KEGG   ORTHOLOGY: K15083
Entry
K15083                      KO                                     
Symbol
RAD16
Name
DNA repair protein RAD16
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K15083  RAD16; DNA repair protein RAD16
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     NER4 complex
      K15083  RAD16; DNA repair protein RAD16
Genes
CLON: 129618345
ATH: AT1G02670 AT1G05120
ALY: 9325601 9325845
CRB: 17897011
CSAT: 104739045 104754655 104759988 104762973
EUS: EUTSA_v10006803mg
BRP: 103836539 103844170 103844175
BNA: 106400558 106401094 106423628 111213864 125577210
BOE: 106312542 106343203 106343321
RSZ: 108821177 108861532 130494247 130506940 130508605 130508613
THJ: 104800996 104801007
CPAP: 110811532
CIT: 102630106
CIC: CICLE_v10014220mg
PVY: 116133899
MINC: 123196101
TCC: 18610587
GRA: 105794145
GHI: 107887153 121214653
GAB: 108479448
HSYR: 120168944
DZI: 111318430
EGR: 104424755
RARG: 115750896
GMX: 100786366 100798333
GSJ: 114376601 114380037
PVU: 137835554
VRA: 106762762
VAR: 108334284
VUN: 114185318
VUM: 124845669
CCAJ: 109817394
APRC: 113855917 113857873
MTR: 11443944
TPRA: 123920319
CAM: 101497977
PSAT: 127086723 127086724 127105669
VVO: 131601767 131638151 131647853 131651031 131653502 131653504
LJA: 130747041 130747064
ADU: 107461959 107477724 127744103
AIP: 107614449 107629976
AHF: 112706989 112737516 112772490 112789592
LANG: 109325605 109350880
PCIN: 129313065
QSA: O6P43_028664
FVE: 101301435
AANS: 126799254
RCN: 112185830
PPER: 18782043
PMUM: 103329295
PAVI: 110764286
PDUL: 117622735
MDM: 103404830
MSYL: 126612289
PCOX: 137707563
ZJU: 107414180
MNT: 21395176
CSAV: 115699045
CSV: 101217865
CMO: 103495970
BHJ: 120088695
MCHA: 111011036
CMAX: 111484062
CMOS: 111448500
CPEP: 111777227
RCU: 8285886
MEAN: 126656460
HBR: 110645249 110669885
MESC: 110627318
POP: 7463406
PEU: 105141660
PALZ: 118040184
PNZ: 133682495
JRE: 109014303
CILL: 122303798
CAVE: 132181471 132181473
AGLU: 133860685 133860686
QSU: 112039680
QLO: 115955945
TWL: 119991631
VVI: 100248564 100253670 100258816 100267049
VRI: 117922907 117923248 117923415 117926516
SLY: 101249085 101251601 101253398 101254010 101254315 101254345 101262723
SPEN: 107001711 107006318 107018510 107020828 107025229 107025231 107025465
SOT: 102584572 102586115 102590390 102593550 102597176 102598459
SSTN: 125842294 125868429 125869272 125876030 125877059 125877060 125877061 125877229 125877295
SDUL: 129872853 129880704 129893396
CANN: 107870827 107878213
LBB: 132618966 132640573
NTA: 107759346 107765031 107783776
NSY: 104231492 104241999
NTO: 104085165 104113252 104118403
NAU: 109225522 109230535
INI: 109159198 109169861
ITR: 116029308
SIND: 105178493
OEU: 111393446 111393448 111402510
EGT: 105961738
SSPL: 121741844 121745053 121757262 121758124
SMIL: 131009362
SHIS: 125189184 125196821
APAN: 127265840
HAN: 110908430 110929694
ECAD: 122600128
LSV: 111905656
CCAV: 112500920
DCR: 108220328 108220338 108220347 108220357 108220366 108221881 108227495
CSIN: 114267280 114312744
RVL: 131330648
AEW: 130789775
DLT: 127792442
BVG: 104903338
SOE: 110795680
CQI: 110711824 110740289
ATRI: 130805681
MOF: 131148812 131154425
NNU: 104588307
MING: 122057848 122078079 122083109 122092326
TSS: 122639648 122639650 122659542
PSOM: 113303817
OSA: 4343361
DOSA: Os07g0511500
OBR: 102700814
OGL: 127778872
BDI: 100826734
ATS: 109759937
TDC: 119354335
TAES: 123044702 123052565 123188450
TUA: 125537262
LPER: 127333349
LRD: 124675673
SBI: 8077499
ZMA: 103633219
MFLO: 136542369
SITA: 101779275
SVS: 117845918
PVIR: 120661478
PHAI: 112883587
PAUA: 133891547 133892393
PDA: 103717783
EGU: 105051048
MUS: 135583042
ZOF: 122010444 122017077
DCT: 110107151
PEQ: 110032652
AOF: 109833490
MSIN: 131242682
ACAK: 137945233
NCOL: 116246301
ATR: 18445783 18445784
CJF: 131066307
SMO: SELMODRAFT_123971(CHR37-1) SELMODRAFT_128555(CHR37-2)
CRE: CHLRE_11g479300v5
VCN: VOLCADRAFT_107529
MNG: MNEG_13186
CSL: COCSUDRAFT_38028
APRO: F751_1706
OLU: OSTLU_27249(CHR3524) OSTLU_36534(CHR3501)
OTA: OT_ostta13g02730
BPG: Bathy04g01900
MIS: MICPUN_81085
MPP: MICPUCDRAFT_58044
CCP: CHC_T00008080001
SCE: YBR114W(RAD16)
SEUB: DI49_1146
SPAO: SPAR_B02150
AGO: AGOS_ADL345C
ERC: Ecym_3458
KLA: KLLA0_B09240g
KMX: KLMA_80298(RAD16)
LTH: KLTH0F10406g
VPO: Kpol_1006p5
ZRO: ZYRO0C16544g
CGR: 2890360(GVI51_K07645)
NCS: NCAS_0I01050(NCAS0I01050)
NDI: NDAI_0A07960(NDAI0A07960)
TPF: TPHA_0A03530(TPHA0A03530)
TBL: TBLA_0H01510(TBLA0H01510)
TGB: HG536_0B02100
TDL: TDEL_0C05100(TDEL0C05100)
KAF: KAFR_0D02640(KAFR0D02640)
KNG: KNAG_0B01440(KNAG0B01440)
ZMK: HG535_0A02160
SLUD: SCDLUD_000583
DHA: DEHA2D07942g
PIC: PICST_49179(RAD16)
PGU: PGUG_02418
SPAA: SPAPADRAFT_132693
LEL: PVL30_001488(RAD16)
LBG: 92208091(LODBEIA_P28950)
CAL: CAALFM_C102810WA(RAD16)
CTP: CTRG_04680
COT: CORT_0B09500
CDU: CD36_02610
CTEN: 18249139(RAD16)
CLU: CLUG_04445
CLUS: A9F13_04g00594
CAUR: CJI96_0001809
ASAU: 88172375(PUMCH_001309)
PPA: PAS_chr1-4_0154
PKZ: C5L36_0B02170
BNN: FOA43_002998(RAD16)
BBRX: BRETT_000767(RAD16)
OPA: HPODL_02433
YLI: 2908216(YALI2_F00978g)
SLB: AWJ20_4944(RAD16)
NCR: NCU03650(rad16)
NTE: NEUTE1DRAFT135230(NEUTE1DRAFT_135230)
SMP: 10809780(SMAC4_02527)
PAN: PODANSg8967
PBEL: QC761_211100(RAD16)
PPSD: QC762_211100(RAD16)
PPSP: QC763_211100(RAD16)
PPSA: QC764_211100(RAD16)
TTT: THITE_2108697
MTM: MYCTH_2302441
RTHE: 98124561(VTJ83DRAFT_3529)
MGR: MGG_07014
PPEI: PpBr36_07489
PGRI: PgNI_06105
TMN: UCRPA7_6965
SSCK: SPSK_04885
FGR: FGSG_05904
FPU: FPSE_03075
FPOA: FPOAC1_008871
FVN: FVRRES_09484
FVR: FVEG_04531
FOX: FOXG_07602
NHE: NECHADRAFT_123411(CHR2127)
FFC: NCS54_01177300
FKR: NCS57_01168100
FMU: J7337_006574
TRE: TRIREDRAFT_121381
TRR: M419DRAFT_136802
TATV: 25778669(TrAtP1_011561)
TASP: 36612061(TrAFT101_008566)
MAW: 19250337(RAD16_1)
MAJ: MAA_06158
MBRN: 26238002(RAD16)
PCHM: VFPPC_06149
CMT: CCM_07907
AMUS: LMH87_003038
PLJ: 28888694(PLICBS_009129)
PTKZ: JDV02_005820(RAD16)
VAL: VDBG_04033
VDA: VDAG_01266
CFJ: CFIO01_10547
CLUP: CLUP02_07709
CHIG: CH63R_04044
CDET: 87941078(CDEST_04575)
SAPO: SAPIO_CDS9554
ELA: UCREL1_4005
PFY: PFICI_12070
SSL: SS1G_03060
BFU: BCIN_06g06920
MBE: MBM_08551
PSCO: LY89DRAFT_711924
GLZ: GLAREA_05864
ANI: ANIA_04272
AFM: AFUA_7G03820
ACT: ACLA_005520
NFI: NFIA_024780
AOR: AO090026000833
ANG: An13g00240
AFV: AFLA_005452
ALUC: AKAW2_20176S(RAD16)
ACHE: ACHE_40244S(RAD16)
APUU: APUU_60522S(RAD16)
PCS: N7525_009314
PDP: PDIP_01910
POU: POX_h09606
TMF: EYB26_005595
TRG: TRUGW13939_09653
CIM: CIMG_07485
CPW: 9693615(RAD16)
URE: UREG_07797
ABE: ARB_00897
TVE: TRV_01372
PBL: PAAG_06688
PBN: PADG_01144
AJE: HCAG_06421
BGH: BDBG_02685
PNO: SNOG_15379
PTE: PTT_09092
PTRR: 6339431(PtrM4_016500)
BZE: COCCADRAFT_6221
BSC: COCSADRAFT_136512
BOR: COCMIDRAFT_9754
AALT: CC77DRAFT_1094323
ADAC: 96088563(ACET3X_008241)
ARAB: EKO05_0002825
ZTR: MYCGRDRAFT_46029
PFJ: MYCFIDRAFT_154753
FFU: CLAFUR5_07285
CBET: CB0940_09727
BCOM: BAUCODRAFT_68713
NPA: UCRNP2_6785
SPO: 2538860(rhp16)
SOM: SOMG_02550(rhp16)
CNE: CNE00510
CNB: CNBE0430
CNG: CNAG_02512
CGI: CGB_E0440W
CDEU: CNBG_4211
CDEC: 89991458(IAS62_004686)
CDEP: 91086439(L203_102227)
KMG: 30163778(I203_102987)
KNE: 92182039(IAR55_004781)
KDJ: 28971151(I303_108222)
KBI: 30212202(I302_108668)
TMS: TREMEDRAFT_36553
TASA: A1Q1_07710
CCAC: CcaHIS019_0110940(RAD16)
TVS: TRAVEDRAFT_144646
DSQ: DICSQDRAFT_154283
PCO: PHACADRAFT_114435
SHS: STEHIDRAFT_59279
HIR: HETIRDRAFT_381949
PSQ: PUNSTDRAFT_64262
ADL: AURDEDRAFT_55390
FME: FOMMEDRAFT_90593
GTR: GLOTRDRAFT_71378
RSX: RhiXN_03802
CCI: CC1G_09941
ABP: AGABI1DRAFT123009(AGABI1DRAFT_123009)
ABV: AGABI2DRAFT184339(AGABI2DRAFT_184339)
PCUB: JR316_0005120
MRR: Moror_1555
MORE: E1B28_003995
SCM: SCHCO_068280(SCHCODRAFT_068280)
CPUT: CONPUDRAFT_122767
SLA: SERLADRAFT_459982
WSE: WALSEDRAFT_20372
WIC: J056_000878
UMA: UMAG_03263
PFP: PFL1_06538
SGRA: EX895_005922
MGL: MGL_2166
MRT: MRET_0343
MSYM: MSY001_1901
PGR: PGTG_13869 PGTG_21518
PTRC: PtA15_15A348
PSTR: Pst134EA_027877
MLR: MELLADRAFT_36161
NCE: NCER_100499
VNX: VNE69_12055
MBR: MONBRDRAFT_717
SRE: PTSG_04822
ACAN: ACA1_389620
PFA: PF3D7_1250800
PFD: PFDG_03499
PFH: PFHG_03645
PREI: PRSY57_1250200
PGAB: PGSY75_1250800
PLAG: 39743219(PADL01_1251000)
PYO: PY17X_1466300
PCB: PCHAS_1466000
PBE: PBANKA_1463700
PVV: PVVCY_1406580
PKN: PKNH_1470800
PVX: PVX_101435
PCY: PCYB_147520
PMAL: PMUG01_14084000
PBRS: 92373969(MKS88_005882)
PREL: PRELSG_1466100
PCOT: PCOAH_00051560
BBO: BBOV_III008700
BBIG: BBBOND_0312070
CPV: cgd4_140
CHO: Chro.40028
TGO: TGME49_226440(RAD16)
PTI: PHATRDRAFT_28568
FCY: FRACYDRAFT_209064
TPS: THAPSDRAFT_268889
PIF: PITG_18962
PSOJ: PHYSODRAFT_566639
SPAR: SPRG_20587
TBR: Tb11.03.0400
TBG: TbgDal_XI750
TCR: 506925.140
LMA: LMJF_25_0740
LIF: LINJ_25_0770
LDO: LDBPK_250770
LMI: LMXM_25_0740
LMAT: 92515260(LSCM1_05276)
LBZ: LBRM_25_0620
LPAN: LPMP_250760
LOI: 92360340(LSCM4_04422)
LEIS: 94179729(GH5_04286)
LENR: 94172378(CUR178_05174)
LEIN: 94188136(JIQ42_04478)
PHET: 94290636(JKF63_04576)
NGR: NAEGRDRAFT_30559
EHX: EMIHUDRAFT_427067 EMIHUDRAFT_467421
GTT: GUITHDRAFT_159018 GUITHDRAFT_77334
 » show all
Reference
PMID:15177043
  Authors
Yu S, Owen-Hughes T, Friedberg EC, Waters R, Reed SH
  Title
The yeast Rad7/Rad16/Abf1 complex generates superhelical torsion in DNA that is required for nucleotide excision repair.
  Journal
DNA Repair (Amst) 3:277-87 (2004)
DOI:10.1016/j.dnarep.2003.11.004
  Sequence
[sce:YBR114W]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system