KEGG   ORTHOLOGY: K20553
Entry
K20553                      KO                                     
Symbol
XRN4
Name
5'-3' exoribonuclease 4 [EC:3.1.13.-]
Pathway
map04016  MAPK signaling pathway - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04016 MAPK signaling pathway - plant
    K20553  XRN4; 5'-3' exoribonuclease 4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K20553  XRN4; 5'-3' exoribonuclease 4
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    5' exonucleases
     K20553  XRN4; 5'-3' exoribonuclease 4
Other DBs
GO: 0004534
Genes
ATH: AT1G54490(XRN4)
ALY: 110224774
CRB: 17894090
CSAT: 104700968 104750270 104787318
EUS: EUTSA_v10023239mg
BRP: 103838732
BNA: 106452657 111215767
BOE: 106318775
RSZ: 108827613
THJ: 104805813
CPAP: 110809667
CIT: 102610368
CIC: CICLE_v10000168mg
PVY: 116133342
MINC: 123201387 123220819
TCC: 18600252
GRA: 105782657 105804723
GHI: 107888726 107901512 107920080 107945963
GAB: 108463922 108473898
HSYR: 120128951 120177454
DZI: 111277213
EGR: 104415467
GMX: 100789497 100793385 100817715
GSJ: 114399239 114403214 114407677
PVU: PHAVU_006G0992000 PHAVU_007G185300g
VRA: 106772392 106775682
VAR: 108342985 108345882
VUN: 114187716 114190881
VUM: 124824771 124828378
CCAJ: 109796112 109815355
APRC: 113861016 113871652
MTR: 112421269 11429796
TPRA: 123890838 123903093
CAM: 101491968 101494356
PSAT: 127097902 127132289
VVO: 131610639 131627418 131644131
LJA: Lj0g3v0279609.1(Lj0g3v0279609.1) Lj0g3v0279609.2(Lj0g3v0279609.2) Lj1g3v4957670.1(Lj1g3v4957670.1)
ADU: 107492071
AIP: 107645843
AHF: 112695458 112758237
LANG: 109329928 109354287
PCIN: 129318321
QSA: O6P43_007603 O6P43_011181
FVE: 101292133
RCN: 112192061
PPER: 18773196
PMUM: 103318564
PAVI: 110759677
PDUL: 117629772
MDM: 103434145 103451007
MSYL: 126593063 126620134
PXB: 103954437
ZJU: 107412266
MNT: 21389622
CSAV: 115716957
CSV: 101218843
CMO: 103495846
BHJ: 120080566
MCHA: 111013096
CMAX: 111493680
CMOS: 111450621
CPEP: 111804820
RCU: 8288429
JCU: 105647651
HBR: 110656738
MESC: 110621412
POP: 18098928 18110978
PEU: 105110438 105131272
PALZ: 118051376 118053300
JRE: 108979482 108994257
CILL: 122315581 122318955
CAVE: 132170313
QSU: 111988968
QLO: 115959132 115979984
TWL: 120000234
VVI: 100253751
VRI: 117930125
SLY: 100147714(XRN4)
SPEN: 107017782
SOT: 102604337
SSTN: 125856825
SDUL: 129903540
CANN: 107849685
LBB: 132616202
NTA: 107780231 107785646 107808663
NSY: 104212536 104216780
NTO: 104097466
NAU: 109225847 109233105
INI: 109191425
ITR: 116010195 116013537 116032087
SIND: 105172263
OEU: 111383991
EGT: 105958469
SSPL: 121749243 121792338 121793002 121798894
SMIL: 130998860 131016073
SHIS: 125207231 125221750 125223541
APAN: 127260889
HAN: 110867879 110909351
ECAD: 122595441 122602836
LSV: 111906467
CCAV: 112501543
DCR: 108204602
CSIN: 114290536 114309962 114312772
RVL: 131319920 131332375
AEW: 130753296 130784038 130795599
BVG: 104890966
SOE: 110788465
CQI: 110708480 110737046
ATRI: 130797258
MOF: 131154107
NNU: 104611789
MING: 122062952 122091826
TSS: 122641975 122651977 122663864
PSOM: 113318107 113350087
OSA: 4334408
DOSA: Os03t0794800-01(Os03g0794800)
OBR: 102718537
OGL: 127766442
BDI: 100823403
ATS: 109762497
TDC: 119303510 119312168
TAES: 123105380 123113651
LPER: 127346757
LRD: 124704542
SBI: 8061178 8083058
ZMA: 100384297 103641862
SITA: 101776459 101777938
SVS: 117837817 117864373
PVIR: 120643489 120649480 120684362 120687787 120696644
PHAI: 112874453
PDA: 103696973 103703566 103712565
EGU: 105036145 105042290 105043828
MUS: 103977403 103983096
ZOF: 121992702 121996663 122032375 122034057
DCT: 110094380
PEQ: 110030703
AOF: 109832974 109848512
MSIN: 131249296
NCOL: 116247275
ATR: 18421415
NCE: NCER_101741
EHX: EMIHUDRAFT_225049
 » show all
Reference
PMID:11106401
  Authors
Kastenmayer JP, Green PJ
  Title
Novel features of the XRN-family in Arabidopsis: evidence that AtXRN4, one of several orthologs of nuclear Xrn2p/Rat1p, functions in the cytoplasm.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 97:13985-90 (2000)
DOI:10.1073/pnas.97.25.13985
  Sequence
[ath:AT1G54490]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system