44156_00854(serA_1) MAA44156_02439(serA_2) MAA44156_03881(yoaD)
MIT: OCO_19330 OCO_36660 OCO_43280
MIA: OCU_19540 OCU_36700 OCU_43050
MID: MIP_02723 MIP_05546 MIP_06499
MYO: OEM_17260 OEM_37300 OEM_43520
MCHI: AN480_09940 AN480_19375 AN480_22570
MIR: OCQ_18030 OCQ_37860 OCQ_44400
MMAL: CKJ54_08345 CKJ54_17370 CKJ54_20590
MLP: MLM_3055
MMAN: MMAN_01170(serA) MMAN_31430(serA2)
MSER: MTY59_06670(serA2) MTY59_54380(serA)
MSA: Mycsm_01043 Mycsm_02247
MUL: MUL_0823(serA2) MUL_1952(serA1)
MMI: MMAR_1065(serA2) MMAR_1715(serA1)
MMAE: MMARE11_10220(serA2) MMARE11_16340(serA1)
MLI: MULP_01197(serA2) MULP_01867(serA)
MPSE: MPSD_12070(serA2) MPSD_41260(serA)
MSHO: MSHO_28620(serA2) MSHO_55300(serA)
MMC: Mmcs_1910
MKM: Mkms_1956
MJL: Mjls_1890
MMM: W7S_09100 W7S_18340 W7S_21625
MKN: MKAN_19810 MKAN_23555
MYV: G155_11430
MYE: AB431_10415 AB431_14490
MHAD: B586_15675 B586_18585
MDX: BTO20_23485
MSHG: MSG_00949(serA2) MSG_01576(serA)
MFJ: MFLOJ_17270(serA) MFLOJ_25280(serA2)
MSTO: MSTO_18930(serA_1) MSTO_28510(serA2)
MSIM: MSIM_08260(serA) MSIM_15610(serA2) MSIM_35770
MSAK: MSAS_45490(serA2) MSAS_53250(serA_2)
MKU: I2456_08745
MLW: MJO58_04995 MJO58_08545(serA)
MXE: MYXE_33940(serA_1) MYXE_39470(serA2)
MNV: MNVI_25780(serA2) MNVI_31350(serA_2)
MPAG: C0J29_05850 C0J29_10030
MNM: MNVM_33310(serA)
MGOR: H0P51_05315 H0P51_08320 H0P51_09410
MCOO: MCOO_42220(serA2) MCOO_49380(serA_2)
MBAI: MB901379_00925(yoaD) MB901379_01525(serA_2)
MSEO: MSEO_03890(serA_1) MSEO_48800(serA2)
MHEK: JMUB5695_02461(serA_1) JMUB5695_03365(serA_2) JMUB5695_03861(serA2)
MGAU: MGALJ_03370 MGALJ_05730(serA) MGALJ_55290(serA2)
MLJ: MLAC_29280(serA) MLAC_34270(serA2)
MBRD: MBRA_06010(serA2) MBRA_48480(serA)
MSHJ: MSHI_06830(serA) MSHI_27120(serA2)
MMAM: K3U93_04530 K3U93_07575(serA)
MSPG: F6B93_04495 F6B93_06930 F6B93_19330
MOT: LTS72_16575(serA)
MLM: MLPF_0979(serA)
MPAA: MKK62_09765 MKK62_16485(serA) MKK62_19885
MMEH: M5I08_05385(serA)
MKY: IWGMT90018_18570(serA)
MADI: A7U43_20425
MWU: PT015_01480(serA) PT015_09790 PT015_22570
MYW: BVC93_00070
MYJ: BCA37_11940
MSM: MSMEG_2378(serA)
MSG: MSMEI_2318(serA)
MSB: LJ00_11825
MSN: LI99_11825
MSH: LI98_11830
MVA: Mvan_2128
MGI: Mflv_4234
MSP: Mspyr1_35790
MCB: Mycch_1844
MNE: D174_10635
MYN: MyAD_10425
MFT: XA26_23550
MPHL: MPHLCCUG_02051(serA_1)
MVQ: MYVA_2015(serA)
MLL: B1R94_18735
MRH: MycrhN_0662 MycrhN_5919 MycrhN_6178
MTHN: 4412656_01295(ghrB) 4412656_01551(serA_2)
MHAS: MHAS_00748 MHAS_00942(serA)
MDU: MDUV_10280 MDUV_23980(serA)
MCHT: MCHIJ_46000(serA_2)
MDR: MDOR_12980(serA)
MAUU: NCTC10437_01979(serA_3)
MMAG: MMAD_20920(serA_3)
MMOR: MMOR_43690(serA) MMOR_46540 MMOR_53720(serA2)
MFX: MFAL_02020(serA)
MAIC: MAIC_17940(serA_2)
MIJ: MINS_19840(serA)
MALV: MALV_15780(serA_1)
MTY: MTOK_39470(serA_3)
MPSC: MPSYJ_45360(serA)
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MHEV: MHEL_42460(serA_2)
MSAR: MSAR_00010 MSAR_48740(serA_2)
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MPOF: MPOR_24620(serA)
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MMAT: MMAGJ_53620(serA_3)
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MFG: K6L26_20905(serA)
MSEI: MSEDJ_33100(serA_3)
MFLV: NCTC10271_03412(serA) NCTC10271_04763(ghrB)
MCEE: MCEL_16430(serA)
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MMON: EWR22_09690
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MHOL: K3U96_17245(serA) K3U96_20970 K3U96_24650
MSEN: K3U95_18345(serA)
MPAE: K0O64_10050(serA)
MRF: MJO55_09575(serA)
MDF: K0O62_10670(serA)
MCRO: MI149_10940(serA)
MGRO: FZ046_10730 FZ046_15730
MAUS: JN090_09590
MFRE: EXE63_04135
MBUG: MU0053_003271(serA)
MYQ: TUM20985_37540(serA_2)
MFLU: HZU40_15405
MYH: QU592_11110(serA)
MPAT: MPNTM1_04100 MPNTM1_04930(serA)
MKR: MKOR_17620(serA)
MPAK: MIU77_12785(serA)
MAB: MAB_3304c
MMV: MYCMA_1819
MABB: MASS_3249
MABL: MMASJCM_3311
MCHE: BB28_16680
MIZ: BAB75_17645
MSTE: MSTE_03283
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MJD: JDM601_2718(serA1)
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MHER: K3U94_15545(serA)
MVM: MJO54_15500(serA)
MKK: MU0083_002522(serA)
ASD: AS9A_2883 AS9A_3192(serA2)
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CGJ: AR0_06900
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CEF: CE1379
CDI: DIP1104(serA)
CDP: CD241_1014(serA)
CDH: CDB402_0981(serA)
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CDB: CDBH8_1084(serA)
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CKP: ckrop_1236
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CSAN: E3227_10170
CGK: CGERO_04875(serA)
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CPRE: Csp1_10850(serA)
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CCYS: SAMEA4530656_1298(serA)
CMAT: HBA49_12435
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CCOE: CETAM_05775(serA)
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CWK: IA203_05735
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CPOY: GP475_05175
CACC: CACC_05580(serA)
CFY: I6L56_00825(serA)
CPSL: KBP54_05175(serA)
CHIN: J5O04_09080
CJH: CJEDD_05745(serA)
CPSP: L9H27_04595(serA)
CMAS: CMASS_04665(serA)
CHEI: CHEID_06555(serA)
CHAD: CHAD_05515(serA)
CFG: CFREI_05750(serA)
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Reference
PMID:7719856
  Authors
Schuller DJ, Grant GA, Banaszak LJ
  Title
The allosteric ligand site in the Vmax-type cooperative enzyme phosphoglycerate dehydrogenase.
  Journal
Nat Struct Biol 2:69-76 (1995)
DOI:10.1038/nsb0195-69
  Sequence
[eco:b2913]
Reference
PMID:8550422
  Authors
Zhao G, Winkler ME
  Title
A novel alpha-ketoglutarate reductase activity of the serA-encoded 3-phosphoglycerate dehydrogenase of Escherichia coli K-12 and its possible implications for human 2-hydroxyglutaric aciduria.
  Journal
J Bacteriol 178:232-9 (1996)
DOI:10.1128/JB.178.1.232-239.1996
  Sequence
[eco:b2913]
LinkDB

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