KEGG   ORTHOLOGY: K08300
Entry
K08300                      KO                                     
Symbol
rne
Name
ribonuclease E [EC:3.1.26.12]
Pathway
map03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K08300  rne; ribonuclease E
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K08300  rne; ribonuclease E
   03009 Ribosome biogenesis
    K08300  rne; ribonuclease E
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.26  Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.26.12  ribonuclease E
     K08300  rne; ribonuclease E
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     K08300  rne; ribonuclease E
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic type
  rRNA processing factors
   K08300  rne; ribonuclease E
Other DBs
COG: COG1530
GO: 0008995
Genes
ECO: b1084(rne)
ECJ: JW1071(rne)
ECD: ECDH10B_1155(rne)
EBW: BWG_0932(rne)
ECOK: ECMDS42_0904(rne)
ECOC: C3026_06565(rne)
ECE: Z1722(rne)
ECS: ECs_1462(rne)
ECF: ECH74115_1463(rne)
ETW: ECSP_1385(rne)
ELX: CDCO157_1397(rne)
EOI: ECO111_1361(rne)
EOJ: ECO26_1417(rne)
EOH: ECO103_1129(rne)
ECOO: ECRM13514_1375(rne)
ECOH: ECRM13516_1332(rne)
ESL: O3K_15140(rne)
ESO: O3O_10160(rne)
ESM: O3M_15115(rne)
ECK: EC55989_1197(rne)
ECG: E2348C_1176(rne)
EOK: G2583_1343(rne)
ELR: ECO55CA74_06555(rne)
ELH: ETEC_1149
ECW: EcE24377A_1207(rne)
ECP: ECP_1076
ENA: ECNA114_1141(rne)
ECOS: EC958_1279
ECV: APECO1_166(rne)
ECOA: APECO78_09385(rne)
ECX: EcHS_A1207(rne)
ECM: EcSMS35_2042(rne)
ECY: ECSE_1147
ECR: ECIAI1_1120(rne)
ECQ: ECED1_1228(rne)
EUM: ECUMN_1260(rne)
ECT: ECIAI39_2076(rne)
EOC: CE10_1165(rne)
EBR: ECB_01080(rne)
ECOB: C3029_09875(rne)
EBL: ECD_01080(rne)
EBE: B21_01088(rne)
EBD: ECBD_2516
ECI: UTI89_C1209(rne)
EIH: ECOK1_1192(rne)
ECZ: ECS88_1098(rne)
ECC: c1353(rne)
ELO: EC042_1153(rne)
ELN: NRG857_05230(rne)
ESE: ECSF_0983
EKF: KO11_17300(rne)
EAB: ECABU_c12980(rne)
EDJ: ECDH1ME8569_1019(rne)
ELU: UM146_11905(rne)
ELW: ECW_m1191(rne)
ELL: WFL_05820(rne)
ELC: i14_1237(rne)
ELD: i02_1237(rne)
ELF: LF82_1909(rne)
ECOL: LY180_05625(rne)
ECOI: ECOPMV1_01163(rne)
ECOJ: P423_05835(rne)
EFE: EFER_1844(rne)
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STY: STY1226(ams)
STT: t1734(rne)
SENT: TY21A_08815(rne)
STM: STM1185(rne)
SEO: STM14_1357(rne)
SEY: SL1344_1122(rne)
SEM: STMDT12_C12030(rne)
SEJ: STMUK_1153(rne)
SEB: STM474_1181(rne)
SEF: UMN798_1232(ams)
SETU: STU288_02255(rne)
SETC: CFSAN001921_11250(rne)
SENR: STMDT2_11191(ams)
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SENI: CY43_06040(rne)
SEEN: SE451236_11775(rne)
SPT: SPA1666(rne)
SEK: SSPA1548
SEI: SPC_2564(rne)
SEC: SCH_1132(rne)
SHB: SU5_01812
SENH: CFSAN002069_03095(rne)
SEEH: SEEH1578_15155(rne)
SENS: Q786_09335(rne)
SED: SeD_A2187
SEG: SG1937(rne)
SEL: SPUL_0986(rne)
SEGA: SPUCDC_0986(rne)
SET: SEN1863(rne)
SENA: AU38_09645(rne)
SENO: AU37_09650(rne)
SENV: AU39_09655(rne)
SENQ: AU40_10790(rne)
SENL: IY59_09910(rne)
SENJ: CFSAN001992_05715(rne)
SEEC: CFSAN002050_12315(rne)
SEEB: SEEB0189_013645(rne)
SENE: IA1_05840(rne)
SENC: SEET0819_12570(rne)
SBG: SBG_1025(rne)
SBZ: A464_1121
SBV: N643_04870(rne)
SFL: SF1088(rne)
SFX: S1168(rne)
SFV: SFV_1106(rne)
SFE: SFxv_1239(rne)
SFN: SFy_1572
SFS: SFyv_1623
SFT: NCTC1_01141(rne)
SSN: SSON_1104(rne)
SBO: SBO_1980(rne)
SBC: SbBS512_E2241(rne)
SDY: SDY_2067(rne)
SHQ: A0259_09560(rne)
ENC: ECL_02552
ENL: A3UG_08490(rne)
ECLE: ECNIH2_09155(rne)
ECLN: ECNIH4_14145(rne)
ECLI: ECNIH5_08195(rne)
ECLX: LI66_08240(rne)
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ECLZ: LI64_08560(rne)
EHM: AB284_16760(rne)
ECLA: ECNIH3_08205(rne)
ECLC: ECR091_08180(rne)
EAU: DI57_10355(rne)
ENO: ECENHK_08500(rne)
EEC: EcWSU1_01678(rne)
ECLS: LI67_009595(rne)
EPT: HWQ17_04245(rne)
ENR: H650_24515(rne)
ENX: NI40_008395(rne)
ENF: AKI40_2604(rne)
END: A4308_13205(rne)
ENZ: G0034_08325(rne)
ENK: LOC22_18940(rne)
EMOR: L6Y89_08235(rne)
EQU: OM418_08215(rne)
EPU: QVH39_08675(rne)
ESA: ESA_02261
CSK: ES15_2402(rne)
CSZ: CSSP291_10705(rne)
CCON: AFK62_07775(rne)
CDM: AFK67_07925(rne)
CMJ: AFK66_012050(rne)
CUI: AFK65_07680(rne)
CMW: AFK63_10965(rne)
CTU: CTU_16630(rne)
KPN: KPN_01083(rne)
KPU: KP1_2074(rne)
KPP: A79E_3147
KPH: KPNIH24_18725(rne)
KPZ: KPNIH27_09265(rne)
KPV: KPNIH29_09795(rne)
KPW: KPNIH30_10315(rne)
KPY: KPNIH31_09700(rne)
KPG: KPNIH32_10155(rne)
KPC: KPNIH10_09800(rne)
KPQ: KPR0928_09975(rne)
KPT: VK055_1382(rne)
KPO: KPN2242_08480(rne)
KPR: KPR_2129(rne)
KPJ: N559_3205
KPI: D364_05625(rne)
KPX: PMK1_03422(rne)
KPB: FH42_01265(rne)
KPNE: KU54_016345(rne)
KPNU: LI86_16655(rne)
KPNK: BN49_2170(rne)
KVA: Kvar_3298
KPE: KPK_3473(rne)
KPK: A593_19915(rne)
KOX: KOX_17245(rne)
KOE: A225_2302
KOY: J415_20295(rne)
KOM: HR38_15780(rne)
KMI: VW41_08090(rne)
KOK: KONIH1_11260(rne)
KOC: AB185_24880(rne)
EAE: EAE_16335(rne)
EAR: CCG30655
KAR: LGL98_15820(rne)
KGR: JJJ10_17265(rne)
KPAS: LUW96_17880(rne)
KLC: K7H21_16980(rne)
REE: electrica_03172(rne)
ROR: RORB6_09245(rne)
RON: TE10_11315(rne)
RTG: NCTC13098_04465(rne)
CRO: ROD_11461(rne)
CKO: CKO_01975
CFD: CFNIH1_15430(rne)
CSED: JY391_09765(rne)
CAMA: F384_05380(rne)
CIX: M4I31_14230(rne)
CIB: HF677_014550(rne)
CENS: P2W74_14145(rne)
BFL: Bfl410(rne)
BPN: BPEN_422(rne)
BVA: BVAF_412(rne)
BCHR: BCHRO640_433(rne)
BHB: M9394_00380(rne)
BVX: M9408_00385(rne)
BEN: BOBLI757_413(rne)
BED: BTURN675_399(rne)
BEM: M9396_00350(rne)
BOCR: M9405_01985(rne)
HDE: HDEF_0352(rne)
SECT: A359_07890
SEHC: A35E_00384
MEN: MEPCIT_156(rne)
MEO: MPC_467(rne)
EBT: EBL_c24220(rne)
CNT: JT31_04345(rne)
CEM: LH23_13675(rne)
CEN: LH86_12980(rne)
CLAP: NCTC11466_02822(rne)
PGE: LG71_18965(rne)
KLE: AO703_08650(rne)
KOR: AWR26_15520(rne)
KRD: A3780_08750(rne)
KPSE: IP581_08905(rne)
KOB: HF650_09330(rne)
KOO: O9K67_15125(rne)
KIE: NCTC12125_01813(rne_1)
KAS: KATP_27860(rne)
KLU: K7B04_14615(rne)
KCY: RIN60_13775(rne)
ICP: ICMP_374(rne)
LAX: APT61_14025(rne)
LPNU: KQ929_12565(rne)
BFT: MNO13_15590(rne)
SBW: TGUWTKB_5770(rne)
DEN: MHIR_DE00210(rne)
HED: TPER_HE00292(rne)
GED: FVIR_GE00460(rne)
CMIK: PMARG_ME00075(rne)
PPET: C9I82_408
SYM: K6K13_12825(rne)
AHN: NCTC12129_03131(rne)
ASUB: NLZ15_08870(rne)
YRE: HEC60_02755(rne)
SGOE: A8O29_014275(rne)
KIN: AB182_09515(rne)
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YPR: BZ20_3729
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YEY: Y11_05201
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PVA: Pvag_0886(rne)
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XPO: XPG1_1309(rne)
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SMAA: IT774_09410(rne)
GNI: GNIT_1722(rne)
GPS: C427_2794
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PAEW: KIH87_08735(rne)
AGZ: M0C34_10245(rne)
AGQ: LQZ07_14005(rne)
ALKM: NKI27_11490(rne)
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ALII: QR722_10270(rne)
PIN: Ping_2208
FBL: Fbal_1387
FES: HER31_03555(rne)
MVS: MVIS_2119(rne)
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MOQ: HWV03_11700(rne)
CJA: CJA_1667
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SAGA: M5M_03695(rnaseE)
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MCA: MCA1481(rne)
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FTS: F92_03935
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FTC: DA46_2103
FTV: CH67_1041
FTZ: CH68_774
FTM: FTM_0716(rne)
FTN: FTN_1246(rne)
FTX: AW25_760
FTD: AS84_1268
FTY: CH70_682
FPH: Fphi_1434
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Reference
  Authors
Carpousis AJ
  Title
The RNA degradosome of Escherichia coli: an mRNA-degrading machine assembled on RNase E.
  Journal
Annu Rev Microbiol 61:71-87 (2007)
DOI:10.1146/annurev.micro.61.080706.093440
  Sequence
[eco:b1084]
Reference
  Authors
Marcaida MJ, DePristo MA, Chandran V, Carpousis AJ, Luisi BF
  Title
The RNA degradosome: life in the fast lane of adaptive molecular evolution.
  Journal
Trends Biochem Sci 31:359-65 (2006)
DOI:10.1016/j.tibs.2006.05.005
  Sequence
[eco:b1084]
Reference
  Authors
Garrey SM, Blech M, Riffell JL, Hankins JS, Stickney LM, Diver M, Hsu YH, Kunanithy V, Mackie GA
  Title
Substrate binding and active site residues in RNases E and G: role of the 5'-sensor.
  Journal
J Biol Chem 284:31843-50 (2009)
DOI:10.1074/jbc.M109.063263
  Sequence
[eco:b1084]
LinkDB

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