KEGG   PATHWAY: pcin03040
Entry
pcin03040                   Pathway                                
Name
Spliceosome - Prosopis cineraria
Description
After transcription, eukaryotic mRNA precursors contain protein-coding exons and noncoding introns. In the following splicing, introns are excised and exons are joined by a macromolecular complex, the spliceosome. The standard spliceosome is made up of five small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs), U1, U2, U4, U5, and U6 snRNPs, and several spliceosome-associated proteins (SAPs). Spliceosomes are not a simple stable complex, but a dynamic family of particles that assemble on the mRNA precursor and help fold it into a conformation that allows transesterification to proceed. Various spliceosome forms (e.g. A-, B- and C-complexes) have been identified.
Class
Genetic Information Processing; Transcription
Pathway map
pcin03040  Spliceosome
pcin03040

Other DBs
GO: 0005681
Organism
Prosopis cineraria [GN:pcin]
Gene
129284662  [KO:K14276]
129284666  [KO:K14280]
129284667  [KO:K14280]
129284675  [KO:K14277]
129284686  [KO:K14277]
129284697  [KO:K14277]
129284709  [KO:K14277]
129284860  [KO:K12840]
129285270  [KO:K13025] [EC:5.6.2.7]
129285767  [KO:K12828]
129285956  [KO:K03283]
129286601  [KO:K12839]
129286707  [KO:K12624]
129287330  [KO:K14279]
129287331  [KO:K14279]
129287332  [KO:K14279]
129287333  [KO:K14279]
129287334  [KO:K14279]
129287335  [KO:K14279]
129287336  [KO:K14280]
129287337  [KO:K14280]
129287338  [KO:K14276]
129287350  [KO:K14276]
129287361  [KO:K14276]
129287373  [KO:K14277]
129287642  [KO:K12877]
129287652  [KO:K12858] [EC:5.6.2.7]
129287923  [KO:K12846]
129288052  [KO:K12825]
129288584  [KO:K06063]
129288815  [KO:K11097]
129288869  [KO:K12741]
129289288  [KO:K12873]
129289711  [KO:K14280]
129289962  [KO:K12817]
129290056  [KO:K11087]
129290459  [KO:K12847]
129290825  [KO:K12893]
129290922  [KO:K12856]
129291004  [KO:K03283]
129291057  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
129291296  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
129291354  [KO:K12893]
129291894  [KO:K14280]
129291895  [KO:K14280]
129291896  [KO:K14280]
129291897  [KO:K14280]
129291915  [KO:K14280]
129291939  [KO:K14280]
129292185  [KO:K12874]
129292302  [KO:K03283]
129292304  [KO:K03283]
129292305  [KO:K03283]
129292571  [KO:K12868]
129292678  [KO:K11087]
129292741  [KO:K12830]
129292788  [KO:K12821]
129292824  [KO:K03283]
129292846  [KO:K12843]
129292892  [KO:K12855]
129292927  [KO:K12622]
129292975  [KO:K03283]
129292976  [KO:K03283]
129292977  [KO:K03283]
129292979  [KO:K03283]
129293226  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
129293422  [KO:K12893]
129293549  [KO:K12871]
129294007  [KO:K14279]
129294008  [KO:K14280]
129294009  [KO:K14280]
129294010  [KO:K14280]
129294012  [KO:K14280]
129294014  [KO:K14280]
129294038  [KO:K14278]
129294291  [KO:K12896]
129294490  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
129294995  [KO:K14278]
129295004  [KO:K11097]
129295130  [KO:K14279]
129295151  [KO:K12836]
129295174  [KO:K12864]
129295247  [KO:K14280]
129295620  [KO:K12826]
129295752  [KO:K14277]
129295778  [KO:K14280]
129295796  [KO:K03283]
129295961  [KO:K14279]
129295962  [KO:K14279]
129296071  [KO:K12833]
129296448  [KO:K14276]
129296455  [KO:K14276]
129296456  [KO:K12621]
129296460  [KO:K14280]
129296462  [KO:K14276]
129296470  [KO:K14276]
129296478  [KO:K14276]
129296488  [KO:K14276]
129296495  [KO:K14276]
129296500  [KO:K14277]
129296507  [KO:K14277]
129296515  [KO:K14277]
129296521  [KO:K14277]
129296529  [KO:K14277]
129296537  [KO:K14277]
129296549  [KO:K14278]
129296561  [KO:K14278]
129296568  [KO:K14278]
129296586  [KO:K14280]
129296594  [KO:K14280]
129296612  [KO:K14280]
129296618  [KO:K14280]
129296636  [KO:K14280]
129296643  [KO:K14280]
129296657  [KO:K14276]
129296658  [KO:K14276]
129297006  [KO:K14280]
129297058  [KO:K12837]
129297198  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
129297233  [KO:K12863]
129297434  [KO:K12896]
129297952  [KO:K12891]
129298025  [KO:K14277]
129298050  [KO:K11086]
129298132  [KO:K14277]
129298543  [KO:K14277]
129298750  [KO:K14280]
129298756  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
129299169  [KO:K14277]
129299209  [KO:K12847]
129299245  [KO:K14277]
129299246  [KO:K14277]
129299247  [KO:K14277]
129299248  [KO:K14277]
129299368  [KO:K14280]
129299388  [KO:K14280]
129299609  [KO:K14277]
129299611  [KO:K14277]
129299612  [KO:K14277]
129300039  [KO:K14280]
129300109  [KO:K14279]
129300398  [KO:K11088]
129300559  [KO:K14280]
129300598  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
129300790  [KO:K12896]
129300887  [KO:K12817]
129301023  [KO:K14280]
129301060  [KO:K12828]
129301294  [KO:K03283]
129301654  [KO:K12891]
129301868  [KO:K12741]
129302386  [KO:K12872]
129302444  [KO:K12850]
129302515  [KO:K12842]
129302841  [KO:K12625]
129302903  [KO:K12881]
129302991  [KO:K12812] [EC:5.6.2.7]
129303033  [KO:K12890]
129303050  [KO:K12827]
129303296  [KO:K13098]
129303433  [KO:K12621]
129303511  [KO:K12834]
129303575  [KO:K12900]
129303591  [KO:K12896]
129303683  [KO:K12864]
129304270  [KO:K14279]
129304271  [KO:K14279]
129304272  [KO:K14279]
129304273  [KO:K14280]
129304275  [KO:K14280]
129304276  [KO:K14280]
129304277  [KO:K14280]
129304278  [KO:K14280]
129304279  [KO:K14280]
129304280  [KO:K14280]
129304282  [KO:K14280]
129304286  [KO:K14280]
129304287  [KO:K14280]
129304401  [KO:K12741]
129304513  [KO:K12882]
129304779  [KO:K12819]
129304903  [KO:K12849]
129305054  [KO:K12830]
129305287  [KO:K12867]
129305328  [KO:K12826]
129305396  [KO:K12741]
129305699  [KO:K12837]
129305700  [KO:K12830]
129305794  [KO:K12890]
129305814  [KO:K03283]
129305823  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
129305993  [KO:K12829]
129306027  [KO:K12891]
129306091  [KO:K12860]
129306168  [KO:K12623]
129306178  [KO:K12848]
129306300  [KO:K12896]
129306328  [KO:K12844]
129306442  [KO:K12826]
129306486  [KO:K12662]
129306500  [KO:K12859]
129306507  [KO:K11099]
129306605  [KO:K11087]
129306808  [KO:K12741]
129306921  [KO:K12900]
129306970  [KO:K03283]
129307112  [KO:K12896]
129307502  [KO:K14279]
129307514  [KO:K14279]
129307527  [KO:K14280]
129307532  [KO:K14280]
129307534  [KO:K14280]
129307536  [KO:K14280]
129307537  [KO:K14280]
129307540  [KO:K14280]
129307561  [KO:K14279]
129307871  [KO:K12832]
129308127  [KO:K11098]
129308173  [KO:K12862]
129308473  [KO:K12813] [EC:5.6.2.6]
129308507  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
129308642  [KO:K12875]
129308648  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
129308734  [KO:K12815] [EC:5.6.2.6]
129308802  [KO:K11092]
129308809  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
129308887  [KO:K12733] [EC:5.2.1.8]
129309349  [KO:K11095]
129309407  [KO:K12900]
129309437  [KO:K12820] [EC:5.6.2.6]
129309809  [KO:K12900]
129309937  [KO:K12855]
129310187  [KO:K14279]
129310189  [KO:K14279]
129310190  [KO:K14280]
129310193  [KO:K14280]
129310194  [KO:K14280]
129310196  [KO:K14280]
129310197  [KO:K14276]
129310199  [KO:K14280]
129310209  [KO:K14276]
129310220  [KO:K14276]
129310232  [KO:K14277]
129310942  [KO:K11098]
129311269  [KO:K12859]
129311287  [KO:K12831]
129311369  [KO:K12879]
129311410  [KO:K12818] [EC:5.6.2.6]
129311503  [KO:K12896]
129311526  [KO:K12863]
129311540  [KO:K12832]
129312037  [KO:K12890]
129312218  [KO:K14280]
129312237  [KO:K14280]
129312245  [KO:K14276]
129312256  [KO:K14277]
129312281  [KO:K14279]
129312400  [KO:K12881]
129312516  [KO:K12741]
129312844  [KO:K12626]
129312889  [KO:K12627]
129313055  [KO:K12878]
129313557  [KO:K03283]
129313788  [KO:K11096]
129314345  [KO:K12836]
129314470  [KO:K12883]
129314515  [KO:K03283]
129314605  [KO:K12857]
129314709  [KO:K14278]
129314710  [KO:K14280]
129314712  [KO:K14280]
129314713  [KO:K14280]
129314714  [KO:K14280]
129314715  [KO:K14280]
129314716  [KO:K14280]
129314717  [KO:K14280]
129314718  [KO:K14280]
129314719  [KO:K14280]
129314974  [KO:K09567] [EC:5.2.1.8]
129315061  [KO:K11086]
129315132  [KO:K11095]
129315405  [KO:K12811] [EC:5.6.2.7]
129315724  [KO:K12837]
129315993  [KO:K12835] [EC:5.6.2.7]
129316038  [KO:K12627]
129316875  [KO:K12870]
129316974  [KO:K14276]
129316975  [KO:K14280]
129316976  [KO:K14280]
129316977  [KO:K14280]
129317031  [KO:K12872]
129317068  [KO:K11094]
129317126  [KO:K12876]
129317192  [KO:K12837]
129317708  [KO:K12865]
129317724  [KO:K12880]
129317734  [KO:K11088]
129317919  [KO:K13098]
129318072  [KO:K11088]
129318087  [KO:K12850]
129318242  [KO:K12821]
129318243  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
129318245  [KO:K11984]
129318433  [KO:K12831]
129318465  [KO:K12869]
129318521  [KO:K12836]
129318579  [KO:K12741]
129318637  [KO:K12816]
129318691  [KO:K12834]
129318907  [KO:K12854] [EC:5.6.2.6]
129318943  [KO:K12837]
129319034  [KO:K12625]
129319073  [KO:K12833]
129319099  [KO:K14280]
129319109  [KO:K14277]
129319121  [KO:K14280]
129319133  [KO:K14280]
129319143  [KO:K14280]
129319396  [KO:K12741]
129319566  [KO:K12823] [EC:5.6.2.7]
129319805  [KO:K10599] [EC:2.3.2.27]
129320263  [KO:K03283]
129320308  [KO:K12837]
129320436  [KO:K12861]
129320461  [KO:K12890]
129320537  [KO:K12845]
129320655  [KO:K12852]
129320985  [KO:K11091]
129321115  [KO:K14277]
129321116  [KO:K14277]
129321117  [KO:K14277]
129321118  [KO:K14277]
129321124  [KO:K14278]
129321125  [KO:K14276]
129321126  [KO:K14280]
129321128  [KO:K14280]
129321129  [KO:K14280]
129321136  [KO:K14276]
129321145  [KO:K14277]
129321157  [KO:K14277]
129321542  [KO:K12863]
129321730  [KO:K12896]
129321824  [KO:K12897]
129321929  [KO:K12824]
129321950  [KO:K12822]
129322129  [KO:K11093]
129322444  [KO:K12741]
129322658  [KO:K11096]
Reference
  Authors
Wahl MC, Will CL, Luhrmann R
  Title
The spliceosome: design principles of a dynamic RNP machine.
  Journal
Cell 136:701-18 (2009)
DOI:10.1016/j.cell.2009.02.009
Reference
  Authors
Morris DP, Greenleaf AL
  Title
The splicing factor, Prp40, binds the phosphorylated carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II.
  Journal
J Biol Chem 275:39935-43 (2000)
DOI:10.1074/jbc.M004118200
Reference
  Authors
Chen YI, Moore RE, Ge HY, Young MK, Lee TD, Stevens SW
  Title
Proteomic analysis of in vivo-assembled pre-mRNA splicing complexes expands the catalog of participating factors.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:3928-44 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm347
Reference
  Authors
Ritchie DB, Schellenberg MJ, MacMillan AM
  Title
Spliceosome structure: piece by piece.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1789:624-33 (2009)
DOI:10.1016/j.bbagrm.2009.08.010
KO pathway
ko03040   

DBGET integrated database retrieval system