KEGG   ORTHOLOGY: K12126
Entry
K12126                      KO                                     
Symbol
PIF3
Name
phytochrome-interacting factor 3
Pathway
map04075  Plant hormone signal transduction
map04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04075 Plant hormone signal transduction
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
Transcription factors [BR:ko03000]
 Eukaryotic type
  Basic helix-loop-helix (bHLH)
   HLH domain only
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
Genes
ATH: AT1G09530(PIF3)
ALY: 9328571
CRB: 17897209
CSAT: 104739545 104755147 104767826
EUS: EUTSA_v10007343mg
BRP: 103843349 103871725
BNA: 106346269 106397555 106419805 111197989
BOE: 106307202 106343710
RSZ: 108815296 108856167
THJ: 104820437 104823710
CPAP: 110814175
CIT: 102608210 102621125
CIC: CICLE_v10019786mg CICLE_v10027890mg
PVY: 116109775 116119657 116143263
MINC: 123196852 123216759 123221777 123222501
TCC: 18600647 18613821
GRA: 105761152 105795211 105802905
GHI: 107912232 107922999 107927211 107953017 107954397 107955422
GAB: 108457881 108474109 108479827
DZI: 111277137 111294151 111297995 111304928
EGR: 104431553 104434287 104456902
GMX: 100794974 100804665 100818543 100820151 102659557
GSJ: 114370212 114372651 114399010 114403093 114407482
PVU: PHAVU_001G218800g PHAVU_007G206000g PHAVU_007G208500g
VRA: 106756809 106757404 106772189
VAR: 108325538 108326247 108327124 108328010
VUN: 114168622 114181698 114192043
CCAJ: 109797206 109808333 109809145
APRC: 113863341 113871065 113873753
MTR: MTR_1g084980 MTR_7g110810 MTR_7g111320
CAM: 101490374 101501589
LJA: Lj0g3v0276629.1(Lj0g3v0276629.1) Lj1g3v4830130.1(Lj1g3v4830130.1) Lj5g3v1533330.1(Lj5g3v1533330.1)
ADU: 107465071 107465093 107492248 107492316
AIP: 107617992 107619574 107645992 107646015
AHF: 112695628 112695653 112710631 112710671 112757529 112757971 112775424 112779460
LANG: 109328952 109329450 109335282 109335978 109345863 109346242
FVE: 101314290
RCN: 112192990
PPER: 18774504
PMUM: 103344515
PAVI: 110770588
PDUL: 117631021
MDM: 103433823 103450807
PXB: 103928262 103955304 103955840
ZJU: 107411687 107426221
MNT: 21405471
CSV: 101216738
CMO: 103493865
BHJ: 120079649
MCHA: 111023303
CMAX: 111468592 111493939
CMOS: 111444298 111450526
CPEP: 111804719
RCU: 8265863 8274969
JCU: 105642714 105647368
HBR: 110633971 110634469 110644015 110653382 110661711
MESC: 110615566 110621032 110622868
POP: 18098446 7478869 7486837
PEU: 105120049 105125228 105135723 105136420
PALZ: 118034932 118041138 118060868
JRE: 109000498 109007770 109018735
QSU: 111988490 112000967
QLO: 115972550 115979922
TWL: 120011465
VVI: 100247781 100253874
VRI: 117918322 117930702
SLY: 101267355
SPEN: 107008621
SOT: 102604891
CANN: 107839757
NTA: 107784593 107795081 107827926
NSY: 104224933 104241015
NTO: 104086604
NAU: 109234067 109236817
INI: 109165868 109174582
ITR: 116028090 116032601
SIND: 105169008
OEU: 111382213 111384888 111410790
EGT: 105967012 105978175
SSPL: 121742142 121743530 121755927 121755985 121758898
HAN: 110885065 110915563
ECAD: 122595537
LSV: 111890722
CCAV: 112517443
DCR: 108202420
CSIN: 114266873 114307536
BVG: 104890618
SOE: 110787251
CQI: 110701254 110736579
NNU: 104585579 104607195
MING: 122063719
PSOM: 113334522 113358034
NCOL: 116262366
OSA: 4327916
DOSA: Os01t0286100-01(Os01g0286100)
OBR: 102711850
BDI: 100823250 100844358
ATS: 109750422
TDC: 119323988 119364251
TAES: 123110986 123180361 123190549
SBI: 110433966 8071295
ZMA: 100382453 103641361
SITA: 101757582 101773457
SVS: 117847462
PVIR: 120672004 120697388 120706604
PHAI: 112884077 112894423
PDA: 103697220 103714720 103720128
EGU: 105035562 105040114 105059744
MUS: 103985843 103993869
DCT: 110113204
PEQ: 110022360
AOF: 109843010 109848277
ATR: 18430168
SMO: SELMODRAFT_114141(PIF3)
PPP: 112275291 112286119 112291418 112294434
 » show all
Reference
PMID:9845368
  Authors
Ni M, Tepperman JM, Quail PH.
  Title
PIF3, a phytochrome-interacting factor necessary for normal photoinduced signal transduction, is a novel basic helix-loop-helix protein.
  Journal
Cell 95:657-67 (1998)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)81636-0
  Sequence
[ath:AT1G09530]
Reference
PMID:10797009
  Authors
Martinez-Garcia JF, Huq E, Quail PH
  Title
Direct targeting of light signals to a promoter element-bound transcription factor.
  Journal
Science 288:859-63 (2000)
DOI:10.1126/science.288.5467.859
  Sequence
[ath:AT1G09530]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system