KEGG   PATHWAY: var03040
Entry
var03040                    Pathway                                
Name
Spliceosome - Vigna angularis (adzuki bean)
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
var03040  Spliceosome
var03040

Other DBs
GO: 0005681
Organism
Vigna angularis (adzuki bean) [GN:var]
Gene
108318957  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
108319261  [KO:K12893]
108319385  [KO:K12624]
108319632  [KO:K03283]
108320004  [KO:K12872]
108320180  [KO:K03283]
108320371  [KO:K12869]
108320666  [KO:K03283]
108320679  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
108320739  [KO:K12831]
108320766  [KO:K12900]
108320789  [KO:K12876]
108320878  [KO:K12891]
108320881  [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
108320900  [KO:K12843]
108321005  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
108321045  [KO:K12862]
108321142  [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
108321244  [KO:K12897]
108321365  [KO:K12832]
108321630  [KO:K03283]
108321631  [KO:K03283]
108321632  [KO:K03283]
108321720  [KO:K03283]
108321721  [KO:K03283]
108321741  [KO:K12741]
108321947  [KO:K12900]
108322069  [KO:K12825]
108322113  [KO:K11098]
108322149  [KO:K11097]
108322185  [KO:K12846]
108322459  [KO:K12836]
108323002  [KO:K03283]
108323048  [KO:K12741]
108323197  [KO:K11087]
108323351  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
108323393  [KO:K11096]
108323404  [KO:K12879]
108323870  [KO:K12840]
108324239  [KO:K12900]
108324273  [KO:K12871]
108324870  [KO:K12868]
108324908  [KO:K11095]
108325016  [KO:K12831]
108325031  [KO:K11095]
108325253  [KO:K12623]
108325804  [KO:K12849]
108325837  [KO:K12821]
108325842  [KO:K12830]
108325854  [KO:K12843]
108325970  [KO:K12837]
108325995  [KO:K03283]
108326053  [KO:K12662]
108326172  [KO:K12865]
108326217  [KO:K12893]
108326298  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
108326316  [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
108326767  [KO:K11087]
108327034  [KO:K12741]
108327122  [KO:K11097]
108327765  [KO:K12625]
108327892  [KO:K12623]
108327922  [KO:K12848]
108328059  [KO:K11099]
108328980  [KO:K12896]
108328982  [KO:K12896]
108328991  [KO:K12830]
108329033  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
108329106  [KO:K12741]
108329125  [KO:K12890]
108329148  [KO:K12882]
108329153  [KO:K12844]
108329173  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
108329179  [KO:K12875]
108329180  [KO:K12881]
108329223  [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
108329437  [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
108329562  [KO:K12741]
108329674  [KO:K12857]
108330500  [KO:K11086]
108330741  [KO:K03283]
108330794  [KO:K11098]
108331620  [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
108331657  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
108331860  [KO:K12819]
108332087  [KO:K12890]
108332142  [KO:K12827]
108332286  [KO:K12826]
108332430  [KO:K12883]
108332454  [KO:K12861]
108333599  [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
108333818  [KO:K12856]
108333899  [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
108333945  [KO:K12855]
108334005  [KO:K12836]
108334155  [KO:K12837]
108334220  [KO:K12881]
108334467  [KO:K12741]
108334597  [KO:K12870]
108335093  [KO:K12859]
108335401  [KO:K11088]
108335650  [KO:K12874]
108335701  [KO:K12822]
108335770  [KO:K11093]
108335808  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
108335814  [KO:K03283]
108335844  [KO:K12836]
108336099  [KO:K11092]
108336358  [KO:K11094]
108336361  [KO:K12900]
108336376  [KO:K12873]
108336407  [KO:K12627]
108336855  [KO:K12845]
108337239  [KO:K12845]
108337367  [KO:K12881]
108337974  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
108338014  [KO:K12850]
108338158  [KO:K12741]
108338178  [KO:K12821]
108338197  [KO:K03283]
108338326  [KO:K12833]
108338377  [KO:K11086]
108338419  [KO:K03283]
108338607  [KO:K12872]
108338641  [KO:K12847]
108338696  [KO:K12896]
108338707  [KO:K13098]
108338798  [KO:K11096]
108338835  [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
108339248  [KO:K12863]
108339764  [KO:K12626]
108339998  [KO:K12859]
108340314  [KO:K12741]
108340343  [KO:K12824]
108340398  [KO:K12860]
108340453  [KO:K11088]
108340621  [KO:K11984]
108340914  [KO:K12819]
108341162  [KO:K12834]
108341746  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
108342633  [KO:K12877]
108342648  [KO:K03283]
108342822  [KO:K12828]
108342869  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
108342882  [KO:K12864]
108342909  [KO:K12816]
108343033  [KO:K12867]
108343061  [KO:K12842]
108343209  [KO:K13098]
108343231  [KO:K12829]
108343235  [KO:K12741]
108343293  [KO:K12880]
108343473  [KO:K03283]
108343597  [KO:K03283]
108343881  [KO:K11091]
108344566  [KO:K12741]
108344647  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
108344860  [KO:K12622]
108345566  [KO:K12860]
108345683  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
108345765  [KO:K12741]
108345956  [KO:K06063]
108345978  [KO:K12844]
108346240  [KO:K12877]
108346358  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
108346955  [KO:K12852]
108347500  [KO:K12839]
108347697  [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
108347701  [KO:K12893]
108347987  [KO:K12817]
128193320  [KO:K12836]
128193325  [KO:K12621]
128193410  [KO:K14276]
128194175  [KO:K14276]
128194181  [KO:K14276]
128194550  [KO:K14277]
128194551  [KO:K14277]
128194552  [KO:K14277]
128194553  [KO:K14277]
128194554  [KO:K14277]
128194555  [KO:K14277]
128194556  [KO:K14279]
128194557  [KO:K14279]
128194559  [KO:K14279]
128194560  [KO:K14279]
128194846  [KO:K14278]
128194847  [KO:K14279]
128194848  [KO:K14279]
128194849  [KO:K14279]
128194850  [KO:K14279]
128194851  [KO:K14279]
128194852  [KO:K14279]
128194853  [KO:K14280]
128194854  [KO:K14280]
128194855  [KO:K14280]
128194857  [KO:K14278]
128194868  [KO:K14278]
128194879  [KO:K14278]
128194882  [KO:K14279]
128195068  [KO:K14277]
128195079  [KO:K14277]
128195090  [KO:K14277]
128195114  [KO:K14279]
128195115  [KO:K14279]
128195128  [KO:K14277]
128195139  [KO:K14277]
128195150  [KO:K14277]
128195654  [KO:K14276]
128195666  [KO:K14279]
128195667  [KO:K14280]
128195668  [KO:K14280]
128195669  [KO:K14280]
128195670  [KO:K14276]
128195671  [KO:K14280]
128195681  [KO:K14276]
128195733  [KO:K12870]
128196040  [KO:K12870]
128196046  [KO:K14278]
128196047  [KO:K14278]
128196048  [KO:K14279]
128196049  [KO:K14279]
128196050  [KO:K14279]
128196051  [KO:K14280]
128196065  [KO:K14276]
128196076  [KO:K14277]
128196078  [KO:K14277]
128196393  [KO:K14279]
128196394  [KO:K14279]
128196395  [KO:K14279]
128196396  [KO:K14280]
128196397  [KO:K14280]
128197301  [KO:K14277]
128197302  [KO:K14277]
128197303  [KO:K14277]
128197304  [KO:K14277]
128197305  [KO:K14277]
128197306  [KO:K14277]
128197308  [KO:K14278]
128197309  [KO:K14280]
128197601  [KO:K14276]
128197605  [KO:K14276]
128197606  [KO:K14276]
128197607  [KO:K14276]
128197608  [KO:K14276]
128197609  [KO:K14276]
128197611  [KO:K14277]
128197612  [KO:K14277]
128197613  [KO:K14277]
128197615  [KO:K14277]
128197617  [KO:K14278]
128197636  [KO:K14276]
128197647  [KO:K14276]
128197694  [KO:K12870]
Reference
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system