KEGG   ORTHOLOGY: K23600
Entry
K23600                      KO                                     
Symbol
TARDBP, TDP43
Name
TAR DNA-binding protein 43
Pathway
map03015  mRNA surveillance pathway
map05014  Amyotrophic lateral sclerosis
map05022  Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
Disease
H00058  Amyotrophic lateral sclerosis (ALS)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K23600  TARDBP, TDP43; TAR DNA-binding protein 43
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05014 Amyotrophic lateral sclerosis
    K23600  TARDBP, TDP43; TAR DNA-binding protein 43
   05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
    K23600  TARDBP, TDP43; TAR DNA-binding protein 43
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K23600  TARDBP, TDP43; TAR DNA-binding protein 43
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Negative regulators of mRNA 3' end processing
     K23600  TARDBP, TDP43; TAR DNA-binding protein 43
Other DBs
GO: 0003730
Genes
HSA: 23435(TARDBP)
PTR: 107974879(TARDBP)
PPS: 100982231(TARDBP)
GGO: 101138626(TARDBP)
PON: 100174676(TARDBP)
NLE: 100602228(TARDBP)
MCC: 100423163(TARDBP)
MCF: 101926677 123569967
CSAB: 103225619(TARDBP)
CATY: 105580876(TARDBP)
PANU: 101012526(TARDBP)
RRO: 104654365(TARDBP)
RBB: 108539382(TARDBP)
TFN: 117091997 117093330(TARDBP)
PTEH: 111526306(TARDBP)
CJC: 100405373(TARDBP)
SBQ: 101048031(TARDBP)
CSYR: 103252231(TARDBP)
MMUR: 105886045(TARDBP)
OGA: 100955986(TARDBP)
MMU: 230908(Tardbp)
MCAL: 110292279(Tardbp)
MPAH: 110323474(Tardbp)
RNO: 298648(Tardbp)
MCOC: 116097020(Tardbp)
MUN: 110548149(Tardbp)
CGE: 100766288 100769142(Tardbp)
PLEU: 114709640
NGI: 103732929(Tardbp)
HGL: 101697585(Tardbp)
CPOC: 100718595(Tardbp)
CCAN: 109689654(Tardbp) 109690879
DORD: 105999208(Tardbp)
DSP: 122121407
NCAR: 124991957
OPI: 101531132
TUP: 102487775(TARDBP)
CFA: 478234(TARDBP)
VVP: 112929737(TARDBP)
VLG: 121496718
AML: 100466671(TARDBP)
UMR: 103666662(TARDBP)
UAH: 113270514(TARDBP)
UAR: 123779093
LLV: 125097952
MPUF: 101671013 101677431(TARDBP)
ORO: 101362265(TARDBP)
EJU: 114213202(TARDBP)
ZCA: 113929735
MLX: 118020014(TARDBP)
FCA: 101097257(TARDBP)
PYU: 121021006
PBG: 122479915
PTG: 102966136(TARDBP)
PPAD: 109274101(TARDBP)
AJU: 106984914(TARDBP)
BTA: 540632(TARDBP)
BOM: 102280144(TARDBP)
BIU: 109570391(TARDBP)
BBUB: 102415776(TARDBP)
CHX: 102186419(TARDBP)
OAS: 101114038(TARDBP)
ODA: 120880207
CCAD: 122451962
SSC: 100739753(TARDBP)
CFR: 102510362(TARDBP)
CBAI: 105070979(TARDBP)
CDK: 105107018(TARDBP)
VPC: 102528801(TARDBP)
BACU: 103005033(TARDBP)
LVE: 103075476(TARDBP)
OOR: 101283086(TARDBP)
DLE: 111187116(TARDBP)
PCAD: 102992395(TARDBP)
PSIU: 116758851(TARDBP)
ECB: 100051482(TARDBP)
EPZ: 103552241(TARDBP)
EAI: 106836681
MYB: 102240030(TARDBP)
MYD: 102767688(TARDBP)
MMYO: 118675854
MLF: 102433414(TARDBP)
MNA: 107540996(TARDBP)
PKL: 118732051
HAI: 109381285(TARDBP)
DRO: 112299102(TARDBP)
SHON: 118986357
AJM: 119064149
PDIC: 114496008
PHAS: 123831605
MMF: 118626290
RFQ: 117026791(TARDBP)
PALE: 102886005(TARDBP)
PGIG: 120585828
PVP: 105294377(TARDBP)
RAY: 107513107(TARDBP)
MJV: 108395495(TARDBP)
TOD: 119235573
SARA: 101549888(TARDBP)
LAV: 100661444(TARDBP)
TMU: 101342618
DNM: 101435926(TARDBP)
MDO: 100014246(TARDBP)
GAS: 123243091
SHR: 100925778(TARDBP)
PCW: 110199263(TARDBP)
OAA: 100078687
GGA: 419453(TARDBP)
PCOC: 116242634(TARDBP)
MGP: 100546731(TARDBP)
CJO: 107323404(TARDBP)
NMEL: 110408615(TARDBP)
APLA: 101801785(TARDBP)
ACYG: 106040227(TARDBP)
AFUL: 116497658(TARDBP)
TGU: 100218414(TARDBP)
LSR: 110470303(TARDBP)
SCAN: 103820769(TARDBP)
PMOA: 120511030
OTC: 121343874
PRUF: 121349632
GFR: 102042091(TARDBP)
FAB: 101808943(TARDBP)
PHI: 102106138(TARDBP)
PMAJ: 107213693(TARDBP)
CCAE: 111938690(TARDBP)
CCW: 104693351
ETL: 114056893(TARDBP)
ZAB: 102062320(TARDBP)
FPG: 101918834(TARDBP)
FCH: 102051132(TARDBP)
CLV: 102092254(TARDBP)
EGZ: 104133075(TARDBP)
NNI: 104008989(TARDBP)
ACUN: 113487865(TARDBP)
TALA: 104359359
PADL: 103917978(TARDBP)
ACHC: 115342612
AAM: 106482449(TARDBP)
AROW: 112970059(TARDBP)
NPD: 112959577(TARDBP)
DNE: 112980567(TARDBP)
ASN: 102371002(TARDBP)
AMJ: 102575271(TARDBP)
CPOO: 109314473(TARDBP)
GGN: 109293680(TARDBP)
PSS: 102453008(TARDBP)
CMY: 102929659
CPIC: 101951236
TST: 117868099(TARDBP)
CABI: 116821927(TARDBP)
MRV: 120387681
PVT: 110073232(TARDBP)
SUND: 121936758
PBI: 103053812(TARDBP)
PMUR: 107295523(TARDBP)
TSR: 106548092(TARDBP)
PGUT: 117673073(TARDBP)
VKO: 123030991
PMUA: 114602451(TARDBP)
ZVI: 118087953(TARDBP)
GJA: 107124368(TARDBP)
XLA: 108697517(tardbp.S) 380329(tardbp.L)
XTR: 394651(tardbp)
NPR: 108789104(TARDBP)
RTEM: 120915670
DRE: 325052(tardbpb) 386630(tardbpa)
CCAR: 109056374 109060967(tardbp)
IPU: 108271795(tardbpb) 108276095(tardbpa)
PHYP: 113528780 113530623(tardbp)
SMEO: 124384148(tardbpb)
TFD: 113643023(tardbpb) 113658158(tardbpa)
AMEX: 103025275(tardbp) 103044966
EEE: 113577984 113581280(tardbp)
TRU: 101062123 101072455(tardbp)
LCO: 109137047(tardbp)
NCC: 104954117(tardbp) 104956354
CGOB: 115008690 115010856(tardbp)
ELY: 117256822(tardbp) 117258477(tardbpl)
PLEP: 121947223(tardbpa) 121958234(tardbpb)
SLUC: 116040755(tardbpl) 116051264
ECRA: 117942984(tardbp) 117947812(tardbpl)
PFLV: 114553937 114559169(tardbp)
GAT: 120829815(tardbpa) 120834653(tardbpb)
PPUG: 119222438(tardbpl) 119229656
MSAM: 119886351(tardbpb) 119919335(tardbpa)
CUD: 121504401(tardbpb) 121517655(tardbpa)
MZE: 101465279(tardbp) 101487819
ONL: 100698312(tardbp) 100704166
OAU: 116309735(tardbpa) 116334261(tardbpb)
OLA: 101167445 101173545(tardbp)
OML: 112145330(tardbp) 112158828(tardbpl)
XMA: 102220505 102227033(tardbp)
XCO: 114136111 114144711(tardbp)
XHE: 116711041 116725906(tardbp)
PRET: 103464518 103467222(tardbp)
PMEI: 106916315 106931269(tardbp)
GAF: 122833598(tardbpb) 122834529(tardbpa)
CVG: 107086901(tardbp) 107089340
CTUL: 119775071(tardbpb) 119797067(tardbpa)
GMU: 124857026(tardbpb) 124875040(tardbpa)
NFU: 107385215 107390749(tardbp)
KMR: 108231372 108236806(tardbpl)
NWH: 119411801(tardbpb) 119417038(tardbpa)
AOCE: 111573234(tardbp) 111579909
CSEM: 103384949(tardbp) 103385642
POV: 109630803(tardbp) 109638570
SSEN: 122768593(tardbpb) 122776824(tardbpa)
HHIP: 117761614(tardbp) 117764884(tardbpl)
LCF: 108876387(tardbp) 108899245
SDU: 111219119(tardbp) 111222865
SLAL: 111653824 111670674(tardbp)
XGL: 120782911(tardbpb) 120804187(tardbpa)
HCQ: 109507104 109526613(tardbp)
BPEC: 110164563(tardbp) 110168628
MALB: 109959029 109971652(tardbp)
SASA: 106565996(TADBP) 106566965(TADBP) 106572054(tardbp) 106582768(TADBP)
OTW: 112232611(tardbpa) 112240771 112247071(tardbpb) 112254245
ELS: 105022966(tardbp) 105025427
SFM: 108918549 108923254(tardbp)
PKI: 111834418(tardbp) 111857063
AANG: 118207625(tardbpl)
LOC: 102690303(tardbp)
LCM: 102358490(TARDBP)
CMK: 103181366(tardbpa)
RTP: 109913429(tardbp)
BBEL: 109487512
CIN: 778772(tardbp)
SKO: 100375928
DME: Dmel_CG10327(TBPH) Dmel_CG7804(cocoon)
DER: 6548015
DSI: Dsimw501_GD12565(Dsim_GD12565) Dsimw501_GD25005(Dsim_GD25005)
DAN: 6495302
DSR: 110191482
DPE: 6590367
DWI: 6640908
DGR: 6559149
DAZ: 108615185
DNV: 108652946
DHE: 111600009
CCAT: 101459254
BOD: 106626889
MDE: 101898617
SCAC: 106094597
LCQ: 111681897
ACOZ: 120949113
AARA: 120908750
AAG: 110679098
CPII: 120420201
AME: 409065
BIM: 100742833
BBIF: 117214154
BVK: 117242309
BVAN: 117161057
BTER: 100646812
BPYO: 122576478
OBB: 114872191
MGEN: 117226859
NMEA: 116432976
CGIG: 122404112
SOC: 105204593
AEC: 105154451
ACEP: 105621053
PBAR: 105430744
VEM: 105558958
HST: 105187190
DQU: 106751046
CFO: 105257957
FEX: 115235774
PGC: 109861524
PCF: 106790228
PFUC: 122513605
VPS: 122637160
NVI: 100118477
CSOL: 105365483
TPRE: 106659904
MDL: 103578168
CGLO: 123261286
DAM: 107041067
AGIF: 122859175
CCIN: 107267257
TCA: 656201
DPA: 109537635
SOY: 115885016
ATD: 109605517
CSET: 123311402
AGB: 108906993
NVL: 108563162
PPYR: 116161034
OTU: 111417047
BMAN: 114243264
BANY: 112043405
PPOT: 106111165
PXU: 106117256
HAW: 110381122
TNL: 113498405
OFU: 114352960
PXY: 105384850
BTAB: 109038269
DCI: 103524885
CLEC: 106670389
HHAL: 106684741
NLU: 111044610
FOC: 113207566
ZNE: 110827530
CSEC: 111865378
FCD: 110852457
DMK: 116920787
PJA: 122243737
PCHN: 125026549
HAME: 121858650
PCLA: 123768431
PTRU: 123513851
HAZT: 108680694
DSV: 119445726
RSAN: 119390579
RMP: 119171565
VDE: 111252877
VJA: 111262103
DPTE: 113795220
DFR: 124497859
CSCU: 111625570
PTEP: 107445603
SDM: 118183788
CEL: CELE_F44G4.4(tdp-1)
CBR: CBG_03235(Cbr-tdp-1)
BMY: BM_BM10439(Bm10439) BM_BM4094(Bma-tdp-1) BM_BM4095(Bm4095)
LAK: 106159635
EGL: EGR_01051
NVE: 5516963
EPA: 110237159
ATEN: 116303252
ADF: 107333856
AMIL: 114962015
PDAM: 113682505
SPIS: 111329210
DGT: 114518423
XEN: 124443667
HMG: 100214458
AQU: 100632327
 » show all
Reference
PMID:7745706
  Authors
Ou SH, Wu F, Harrich D, Garcia-Martinez LF, Gaynor RB
  Title
Cloning and characterization of a novel cellular protein, TDP-43, that binds to human immunodeficiency virus type 1 TAR DNA sequence motifs.
  Journal
J Virol 69:3584-96 (1995)
DOI:10.1128/JVI.69.6.3584-3596.1995
  Sequence
[hsa:23435]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system