KEGG   ORTHOLOGY: K11098
Entry
K11098                      KO                                     
Symbol
SNRPF, SMF
Name
small nuclear ribonucleoprotein F
Pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
   03041 Spliceosome
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
   03032 DNA replication proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    U7-dependent histone pre-mRNA processing factors
     K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U1 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
 Complex B
  U1 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
 Complex C
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic type
  DNA Replication Termination Factors
   Telomerase complex (fungi)
    Sm core complex
     K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
Other DBs
GO: 0030532
Genes
HSA: 6636(SNRPF)
PTR: 452143(SNRPF)
PPS: 100993647(SNRPF)
GGO: 101124905(SNRPF)
PON: 100451758(SNRPF)
NLE: 100594777(SNRPF)
HMH: 116479119(SNRPF)
MCC: 107000998 716917(SNRPF)
MCF: 102141572 102146659(SNRPF)
MTHB: 126930316 126930916 126942378
MNI: 105483667(SNRPF) 105497721
CSAB: 103238901(SNRPF)
CATY: 105573360(SNRPF) 105573398
PANU: 101012297(SNRPF) 103876025
TGE: 112634636(SNRPF) 112634803
MLEU: 105546976(SNRPF)
RRO: 104657389 104678576(SNRPF)
RBB: 108521797(SNRPF) 108530794
TFN: 117089588(SNRPF)
PTEH: 111554833(SNRPF)
CANG: 105506138(SNRPF)
CJC: 100399108(SNRPF)
MMUR: 105871467 105877091(SNRPF)
LCAT: 123639426(SNRPF)
OGA: 100957263 100964942(SNRPF)
MMU: 69878(Snrpf)
MPAH: 110326773(Snrpf)
RNO: 108350623 680737(Snrpf)
MCOC: 116075984(Snrpf)
ANU: 117696795(Snrpf)
MUN: 110545533
PROB: 127237905(Snrpf)
PLEU: 114695510 114700564(Snrpf)
NGI: 103728999 103733264(Snrpf)
HGL: 101701100(Snrpf) 101725717
CPOC: 100723019(Snrpf)
CCAN: 109686605(Snrpf)
MMMA: 107139999(Snrpf) 125618925
OCU: 100348389
OPI: 101516101(SNRPF) 101522835
GVR: 103593289 103593751(SNRPF)
VVP: 112910823 112930713(SNRPF)
AML: 100469419(SNRPF) 100471390
UMR: 103660122(SNRPF) 103671444
ELK: 111142193
LLV: 125109691
MPUF: 101694180(SNRPF)
MNP: 132019349(SNRPF)
MLK: 131839289(SNRPF)
NVS: 122891366 122892075(SNRPF)
ORO: 101367652(SNRPF) 101376578
MLX: 118007425
NSU: 110578022(SNRPF) 110587414
LWW: 102744555(SNRPF) 102750674
PYU: 121031299 121040584(SNRPF)
PCOO: 112856124 112863656(SNRPF)
PTG: 102950891 102961212(SNRPF)
PPAD: 109251565 109265367(SNRPF)
AJU: 106973428
HHV: 120234639(SNRPF)
BTA: 107131530 615240(SNRPF)
BOM: 102273911(SNRPF) 106701434
BIU: 109559404(SNRPF) 109574461
BBUB: 102404764 102405810(SNRPF)
BBIS: 104982990 104985893(SNRPF)
CHX: 102185068(SNRPF)
OAS: 101121249(SNRPF) 105612015
BTAX: 128048180(SNRPF)
ODA: 120857341(SNRPF)
CCAD: 122423377(SNRPF)
MBEZ: 129536789(SNRPF)
SSC: 100155855(SNRPF)
CFR: 102510005(SNRPF)
CBAI: 105075014(SNRPF)
CDK: 105097429(SNRPF)
VPC: 102543758(SNRPF)
BACU: 103011092(SNRPF)
BMUS: 118901838(SNRPF)
LVE: 103072935(SNRPF)
OOR: 101285259(SNRPF)
DLE: 111168731(SNRPF)
PCAD: 102977607(SNRPF)
PSIU: 116760801(SNRPF)
NASI: 112405822(SNRPF)
ECB: 100630068(SNRPF)
EPZ: 103561940(SNRPF)
EAI: 106837254(SNRPF)
PKL: 118730662(SNRPF)
EFUS: 103288986(SNRPF) 103295519
MNA: 107544070(SNRPF)
DRO: 112307410 112321855(SNRPF)
AJM: 119057702 119060537(SNRPF)
PDIC: 114513201(SNRPF) 118499272
PHAS: 123810691(SNRPF) 123831251
MMF: 118616139 118623882(SNRPF)
PPAM: 129071280(SNRPF)
HAI: 109382293(SNRPF) 109385754
PALE: 102882064(SNRPF)
PGIG: 120611611(SNRPF)
PVP: 105295993(SNRPF)
RAY: 107518056(SNRPF)
MJV: 108404912(SNRPF)
TOD: 119247412(SNRPF) 119257397
SARA: 101543898 101557673(SNRPF)
LAV: 100662636(SNRPF)
TMU: 101345555
ETF: 101661481(SNRPF) 105979176
MDO: 100017542(SNRPF) 100617914
GAS: 123249392(SNRPF)
SHR: 116419220(SNRPF)
AFZ: 127564523
PCW: 110221811(SNRPF)
OAA: 114816634(SNRPF)
GGA: 417916(SNRPF)
PCOC: 116233246(SNRPF)
MGP: 100547816(SNRPF)
CJO: 107311805(SNRPF)
TPAI: 128073066(SNRPF)
LMUT: 125687924(SNRPF)
NMEL: 110396178(SNRPF)
APLA: 101795975(SNRPF)
CATA: 118250588(SNRPF)
AFUL: 116496009(SNRPF)
TGU: 105758572(SNRPF)
LSR: 110469385(SNRPF)
SCAN: 103813641(SNRPF)
PMOA: 120499834(SNRPF)
OTC: 121338635(SNRPF)
PRUF: 121357226(SNRPF)
FAB: 101817387(SNRPF)
OMA: 130265352(SNRPF)
PHI: 102100469(SNRPF)
PMAJ: 107205011(SNRPF)
CCAE: 111931087(SNRPF)
CCW: 120411904(SNRPF)
ETL: 114059235(SNRPF)
ZAB: 102065741(SNRPF)
SVG: 106860650(SNRPF)
MMEA: 130586364(SNRPF)
HRT: 120751935(SNRPF)
FCH: 114017840(SNRPF)
EGZ: 104132357(SNRPF)
NNI: 104011707(SNRPF)
PCRI: 104029353(SNRPF)
PLET: 104616977(SNRPF)
PCAO: 104050748(SNRPF)
TALA: 104363526(SNRPF)
PADL: 103914665(SNRPF)
ACHC: 115336382(SNRPF)
HLE: 104828294(SNRPF)
AGEN: 126034452
GCL: 127029369
MUI: 104533634(SNRPF)
BREG: 104640076(SNRPF)
LDI: 104344763(SNRPF)
MNB: 103771311(SNRPF)
NNT: 104405489(SNRPF)
SHAB: 115605119(SNRPF)
DPUB: 104299190(SNRPF)
CVF: 104284319(SNRPF)
RTD: 128914484(SNRPF)
CUCA: 104055171(SNRPF)
BRHI: 104488065(SNRPF)
AAM: 106488188(SNRPF)
AROW: 112966199(SNRPF)
NPD: 112959454(SNRPF)
TGT: 104574375(SNRPF)
DNE: 112997279(SNRPF)
ASN: 102384542(SNRPF)
AMJ: 102576464(SNRPF)
CPOO: 109316075(SNRPF)
GGN: 109296392(SNRPF)
PSS: 102455127(SNRPF)
ACS: 100566616(snrpf)
ASAO: 132776080(SNRPF) 132783087
PVT: 110091449(SNRPF)
SUND: 121931181(SNRPF)
PBI: 103067306(SNRPF)
PMUR: 107284560(SNRPF)
CTIG: 120314746(SNRPF)
TSR: 106552109(SNRPF)
PGUT: 117655813(SNRPF)
APRI: 131202438(SNRPF)
PTEX: 113434943(SNRPF)
NSS: 113413775 113431714(SNRPF)
VKO: 123036357(SNRPF)
PRAF: 128401376 128421787(SNRPF)
ZVI: 118084030 118090757(SNRPF)
HCG: 128325646(SNRPF) 128339650
STOW: 125435766(SNRPF)
EMC: 129325062 129336001(SNRPF)
XLA: 108711072(snrpf.L) 380595(snrpf.S)
XTR: 448659(snrpf)
NPR: 108792586(SNRPF) 108800426
BBUF: 120980141(SNRPF)
BGAR: 122925895(SNRPF)
MUO: 115459156 115477293(SNRPF)
GSH: 117360436 117364154(SNRPF)
DRE: 445404(snrpf)
SANH: 107679260(snrpf)
PTET: 122349361(snrpf)
LROH: 127168467(snrpf)
OMC: 131544734(snrpf)
PPRM: 120469836(snrpf)
RKG: 130091300(snrpf)
MAMB: 125264069(snrpf)
CIDE: 127516646
TROS: 130561355(snrpf)
TDW: 130420918(snrpf)
MANU: 129438460(snrpf)
IPU: 100528977(snrpf)
IFU: 128609948(snrpf)
PHYP: 113540432(snrpf)
SMEO: 124386803(snrpf)
TFD: 113657559(snrpf)
TVC: 132847943(snrpf)
AMEX: 103043442(snrpf)
CMAO: 118825846(snrpf)
EEE: 113584706(snrpf)
CHAR: 105912760(snrpf)
TRU: 101074074(snrpf)
TFS: 130519181(snrpf)
LCO: 104937391(snrpf)
NCC: 104945680(snrpf)
TBEN: 117484824(snrpf)
CGOB: 115028519(snrpf)
PGEO: 117439178(snrpf)
GACU: 117552503(snrpf)
EMAC: 134879215(snrpf)
ELY: 117249130(snrpf)
EFO: 125882933(snrpf)
SLUC: 116060162(snrpf)
ECRA: 117938885(snrpf)
ESP: 116673375(snrpf)
PFLV: 114550182(snrpf)
GAT: 120818400(snrpf)
PPUG: 119210791(snrpf)
AFB: 129112602(snrpf)
CLUM: 117726129(snrpf)
PSWI: 130200569(snrpf)
MSAM: 119918001(snrpf)
SCHU: 122870921(snrpf)
CUD: 121505589(snrpf)
ALAT: 119032214(snrpf)
MZE: 101483952(snrpf)
ONL: 100704347(snrpf)
OAU: 116325470(snrpf)
OLA: 101170138(snrpf)
OML: 112156430(snrpf)
CSAI: 133424326(snrpf)
XMA: 102234736(snrpf)
XCO: 114141338(snrpf)
XHE: 116737038(snrpf)
PRET: 103459148(snrpf)
PLAI: 106955935(snrpf)
PMEI: 106905326(snrpf)
GAF: 122826232(snrpf)
PPRL: 129351477(snrpf)
CVG: 107085214(snrpf)
CTUL: 119793183(snrpf)
GMU: 124882894(snrpf)
NFU: 107387488(snrpf)
KMR: 108233316(snrpf)
ALIM: 106530266(snrpf)
NWH: 119418005(snrpf)
AOCE: 111571100(snrpf)
MCEP: 124999983(snrpf)
CSEM: 103382608(snrpf)
POV: 109643791(snrpf)
SSEN: 122766825(snrpf)
HHIP: 117757159(snrpf)
HSP: 118101547(snrpf)
SMAU: 118286920(snrpf)
LCF: 108897575
SDU: 111224863(snrpf)
SLAL: 111664687(snrpf)
XGL: 120801413(snrpf)
HCQ: 109508638 109530060(snrpf)
SSCV: 125992310
SBIA: 133493975(snrpf)
PEE: 133396925(snrpf)
PTAO: 133471908(snrpf)
BPEC: 110161828(snrpf)
MALB: 109967806(snrpf)
BSPL: 114862332(snrpf)
SJO: 128353473(snrpf)
SASA: 106561682(RUXF) 106573056(RUXF) 106576293(RUXF) 106609479
ELS: 105020274(snrpf) 105021811
SFM: 108920875(snrpf)
PKI: 111844299(snrpf)
AANG: 118231804(snrpf)
LOC: 102684730(snrpf)
PSEX: 120540825(snrpf)
RTP: 109918889(snrpf)
CPLA: 122561543(snrpf)
HOC: 132826953(snrpf)
LERI: 129707635(snrpf)
PMRN: 116947567(SNRPF)
LRJ: 133351594(SNRPF)
BFO: 118415580
BBEL: 109471350
CIN: 100181243
SPU: 592177
APLC: 110989179
AJC: 117119361
SKO: 100370688
DME: Dmel_CG16792(SmF)
DER: 6546889
DSE: 6608777
DSI: Dsimw501_GD15243(Dsim_GD15243)
DAN: 6494939
DSR: 110189237
DPO: 4803687
DPE: 6590199
DWI: 6643331
DGR: 6569088
DNV: 108654445
DHE: 111597934
DVI: 6626372
CCAT: 101456550
BOD: 106622476
BDR: 105233046
RZE: 108363847
AOQ: 129237966
TDA: 119666993
SCAC: 106086302
LCQ: 111680767
LSQ: 119608449
GFS: 119644635
ECOE: 129944640
CLON: 129608395
HIS: 119661048
AGA: 1273301
ACOZ: 120947866
AARA: 120898622
AMER: 121588029
ASTE: 118504978
AFUN: 125765270
AMOU: 128305551
AALI: 118469015
AAG: 110681523
AALB: 109417287
CNS: 116342628
BCOO: 119083508
AME: 725880
ACER: 108001184
ALAB: 122710359
ADR: 102678121
AFLR: 100867517
BIM: 100748964
BBIF: 117205243
BVK: 117230176
BVAN: 117162974
BTER: 100651890
BAFF: 126923319
BPYO: 122571791
BPAS: 132908828
FVI: 122538929
CCAL: 108626041
OBB: 114880033
OLG: 117605965
MGEN: 117217463
NMEA: 116424103
CGIG: 122402862
SOC: 105196810
MPHA: 105834179
AEC: 105152287
ACEP: 105620997
PBAR: 105427665
VEM: 105559168
HST: 105191504
DQU: 106744486
CFO: 105247918
FEX: 115240836
LHU: 105676495
PGC: 109852727
OBO: 105287395
PCF: 106785820
PFUC: 122524454
VPS: 122634049
VCRB: 124430529
VVE: 124954246
NVI: 100117043(Snrpf)
CSOL: 105365861
TPRE: 106652765
LHT: 122506038
LBD: 127283332
MDL: 103578122
CGLO: 123263480
FAS: 105269566
DAM: 107040066
AGIF: 122852834
CINS: 118066641
DSM: 124415009
NPT: 124222989
NFB: 124186257
NLO: 107221314
NVG: 124309342
AROA: 105692165
TCA: 658284
DPA: 109543616
SOY: 115875459
ATD: 109594128
CSET: 123311307
AGB: 108914582
LDC: 111509949
NVL: 108559386
PPYR: 116175066
OTU: 111415005
BMOR: 100101178
MSEX: 115451252
BANY: 112052200
MJU: 123868554
NIQ: 126774500
VCD: 124536251
MCIX: 123659364
PMAC: 106713769
PPOT: 106104640
PXU: 106121461
PRAP: 111002121
PBX: 123709838
PNAP: 125048789
ZCE: 119840685
CCRC: 123694403
LSIN: 126970339
AAGE: 121738798
HAW: 110371987
HZE: 124635018
TNL: 113497627
SLIU: 111358969
OFU: 114349597
PXY: 105393302
PGW: 126372828
CCRN: 123298368
API: 100162422
DNX: 107172609
AGS: 114127201
RMD: 113553751
DVT: 126908369
BTAB: 109031692
CLEC: 106667413
HHAL: 106679541
HVI: 124353618
FOC: 113209547
TPAL: 117650377
BROR: 134541939
DMK: 116924955
DPZ: 124337382
PVM: 113806266
PJA: 122253281
PCHN: 125028264
PMOO: 119578682
PCLA: 123756453
CQD: 128694581
PTRU: 123505051
ESN: 126981315
MNZ: 135195699
HAZT: 108678071
LSM: 121120915
TCF: 131885387
PPOI: 119107747
ISC: 8040085
DSV: 119452879
RSAN: 119400441
RMP: 119180030
VDE: 111253647
VJA: 111259079
DPTE: 113797520
DFR: 124490782
CSCU: 111623277
UDV: 129231396
LPOL: 106463760
PMEO: 129582925
CEL: CELE_ZK652.1(snr-5)
CBR: CBG_12250(Cbr-snr-5)
BMY: BM_BM14077(Bma-snr-5)
TSP: Tsp_11073
PCAN: 112571431
BGT: 106051585
HRF: 124136168
HRJ: 124253266
CRG: 105328191
CANU: 128161223
OED: 125653231
MYI: 110466285
PMAX: 117331643
MCAF: 127698696
MMER: 123529068
DPOL: 127865053
OBI: 106883615
OSN: 115213071
EGL: EGR_03805
NVE: 5515848
EPA: 110250094
ATEN: 116305931
AMIL: 114953684
PDAM: 113682973
SPIS: 111324851
DGT: 114537572
XEN: 124434231
HMG: 100198581
HSY: 130625599
AQU: 100640351
ATH: AT2G14285 AT4G30220(RUXF)
CRB: 17878899
CIT: 102609283
PVY: 116130075
MINC: 123194003
TCC: 18589305
GRA: 105770622
GAB: 108484487
EGR: 104435957
MTR: 11428365
TPRA: 123911312
CAM: 101496464
PSAT: 127135023
VVO: 131628543
LJA: Lj0g3v0298839.1(Lj0g3v0298839.1) Lj5g3v0292810.1(Lj5g3v0292810.1) Lj5g3v0292810.2(Lj5g3v0292810.2)
RCN: 112175616
ZJU: 107418828
CSV: 101204969
CMO: 103501840
BHJ: 120085368
MCHA: 111013917
POP: 7461580
PEU: 105139281
PALZ: 118051567
VVI: 100263985
VRI: 117917516
SLY: 101260491
SPEN: 107032133
SOT: 102600295
SSTN: 125865131
SDUL: 129877399
CANN: 107854579
LBB: 132607287
SIND: 105179597
EGT: 105955581
CCAV: 112518054
MOF: 131160189
DOSA: Os02t0177500-01(Os02g0177500) Os11t0657300-01(Os11g0657300)
OBR: 102709142
PHAI: 112896258
DCT: 110111480
PEQ: 110021762
MSIN: 131218753
NCOL: 116254236
ATR: 18437879
APRO: F751_0718
MPP: MICPUCDRAFT_9282(JGI:MicpuC2_9282)
SCE: YPR182W(SMX3)
SEUB: DI49_5626
ERC: Ecym_2813
NCS: NCAS_0A15220(NCAS0A15220)
NDI: NDAI_0J00380(NDAI0J00380)
TPF: TPHA_0I03270(TPHA0I03270)
TBL: TBLA_0B04935(TBLA0B04935)
TDL: TDEL_0H00320(TDEL0H00320)
KAF: KAFR_0B00320(KAFR0B00320)
KNG: KNAG_0F03940(KNAG0F03940)
NCR: NCU01614
NTE: NEUTE1DRAFT83630(NEUTE1DRAFT_83630)
MGR: MGG_03895
PGRI: PgNI_07041
SSCK: SPSK_10102
MAW: MAC_02612
MAJ: MAA_03025
CMT: CCM_02006
BFU: BCIN_13g02370(Bcsmx3)
MBE: MBM_07409
ACHE: ACHE_51232A(SMF1)
PTE: PTT_15691
SPO: SPBC3E7.14(smf1)
SOM: SOMG_01174(smf1)
CNE: CND03220
CNB: CNBD3130
CDEU: CNBG_0768
TASA: A1Q1_01666
CCAC: CcaHIS019_0308870(CcaverHIS019_0308870)
SCM: SCHCO_02623787(SCHCODRAFT_02623787)
MGL: MGL_2967
MRT: MRET_3571
DDI: DDB_G0278821(snrpF)
EHI: EHI_188130(75.t00014)
PREL: PRELSG_0923900(SNRPF)
TAN: TA21000
TPV: TP01_0376
CPV: cgd1_2690
SPAR: SPRG_05695
 » show all
Reference
  Authors
Kambach C, Walke S, Young R, Avis JM, de la Fortelle E, Raker VA, Luhrmann R, Li J, Nagai K
  Title
Crystal structures of two Sm protein complexes and their implications for the assembly of the spliceosomal snRNPs.
  Journal
Cell 96:375-87 (1999)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)80550-4
  Sequence
[hsa:6636]
Reference
  Authors
Chari A, Golas MM, Klingenhager M, Neuenkirchen N, Sander B, Englbrecht C, Sickmann A, Stark H, Fischer U
  Title
An assembly chaperone collaborates with the SMN complex to generate spliceosomal SnRNPs.
  Journal
Cell 135:497-509 (2008)
DOI:10.1016/j.cell.2008.09.020
  Sequence
[hsa:6636]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system