KEGG   ORTHOLOGY: K03212
Entry
K03212                      KO                                     
Symbol
rumB
Name
23S rRNA (uracil747-C5)-methyltransferase [EC:2.1.1.189]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K03212  rumB; 23S rRNA (uracil747-C5)-methyltransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.189  23S rRNA (uracil747-C5)-methyltransferase
     K03212  rumB; 23S rRNA (uracil747-C5)-methyltransferase
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic type
  rRNA modification factors
   23S rRNA modification factors
    K03212  rumB; 23S rRNA (uracil747-C5)-methyltransferase
Other DBs
COG: COG2265
GO: 0070041
Genes
ECO: b0859(rlmC)
ECJ: JW0843(rumB)
ECD: ECDH10B_0929(rumB)
EBW: BWG_0712(rumB)
ECOK: ECMDS42_0711(rumB)
ECOC: C3026_05355(rumB)
ECE: Z1086(ybjF)
ECS: ECs_0939(rlmC)
ECF: ECH74115_1015(rumB)
ETW: ECSP_0959(rumB)
ELX: CDCO157_0915(rumB)
EOI: ECO111_0928(rumB)
EOJ: ECO26_0986(rumB)
EOH: ECO103_0903(rumB)
ECOO: ECRM13514_0939(rumB)
ECOH: ECRM13516_0894(rumB)
ESL: O3K_17050(rumB)
ESO: O3O_08240(rumB)
ESM: O3M_17025(rumB)
ECK: EC55989_0904(rumB)
ECG: E2348C_0856(rumB)
EOK: G2583_1090(rumB)
ELR: ECO55CA74_05300(rumB)
ELH: ETEC_0926
ECW: EcE24377A_0931(rumB)
EUN: UMNK88_955(rumB)
ECP: ECP_0873
ENA: ECNA114_0801(rumB)
ECOS: EC958_0971(ybjF)
ECV: APECO1_1234(ybjF)
ECOA: APECO78_08070(rumB)
ECX: EcHS_A0962(rumB)
ECM: EcSMS35_0887(rumB)
ECY: ECSE_0917
ECR: ECIAI1_0898(rumB)
ECQ: ECED1_0824(rumB)
EUM: ECUMN_1049(rumB)
ECT: ECIAI39_0839(rumB)
EOC: CE10_0882(rumB)
EBR: ECB_00864(ybjF)
ECOB: C3029_08705(rumB)
EBL: ECD_00864(rlmC)
EBE: B21_00870(rlmC)
EBD: ECBD_2735
ECI: UTI89_C0862(ybjF)
EIH: ECOK1_0861(rumB)
ECZ: ECS88_0876(rumB)
ECC: c0992(ybjF)
ELO: EC042_0950(rumB)
ELN: NRG857_03875(rumB)
ESE: ECSF_0784
ECL: EcolC_2737
EKF: KO11_19220(rumB)
EAB: ECABU_c09000(rumB)
EDH: EcDH1_2783
EDJ: ECDH1ME8569_0811(rumB)
ELU: UM146_13355(rumB)
ELW: ECW_m0967(rumB)
ELL: WFL_04710(rumB)
ELC: i14_0908(rumB)
ELD: i02_0908(rumB)
ELP: P12B_c0844(rumB)
ELF: LF82_2047(rumB)
ECOL: LY180_04520(rumB)
ECOI: ECOPMV1_00862(rlmC)
ECOJ: P423_04265(rumB)
EFE: EFER_1002(rumB)
EAL: EAKF1_ch0614c(rumB)
EMA: C1192_07995
ESZ: FEM44_18825(rlmC)
ERUY: OSH18_05400(rlmC)
STY: STY0915(ybjF)
STT: t2014(ybjF)
SEX: STBHUCCB_21290
SENT: TY21A_10225(rumB)
STM: STM0882(ybjF)
SEO: STM14_1033(rumB)
SEV: STMMW_09331
SEY: SL1344_0859(rumB)
SEM: STMDT12_C09410(rumB)
SEJ: STMUK_0888(rumB)
SEB: STM474_0907(rumb)
SEF: UMN798_0958(ybjF)
SETU: STU288_09990(rumB)
SETC: CFSAN001921_12595(rumB)
SENR: STMDT2_08581(ybjF)
SEND: DT104_08961(ybjF)
SENI: CY43_04720(rumB)
SEEN: SE451236_10445(rumB)
SPT: SPA1880(ybjF)
SEK: SSPA1750
SPQ: SPAB_02607
SEI: SPC_0921(ybjF)
SEC: SCH_0875(ybjF)
SEH: SeHA_C1016(rumB)
SHB: SU5_01551
SENH: CFSAN002069_04440(rumB)
SEEH: SEEH1578_13810(rumB)
SEE: SNSL254_A0955(rumB)
SENN: SN31241_19370
SEW: SeSA_A1035(rumB)
SEA: SeAg_B0919(rumB)
SENS: Q786_04270(rumB)
SED: SeD_A0987(rumB)
SEL: SPUL_2086(ybjF)
SEGA: SPUCDC_2072(ybjF)
SET: SEN0828(ybjF)
SENA: AU38_04300(rumB)
SENO: AU37_04285(rumB)
SENV: AU39_04290(rumB)
SENQ: AU40_04770(rumB)
SENL: IY59_04360(rumB)
SENJ: CFSAN001992_07025(rumB)
SEEC: CFSAN002050_10960(rumB)
SEEB: SEEB0189_014945(rumB)
SEEP: I137_09490(rumB)
SENB: BN855_8630
SENE: IA1_04495(rumB)
SENC: SEET0819_11535(rumB)
SES: SARI_02048
SBG: SBG_0777(ybjF)
SBZ: A464_843
SBV: N643_03850(rumB)
SALZ: EOS98_14770(rlmC)
SFL: SF0813(rumB)
SFX: S0855(ybjF)
SFV: SFV_0844(ybjF)
SFE: SFxv_0881(rumB)
SFN: SFy_1098
SFS: SFyv_1140
SFT: NCTC1_00813(rumB)
SSN: SSON_0844(ybjF)
SBO: SBO_0793(ybjF)
SBC: SbBS512_E2472(rumB)
SDY: SDY_0736(ybjF)
SDZ: Asd1617_00923
SHQ: A0259_08390(rumB)
SHIG: LXH19_14330(rlmC)
ENC: ECL_02814
ENL: A3UG_07220(rumB)
ECLG: EC036_13990
ECLE: ECNIH2_08080(rumB)
ECLN: ECNIH4_15340(rumB)
ECLI: ECNIH5_07135(rumB)
ECLX: LI66_07180(rumB)
ECLY: LI62_07930(rumB)
ECLZ: LI64_07485(rumB)
EHM: AB284_17825(rumB)
EXF: BFV63_07135
ECLA: ECNIH3_07155(rumB)
ECLC: ECR091_07130(rumB)
EAU: DI57_11580(rumB)
EKB: BFV64_07015
ENO: ECENHK_07300(rumB)
EEC: EcWSU1_01420(rumB)
ELG: BH714_03220
ECAN: CWI88_15050(rumB)
ERN: BFV67_06805
ECLS: LI67_008040(rumB)
ECHG: FY206_08405(rlmC)
ESH: C1N69_07150(rumB)
EPT: HWQ17_05450(rlmC)
ENT: Ent638_1373
EAS: Entas_1345
ENR: H650_23130(rumB)
ENX: NI40_006755(rumB)
ENF: AKI40_2346(rumB)
LNI: CWR52_05090(rlmC)
EBG: FAI37_22310(rlmC)
END: A4308_11155(rumB)
ENZ: G0034_07120(rlmC)
ENS: HWQ15_15600(rlmC)
ENK: LOC22_17885(rlmC)
EHU: D5067_0015535(rlmC)
EMOR: L6Y89_07000(rlmC)
ENB: ELK40_07650(rlmC)
EQU: OM418_06920(rlmC)
EPU: QVH39_07160(rlmC)
EDY: F0320_06650(rlmC)
EAX: AAHF05_06925(rlmC)
ESA: ESA_02478
CSK: ES15_2576(rumB)
CSZ: CSSP291_11575(rumB)
CSJ: CSK29544_03783
CCON: AFK62_06775(rumB)
CDM: AFK67_06985(rumB)
CSI: P262_03748
CMJ: AFK66_012900(rumB)
CUI: AFK65_06770(rumB)
CMW: AFK63_11865(rumB)
CTU: CTU_14670(rumB)
KPN: KPN_00890(ybjF)
KPU: KP1_1854(ybjF)
KPM: KPHS_17670
KPP: A79E_3349
KPH: KPNIH24_19920(rumB)
KPZ: KPNIH27_08340(rumB)
KPV: KPNIH29_08850(rumB)
KPW: KPNIH30_09110(rumB)
KPY: KPNIH31_08750(rumB)
KPG: KPNIH32_09215(rumB)
KPC: KPNIH10_08880(rumB)
KPQ: KPR0928_08770(rumB)
KPT: VK055_1599(rumB)
KPO: KPN2242_07515(rumB)
KPR: KPR_3692(rlmC)
KPJ: N559_3390
KPI: D364_04670(rumB)
KPA: KPNJ1_03635
KPS: KPNJ2_03624
KPX: PMK1_03226(rlmC)
KPB: FH42_00140(rumB)
KPNE: KU54_017545(rumB)
KPNU: LI86_17595(rumB)
KPNK: BN49_1986(rlmC)
KVA: Kvar_3487
KPE: KPK_3673(rumB)
KPK: A593_18965(rumB)
KVD: KR75_16595
KVQ: SP68_23010
KQU: AVR78_13265
KQV: B8P98_18820(rumB)
KOX: KOX_15705(rumB)
KOE: A225_1985
KOY: J415_21890(rumB)
KOM: HR38_14260(rumB)
KMI: VW41_06975(rumB)
KOK: KONIH1_09810(rumB)
KOC: AB185_26735(rumB)
EAE: EAE_14900(rumB)
EAR: CCG30984
KLL: BJF97_10070
KLW: DA718_18850(rlmC)
KAR: LGL98_16830(rlmC)
KGR: JJJ10_18735(rlmC)
KPAS: LUW96_16470(rlmC)
KLC: K7H21_18425(rlmC)
KLM: BWI76_09485(rumB)
REE: electrica_03433(rlmC)
KLP: GUC22_17760(rlmC)
ROR: RORB6_10720(rumB)
RON: TE10_10170(rumB)
RPLN: B1209_18290(rumB)
RAO: DSD31_17120
RTG: NCTC13098_05107(rlmC)
CRO: ROD_08651(rumB)
CKO: CKO_02247
CFD: CFNIH1_14435(rumB)
CBRA: A6J81_08440
CWE: CO701_14455
CYO: CD187_15425(rumB)
CPOT: FOB25_03350(rlmC)
CFQ: C2U38_08470
CSED: JY391_14035(rlmC)
CAMA: F384_04000(rumB)
CAF: AL524_18305
CIF: AL515_08915
CFAR: CI104_08735(rumB)
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CTEL: GBC03_21260(rlmC)
CITZ: E4Z61_09405(rlmC)
CARS: E1B03_09535(rlmC)
CIX: M4I31_15285(rlmC)
CIB: HF677_015465(rlmC)
CENS: P2W74_15225(rlmC)
CITR: GUC46_15550(rlmC)
CIQ: FD428_14035(rlmC)
CIY: HAP28_08945(rlmC)
EBT: EBL_c25510(rumB)
CNT: JT31_05410(rumB)
CEM: LH23_12535(rumB)
CEN: LH86_11935(rumB)
CLAP: NCTC11466_03082(rlmC)
PGE: LG71_20285(rumB)
ESC: Entcl_2957
KLE: AO703_07520(rumB)
KSA: C813_07095(rumB)
KOR: AWR26_16710(rlmC)
KRD: A3780_07545(rumB)
KCO: BWI95_13195(rumB)
KOT: EH164_14860(rlmC)
KPSE: IP581_07505(rlmC)
KOB: HF650_08315(rlmC)
KOO: O9K67_16380(rlmC)
KOU: C0557_07970
KCA: AAEY27_14555(rlmC)
KIE: NCTC12125_02117(rlmC)
KAS: KATP_30480(rlmC)
KLU: K7B04_13165(rlmC)
KCY: RIN60_15540(rlmC)
LAX: APT61_15300(rumB)
LEI: C2U54_12190(rumB)
LEH: C3F35_04280(rumB)
LEE: DVA44_16375
LER: GNG29_07395(rlmC)
LEA: GNG26_07025(rlmC)
LPNU: KQ929_13850(rlmC)
LEY: DVA43_10440
LAZ: A8A57_07320(rumB)
LEF: LJPFL01_1418
LEW: DAI21_19435
BUF: D8682_07840(rlmC)
BAGE: BADSM9389_27800(rumB)
BFT: MNO13_16920(rlmC)
BSEL: RHD99_16740(rlmC)
SYM: K6K13_08625(rlmC)
AHN: NCTC12129_01800(rumB)
ASUB: NLZ15_14055(rlmC)
YRE: HEC60_01415(rlmC)
SGOE: A8O29_015275(rlmC)
KIN: AB182_16800(rumB)
PDZ: HHA33_19340(rlmC)
METY: MRY16398_38750(rlmC)
IZH: FEM41_14140(rlmC)
PSHI: SAMEA2665130_2151(rlmC)
PSGC: G163CM_19360(rlmC)
SCOL: KFZ77_06370(rlmC)
PVJ: LMA04_05310(rlmC)
SUPE: P0H77_08400(rlmC)
TOE: QMG90_14080(rlmC)
MPHG: MPHASIOC01_000555(rlmC)
FPUL: ACBV55_07015(rlmC)
EBF: D782_2952
EBC: C2U52_27795
EBU: CUC76_06870
EBB: F652_642
PSTS: E05_10110
YPE: YPO1336
YPK: y2845
YPH: YPC_2850(rumB)
YPA: YPA_0626
YPN: YPN_2644
YPM: YP_1257(trmA1)
YPP: YPDSF_2360
YPG: YpAngola_A1568(rumB)
YPZ: YPZ3_1221
YPT: A1122_20570(rumB)
YPD: YPD4_1184
YPX: YPD8_0961
YPW: CH59_508(rumA)
YPJ: CH55_1210(rumA)
YPV: BZ15_2219(rumA)
YPL: CH46_3794(rumA)
YPS: YPTB1366
YPO: BZ17_1153(rumA)
YPI: YpsIP31758_2640(rumB)
YPY: YPK_2725
YPB: YPTS_1463
YPQ: DJ40_862(rumA)
YPU: BZ21_642(rumA)
YPR: BZ20_613(rumA)
YPC: BZ23_976(rumA)
YPF: BZ19_774(rumA)
YEN: YE1490
YEP: YE105_C2627
YEY: Y11_03711
YEW: CH47_944(rumA)
YET: CH48_158(rumA)
YEF: FORC2_1526
YEE: YE5303_13371
YSI: BF17_15850(rumB)
YAL: AT01_1014(rumA)
YFR: AW19_1735(rumA)
YIN: CH53_200(rumA)
YKR: CH54_4051(rumA)
YRO: CH64_1078(rumA)
YRU: BD65_3202(rumB)
YRB: UGYR_16295(rumB)
YAK: ACZ76_16310(rumB)
YMA: DA391_14615
YHI: D5F51_05825(rlmC)
YEL: LC20_03532
YCA: F0T03_08305(rlmC)
YMO: HRD69_18195(rlmC)
YAS: N0H69_11005(rlmC)
YKI: HRD70_12370(rlmC)
YEG: PL78_02410(rumB)
SMAR: SM39_1110(rumB)
SMAC: SMDB11_0941(rumB)
SMW: SMWW4_v1c16450(rumB)
SPE: Spro_1650
SRR: SerAS9_1628
SRL: SOD_c15220(rlmC)
SRY: M621_08475(rumB)
SPLY: Q5A_008215(rlmC)
SRS: SerAS12_1628
SRA: SerAS13_1629
SMAF: D781_1565
SLQ: M495_07805(rumB)
SERF: L085_20255(rumB)
SERS: SERRSCBI_07910(rumB)
SFW: WN53_17555(rumB)
SFG: AV650_12990(rumB)
SRZ: AXX16_3530
SERM: CLM71_07625
SQU: E4343_07870(rlmC)
SFJ: SAMEA4384070_1702(rlmC)
SOF: NCTC11214_05244(rlmC)
SSUR: ATE40_005025(rumB)
SURI: J0X03_15480(rlmC)
SRHZ: FO014_02265(rlmC)
SENP: KHA73_08475(rlmC)
SNEM: NLX84_08275(rlmC)
SNEV: OI978_25410(rlmC)
SGRI: SGBXF1_01625(rlmC)
SSAR: SSARUM_001610(rlmC)
SERB: QEP77_14160(rlmC)
SERN: GUC32_08160(rlmC)
SERT: TAN611_1686(rumB)
SERH: GF111_04120(rlmC)
SFO: Z042_21615(rumB)
RAH: Rahaq_2502
RACE: JHW33_04470(rlmC)
RAQ: Rahaq2_2562
RAA: Q7S_12655(rumB)
ROX: BV494_07120(rumB)
RVC: J9880_17265(rlmC)
RIU: I2123_11195(rlmC)
GQU: AWC35_19975(rumB)
EAME: GXP68_11300(rlmC)
RBAD: H2866_20490(rlmC)
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Reference
PMID:12907714
  Authors
Madsen CT, Mengel-Jorgensen J, Kirpekar F, Douthwaite S
  Title
Identifying the methyltransferases for m(5)U747 and m(5)U1939 in 23S rRNA using MALDI mass spectrometry.
  Journal
Nucleic Acids Res 31:4738-46 (2003)
DOI:10.1093/nar/gkg657
  Sequence
[eco:b0859]
Reference
PMID:21051506
  Authors
Auxilien S, Rasmussen A, Rose S, Brochier-Armanet C, Husson C, Fourmy D, Grosjean H, Douthwaite S
  Title
Specificity shifts in the rRNA and tRNA nucleotide targets of archaeal and bacterial m5U methyltransferases.
  Journal
RNA 17:45-53 (2011)
DOI:10.1261/rna.2323411
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LinkDB

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