KEGG   PATHWAY: twl03040
Entry
twl03040                    Pathway                                
Name
Spliceosome - Tripterygium wilfordii (thunder duke vine)
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
twl03040  Spliceosome
twl03040

Other DBs
GO: 0005681
Organism
Tripterygium wilfordii (thunder duke vine) [GN:twl]
Gene
119979959  [KO:K12741]
119980066  [KO:K12876]
119980152  [KO:K14276]
119980164  [KO:K14278]
119980254  [KO:K12625]
119980388  [KO:K12741]
119980487  [KO:K12878]
119980827  [KO:K12874]
119980853  [KO:K03283]
119981038  [KO:K11086]
119981104  [KO:K03283]
119981122  [KO:K12857]
119981189  [KO:K12869]
119981262  [KO:K11097]
119981303  [KO:K12625]
119981307  [KO:K12872]
119981556  [KO:K14276]
119981558  [KO:K14277]
119981560  [KO:K14278]
119981561  [KO:K14279]
119981562  [KO:K14280]
119981769  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
119981792  [KO:K12821]
119982140  [KO:K12891]
119982162  [KO:K12877]
119982260  [KO:K12624]
119982321  [KO:K12621]
119982464  [KO:K12623]
119982474  [KO:K11096]
119982490  [KO:K11087]
119982503  [KO:K12828]
119982565  [KO:K03283]
119982638  [KO:K12893]
119982956  [KO:K12883]
119983207  [KO:K14279]
119983208  [KO:K14279]
119983209  [KO:K14280]
119983334  [KO:K11091]
119983531  [KO:K12897]
119983619  [KO:K12890]
119983659  [KO:K12623]
119983672  [KO:K11095]
119983716  [KO:K11087]
119983731  [KO:K11096]
119983746  [KO:K12827]
119983806  [KO:K12626]
119983861  [KO:K14276]
119983878  [KO:K12891]
119983943  [KO:K12890]
119983955  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
119984148  [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
119984180  [KO:K12893]
119984340  [KO:K12879]
119984395  [KO:K12817]
119984671  [KO:K12839]
119984907  [KO:K14277]
119984919  [KO:K14279]
119984920  [KO:K14279]
119985168  [KO:K12880]
119985275  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
119985331  [KO:K12741]
119985678  [KO:K12863]
119985717  [KO:K12893]
119985807  [KO:K12834]
119985915  [KO:K12882]
119985916  [KO:K12890]
119985947  [KO:K12741]
119986251  [KO:K11099]
119986364  [KO:K14279]
119986497  [KO:K12627]
119986617  [KO:K12825]
119986647  [KO:K12861]
119987224  [KO:K12871]
119987267  [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
119987337  [KO:K11086]
119987514  [KO:K12741]
119987674  [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
119987886  [KO:K12830]
119988090  [KO:K12880]
119988162  [KO:K12849]
119988543  [KO:K12834]
119988631  [KO:K12863]
119988707  [KO:K03283]
119989028  [KO:K12843]
119989095  [KO:K12873]
119989107  [KO:K12741]
119989161  [KO:K12897]
119989200  [KO:K12741]
119989252  [KO:K03283]
119989483  [KO:K12837]
119989501  [KO:K12845]
119989525  [KO:K12741]
119989574  [KO:K12900]
119989651  [KO:K12847]
119989939  [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
119990160  [KO:K12829]
119990191  [KO:K12881]
119990245  [KO:K14277]
119990246  [KO:K14280]
119990247  [KO:K14280]
119990474  [KO:K12826]
119990516  [KO:K12833]
119990582  [KO:K03283]
119990729  [KO:K11092]
119990939  [KO:K12836]
119991056  [KO:K12830]
119991234  [KO:K13098]
119991279  [KO:K03283]
119991306  [KO:K12741]
119991321  [KO:K12859]
119991622  [KO:K12896]
119991628  [KO:K12741]
119991656  [KO:K11092]
119991668  [KO:K12872]
119991747  [KO:K12856]
119991779  [KO:K12870]
119991811  [KO:K12844]
119992027  [KO:K12822]
119992178  [KO:K12831]
119992201  [KO:K12881]
119992290  [KO:K12881]
119992331  [KO:K14276]
119992335  [KO:K14279]
119992342  [KO:K14276]
119992353  [KO:K14276]
119992370  [KO:K14278]
119992515  [KO:K12846]
119992534  [KO:K12896]
119992971  [KO:K11098]
119992986  [KO:K03283]
119993195  [KO:K11984]
119993351  [KO:K12836]
119993404  [KO:K12876]
119993440  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
119993544  [KO:K12845]
119993599  [KO:K12842]
119993636  [KO:K12900]
119993891  [KO:K14276]
119993903  [KO:K14276]
119993914  [KO:K14277]
119993919  [KO:K14280]
119994970  [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
119995016  [KO:K12875]
119995070  [KO:K12741]
119995150  [KO:K12850]
119995240  [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
119995278  [KO:K12662]
119995290  [KO:K12896]
119995495  [KO:K12824]
119995684  [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
119995688  [KO:K12865]
119995859  [KO:K12896]
119996184  [KO:K12622]
119996520  [KO:K12852]
119996604  [KO:K11093]
119996740  [KO:K12876]
119997448  [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
119998015  [KO:K14276]
119998016  [KO:K14276]
119998017  [KO:K14277]
119998018  [KO:K14280]
119998168  [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
119998331  [KO:K12836]
119998472  [KO:K12836]
119998503  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
119998716  [KO:K12875]
119998749  [KO:K11099]
119998876  [KO:K12850]
119999022  [KO:K12900]
119999054  [KO:K12845]
119999147  [KO:K12881]
119999294  [KO:K12741]
119999472  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
119999665  [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
119999737  [KO:K12848]
119999784  [KO:K12859]
119999785  [KO:K12859]
119999874  [KO:K12627]
119999888  [KO:K12816]
119999893  [KO:K12822]
120000178  [KO:K11088]
120000205  [KO:K11092]
120000270  [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
120000306  [KO:K12855]
120000507  [KO:K11098]
120001145  [KO:K14279]
120001146  [KO:K14279]
120001147  [KO:K14279]
120001148  [KO:K14280]
120001150  [KO:K14280]
120001151  [KO:K14280]
120001152  [KO:K14280]
120001187  [KO:K14278]
120001414  [KO:K12837]
120001640  [KO:K11094]
120001939  [KO:K12860]
120002251  [KO:K13098]
120002353  [KO:K12868]
120002746  [KO:K12881]
120002844  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
120003000  [KO:K12870]
120003421  [KO:K11091]
120003448  [KO:K12621]
120003473  [KO:K11095]
120003684  [KO:K12828]
120003727  [KO:K11087]
120003853  [KO:K12890]
120003881  [KO:K12883]
120003998  [KO:K12882]
120004001  [KO:K11096]
120004003  [KO:K12891]
120004104  [KO:K12877]
120004190  [KO:K12839]
120004352  [KO:K14276]
120004411  [KO:K14277]
120004488  [KO:K12893]
120004687  [KO:K14276]
120004688  [KO:K14276]
120004689  [KO:K14279]
120004690  [KO:K14279]
120004691  [KO:K14279]
120005060  [KO:K11098]
120005063  [KO:K12852]
120005173  [KO:K11097]
120005216  [KO:K12845]
120005330  [KO:K03283]
120005617  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
120005675  [KO:K06063]
120005722  [KO:K12857]
120005742  [KO:K12741]
120005760  [KO:K12867]
120005790  [KO:K12842]
120005820  [KO:K12830]
120006216  [KO:K12874]
120006231  [KO:K12896]
120006408  [KO:K12900]
120006638  [KO:K12829]
120006729  [KO:K14276]
120006730  [KO:K14276]
120006733  [KO:K14279]
120006818  [KO:K12819]
120006877  [KO:K03283]
120007088  [KO:K11094]
120007195  [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
120007491  [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
120007576  [KO:K12896]
120007582  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
120007669  [KO:K12816]
120007912  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
120008063  [KO:K12822]
120008287  [KO:K14277]
120008288  [KO:K14277]
120008289  [KO:K14278]
120008290  [KO:K14279]
120008292  [KO:K14279]
120008293  [KO:K14279]
120008294  [KO:K14279]
120008295  [KO:K14280]
120008921  [KO:K12849]
120008993  [KO:K12821]
120009020  [KO:K12890]
120009215  [KO:K11088]
120009247  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
120009252  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
120009253  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
120009278  [KO:K12848]
120009382  [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
120009743  [KO:K12836]
120009977  [KO:K14280]
120009996  [KO:K14276]
120010008  [KO:K14276]
120010019  [KO:K14276]
120010156  [KO:K12849]
120010193  [KO:K12819]
120010331  [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
120010595  [KO:K12831]
120010819  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
120010850  [KO:K03283]
120010857  [KO:K11088]
120010863  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
120011557  [KO:K12741]
120011600  [KO:K14276]
120011601  [KO:K14277]
120011602  [KO:K14277]
120011603  [KO:K14279]
120011612  [KO:K14276]
120011624  [KO:K14277]
120011635  [KO:K14277]
120011647  [KO:K14277]
120011947  [KO:K12741]
120011953  [KO:K12881]
120012028  [KO:K12741]
120012177  [KO:K12832]
120012332  [KO:K12837]
120012408  [KO:K11093]
120012744  [KO:K12860]
120013002  [KO:K12831]
120013009  [KO:K12896]
120013031  [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
120013039  [KO:K12864]
120013083  [KO:K11099]
120013089  [KO:K03283]
120013114  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
120013236  [KO:K12825]
120013239  [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
120013249  [KO:K12741]
120013268  [KO:K12840]
120013312  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
120013388  [KO:K12875]
120013445  [KO:K12900]
120013447  [KO:K12881]
120013605  [KO:K12845]
120013648  [KO:K12824]
120013963  [KO:K14277]
120013964  [KO:K14277]
120013967  [KO:K14278]
120013968  [KO:K14280]
120014004  [KO:K14277]
120014420  [KO:K12831]
120014876  [KO:K11093]
120014896  [KO:K12837]
120015064  [KO:K12837]
120015076  [KO:K12837]
120015137  [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
120015159  [KO:K12900]
120015257  [KO:K12897]
120015337  [KO:K12862]
120015604  [KO:K12624]
120015815  [KO:K14277]
120015838  [KO:K14277]
120016279  [KO:K12869]
120016281  [KO:K12622]
120016395  [KO:K12625]
120016602  [KO:K12861]
120017060  [KO:K12900]
120017081  [KO:K12741]
120017107  [KO:K11097]
Reference
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system